Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CDK9
Белок CDK9 PDB 1PF6.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3BLH , 3BLQ , 3BLR , 3LQ5 , 3MI9 , 3MIA , 3MY1 , 3TN8 , 3TNH , 3TNI , 4BCF , 4BCG , 4BCH , 4BCI , 4BCJ , 4EC8 , 4EC9 , 4IMY , 4OGR , 4OR5

Идентификаторы
ПсевдонимыCDK9 , C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, циклинзависимая киназа 9, циклинзависимая киназа 9
Внешние идентификаторыOMIM : 603251 MGI : 1328368 HomoloGene : 55566 GeneCards : CDK9
Расположение гена ( человек )
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек) [1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение CDK9
Геномное расположение CDK9
Группа9q34.11Начинать127 785 679 п.н. [1]
Конец127 790 792 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Группа2 | 2 млрдНачинать32 705 784 п.н. [2]
Конец32 713 076 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• нуклеотид связывание
• трансферазной активность
• протеинкиназа активность
• 7SK мяРНК связывание
• транскрипция коактиватор связывание
• связывание мяРНКа
• АТФ связывание
• связывания РНК - полимераза Ядро ДНК-последовательность промотора II
• ДНК связывание
• транскрипционный фактор связывания
• GO: связывание 0001948 белка
• белка серин / треонин киназа
• хроматин связывание
• активность киназы
• циклин-зависимый белок серин / треонин киназа
• Активность киназы карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II
• Связывание протеинкиназы
• Связывание с циклином
• GO: 0000980 Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядро клетки
• мембрана
• нуклеоплазма
• комплекс факторов элонгации транскрипции
• комплекс положительных факторов элонгации транскрипции циклин / CDK
• тело PML
• хромосома
• гранула цитоплазматического рибонуклеопротеина
• комплекс холофермента циклин-зависимой протеинкиназы
• ядерный хроматин
Биологический процесс• позитивная регуляция гипертрофии сердечной мышцы
• позитивная регуляция связывания 3'-UTR мРНК
• регуляция дифференцировки мышечных клеток
• негативная регуляция полиаденилирования мРНК
• репарация ДНК
• клеточный ответ на цитокиновый стимул
• позитивная регуляция вирусной транскрипции
• процессинг репликационной вилки
• белок фосфорилирование
• регуляция модификации гистонов
• регуляция митотического клеточного цикла
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• отрицательная регуляция остановки клеточного цикла
• регуляция репарации ДНК
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• клеточная пролиферация
• ответ на лекарство
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• фосфорилирование
• позитивная регуляция фосфорилирования гистона
• позитивная регуляция убиквитинирования гистона H2B
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, шаблонная ДНК
• транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II
• элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1025

107951

Ансамбль

ENSG00000136807

ENSMUSG00000009555

UniProt

P50750

Q99J95

RefSeq (мРНК)

NM_001261

NM_130860

RefSeq (белок)

NP_001252
NP_001252.1

NP_570930

Расположение (UCSC)Chr 9: 127,79 - 127,79 МбChr 2: 32,71 - 32,71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Циклин-зависимая киназа 9 или CDK9 представляет собой циклин-зависимую киназу, связанную с P-TEFb .

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства циклин-зависимых киназ (CDK). Члены семейства CDK очень похожи на генные продукты S. cerevisiae cdc28 и S. pombe cdc2 и известны как важные регуляторы клеточного цикла. Было обнаружено, что эта киназа является компонентом мультибелкового комплекса TAK / P-TEFb, который представляет собой фактор элонгации для транскрипции, управляемой РНК-полимеразой II, и функционирует путем фосфорилирования С-концевого домена самой большой субъединицы РНК-полимеразы II . Этот белок образует комплекс и регулируется его регуляторной субъединицей циклином Т или циклином К. Было обнаружено, что белок Tat ВИЧ-1 взаимодействует с этим белком и циклином Т, что предполагает возможное участие этого белка в развитии СПИДа. [5]

CDK9, как известно, связывается с другими белками, такими как TRAF2 , и участвует в дифференцировке скелетных мышц. [6]

Взаимодействия [ править ]

CDK9 взаимодействует с:

  • Рецептор андрогенов , [7]
  • CDC34 [8] и
  • CCNK , [9]
  • CCNT1 , [9] [10] [11] [12] [13] [14] [8] [15] [16]]
  • CCNT2 , [10]
  • MYBL2 , [15]
  • РЕЛА , [17]
  • RB1 , [18]
  • SKP1A , [8] и
  • SUPT5H . [16]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000136807 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009555 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Entrez Gene: CDK9, циклин-зависимая киназа 9 (CDC2-родственная киназа)» .
  6. ^ MacLachlan Т.К., Санг N, De Luca A, Puri PL, Levrero М, Джордано A (1998). «Связывание CDK9 с TRAF2». J. Cell. Биохим . 71 (4): 467–78. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19981215) 71: 4 <467 :: AID-JCB2> 3.0.CO; 2-G . PMID 9827693 . 
  7. Перейти ↑ Lee DK, Duan HO, Chang C (март 2001). «Рецептор андрогенов взаимодействует с положительным фактором элонгации P-TEFb и увеличивает эффективность удлинения транскрипции» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9978–84. DOI : 10.1074 / jbc.M002285200 . PMID 11266437 . 
  8. ^ a b c Кирнан Р. Э., Эмилиани С., Накаяма К., Кастро А., Лаббе Дж. К., Лорка Т., Накаяма Ки К., Бенкиран М. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между циклином T1 и SCF (SKP2) нацелено на CDK9 для убиквитинирования и деградации протеасомой» . Мол. Клетка. Биол . 21 (23): 7956–70. DOI : 10.1128 / MCB.21.23.7956-7970.2001 . PMC 99964 . PMID 11689688 .  
  9. ↑ a b Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (декабрь 1999 г.). «Циклин К функционирует как регуляторная субъединица CDK9 и участвует в транскрипции РНК-полимеразы II» . J. Biol. Chem . 274 (49): 34527–30. DOI : 10.1074 / jbc.274.49.34527 . PMID 10574912 . 
  10. ^ а б Пэн Дж., Чжу Й., Милтон Дж. Т., Price DH (март 1998 г.). «Идентификация множественных циклиновых субъединиц человеческого P-TEFb» . Genes Dev . 12 (5): 755–62. DOI : 10,1101 / gad.12.5.755 . PMC 316581 . PMID 9499409 .  
  11. ^ Cabart P, Chew HK, Murphy S (июль 2004 г.). «BRCA1 взаимодействует с NUFIP и P-TEFb для активации транскрипции с помощью РНК-полимеразы II» . Онкоген . 23 (31): 5316–29. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207684 . PMID 15107825 . 
  12. ^ Молодые TM, Ван Q, T Pe'ery, Mathews MB (сентябрь 2003). «Белок, содержащий домен I-mfa человека, HIC, взаимодействует с циклином T1 и модулирует P-TEFb-зависимую транскрипцию» . Мол. Клетка. Биол . 23 (18): 6373–84. DOI : 10.1128 / MCB.23.18.6373-6384.2003 . PMC 193714 . PMID 12944466 .  
  13. ^ Михельс А.А., Нгуен В.Т., Fraldi А, Лабас В, Эдвардс М, Bonnet Ж, Лания л, Bensaude О (июль 2003 г.). «РНК MAQ1 и 7SK взаимодействуют с комплексами CDK9 / циклин Т транскрипционно-зависимым образом» . Мол. Клетка. Биол . 23 (14): 4859–69. DOI : 10.1128 / MCB.23.14.4859-4869.2003 . PMC 162212 . PMID 12832472 .  
  14. ^ Hoque M, Young Т.М., Ли CG, Serrero G, Mathews MB, Pe'ery T (март 2003). «Фактор роста гранулин взаимодействует с циклином T1 и модулирует P-TEFb-зависимую транскрипцию» . Мол. Клетка. Биол . 23 (5): 1688–702. DOI : 10.1128 / MCB.23.5.1688-1702.2003 . PMC 151712 . PMID 12588988 .  
  15. ^ а б Де Фалько G, Багелла Л., Клаудио П. П., Де Лука А., Фу Y, Калабретта Б., Сала А., Джордано А. (январь 2000 г.). «Физическое взаимодействие между CDK9 и B-Myb приводит к подавлению ауторегуляции гена B-Myb» . Онкоген . 19 (3): 373–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203305 . PMID 10656684 . 
  16. ^ a b Гарбер М.Э., Мэйалл Т.П., Зьюсс Е.М., Мейзенхелдер Дж., Томпсон Н.Э., Джонс К.А. (сентябрь 2000 г.) «Автофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание комплекса tat-P-TEFb вируса иммунодефицита человека типа 1 с TAR РНК» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6958–69. DOI : 10.1128 / MCB.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .  
  17. ^ Amini S, Clavo A, Надраг Y, Джордано A, K - Халили, Sawaya В (август 2002). «Взаимодействие между факторами cdk9 и NF-kappaB определяет уровень транскрипции гена ВИЧ-1 в астроцитарных клетках» . Онкоген . 21 (37): 5797–803. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205754 . PMID 12173051 . 
  18. ^ Simone C, Bagella L, Bellan C, Джордано A (июнь 2002). «Физическое взаимодействие между pRb и комплексом cdk9 / cyclinT2» . Онкоген . 21 (26): 4158–65. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205511 . PMID 12037672 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. DOI : 10.1007 / BF02253352 . PMID  9570510 .
  • Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол . 8 (13): R447–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1 . PMID  9651670 . S2CID  15480646 .
  • Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. И др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Биохим . 75 (3): 357–68. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K . PMID  10536359 .
  • Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life . 51 (3): 175–81. DOI : 10.1080 / 152165401753544241 . PMID  11547919 . S2CID  10931640 .
  • Хьюген М.С., Камп В., Ноттет Х.С. (2004). «Множественные эффекты трансактиваторного белка ВИЧ-1 на патогенез инфекции ВИЧ-1». Евро. J. Clin. Инвестируйте . 34 (1): 57–66. DOI : 10.1111 / j.1365-2362.2004.01282.x . PMID  14984439 . S2CID  29713968 .
  • Райс А. П., Херрманн СН (2004). «Регулирование TAK / P-TEFb в CD4 + Т-лимфоцитах и ​​макрофагах». Curr. HIV Res . 1 (4): 395–404. DOI : 10.2174 / 1570162033485159 . PMID  15049426 .
  • Мингетти Л., Визентин С., Патрицио М. и др. (2004). «Множественные действия белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 на функции микроглиальных клеток». Neurochem. Res . 29 (5): 965–78. DOI : 10,1023 / Б: NERE.0000021241.90133.89 . PMID  15139295 . S2CID  25323034 .
  • Лиу Л. Я., Херрманн СН, Райс А. П. (2005). «ВИЧ-1 инфекция и регуляция функции Tat в макрофагах». Int. J. Biochem. Cell Biol . 36 (9): 1767–75. DOI : 10.1016 / j.biocel.2004.02.018 . PMID  15183343 .
  • Пульезе А., Видотто В., Бельтрамо Т. и др. (2005). «Обзор биологических эффектов белка Tat ВИЧ-1». Cell Biochem. Функц . 23 (4): 223–7. DOI : 10.1002 / cbf.1147 . PMID  15473004 . S2CID  8408278 .
  • Баннварт С., Гатиньол А (2005). «РНК TAR ВИЧ-1: мишень молекулярных взаимодействий между вирусом и его хозяином». Curr. HIV Res . 3 (1): 61–71. DOI : 10.2174 / 1570162052772924 . PMID  15638724 .
  • Гибеллини Д., Витоне Ф, Скьявоне П., Ре MC (2005). «Белок tat ВИЧ-1, пролиферация и выживаемость клеток: краткий обзор». New Microbiol . 28 (2): 95–109. PMID  16035254 .
  • Перуцци F (2006). «Множественные функции Tat ВИЧ-1: пролиферация против апоптоза». Фронт. Biosci . 11 : 708–17. DOI : 10.2741 / 1829 . PMID  16146763 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Cyclin-Dependent + Kinase + 9 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Циклинзависимая киназа 9 дрозофилы - Интерактивная муха
  • CDK9 местоположение гена человеческого в браузере УСК генома .
  • CDK9 детали гена человеческого в браузере УСК генома .


  • v
  • т
  • е