DHX29

Идентификаторы

DHX29 , DDX29, DEAH-бокс-геликаза 29, DExH-бокс-геликаза 29

Внешние идентификаторы

OMIM : 612720 MGI : 2145374 HomoloGene : 10387 GeneCards : DHX29

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 5 (человека) ^[1]

Группа	5q11.2	Начинать	55 256 055 п.н. ^[1]
Группа	5q11.2	Конец	55 307 694 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 13 (мышь) ^[2]

Группа	13 \| 13 D2.2	Начинать	112 927 454 п.н. ^[2]
Группа	13 \| 13 D2.2	Конец	112 969 432 п.н. ^[2]

Генная онтология
Молекулярная функция	• перевод фактор инициации активность • связывание АТФ • гидролазы активности • нуклеотида связывание • нуклеиновой кислоты связывания • GO: 0008026 хеликазной активности • рибосомальной малой субъединицы связывания • кадгерин связывания • связывания РНКА • РНК геликазы активность • гидролазы активности, действующий на ангидридах кислот, фосфор -содержащие ангидриды • GO: 0034459 3'-5 'РНК-геликазная активность
Сотовый компонент	• цитоплазма • преинициативный комплекс эукариот 43S • митохондрия
Биологический процесс	• Процессинг РНК • инициация трансляции • биосинтез белка • положительная регуляция инициации трансляции
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


54505


218629

Ансамбль


ENSG00000067248


ENSMUSG00000042426

UniProt


Q7Z478


Q6PGC1

RefSeq (мРНК)


NM_019030 NM_001345964 NM_001345965


NM_172594

RefSeq (белок)


NP_001332893 NP_001332894 NP_061903


NP_766182

Расположение (UCSC)

Chr 5: 55.26 - 55.31 Мб

Chr 13: 112.93 - 112.97 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

DExH-бокс хеликазную 29 ( DHX29 ) является 155 кДа белок , который у человека кодируется DHX29 гена . ^[5]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член подсемейства белков DEAH (Asp-Glu-Ala-His), часть семейства РНК- геликаз DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокса . Кодируемый белок участвует в инициации трансляции и, в частности, необходим для сканирования рибосом через стабильные вторичные структуры мРНК во время выбора инициирующего кодона . ^[6] Этот белок также может играть роль в обнаружении цитозольных нуклеиновых кислот вирусного происхождения. ^[7] Нокдаун этого гена приводит к снижению трансляции белка и нарушению пролиферации раковых клеток. ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что DHX29 взаимодействует с эукариотической малой рибосомной субъединицей (40S) и eIF3 . ^[9]^[10]^[11]^[12]

См. Также [ править ]

Эукариотический перевод
Белки DExD / H-бокса
Ded1 / DDX3

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000067248 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042426 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: DExH-box геликаза 29" .
^ Писарева В.П., Писарев А.В., Комар А.А., Hellen CU, Пестова Т.В. (декабрь 2008 г.). «Инициирование трансляции мРНК млекопитающих со структурированными 5'UTR требует DExH-бокса белка DHX29» . Cell . 135 (7): 1237–50. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.10.037 . PMC 2948571 . PMID 19109895 .
^ Сугимото Н, Mitoma Н, Ким Т, Hanabuchi S, Лю YJ (май 2014 г.). «Белки геликазы DHX29 и RIG-I косенсируют цитозольные нуклеиновые кислоты в системе дыхательных путей человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (21): 7747–52. DOI : 10.1073 / pnas.1400139111 . PMC 4040624 . PMID 24821782 .
^ Parsyan А, D Шахбазян, Мартино Y, Petroulakis Е, Алена Т, Ларссон О, Mathonnet G, G Tettweiler, Хеллен CU, Пестова ТВ, Svitkin Ю.В., Sonenberg N (декабрь 2009). «Белок геликазы DHX29 способствует инициации трансляции, пролиферации клеток и онкогенезу» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (52): 22217–22. DOI : 10.1073 / pnas.0909773106 . PMC 2799747 . PMID 20018725 .
^ Гаш Y, дез Жорж А, Dhote В, R Ланглуа, Ем ГИ, Grassucci Р.А., Хеллен CU, Пестово ТВ, Франк J (май 2013 г. ). «Структура преинициативного комплекса 43S рибосом млекопитающих, связанного со сканирующим фактором DHX29» . Cell . 153 (5): 1108–19. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.04.036 . PMC 3730827 . PMID 23706745 .
^ Гаш Y, дез Жорж А, Dhote В, R Ланглуа, Ем ГИ, Grassucci Р.А., Пестово ТВ, Хеллен CU, Франк J (ноябрь 2013 г. ). «Внутренние сайты входа в рибосомы, подобные вирусу гепатита С, вытесняют eIF3, чтобы получить доступ к субъединице 40S» . Природа . 503 (7477): 539–43. DOI : 10,1038 / природа12658 . PMC 4106463 . PMID 24185006 .
^ Писарева В.П., Писарев А.В. (декабрь 2016 г.). «DHX29 и eIF3 взаимодействуют при сканировании рибосом на структурированных мРНК во время инициации трансляции» . РНК . 22 (12): 1859–1870. DOI : 10,1261 / rna.057851.116 . PMC 5113206 . PMID 27733651 .
^ Де Жорж А, Dhote В, Куне л, Хеллен CU, Пестово телевидение, Франк Дж, Хаш Y (сентябрь 2015). «Структура eIF3 млекопитающих в контексте преинициативного комплекса 43S» . Природа . 525 (7570): 491–5. DOI : 10,1038 / природа14891 . PMC 4719162 . PMID 26344199 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (сентябрь 2010 г.). «Генетические варианты в ядерно-кодируемых митохондриальных генах влияют на прогрессирование СПИДа» . PLOS ONE . 5 (9): e12862. DOI : 10.1371 / journal.pone.0012862 . PMC 2943476 . PMID 20877624 .
Дхоте В., Суини Т.Р., Ким Н., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В. (ноябрь 2012 г.). «Роли отдельных доменов в функции DHX29, важного фактора, необходимого для трансляции структурированных мРНК млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (46): E3150-9. DOI : 10.1073 / pnas.1208014109 . PMC 3503174 . PMID 23047696 .
Писарева В.П., Писарев А.В. (май 2016). «DHX29 снижает неплотное сканирование восходящего кодона AUG независимо от его нуклеотидного контекста» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (9): 4252–65. DOI : 10.1093 / NAR / gkw240 . PMC 4872109 . PMID 27067542 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

Эта статья о гене в хромосоме 5 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000067248 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042426 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Entrez Gene: DExH-box геликаза 29" .

[Pisareva_2008-6] Писарева В.П., Писарев А.В., Комар А.А., Hellen CU, Пестова Т.В. (декабрь 2008 г.). «Инициирование трансляции мРНК млекопитающих со структурированными 5'UTR требует DExH-бокса белка DHX29» . Cell . 135 (7): 1237–50. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.10.037 . PMC 2948571 . PMID 19109895 .

[Sugimoto_2014-7] Сугимото Н, Mitoma Н, Ким Т, Hanabuchi S, Лю YJ (май 2014 г.). «Белки геликазы DHX29 и RIG-I косенсируют цитозольные нуклеиновые кислоты в системе дыхательных путей человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (21): 7747–52. DOI : 10.1073 / pnas.1400139111 . PMC 4040624 . PMID 24821782 .

[Parsyan_2009-8] Parsyan А, D Шахбазян, Мартино Y, Petroulakis Е, Алена Т, Ларссон О, Mathonnet G, G Tettweiler, Хеллен CU, Пестова ТВ, Svitkin Ю.В., Sonenberg N (декабрь 2009). «Белок геликазы DHX29 способствует инициации трансляции, пролиферации клеток и онкогенезу» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (52): 22217–22. DOI : 10.1073 / pnas.0909773106 . PMC 2799747 . PMID 20018725 .

[Hashem_2013-9] Гаш Y, дез Жорж А, Dhote В, R Ланглуа, Ем ГИ, Grassucci Р.А., Хеллен CU, Пестово ТВ, Франк J (май 2013 г. ). «Структура преинициативного комплекса 43S рибосом млекопитающих, связанного со сканирующим фактором DHX29» . Cell . 153 (5): 1108–19. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.04.036 . PMC 3730827 . PMID 23706745 .

[Hashem_2013b-10] Гаш Y, дез Жорж А, Dhote В, R Ланглуа, Ем ГИ, Grassucci Р.А., Пестово ТВ, Хеллен CU, Франк J (ноябрь 2013 г. ). «Внутренние сайты входа в рибосомы, подобные вирусу гепатита С, вытесняют eIF3, чтобы получить доступ к субъединице 40S» . Природа . 503 (7477): 539–43. DOI : 10,1038 / природа12658 . PMC 4106463 . PMID 24185006 .

[Pisarev_2016-11] Писарева В.П., Писарев А.В. (декабрь 2016 г.). «DHX29 и eIF3 взаимодействуют при сканировании рибосом на структурированных мРНК во время инициации трансляции» . РНК . 22 (12): 1859–1870. DOI : 10,1261 / rna.057851.116 . PMC 5113206 . PMID 27733651 .

[des_Georges_2015-12] Де Жорж А, Dhote В, Куне л, Хеллен CU, Пестово телевидение, Франк Дж, Хаш Y (сентябрь 2015). «Структура eIF3 млекопитающих в контексте преинициативного комплекса 43S» . Природа . 525 (7570): 491–5. DOI : 10,1038 / природа14891 . PMC 4719162 . PMID 26344199 .

[1]