Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
COPS2
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4Д10 , 4Д18 , 4WSN

Идентификаторы
ПсевдонимыCOPS2 , ALIEN, CSN2, SGN2, TRIP15, COP9 сигнальная субъединица 2
Внешние идентификаторыOMIM : 604508 HomoloGene : 134283 GeneCards : COPS2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человека) [1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное местоположение для COPS2
Геномное местоположение для COPS2
Группа15q21.1Начинать49 106 068 п.н. [1]
Конец49 155 661 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE COPS2 209838 в формате fs.png

PBB GE COPS2 202467 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
• Активность преобразователя сигнала
• Активность корепрессора транскрипции GO: 0001106
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• ядро
• сигналосома COP9
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• негативная регуляция транскрипции с помощью РНК - полимеразы II
• транскрипции РНК - полимеразы II ,
• репарации нуклеотидов-иссечения, ДНК распознавания повреждений
• нейрон дифференциации
• пролиферации популяции клеток
• трансдукции сигнала
• отрицательная регуляция нуклеиновой кислоты-шаблонный транскрипции
• скелетных мышц клеточной дифференцировки
• транскрипции -связанная эксцизионная репарация нуклеотидов
• нейрогенез
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• денеддилирование белка
• посттрансляционная модификация белка
• фосфорилирование белков
• пролиферация клеток внутренней массы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9318

н / д

Ансамбль

ENSG00000166200

н / д

UniProt

P61201

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_004236
NM_001143887

н / д

RefSeq (белок)

NP_001137359
NP_004227

н / д

Расположение (UCSC)Chr 15: 49.11 - 49.16 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Сигналосома cop9 комплекс субъединица 2 представляет собой белок , который у человека кодируется COPS2 гена . [3] [4] [5] Он кодирует субъединицу сигнаносомы COP9 .

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что COPS2 взаимодействует с:

  • DAX1 , [6]
  • IRF8 , [7]
  • NIF3L1 , [8] и
  • THRA . [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000166200 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ Ли JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Мур DD (июль 1995). «Два класса белков, зависящих от наличия или отсутствия тироидного гормона для взаимодействия с рецептором тироидного гормона». Мол Эндокринол . 9 (2): 243–54. DOI : 10,1210 / me.9.2.243 . PMID 7776974 . 
  4. ↑ Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в передаче сигнала, обладающий сходством с субъединицами 26S протеасомы». FASEB J . 12 (6): 469–78. DOI : 10.1096 / fasebj.12.6.469 . PMID 9535219 . 
  5. ^ "Энтрез Ген: COPS2 COP9 конститутивный фотоморфогенный гомолог субъединица 2 (Arabidopsis)" .
  6. ^ Altincicek B, Tenbaum SP, Dressel U, Thormeyer D, Renkawitz R, Baniahmad A (март 2000). «Взаимодействие корепрессора Alien с DAX-1 отменяется мутациями DAX-1, вызывающими врожденную гипоплазию надпочечников» . J. Biol. Chem . 275 (11): 7662–7. DOI : 10.1074 / jbc.275.11.7662 . PMID 10713076 . 
  7. ^ Коэна Н, Азриель А, Т Коэна, Meraro D, Hashmueli S, Bech-Otschir D, R Крафт, Dubiel Вт, Леви Б. З. (декабрь 2000). «Взаимодействие между связывающим консенсусную последовательность белком интерферона и COP9 / субъединицей CSN2 (Trip15). Возможная связь между передачей сигналов фактора регуляции интерферона и COP9 / сигналосомой» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39081–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004900200 . PMID 10991940 . 
  8. Перейти ↑ Akiyama H, Fujisawa N, Tashiro Y, Takanabe N, Sugiyama A, Tashiro F (март 2003 г.). «Роль транскрипционного корепрессора Nif3l1 на ранней стадии нейральной дифференцировки через сотрудничество с Trip15 / CSN2» . J. Biol. Chem . 278 (12): 10752–62. DOI : 10.1074 / jbc.M209856200 . PMID 12522100 . 
  9. ^ Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов» . Мол. Клетка. Биол . 19 (5): 3383–94. DOI : 10.1128 / mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека COPS2 и страница сведений о гене COPS2 в браузере генома UCSC .
  • Человек CSN2 место генома и CSN2 ген подробно страницу в браузере УСК генома .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (2004). «Сигналосома COP9: платформа для сборки и обслуживания лигаз убиквитина cullin?». Nat. Cell Biol . 5 (12): 1029–33. DOI : 10.1038 / ncb1203-1029 . PMID  14647295 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Вэй Н, Цуге Т., Серино Дж., Дохмае Н., Такио К., Мацуи М., Дэн XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется у растений и млекопитающих и связан с регуляторным комплексом протеасомы 26S». Curr. Биол . 8 (16): 919–22. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7 . PMID  9707402 .
  • Шефер Л., Берманн М.Л., Миллер Дж. Б. (1999). «Кодирующая последовательность, геномная организация, хромосомная локализация и паттерн экспрессии сигнального компонента Cops2: мышиный гомолог чужеродной дрозофилы». Геномика . 56 (3): 310–6. DOI : 10.1006 / geno.1998.5728 . PMID  10087198 .
  • Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (1999). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов» . Мол. Клетка. Биол . 19 (5): 3383–94. DOI : 10.1128 / mcb.19.5.3383 . PMC  84131 . PMID  10207062 .
  • Науманн М., Бех-Отсшир Д., Хуанг X, Феррелл К., Дубиль В. (2000). «Направленная сигнаносомой COP9 активация / стабилизация c-Jun не зависит от JNK» . J. Biol. Chem . 274 (50): 35297–300. DOI : 10.1074 / jbc.274.50.35297 . PMID  10585392 .
  • Алтынчичек Б., Тенбаум С.П., Дрессел Ю., Тормейер Д., Ренкавиц Р., Баниахмад А. (2000). «Взаимодействие корепрессора Alien с DAX-1 отменяется мутациями DAX-1, вызывающими врожденную гипоплазию надпочечников» . J. Biol. Chem . 275 (11): 7662–7. DOI : 10.1074 / jbc.275.11.7662 . PMID  10713076 .
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Е М., Чжоу Дж., Сюй Ш., Гу Дж, Ши Дж. Х, Джин В. Р., Чжан СК, Ву TM, Хуан Г. Ю., Чен З, Чен М. Д., Чен Дж. Л. (2000). «Профили экспрессии генов в человеческой оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники и клонирование полноразмерной кДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (17): 9543–8. DOI : 10.1073 / pnas.160270997 . PMC  16901 . PMID  10931946 .
  • Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Отсчир Д., Крафт Р., Дубиль В., Леви Б.З. (2001). «Взаимодействие между связывающим консенсусную последовательность белком интерферона и COP9 / субъединицей CSN2 (Trip15). Возможная связь между передачей сигналов фактора регуляции интерферона и COP9 / сигналосомой» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39081–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004900200 . PMID  10991940 .
  • Цугэ Т., Мацуи М., Вэй Н. (2001). «Субъединица 1 сигнаносомы COP9 подавляет экспрессию гена через свой N-концевой домен и включается в комплекс через домен PCI». J. Mol. Биол . 305 (1): 1–9. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4288 . PMID  11114242 . S2CID  14434381 .
  • Бех-Отшир Д., Крафт Р., Хуанг Х, Хенкляйн П., Капелари Б., Поллманн С., Дубиль В. (2001). «Фосфорилирование, специфичное для сигнаносомы COP9, направлено на расщепление р53 системой убиквитина» . EMBO J . 20 (7): 1630–9. DOI : 10.1093 / emboj / 20.7.1630 . PMC  145508 . PMID  11285227 .
  • Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вей Н., Шевченко А., Дешайс Р.Дж. (2001). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. DOI : 10.1126 / science.1059780 . PMID  11337588 .
  • Хоро Алвес К., Бочард В., Рети С., Жалино П. (2002). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами eIF3, сигнаносомой COP9 и протеасомой 26S» . FEBS Lett . 527 (1–3): 15–21. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2 . PMID  12220626 .
  • Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Ю., Таканабэ Н., Сугияма А., Таширо Ф. (2003). «Роль транскрипционного корепрессора Nif3l1 на ранней стадии нейральной дифференцировки через сотрудничество с Trip15 / CSN2» . J. Biol. Chem . 278 (12): 10752–62. DOI : 10.1074 / jbc.M209856200 . PMID  12522100 .
  • Серино Дж., Су Х, Пэн З., Цугэ Т., Вэй Н, Гу Х, Дэн XW (2003). «Характеристика последней субъединицы сигналосомы Arabidopsis COP9: значение для общей структуры и происхождения комплекса» . Растительная клетка . 15 (3): 719–31. DOI : 10.1105 / tpc.009092 . PMC  150025 . PMID  12615944 .
  • Uhle S, Medalia O, Waldron R, Dumdey R, Henklein P, Bech-Otschir D, Huang X, Berse M, Sperling J, Schade R, Dubiel W (2003). «Протеинкиназа CK2 и протеинкиназа D связаны с сигнаносомой COP9» . EMBO J . 22 (6): 1302–12. DOI : 10,1093 / emboj / cdg127 . PMC  151059 . PMID  12628923 .


  • v
  • т
  • е