Центросомные белки 290 кДа является белком , который в организме человека кодируется CEP290 геном . [5] [6] [7] [8] CEP290 расположен на плече Q хромосомы 12.
CEP290 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | CEP290 , 3H11Ag, BBS14, CT87, JBTS5, LCA10, MKS4, NPHP6, POC3, SLSN6, rd16, центросомный белок 290 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 610142 MGI : 2384917 HomoloGene : 77213 GeneCards : CEP290 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 12: 88.05 - 88.14 Мб | Chr 10: 100,49 - 100,57 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Ген CEP290 - это центросомный белок, который играет важную роль в развитии центросом и ресничек . Этот ген жизненно важен для формирования первичной реснички, небольших антенно-подобных выступов клеточной мембраны, которые играют важную роль в фоторецепторах на задней стороне сетчатки (которые обнаруживают свет и цвет) и в почках, головном мозге, и многие другие органы тела. Снижение уровней транскрипта гена CEP290 приводит к резкому подавлению цилиогенеза в пигментных эпителиальных клетках сетчатки в культуре, доказывая, насколько важен CEP290 для образования ресничек.
На молекулярном уровне CEP290, как было установлено, играет критическую регуляторную и структурную роль в формировании первичных ресничек. Недавние исследования подтвердили участие CEP290 в качестве связывающего микротрубочки и мембрану белка, который может служить структурной связью между ядром микротрубочек ресничек и лежащей выше мембраной ресничек. [9] Нарушение домена связывания микротрубочек CEP290 в модели заболевания CEP290 у мышей rd16 [7], как было показано, приводит к быстрой и драматической дегенерации сетчатки, демонстрируя важность связывания микротрубочек CEP290 при заболевании. Роль CEP290 в стимулировании цилиогенеза ингибируется как саморегулирующими доменами, обнаруженными на обоих концах белка CEP290 [9], так и посредством взаимодействия CEP290 с ингибирующим белком CP110. [10]
Открытие гена CEP290 привело исследователей к открытию еще одного гена, важного для функции сетчатки - LCA5. Клинические испытания, включающие замену этих двух генов, начались в Филадельфии, где исследователи надеются, что однажды врожденный амавроз Лебера будет излечен. [11] [12] [13]
Состав
Этот ген кодирует белок с 13 предполагаемыми биспиральных доменов , области с гомологией к SMC хромосомных сегрегации АТФазы , шесть KID мотивов , три тропомиозин гомологии доменов и с АТФ / ГТФ сайт связывания мотива A . Белок локализован в центросоме и ресничках и имеет сайты для N- гликозилирования , сульфирования тирозина , фосфорилирования , N- миристоилирования и амидирования . [8]
Клиническое значение
Мутации в этом гене были связаны с синдромом Жубера и нефронофтизом , а в последнее время - с частой формой врожденного амавроза Лебера , называемой LCA10. Наличие антител против этого белка связано с несколькими формами рака. [8]
Мутация в этом гене приводит к слепоте младенцев и детей, заболеванию, известному как врожденный амавроз Лебера. На сегодняшний день за LCA ответственны 35 различных мутаций в CEP290. Другие мутации в CEP290 также были идентифицированы, вызывая синдром Меккеля и синдром Жубера, некоторые из многих синдромов. Дефектный ген CEP290 обычно является причиной этих нарушений из-за аномальных ресничек. Неизвестно, как одна мутация в гене может вызывать столько разных типов синдромов, особенно многие из которых влияют на центральную нервную систему.
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000198707 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019971 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Го Дж, Джин Дж, Мэн Л., Ма Х, Не Д., Ву Дж, Юань Л., Шоу С. (октябрь 2004 г.). «Субклеточная локализация опухоль-ассоциированного антигена 3H11Ag». Biochem Biophys Res Commun . 324 (2): 922–30. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.09.133 . PMID 15474516 .
- ^ Sayer JA, Otto EA, O'Toole JF, Nurnberg G, Kennedy MA, Becker C, Hennies HC, Helou J, Attanasio M, Fausett BV, Utsch B, Khanna H, Liu Y, Drummond I, Kawakami I, Kusakabe T., Цуда М., Ма Л., Ли Х., Ларсон Р.Г., Аллен С.Дж., Уилкинсон С.Дж., Нигг Э.А., Шоу К., Лилло К., Уильямс Д.С., Хоппе Б., Кемпер М.Дж., Нойхаус Т., Паризи М.А., Гласс И.А., Петри М., Кишперт А. , Gloy J, Ganner A, Walz G, Zhu X, Goldman D, Nurnberg P, Swaroop A, Leroux MR, Hildebrandt F (май 2006 г.). «Центросомный белок нефроцистин-6 мутирован при синдроме Жубера и активирует фактор транскрипции ATF4». Нат Жене . 38 (6): 674–81. DOI : 10.1038 / ng1786 . PMID 16682973 . S2CID 16941062 .
- ^ а б Чанг Б., Ханна Х, Хос Н, Джимено Д., Хе С., Лилло С., Парапурам С. К., Ченг Х, Скотт А., Херд Р. Э., Сайер Дж. А., Отто Э. А., Аттанасио М., О'Тул Дж. Ф., Джин Дж., Шоу К., Hildebrandt F, Williams DS, Heckenlively JR, Swaroop A (май 2006 г.). «Делеция в рамке считывания нового центросомного / цилиарного белка CEP290 / NPHP6 нарушает его взаимодействие с RPGR и приводит к раннему началу дегенерации сетчатки у мышей rd16» . Hum Mol Genet . 15 (11): 1847–57. DOI : 10,1093 / HMG / ddl107 . PMC 1592550 . PMID 16632484 .
- ^ а б в «Ген Entrez: центросомный белок CEP290 290 кДа» .
- ^ а б Дривас Т.Г., Хольцбаур Е.Л., Беннет Дж. (Октябрь 2013 г.). «Нарушение доменов связывания микротрубочек / мембран CEP290 вызывает дегенерацию сетчатки» . J Clin Invest . 123 (10): 4525–39. DOI : 10.1172 / JCI69448 . PMC 3784542 . PMID 24051377 .
- ^ Цанг В.Й., Боссард К., Ханна Х., Перянен Дж., Сваруп А., Малхотра В., Динлахт Б.Д. (август 2008 г.). «CP110 подавляет образование первичных ресничек за счет взаимодействия с CEP290, белком, дефицитным при цилиарной болезни человека» . Dev Cell . 15 (2): 187–97. DOI : 10.1016 / j.devcel.2008.07.004 . PMC 3987787 . PMID 18694559 .
- ^ Kniffin, Cassandra L. "OMIM запись центросомного Protein 290-KD." [1] Архивировано 26 октября 2011 г.на Wayback Machine Np, 24 мая 2006 г. Интернет. 30 марта 2013 г.
- ^ "Genetics Home Reference Gene CEP290". [2] . Национальная медицинская библиотека США, 25 марта 2013 г. Интернет. 30 марта 2013 г.
- ^ Центр здоровья Университета Макгилла. «Определен ген, ответственный за слепоту у младенцев и детей». ScienceDaily, 4 июня 2007 г. Web. 30 марта 2013 г.
Внешние ссылки
- GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о синдроме Барде-Бидла
- Расположение генома человека CEP290 и страница сведений о гене CEP290 в браузере генома UCSC .
- Расположение генома человека LCA10 и страница сведений о гене LCA10 в браузере генома UCSC .
дальнейшее чтение
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Res . 4 (2): 141–50. DOI : 10.1093 / dnares / 4.2.141 . PMID 9205841 .
- Эйхмюллер С., Усенер Д., Даммер Р. и др. (2001). «Серологическое обнаружение кожных антигенов, связанных с Т-клеточной лимфомой» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (2): 629–34. DOI : 10.1073 / pnas.021386498 . PMC 14639 . PMID 11149944 .
- Чен Д., Шоу С. (2001). «Молекулярное клонирование ассоциированного с опухолью антигена, распознаваемого моноклональным антителом 3H11». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 280 (1): 99–103. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.4087 . PMID 11162484 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М. и др. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона» . J. Biol. Chem . 278 (9): 7607–16. DOI : 10.1074 / jbc.M210455200 . PMID 12493773 .
- Миллар JK, Christie S, Porteous DJ (2004). «Двухгибридные дрожжевые скрининги задействуют DISC1 в развитии и функционировании мозга». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 311 (4): 1019–25. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2003.10.101 . PMID 14623284 .
- Андерсен Дж. С., Уилкинсон С. Дж., Мэр Т. и др. (2003). «Протеомная характеристика центросомы человека с помощью профилирования корреляции белков». Природа . 426 (6966): 570–4. DOI : 10,1038 / природа02166 . PMID 14654843 . S2CID 4427303 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
- Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ, et al. (2006). «Готовая последовательность ДНК хромосомы 12 человека» . Природа . 440 (7082): 346–51. DOI : 10,1038 / природа04569 . PMID 16541075 .
- Валенте Е.М., Силхави Дж. Л., Бранкати Ф. и др. (2006). «Мутации в CEP290, который кодирует центросомный белок, вызывают плейотропные формы синдрома Жубера». Nat. Genet . 38 (6): 623–5. DOI : 10.1038 / ng1805 . PMID 16682970 . S2CID 32532810 .
- ден Холландер А.И., Коенекоп Р.К., Изер С. и др. (2006). «Мутации в гене CEP290 (NPHP6) - частая причина врожденного амавроза Лебера» . Являюсь. J. Hum. Genet . 79 (3): 556–61. DOI : 10.1086 / 507318 . PMC 1559533 . PMID 16909394 .
- Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
- Perrault I, Delphin N, Hanein S и др. (2007). «Спектр мутаций NPHP6 / CEP290 при врожденном амаврозе Лебера и определение связанного с ним фенотипа» . Гм. Мутат . 28 (4): 416. DOI : 10.1002 / humu.9485 . PMID 17345604 . S2CID 24057475 .
- Тори К., Лакост Т., Бурглен Л. и др. (2007). «Высокая частота мутаций NPHP1 и NPHP6 у пациентов с синдромом Жубера и нефронофтизом: потенциальный эпистатический эффект мутаций NPHP6 и AHI1 у пациентов с мутациями NPHP1» . Варенье. Soc. Нефрол . 18 (5): 1566–75. DOI : 10,1681 / ASN.2006101164 . PMID 17409309 .
- Чидесиян А.В., Алеман Т.С., Якобсон С.Г. и др. (2007). «Мутации центросомно-цилиарного гена CEP290 / NPHP6 приводят к слепоте с неожиданной сохранностью фоторецепторов и зрительного мозга: значение для терапии врожденного амавроза Лебера». Гм. Мутат . 28 (11): 1074–83. DOI : 10.1002 / humu.20565 . ЛВП : 2027,42 / 57387 . PMID 17554762 . S2CID 5130364 .
- Бранкати Ф., Баррано Дж., Силхави Дж. Л. и др. (2007). «Мутации CEP290 часто выявляются при окуло-почечной форме расстройств, связанных с синдромом Жубера» . Являюсь. J. Hum. Genet . 81 (1): 104–13. DOI : 10.1086 / 519026 . PMC 1950920 . PMID 17564967 .