Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для использования в других целях см. CSDA .


YBX3
Белок CSDA PDB 1h95.png
Идентификаторы
ПсевдонимыYBX3 , CSDA, CSDA1, DBPA, ZONAB, Y-бокс-связывающий белок 3
Внешние идентификаторыOMIM: 603437 MGI: 2137670 HomoloGene: 2708 Генные карты : YBX3
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение YBX3
Геномное расположение YBX3
Группа12p13.2Начинать10 699 089 п.н. [1]
Конец10 723 323 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 6 (мышь)
Chr.Хромосома 6 (мышь) [2]
Хромосома 6 (мышь)
Геномное расположение YBX3
Геномное расположение YBX3
Группа6 | 6 F3Начинать131 364 855 п.н. [2]
Конец131 388 476 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CSDA 201160 s на fs.png

PBB GE CSDA 201161 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• связывание РНК - полимеразы II , регуляторная область последовательности ДНК , специфичные
• ГО: 0001106 транскрипции корепрессор активность
• ГО: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции активности
• мРНК 3'-UTR связывания
• Связывание с одноцепочечной ДНК
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Связывание нуклеиновой кислоты
• Связывание с Rho GTPase
• Связывание с двухцепочечной ДНК
• Связывание РНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Связывание с белками GO: 0001948
• Связывание с полисомами
Сотовый компонент• полисома
• двухклеточное плотное соединение
• перинуклеарная область цитоплазмы
• ядро клетки
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• развитие мужских гонад
• регуляция транскрипции по шаблону ДНК
• негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на осмотический стресс
• негативная регуляция некроптотического процесса
• позитивная регуляция цитоплазматической трансляции
• клеточный ответ на фактор некроза опухоли
• позитивная регуляция роста органов
• негативная регуляция апоптотического процесса
• внутриутробное эмбриональное развитие
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• клеточный гиперосмотический ответ
• отрицательная регуляция развития скелетных мышечных тканей
• сперматогенез
• реакция на холод
• оплодотворение
• 3'-UTR-опосредованная стабилизация мРНК
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8531

56449

Ансамбль

ENSG00000060138

ENSMUSG00000030189

UniProt

P16989

Q9JKB3

RefSeq (мРНК)

NM_001145426
NM_003651

NM_011733
NM_139117

RefSeq (белок)

NP_001138898
NP_003642

NP_035863
NP_620817

Расположение (UCSC)Chr 12: 10,7 - 10,72 МбChr 6: 131,36 - 131,39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий белок А представляет собой белок , который у человека кодируется ЦУРА гена . [5] [6] [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000060138 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030189 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Sakura Н, Маекав Т, Imamoto Ж, Ясуд К, S Ишия июня (1989). «Два гена человека, выделенные новым методом, кодируют ДНК-связывающие белки, содержащие общую область гомологии». Джин . 73 (2): 499–507. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (88) 90514-8 . PMID 2977358 . 
  6. ^ Coles LS, Diamond P, Occhiodoro F, Vadas MA, Shannon MF (сентябрь 1996). «Белки домена холодного шока репрессируют транскрипцию с промотора GM-CSF» . Nucleic Acids Res . 24 (12): 2311–7. DOI : 10.1093 / NAR / 24.12.2311 . PMC 145951 . PMID 8710501 .  
  7. ^ «Энтрез Ген: белок A домена холодного шока CSDA» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). «Механизмы репрессии гена IA бета главного комплекса гистосовместимости». Иммунобиология . 198 (1–3): 249–63. DOI : 10.1016 / s0171-2985 (97) 80045-9 . PMID  9442396 .
  • Кудо С., Маттей М.Г., Фукуда М. (1995). «Характеристика гена dbpA, члена семейства белков, связывающих нуклеиновые кислоты, содержащих домен холодового шока». Евро. J. Biochem . 231 (1): 72–82. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20672.x . PMID  7628487 .
  • Funke B, Zuleger B, Benavente R, et al. (1996). «Мышиный поли (С) -связывающий белок существует в нескольких изоформах и взаимодействует с несколькими РНК-связывающими белками» . Nucleic Acids Res . 24 (19): 3821–8. DOI : 10.1093 / NAR / 24.19.3821 . PMC  146158 . PMID  8871564 .
  • Вайнманн А.С., Ян П.С., Оберли М.Дж. и др. (2002). «Выделение мишеней человеческого фактора транскрипции путем сочетания иммунопреципитации хроматина и анализа микрочипов CpG-островков» . Genes Dev . 16 (2): 235–44. DOI : 10,1101 / gad.943102 . PMC  155318 . PMID  11799066 .
  • Хаяси Дж., Кадзино К., Умеда Т. и др. (2003). «Соматическая мутация и SNP в промоторе dbpA и гепатоканцерогенез человека». Int. J. Oncol . 21 (4): 847–50. DOI : 10.3892 / ijo.21.4.847 . PMID  12239625 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Коулз Л.С., Бартли М.А., Берт А. и др. (2004). «Мультибелковый комплекс, содержащий домен холодового шока (Y-бокс) и белки, связывающие полипиримидиновый тракт, формируется на мРНК фактора роста эндотелия сосудов. Возможная роль в стабилизации мРНК» . Евро. J. Biochem . 271 (3): 648–60. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.2003.03968.x . PMID  14728692 .
  • Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. DOI : 10.1038 / ncb1086 . PMID  14743216 . S2CID  11683986 .
  • Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Франкель П., Аронхейм А., Кавана Э. и др. (2005). «RalA взаимодействует с ZONAB в зависимости от плотности клеток и регулирует его транскрипционную активность» . EMBO J . 24 (1): 54–62. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600497 . PMC  544910 . PMID  15592429 .
  • Тао В.А., Волльшайд Б., О'Брайен Р. и др. (2005). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Nat. Методы . 2 (8): 591–8. DOI : 10.1038 / nmeth776 . PMID  16094384 . S2CID  20475874 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Суриссо Т., Георгиадис А., Цапара А. и др. (2006). «Регуляция экспрессии PCNA и циклина D1 и морфогенеза эпителия с помощью ZO-1-регулируемого фактора транскрипции ZONAB / DbpA» . Мол. Клетка. Биол . 26 (6): 2387–98. DOI : 10.1128 / MCB.26.6.2387-2398.2006 . PMC  1430269 . PMID  16508013 .
  • Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .

Внешние ссылки [ править ]

  • CSDA + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Человек YBX3 место генома и YBX3 ген подробно страницу в браузере УСК генома .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .