Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с циклических пептидов )
Перейти к навигации Перейти к поиску
α-Аманитин
Бацитрацин
Циклоспорин

Циклические пептиды представляют собой полипептидные цепи, которые содержат кольцевую последовательность связей. Это может происходить через связь между амино- и карбоксильными концами пептида, например, в циклоспорине ; связь между амино-концом и боковой цепью, например, в бацитрацине ; карбоксильный конец и боковая цепь, например, в колистине ; или две боковые цепи, или более сложные конструкции, например, в аманитине. Многие циклические пептиды были обнаружены в природе, а многие другие синтезированы в лаборатории. Их длина колеблется от двух до сотен аминокислотных остатков. По своей природе они часто бывают противомикробными или токсичными; в медицине они находят различное применение, например, в качестве антибиотиков и иммунодепрессантов. [1] Тонкослойная хроматография (ТСХ) - удобный метод обнаружения циклических пептидов в неочищенном экстракте из биомассы. [2]

Классификация [ править ]

Циклические пептиды можно классифицировать по типам связей, составляющих кольцо.

  • Гомодетические циклические пептиды, такие как циклоспорин А, представляют собой пептиды, в которых кольцо состоит исключительно из нормальных пептидных связей (т.е. между альфа-карбоксилом одного остатка и альфа-амином другого). Самые маленькие такие виды 2,5-дикетопиперазины , [3] является производным от циклизации дипептида.
  • Циклические изопептиды содержат по меньшей мере одну не-альфа-амидную связь, такую ​​как связь между боковой цепью одного остатка с альфа-карбоксильной группой другого остатка, как в микроцистине и бацитрацине.
  • Циклические депсипептиды , такие как ауреобазидин A и HUN-7293, имеют по меньшей мере одну лактоновую (сложноэфирную) связь вместо одного из амидов. Некоторые циклические депсипептиды циклизуются между С-концевым карбоксилом и боковой цепью остатка Thr или Ser в цепи, такие как кахалалид F, теонеллапептолид и дидемнин B.
  • Бициклические соединения, такие как аманитины и фаллоидины, содержат мостиковую группу, обычно между двумя боковыми цепями. В аматоксинах он образуется в виде сульфоксидного мостика между остатками Trp и Cys. Другие бициклические пептиды включают эхиномицин, триостин А и целогентин С.
  • Существует ряд би- и моноциклических пептидов, которые циклизуются посредством дисульфидной связи между двумя цистеинами , ярким примером которых является окситоцин .

Биосинтез [ править ]

Циклические пептиды в растениях синтезируются с помощью двухэтапного процесса; перевод линейной пептидной цепи, и его последующее формирование в циклическую структуру посредством деятельности протеазы-подобного фермента , или других способов. [4] [5] [6]

Свойства и приложения [ править ]

Циклические пептиды, как правило, чрезвычайно устойчивы к процессу пищеварения, что делает их интересными для ученых, работающих над новыми пероральными лекарствами. [7]

Примеры включают:

См. Также [ править ]

  • Нерибосомальный пептид
  • лантибиотики , 19–37 остатков и от 1 до 5 «мостиков»

Ссылки [ править ]

  1. ^ Дженсен, Кнуд (2009-09-01). Дизайн пептидов и белков для биофармацевтических применений . Джон Вили и сыновья. ISBN 9780470749715.
  2. ^ Вэньян, Сюй; Цзюнь, Тан; Чанцзю, Цзи; Вэньцзюнь, Он; Нинхуа, Тан (2008). «Применение химического метода ТСХ для обнаружения циклотидов в растениях» . Вестник науки . 53 (11): 1671–1674. DOI : 10.1007 / s11434-008-0178-8 .
  3. ^ Бортвик AD (май 2012). «2,5-Дикетопиперазины: синтез, реакции, лекарственная химия и биоактивные натуральные продукты». Химические обзоры . 112 (7): 3641–3716. DOI : 10.1021 / cr200398y . PMID 22575049 . 
  4. ^ Барбер, Карла JS; Пуджара, Парешкумар Т .; Рид, Дарвин В .; Чивоча, Шила; Чжан, Хайся; Ковелло, Патрик С. (2013). «Двухэтапный биосинтез циклических пептидов из линейных предшественников в члене семейства растений Caryophyllaceae включает циклизацию ферментом, подобным сериновой протеазе» . Журнал биологической химии . 288 (18): 12500–12510. DOI : 10.1074 / jbc.M112.437947 . PMC 3642298 . PMID 23486480 .  
  5. ^ Вэньянь Сюй; и другие. (2011). «Различные механизмы производства циклопептидов из предшественников, синтезированных независимо от нерибосомальных пептидных синтетаз» . Acta Biochimica et Biophysica Sinica . 43 (10): 757–762. DOI : 10,1093 / Abbs / gmr062 . PMC 3180235 . PMID 21764803 .  
  6. ^ Вэньянь Сюй; и другие. «Циклопептиды растений и возможные биосинтетические механизмы» . Cite journal requires |journal= (help)
  7. ↑ Дэвид Дж. Крейк (17 марта 2006 г.). «Бесшовные белки связывают свободные концы». Наука . 311 (5767): 1563–7. DOI : 10.1126 / science.1125248 . PMID 16543448 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Cybase
  • Cyclic + Peptides в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)