CNOT7

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2D5R , 4GMJ

Идентификаторы

Псевдонимы

CNOT7 , CAF1 , Caf1a, hCAF-1, CAF-1, CCR4-NOT субъединица 7 транскрипционного комплекса

Внешние идентификаторы

OMIM : 604913 MGI : 1298230 HomoloGene : 49011 GeneCards : CNOT7

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 8 (человек) ^[1]

Группа	8p22	Начинать	17 224 966 п.н. ^[1]
Группа	8p22	Конец	17 246 878 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[2]

Группа	8 \| 8 A4	Начинать	40 492 540 п.н. ^[2]
Группа	8 \| 8 A4	Конец	40 515 847 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• нуклеазная активность • связывание нуклеиновых кислот • экзорибонуклеазная активность • связывание с белком GO: 0001948 • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • активность сигнального преобразователя • поли (A) -специфическая рибонуклеазная активность • экзонуклеазная активность • связывание РНК • GO: 0001131, GO : 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • активность гидролазы • связывание с ионом металла • связывание фактора транскрипции • активность корепрессора транскрипции GO: 0001106
Сотовый компонент	• ядро клетки • комплекс CCR4-NOT • цитозоль • мембрана • ядерное тело • Р-тело • цитоплазма • ядерное пятнышко • ядерный комплекс CCR4-NOT • тело PML клетки-хозяина
Биологический процесс	• негативная регуляция клеточной пролиферации • негативная регуляция экспрессии генов • экзонуклеолитический ядерно-транскрибируемый мРНК катаболический процесс, участвующий в деаденилировании-зависимом распаде • зависимое от деаденилирования расщепление транскрибируемой ядерной мРНК • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • сборка тела цитоплазматической мРНК • положительная регулирование процесс катаболического ядерно-транскрибируются мРНК, деаденилирование-зависимого затухание • регуляции транскрипции ДНК-шаблонные • положительного регулирования пролиферации клеток • положительного регулирование мРНК поли ядерного транскрибируется (А) хвост укорочения • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция катаболического процесса мРНК • сайленсинг генов с помощью миРНК • регуляция трансляции • ядерная транскрипция мРНК поли (A) укорочение хвоста • сигнальная трансдукция • сайленсинг генов с помощью РНК • транскрипция, ДНК-шаблон • гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический • реакция на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT • позитивная регуляция репликации вирусного генома • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • защитный ответ на вирус • негативная регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа • углеводный метаболический процесс • негативная регуляция трансляции
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


29883


18983

Ансамбль


ENSG00000198791


ENSMUSG00000031601

UniProt


Q9UIV1


Q60809

RefSeq (мРНК)

NM_013354 NM_054026 NM_001322087 NM_001322088 NM_001322089
NM_001322090 NM_001322091 NM_001322092 NM_001322093 NM_001322094 NM_001322095 NM_001322096 NM_001322097 NM_001322098 NM_001322099 NM_001322100


NM_001271542 NM_001271543 NM_011135 NM_001361938 NM_001361939

RefSeq (белок)

NP_001309016 NP_001309017 NP_001309018 NP_001309019 NP_001309020
NP_001309021 NP_001309022 NP_001309023 NP_001309024 NP_001309025 NP_001309026 NP_001309027 NP_001309028 NP_001309029 NP_037486 NP_473367


NP_001258471 NP_001258472 NP_035265 NP_001348867 NP_001348868

Расположение (UCSC)

Chr 8: 17.22 - 17.25 Мб

Chr 8: 40,49 - 40,52 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

CCR4-НЕ транскрипционный комплекс субъединица 7 представляет собой белка , который у человека кодируется CNOT7 геном . ^[5]^[6]^[7]^[8] Это субъединица комплекса CCR4-Not деаденилаза .

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, связывается с антипролиферативным белком, белком транслокации B-клеток 1, который негативно регулирует пролиферацию клеток. Связывание двух белков, которое запускается фосфорилированием антипролиферативного белка, вызывает сигнальные события при делении клеток, которые приводят к изменениям в пролиферации клеток, связанных с контактом между клетками. Белок имеет ортологи как у мышей, так и у дрожжей. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы. ^[8]

Взаимодействия [ править ]

CNOT7 взаимодействует с:

BTG1 , ^[9]^[10]
PABPC1 , ^[11]
TOB1 , ^[11]^[12] и
ТОБ2 . ^[12]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000198791 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031601 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Альберт Т.К., Лемэр M, ван Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Тиммерс HT (март 2000). «Выделение и характеристика человеческих ортологов дрожжевых субъединиц CCR4-NOT» . Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. DOI : 10.1093 / NAR / 28.3.809 . PMC 102560 . PMID 10637334 .
^ Адамс MD, Дубник M, Kerlavage AR, Морено R, Келли JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (март 1992). «Идентификация последовательности 2375 генов мозга человека». Природа . 355 (6361): 632–4. DOI : 10.1038 / 355632a0 . PMID 1538749 . S2CID 4234345 .
^ Robin-Lespinasse Y, Sentis S, Kolytcheff C, Ростан MC, Corbo L, Le Romancer M (февраль 2007). «hCAF1, новый регулятор PRMT1-зависимого метилирования аргинина» . J. Cell Sci . 120 (Pt 4): 638–47. DOI : 10,1242 / jcs.03357 . PMID 17264152 .
^ a b «Ген Entrez: CNOT7 CCR4-NOT транскрипционный комплекс, субъединица 7» .
^ Богдан JA, Адамс-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Бенфилд PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Диккер IB (декабрь 1998). «Человеческий углеродный репрессорный белок катаболита (CCR4) -ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с белком транслокации B-клеток BTG1» . Биохим. Дж . 336 (2): 471–81. DOI : 10.1042 / bj3360471 . PMC 1219893 . PMID 9820826 .
^ Прево Д, Морель А.П., Voeltzel Т, Ростан МС, Rimokh R, Magaud JP, Корб л (март 2001 г.). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
↑ a b Фунакоши Y, Дои Y, Хосода Н., Учида Н., Осава М., Симада И., Цудзимото М., Судзуки Т., Катада Т., Хосино С. (декабрь 2007 г.). «Механизм деаденилирования мРНК: доказательства молекулярного взаимодействия между фактором терминации трансляции eRF3 и деаденилазами мРНК» . Genes Dev . 21 (23): 3135–48. DOI : 10,1101 / gad.1597707 . PMC 2081979 . PMID 18056425 .
^ a b Ikematsu N, Yoshida Y, Kawamura-Tsuzuku J, Ohsugi M, Onda M, Hirai M, Fujimoto J, Yamamoto T (декабрь 1999 г.). «Tob2, новый антипролиферативный член семейства Tob / BTG1, ассоциируется с компонентом транскрипционного регуляторного комплекса CCR4, способным связывать циклин-зависимые киназы» . Онкоген . 18 (52): 7432–41. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203193 . PMID 10602502 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Депутат Дрейпера, Сальвадор С., Денис К.Л. (1995). «Идентификация белка мыши, гомолог которого в Saccharomyces cerevisiae является компонентом комплекса регуляции транскрипции CCR4» . Мол. Клетка. Биол . 15 (7): 3487–95. DOI : 10,1128 / MCB.15.7.3487 . PMC 230585 . PMID 7791755 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж К., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Е., Андервуд К., Вольдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М (1996). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком» . Genome Res . 6 (9): 807–28. DOI : 10.1101 / gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Rouault JP, Prevôt D, Berthet C, Birot AM, Billaud M, Magaud JP, Corbo L (1998). «Взаимодействие продуктов гена BTG1 и p53, регулируемых BTG2, с mCaf1, мышиным гомологом компонента дрожжевого комплекса регуляции транскрипции CCR4» . J. Biol. Chem . 273 (35): 22563–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.35.22563 . PMID 9712883 .
Богдан Дж. А., Адамс-Бертон С., Педикорд Д. Л., Сукович Д. А., Бенфилд П. А., Корджай М. Х., Столтенборг Дж. К., Дикер И.Б. (1998). «Человеческий углеродный репрессорный белок катаболита (CCR4) -ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с белком транслокации B-клеток BTG1» . Биохим. Дж . 336 (2): 471–81. DOI : 10.1042 / bj3360471 . PMC 1219893 . PMID 9820826 .
Икэмацу Н., Йошида Й, Кавамура-Цузуку Дж, Осуги М., Онда М., Хираи М., Фудзимото Дж., Ямамото Т. (1999). «Tob2, новый антипролиферативный член семейства Tob / BTG1, ассоциируется с компонентом транскрипционного регуляторного комплекса CCR4, способным связывать циклин-зависимые киназы» . Онкоген . 18 (52): 7432–41. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203193 . PMID 10602502 .
Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Магауд Дж. П., Корбо Л. (2001). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
Йошида Ю., Хосода Е., Накамура Т., Ямамото Т. (2001). «Ассоциация ANA, члена антипролиферативного семейства белков Tob, с компонентом Caf1 транскрипционного регуляторного комплекса CCR4» . Jpn. J. Cancer Res . 92 (6): 592–6. DOI : 10.1111 / j.1349-7006.2001.tb01135.x . PMC 5926753 . PMID 11429045 .
Фланаган Дж., Хили С., Янг Дж., Уайтхолл В., Ченевикс-Тренч Г. (2003). «Анализ регулятора транскрипции, CNOT7, в качестве гена-кандидата хромосомы 8 опухолевого супрессора при колоректальном раке». Int. J. Рак . 106 (4): 505–9. DOI : 10.1002 / ijc.11264 . PMID 12845644 . S2CID 25191544 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026.
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CNOT7 и страница сведений о гене CNOT7 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9UIV1 (субъединица 7 транскрипционного комплекса CCR4-NOT) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на хромосоме 8 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000198791 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031601 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10637334-5] Альберт Т.К., Лемэр M, ван Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Тиммерс HT (март 2000). «Выделение и характеристика человеческих ортологов дрожжевых субъединиц CCR4-NOT» . Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. DOI : 10.1093 / NAR / 28.3.809 . PMC 102560 . PMID 10637334 .

[pmid1538749-6] Адамс MD, Дубник M, Kerlavage AR, Морено R, Келли JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (март 1992). «Идентификация последовательности 2375 генов мозга человека». Природа . 355 (6361): 632–4. DOI : 10.1038 / 355632a0 . PMID 1538749 . S2CID 4234345 .

[pmid17264152-7] Robin-Lespinasse Y, Sentis S, Kolytcheff C, Ростан MC, Corbo L, Le Romancer M (февраль 2007). «hCAF1, новый регулятор PRMT1-зависимого метилирования аргинина» . J. Cell Sci . 120 (Pt 4): 638–47. DOI : 10,1242 / jcs.03357 . PMID 17264152 .

[entrez-8] «Ген Entrez: CNOT7 CCR4-NOT транскрипционный комплекс, субъединица 7» .

[pmid9820826-9] Богдан JA, Адамс-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Бенфилд PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Диккер IB (декабрь 1998). «Человеческий углеродный репрессорный белок катаболита (CCR4) -ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с белком транслокации B-клеток BTG1» . Биохим. Дж . 336 (2): 471–81. DOI : 10.1042 / bj3360471 . PMC 1219893 . PMID 9820826 .

[pmid11136725-10] Прево Д, Морель А.П., Voeltzel Т, Ростан МС, Rimokh R, Magaud JP, Корб л (март 2001 г.). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .

[pmid18056425-11] Фунакоши Y, Дои Y, Хосода Н., Учида Н., Осава М., Симада И., Цудзимото М., Судзуки Т., Катада Т., Хосино С. (декабрь 2007 г.). «Механизм деаденилирования мРНК: доказательства молекулярного взаимодействия между фактором терминации трансляции eRF3 и деаденилазами мРНК» . Genes Dev . 21 (23): 3135–48. DOI : 10,1101 / gad.1597707 . PMC 2081979 . PMID 18056425 .

[pmid10602502-12] Ikematsu N, Yoshida Y, Kawamura-Tsuzuku J, Ohsugi M, Onda M, Hirai M, Fujimoto J, Yamamoto T (декабрь 1999 г.). «Tob2, новый антипролиферативный член семейства Tob / BTG1, ассоциируется с компонентом транскрипционного регуляторного комплекса CCR4, способным связывать циклин-зависимые киназы» . Онкоген . 18 (52): 7432–41. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203193 . PMID 10602502 .

[1]