Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с хромосомы 15 (человека) )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Хромосома 15 является одним из 23 пар хромосом в организме человека . Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. Хромосома 15 охватывает около 101 миллиона пар оснований (строительный материал ДНК ) и составляет от 3% до 3,5% всей ДНК в клетках .

Ген лейкоцитарного антигена человека β2-микроглобулина находится на хромосоме 15.

Гены [ править ]

Количество генов [ править ]

Ниже приведены некоторые оценки количества генов на хромосоме 15 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их прогнозы количества генов на каждой хромосоме варьируются (технические подробности см. В разделе « Прогнозирование генов» ). Среди различных проектов совместный проект согласованной последовательности кодирования ( CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего числа генов, кодирующих человеческий белок. [5]

Список генов [ править ]

Ниже приведен неполный список генов на хромосоме 15 человека. Полный список см. По ссылке в информационном окне справа.

  • AAGAB : белок, связывающий альфа- и гамма-адаптин
  • ACSBG1 : кодирующий фермент ацил-КоА синтетазу, семейство жевательной резинки, член 1
  • ARPP-19 : кодирующий белок цАМФ-регулируемый фосфопротеин 19
  • C15orf15 : кодирующий белок. Вероятный белок биогенеза рибосом RLP24.
  • CAPN3 : Calpain 3 (мышечная дистрофия конечностей типа 2A)
  • CHP : кальций-связывающий белок P22
  • CHSY1 : хондроитинсульфатсинтаза 1
  • CLK3 : CDC-подобная киназа 3
  • ClpX : кодирующий фермент АТФ-зависимую протеазу Clp АТФ-связывающая субъединица clpX-подобная, митохондриальная
  • COMMD4 : кодирующий белок COMM-домен, содержащий белок 4
  • CPEB1 : белок 1, связывающий элемент цитоплазматического полиладенилирования
  • DTWD1 :
  • ELL3 : кодирующий белок фактор элонгации РНК-полимераза II-подобная 3
  • FAH : фумарилацетоацетатгидролаза (фумарилацетоацетаза)
  • FAM214A : кодирующий белок белок FAM214A
  • FBN1 : фибриллин 1 (синдром Марфана)
  • FOXB1 : кодирующий белок Forkhead box B1
  • GATM : глицинаминотрансфераза, митохондриальная
  • GCHFR : белок обратной связи GTP-циклогидролазы 1
  • GLCE : D-глюкуронил C5-эпимераза
  • HDGFRP3 :
  • HEXA : гексозаминидаза A (альфа-полипептид) ( болезнь Тея – Сакса )
  • HMG20A : кодирующий белок белок группы высокой подвижности 20A
  • IDDM3, кодирующий белок, инсулинозависимый сахарный диабет 3
  • IMP3 : кодирующий белок U3 малый ядрышковый рибонуклеопротеин, белок IMP3
  • ITPKA : кодирующий фермент инозитол-трифосфат-3-киназу A
  • IVD : изовалерилкоэнзим А дегидрогеназа
  • KATNBL1 : кодирующий белок KATNBL1
  • LARP6, кодирующий белок, родственный белок 6 La, также известный как ахерон или член семейства 6 домена рибонуклеопротеина La (LARP6),
  • LCMT2 : кодирующий фермент лейцинкарбоксилметилтрансферазу 2
  • LINC00926, кодирующий белок Длинная межгенная небелковая кодирующая РНК 926
  • MESDC2 : кодирующий белок шаперон LDLR MESD
  • MESP1 : кодирующий белок задний гомолог 1 мезодермы (мышь)
  • MFAP1 : кодирующий белок, связанный с микрофибриллами белок 1
  • MCPH4 : микроцефалия, первичный аутосомно-рецессивный 4
  • MIR7-2 : кодирующий белок MicroRNA 7-2
  • MIR627 : кодирующий белок MicroRNA 627
  • NIPA2 : кодирующий белок, не импринтированный в белок 2 области синдрома Прадера-Вилли / Ангельмана
  • OCA2 : глазокожный альбинизм II (гомолог разведения розовых глаз, мышь)
  • PDCD7 : кодирующий белок белок программируемой гибели клеток 7
  • ПМЛ : белок промиелоцитарного лейкоза (участвует в t (15,17) с RARalpha, преобладающей причиной острого промиелоцитарного лейкоза.
  • PTPLAD1 : кодирующий фермент Белок, подобный тирозинфосфатазе, белок PTPLAD1
  • PYGO1 : кодирующий белок гомолог 1 Pygopus (Drosophila)
  • RAD51 : гомолог RAD51 (гомолог RecA, E. coli) (S. cerevisiae)
  • RMDN3 : кодирующий белок регулятор динамики микротрубочек белок 3
  • RNR3 : кодирующая РНК, рибосомный 45S кластер 3
  • RTF1 : кодирующий белок Rtf1, компонент комплекса Paf1 / РНК-полимераза II, гомолог ( S. cerevisiae )
  • SCAMP2 : кодирующий белок секреторный мембранный белок-носитель 2
  • SCAMP5 : кодирующий белок секреторный мембранный белок-носитель 5
  • SCZD10 : кодирующий белок шизофреническое расстройство 10 (периодическая кататония)
  • SCAPER : S-фаза CyclinA-ассоциированный белок, находящийся в эндоплазматическом ретикулуме.
  • SENP8 : кодирующий фермент Sentrin-специфическую протеазу 8
  • SERF2 : кодирующий белок Малый EDRK-богатый фактор 2
  • SLC24A5 : ген, ответственный за не менее 1/3 различий в цвете кожи между расами, выраженный в мозге и нервной системе.
  • SNAPC5 : кодирующий белок субъединица 5-го протеинового комплекса, активирующего snRNA
  • SPN1 : кодирующий белок Snurportin1
  • STRC : стереоцилин
  • SUHW4 : кодирующий белок белок цинкового пальца 280D
  • SYNM : кодирующий белок Synemin
  • TGFBR2 : расположение 3p24.2-p25 из-за инактивационной мутации
  • TMC3 : кодирующий белок трансмембранный канал типа 3
  • TMCO5A : кодирующий белок трансмембранный и спиральный домены 5A
  • TMED3 : кодирующий белок Трансмембранный транспортный белок p24 3
  • UBE3A : убиквитин протеинлигаза E3A (белок, связанный с вирусом папилломы человека E6, синдром Ангельмана)
  • Ube3a-ATS :
  • VPS39 : кодирующий белок hVam6p / Vps39-подобный белок
  • ZNF592 : кодирующий белок белок цинкового пальца 592
  • UNC13C: кодирующий белок unc-13 гомолог C

Хромосомные состояния [ править ]

Следующие состояния вызваны мутациями в хромосоме 15. Два состояния ( синдром Ангельмана и синдром Прадера-Вилли ) включают потерю активности генов в одной и той же части хромосомы 15, в регионе 15q11.2-q13.1. Это открытие предоставило людям первое доказательство того, что что-то помимо генов может определять их экспрессию . [12]

Синдром Ангельмана [ править ]

Основными характеристиками синдрома Ангельмана являются тяжелая умственная отсталость, атаксия , отсутствие речи и чрезмерно счастливое поведение. Синдром Ангельмана возникает в результате потери активности генов в определенной части хромосомы 15, области 15q11-q13. Эта область содержит ген под названием UBE3A, который в случае мутации или отсутствия, вероятно, вызывает характерные признаки этого состояния. Обычно у людей есть две копии гена UBE3A, по одной от каждого родителя. Обе копии этого гена активны во многих тканях организма. В мозгу, однако, активна только копия, унаследованная от матери человека (материнская копия). Если материнская копия потеряна из-за хромосомного изменения или мутации гена, у человека не будет рабочих копий гена UBE3A в мозгу.

В большинстве случаев (около 70%) [ необходима цитата ] у людей с синдромом Ангельмана есть делеция в материнской копии хромосомы 15. Это хромосомное изменение удаляет область 15 хромосомы, которая включает ген UBE3A . Поскольку копия гена UBE3A, унаследованная от отца человека (отцовская копия), обычно неактивна в головном мозге, делеция в материнской хромосоме 15 приводит к отсутствию активных копий гена UBE3A в мозге.

В 3% до 7% случаев, [ править ] Синдром Angelman происходит , когда человек имеет две копии отцовской хромосомы 15 вместо одной копии от каждого из родителей. Это явление называется отцовской однопородной дисомией (UPD). Люди с отцовским UPD для хромосомы 15 имеют две копии гена UBE3A, но обе они унаследованы от отца и поэтому неактивны в мозге.

Около 10% случаев синдрома Ангельмана вызваны мутацией в гене UBE3A, а еще 3% являются результатом дефекта в области ДНК, которая контролирует активацию гена UBE3A и других генов в материнской копии хромосомы 15. В В небольшом проценте случаев синдром Ангельмана может быть вызван хромосомной перестройкой, называемой транслокацией, или мутацией в гене, отличном от UBE3A. Эти генетические изменения могут ненормально инактивировать ген UBE3A.

Синдром Ангельмана может быть наследственным, о чем свидетельствует один случай, когда пациентка забеременела дочерью, у которой также было это заболевание. [13]

Синдром Прадера – Вилли [ править ]

Основные характеристики этого состояния включают полифагию (чрезмерный, ненасытный аппетит), задержку развития от легкой до умеренной, гипогонадизм, приводящий к отсрочке полового созревания или его отсутствию, и гипотонию . Синдром Прадера-Вилли вызван потерей активных генов в определенной части хромосомы 15, области 15q11-q13. Обычно люди имеют две копии этой хромосомы в каждой клетке, по одной копии от каждого родителя. Синдром Прадера-Вилли возникает, когда отцовская копия частично или полностью отсутствует.

Примерно в 70% случаев, [ править ] синдром Прадера-Вилли возникает , когда 15q11-q13 область отцовской хромосомы 15 удаляется. Гены в этой области обычно активны на отцовской копии хромосомы и неактивны на материнской копии. Следовательно, у человека с делецией в отцовской хромосоме 15 не будет активных генов в этой области.

Примерно в 25% случаев человек с синдромом Прадера-Вилли имеет две материнские копии хромосомы 15 в каждой клетке вместо одной копии от каждого родителя. Это явление называется материнской однопородной дисомией. Поскольку некоторые гены обычно активны только на отцовской копии этой хромосомы, у человека с двумя материнскими копиями хромосомы 15 не будет активных копий этих генов.

В небольшом проценте случаев синдром Прадера-Вилли не вызван хромосомной перестройкой, называемой транс-локацией. В редких случаях это состояние вызвано аномалией в области ДНК, которая контролирует активность генов на отцовской хромосоме 15. Поскольку пациенты почти всегда имеют трудности с воспроизведением, синдром Прадера – Вилли, как правило, не является наследственным.

Изодицентрическая хромосома 15 [ править ]

Специфическое хромосомное изменение, называемое изодицентрической хромосомой 15 (IDIC15) (также известное под другими названиями ), может повлиять на рост и развитие. У пациента есть «лишняя» или «маркерная» хромосома. Эта небольшая дополнительная хромосома состоит из генетического материала хромосомы 15, который был ненормально дублирован (скопирован) и прикреплен встык. В некоторых случаях дополнительная хромосома очень мала и не влияет на здоровье человека. Изодицентрическая хромосома 15 большего размера может привести к слабому мышечному тонусу (гипотонии), умственной отсталости, судорогам и поведенческим проблемам. [14] Признаки и симптомы аутизма (нарушения развития, которое влияет на общение и социальное взаимодействие) также были связаны с наличием изодицентрической хромосомы 15.

Другие хромосомные состояния [ править ]

Другие изменения числа или структуры хромосомы 15 могут вызвать умственную отсталость, задержку роста и развития, гипотонию и характерные черты лица. [ необходима цитата ] Эти изменения включают дополнительную копию части хромосомы 15 в каждой клетке (частичная трисомия 15) или отсутствующий сегмент хромосомы в каждой клетке (частичная моносомия 15). В некоторых случаях удаляются или дублируются несколько строительных блоков ДНК хромосомы (нуклеотидов).

Следующие заболевания являются одними из тех, которые связаны с генами на хромосоме 15: [ необходима цитата ]

  • Синдром Блума
  • Рак молочной железы
  • Изовалериановая ацидемия
  • Loeys – Dietz , тип 3 (ген SMAD3)
  • Синдром Марфана
  • Несиндромная глухота
  • Синдром Шааф-Янга (SYS)
  • Болезнь Тея – Сакса
  • Тирозинемия

Цитогенетическая полоса [ править ]

Идеограммы G-бэндинга 15 хромосомы человека
Шаблоны G-полос 15 хромосомы человека в трех различных разрешениях (400, [15], 550 [16] и 850 [4] ). Длина полосы на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). [17] Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты митотического процесса . [18]

Ссылки [ править ]

Конкретные ссылки:

  1. ^ "Сборка генома человека GRCh38 - Консорциум ссылок на геном" . Национальный центр биотехнологической информации . 2013-12-24 . Проверено 4 марта 2017 .
  2. ^ a b "Результаты поиска - 15 [CHR] И" Homo sapiens "[Организм] И (" имеет ccds "[Свойства] И живые [prop]) - Ген" . NCBI . CCDS Release 20 для Homo sapiens . 2016-09-08 . Проверено 28 мая 2017 .
  3. Том Страчан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека . Наука о гирляндах. п. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  4. ^ a b Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (850 bphs, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 2014-06-03. Проверено 26 апреля 2017.
  5. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества генов человека» . Genome Biol . 11 (5): 206. DOI : 10.1186 / GB-2010-11-5-206 . PMC 2898077 . PMID 20441615 .  
  6. ^ «Статистика и загрузки для хромосомы 15» . Комитет по номенклатуре генов HUGO . 2017-05-12 . Проверено 19 мая 2017 .
  7. ^ «Хромосома 15: Сводка хромосом - Homo sapiens» . Ансамбль Выпуск 88 . 2017-03-29 . Проверено 19 мая 2017 .
  8. ^ «Человеческая хромосома 15: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM» . UniProt . 2018-02-28 . Проверено 16 марта 2018 .
  9. ^ "Результаты поиска - 15 [CHR] И" Homo sapiens "[Организм] И (" кодирующий белок генотипа "[Свойства] И живой [опора]) - Ген" . NCBI . 2017-05-19 . Проверено 20 мая 2017 .
  10. ^ "Результаты поиска - 15 [CHR] И" Homo sapiens "[Организм] И ((" genetype miscrna "[Свойства] ИЛИ" genetype ncrna "[Свойства] ИЛИ" genetype rrna "[Свойства] ИЛИ" genetype trna "[Свойства ] ИЛИ "генотип scrna" [Свойства] ИЛИ "genetype snrna" [Свойства] ИЛИ "genetype snorna" [Свойства]) НЕ "кодирование белка генотипа" [Свойства] И живое [свойство]) - Ген " . NCBI . 2017-05-19 . Проверено 20 мая 2017 .
  11. ^ "Результаты поиска - 15 [CHR] И" Homo sapiens "[Организм] И (" псевдо-генотип "[Свойства] И живой [опора]) - Ген" . NCBI . 2017-05-19 . Проверено 20 мая 2017 .
  12. ^ "Руководство для учителя" . Призрак в твоих генах (35 сезон) . Нова (сериал) . 16 октября 2007 . Проверено 26 сентября 2009 . В программе ... рассказывается, как один ученый определил, как делеция ключевой последовательности ДНК на хромосоме 15 человека может привести к двум различным синдромам в зависимости от того, произошла ли делеция от матери или отца [и] объясняет, что это было первым человеческие доказательства того, что нечто иное, чем сами гены, может определять экспрессию генов.
  13. ^ Lossie А, Дрисколл D (1999). «Передача синдрома Ангельмана от пораженной матери» . Genet Med . 1 (6): 262–6. DOI : 10.1097 / 00125817-199909000-00004 . PMID 11258627 . 
  14. ^ «Что такое синдром Dup15q? - Dup15q» . www.dup15q.org . Архивировано из оригинала на 2017-09-06 . Проверено 5 сентября 2017 .
  15. ^ Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (400 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 2014-03-04. Проверено 26 апреля 2017.
  16. ^ Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (550 bphs, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 2015-08-11. Проверено 26 апреля 2017.
  17. ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013) . Медицинские и научные издательства Karger. ISBN 978-3-318-02253-7.
  18. ^ Sethakulvichai, W .; Manitpornsut, S .; Wiboonrat, M .; Lilakiatsakun, W .; Assawamakin, A .; Тонгсима, С. (2012). «Оценка разрешающей способности на уровне полосы изображений хромосом человека» . В области компьютерных наук и программной инженерии (JCSSE), Международная совместная конференция 2012 на : 276–282. DOI : 10.1109 / JCSSE.2012.6261965 . ISBN 978-1-4673-1921-8.
  19. ^ Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (850 bphs, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 2014-06-03. Проверено 26 апреля 2017.
  20. ^ " p ": короткое плечо; « q »: длинная рука.
  21. ^ Для цитогенетической номенклатуры полос, см. Статью locus .
  22. ^ a b Эти значения (начало / конец ISCN) основаны на длине полос / идеограмм из книги ISCN, Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013). Произвольная единица .
  23. ^ gpos : область, которая положительно окрашивается полосой G , обычно богатая АТ и бедная генами; gneg : область, которая отрицательно окрашивается G-полосами, обычно богатая CG и богатая генами; АСОБ Центромера . var : переменная область; стебель : Стебель.

Общие ссылки:

  • Биттел DC, Батлер MG (2005). «Синдром Прадера-Вилли: клиническая генетика, цитогенетика и молекулярная биология» . Эксперт Rev Mol Med . 7 (14): 1–20. DOI : 10.1017 / S1462399405009531 . PMC  6750281 . PMID  16038620 .
  • Биттел DC, Кибирева Н, Талебизаде З., Батлер М.Г. (2003). «Микроматричный анализ экспрессии гена / транскрипта при синдроме Прадера-Вилли: делеция по сравнению с UPD» . J Med Genet . 40 (8): 568–574. DOI : 10.1136 / jmg.40.8.568 . PMC  1735542 . PMID  12920063 .
  • Биттел DC, Кибирева N, Талебизаде З., Дрисколл DJ, Батлер MG (2005). «Микроматричный анализ экспрессии гена / транскрипта при синдроме Ангельмана: делеция по сравнению с UPD» . Геномика . 85 (1): 85–91. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2004.10.010 . PMC  6800218 . PMID  15607424 .
  • Боргатти Р., Пиччинелли П., Пассони Д., Дальпра Л., Миоццо М., Микели Р., Гальярди С., Балоттин Ю. (2001). «Взаимосвязь между клиническими и генетическими особенностями у пациентов с« инвертированной дублированной хромосомой 15 »». Pediatr Neurol . 24 (2): 111–116. DOI : 10.1016 / S0887-8994 (00) 00244-7 . PMID  11275459 .
  • Батлер М.Г., Биттел Д.К., Кибирьева Н., Талебизаде З., Томпсон Т. (2004). «Поведенческие различия между субъектами с синдромом Прадера-Вилли и типом делеции I или типа II и материнской дисомией» . Педиатрия . 113 (3 Pt 1): 565–573. DOI : 10.1542 / peds.113.3.565 . PMC  6743499 . PMID  14993551 .
  • Кэссиди С.Б., Дайкенс Э., Уильямс, Калифорния (2000). «Синдромы Прадера-Вилли и Ангельмана: сестринские запечатленные расстройства». Am J Med Genet . 97 (2): 136–146. DOI : 10.1002 / 1096-8628 (200022) 97: 2 <136 :: АИД-AJMG5> 3.0.CO; 2-V . PMID  11180221 .
  • Клейтон-Смит Дж, Лаан Л. (2003). «Синдром Ангельмана: обзор клинических и генетических аспектов» . J Med Genet . 40 (2): 87–95. DOI : 10.1136 / jmg.40.2.87 . PMC  1735357 . PMID  12566516 .
  • Гилберт Ф (1999). «Гены и хромосомы болезней: карты болезней генома человека. Хромосома 15». Genet Test . 3 (3): 309–322. DOI : 10.1089 / 109065799316653 . PMID  10495933 .
  • Ли С., Веврик Р. (2000). «Идентификация новых импринтированных транскриптов в области делеции синдрома Прадера-Вилли и синдрома Ангельмана: дальнейшее доказательство регионального контроля импринтинга» . Am J Hum Genet . 66 (3): 848–858. DOI : 10.1086 / 302817 . PMC  1288168 . PMID  10712201 .
  • Райнир С., Финукейн Б., Саймон Э. У. (1998). «Симптомы аутизма у детей и молодых людей с изодицентрической хромосомой 15». Am J Med Genet . 81 (5): 428–433. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19980907) 81: 5 <428 :: AID-AJMG12> 3.0.CO; 2-E . PMID  9754629 .
  • Золлино М, Тициано Ф, Ди Стефано С, Нери Г (1999). «Частичная дупликация длинного плеча хромосомы 15: подтверждение причинной роли в краниосиностозе и определение синдрома трисомии 15q25-qter». Am J Med Genet . 87 (5): 391–394. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19991222) 87: 5 <391 :: AID-AJMG4> 3.0.CO; 2-O . PMID  10594876 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Национальные институты здоровья. «Хромосома 15» . Домашний справочник по генетике . Проверено 6 мая 2017 .
  • «Хромосома 15» . Информационный архив проекта "Геном человека" 1990–2003 гг . Проверено 6 мая 2017 .