Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
DCN
Белок DCN PDB 1xcd.png
Идентификаторы
ПсевдонимыDCN , Dcn, DC, DSPG2, PG40, PGII, PGS2, SLRR1B, mDcn, CSCD, декорин
Внешние идентификаторыOMIM : 125255 MGI : 94872 HomoloGene : 22430 GeneCard : DCN
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение DCN
Геномное расположение DCN
Группа12q21.33Начинать91 140 484 п.н. [1]
Конец91 183 217 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение DCN
Геномное расположение DCN
Группа10 C3 | 10 50,27 смНачинать97 479 609 п.н. [2]
Конец97 518 143 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE DCN 201893 x at fs.png

PBB GE DCN 211813 x в формате fs.png

PBB GE DCN 209335 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Коллаген связывания
• белок N-конец связывание
• протеинкиназа ингибитор активность
• гликозаминогликаны связывание
• внеклеточный матрикс связывание
• GO: 0001948 связывание белки
• РНК связывания
• внеклеточный матрикс структурно составляющая присвоение сопротивление сжатию
Сотовый компонент• цитоплазма
• внеклеточный матрикс
• просвет лизосомы
• просвет Гольджи
• тример коллагена VI типа
• внеклеточная
• внеклеточная область
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• метаболический процесс гликозаминогликанов
• позитивная регуляция деления митохондрий
• негативная регуляция активности протеинкиназ
• позитивная регуляция аутофагии
• развитие почек
• опосредованный цитокинами сигнальный путь
• плацентация
• процесс биосинтеза хондроитинсульфата
• реакция на механический стимул
• старение
• разрушение внеклеточного матрикса
• организация внеклеточного матрикса
• заживление ран
• негативная регуляция миграции эндотелиальных клеток
• положительное регулирование macroautophagy
• ответ на липополисахарид
• положительное регулирование митохондриальной деполяризации
• животного органа морфогенез
• хондроитинсульфат катаболический процесс
• негативной регуляции ангиогенеза
• положительное регулирование фосфатидилинозитол 3-киназы сигнализации
• пептидный сшивающий с помощью хондроитин - 4-сульфат гликозаминогликанов
• отрицательное регуляция сигнального пути фактора роста эндотелия сосудов
• процесс биосинтеза дерматансульфата
• развитие ткани скелетных мышц
• положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• отрицательная регуляция каскада JAK-STAT
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1634

13179

Ансамбль

ENSG00000011465

ENSMUSG00000019929

UniProt

P07585

P28654

RefSeq (мРНК)
NM_001920
NM_133503
NM_133504
NM_133505
NM_133506

NM_133507

NM_001190451
NM_007833

RefSeq (белок)
NP_001911
NP_598010
NP_598011
NP_598012
NP_598013

NP_598014

NP_001177380
NP_031859

Расположение (UCSC)Chr 12: 91,14 - 91,18 МбChr 10: 97,48 - 97,52 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Декорина является белком , который в организме человека кодируется DCN гена .

Декорин представляет собой протеогликан , молекулярная масса которого составляет в среднем 90–140 килодальтон (кДа). Он принадлежит к небольшому семейству протеогликанов, богатых лейцином (SLRP), и состоит из белкового ядра, содержащего лейциновые повторы, с цепью гликозаминогликана (GAG), состоящей либо из хондроитинсульфата (CS), либо из дерматансульфата (DS).

Декорин представляет собой небольшой протеогликан клеточного или перицеллюлярного матрикса, который по структуре тесно связан с белком бигликан . Считается, что декорин и бигликан являются результатом дупликации гена . Этот белок является компонентом соединительной ткани , связывается с фибриллами коллагена I типа и играет роль в сборке матрикса . [5]

Именование [ править ]

Название Декорин является производным как от того факта, что он «украшает» коллаген I типа , так и от того, что он взаимодействует с полосами «d» и «e» фибрилл этого коллагена.

Функция [ править ]

Декорин, по-видимому, влияет на фибриллогенез , а также взаимодействует с фибронектином , тромбоспондином , компонентом комплемента C1q , рецептором эпидермального фактора роста (EGFR) и трансформирующим фактором роста-бета ( TGF-beta ).

Было показано, что декорин усиливает или ингибирует активность TGF-бета 1 . Основная функция декорина заключается в регуляции клеточного цикла .

Он участвует в регуляции аутофагии , из эндотелиальных клеток и ингибирует ангиогенез . Этот процесс опосредуется высокоаффинным взаимодействием с VEGFR2 (рецептором фактора роста эндотелия сосудов), что приводит к повышению уровня гена-супрессора опухоли, называемого PEG3 . [6] Другими ангиогенными факторами роста, которые ингибирует декорин, являются ангиопоэтин , фактор роста гепатоцитов (HGF) и фактор роста тромбоцитов ( PDGF ). [7]

Декорин недавно был признан миокином . В этой роли он способствует гипертрофии мышц , связываясь с миостатином . [8]

Клиническое значение [ править ]

В келоидных рубцах экспрессия декорина снижена по сравнению со здоровой кожей . [9] Развитие врожденной стромальной дистрофии роговицы зависит от экспорта и внеклеточного отложения усеченного декорина. [10]

Исследования на животных [ править ]

Было показано, что введение декорина в экспериментальные повреждения спинного мозга грызунов подавляет образование рубцов и способствует росту аксонов.

На экспериментальной модели опухоли мышей было показано, что Декорин обладает противоопухолевыми свойствами и способен подавлять рост различных линий опухолевых клеток. [11] Нокаут-мыши с дефицитом декорина демонстрируют снижение воспалительных реакций во время контактного дерматита из-за нарушения рекрутирования лейкоцитов и изменения гамма- функции интерферона . [12] [13]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что Декорин взаимодействует с:

  • Коллаген I типа [14]
  • Рецептор эпидермального фактора роста [15] [16] и
  • TGF бета 1 , [14] [17] [18]
  • TLR2 , [19] и
  • TLR4 . [19]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000011465 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019929 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Entrez Gene: DCN decorin" .
  6. ^ Buraschi S, Neill T, Goyal A, Poluzzi C, Smythies J, Owens RT и др. (Июль 2013). «Декорин вызывает аутофагию в эндотелиальных клетках через Peg3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (28): E2582-91. Bibcode : 2013PNAS..110E2582B . DOI : 10.1073 / pnas.1305732110 . PMC 3710796 . PMID 23798385 .  
  7. ^ Järveläinen H, Sainio A, Wight TN (апрель 2015). «Ключевая роль декорина в ангиогенезе» . Матричная биология . 43 : 15–26. DOI : 10.1016 / j.matbio.2015.01.023 . PMC 4560244 . PMID 25661523 .  
  8. ^ Kanzleiter T, Rath M, Görgens SW, Jensen J, Tangen DS, Kolnes AJ и др. (Июль 2014 г.). «Миокиновый декорин регулируется сокращением и участвует в мышечной гипертрофии». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 450 (2): 1089–94. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2014.06.123 . PMID 24996176 . 
  9. Перейти ↑ Jumper N, Paus R, Bayat A (сентябрь 2015 г.). «Функциональная гистопатология келоидных заболеваний». Гистология и гистопатология . 30 (9): 1033–57. DOI : 10.14670 / HH-11-624 . PMID 25900252 . 
  10. ^ Mellgren AE, Bruland O, Vedeler A, Saraste J, Schönheit J, Bredrup C и др. (Май 2015 г.). «Развитие врожденной стромальной дистрофии роговицы зависит от экспорта и внеклеточного отложения усеченного декорина». Исследовательская офтальмология и визуализация . 56 (5): 2909–15. DOI : 10.1167 / iovs.14-16014 . PMID 26029887 . 
  11. ^ Sofeu Feugaing DD, Götte M, Viola M (январь 2013). «Больше, чем матрица: многогранная роль декорина в развитии рака». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / j.ejcb.2012.08.004 . PMID 23058688 . 
  12. ^ Seidler DG, Mohamed NA, Bocian C, Stadtmann A, Hermann S, Schäfers K и др. (Декабрь 2011 г.). «Роль декорина в гиперчувствительности замедленного типа» . Журнал иммунологии . 187 (11): 6108–19. DOI : 10.4049 / jimmunol.1100373 . PMC 5070385 . PMID 22043007 .  
  13. ^ Bocian C, Urbanowitz А.К., Owens RT, Iozzo RV, Götte M, Seidler DG (май 2013). «Декорин усиливает активность интерферона-γ в модели аллергического воспаления» . Журнал биологической химии . 288 (18): 12699–711. DOI : 10.1074 / jbc.M112.419366 . PMC 3642316 . PMID 23460644 .  
  14. ^ a b Schönherr E, Broszat M, Brandan E, Bruckner P, Kresse H (июль 1998 г.). «Фрагмент основного белка декорина Leu155-Val260 взаимодействует с TGF-бета, но не конкурирует за связывание декорина с коллагеном I типа». Архивы биохимии и биофизики . 355 (2): 241–8. DOI : 10.1006 / abbi.1998.0720 . PMID 9675033 . 
  15. ^ Santra M, CC Рид, Iozzo RV (сентябрь 2002). «Декорин связывается с узкой областью рецептора эпидермального фактора роста (EGF), частично перекрывающейся, но отличной от EGF-связывающего эпитопа» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35671–81. DOI : 10.1074 / jbc.M205317200 . PMID 12105206 . S2CID 20575381 .  
  16. ^ Iozzo RV, Moscatello DK, McQuillan DJ, Eichstetter I (февраль 1999). «Декорин является биологическим лигандом рецептора эпидермального фактора роста» . Журнал биологической химии . 274 (8): 4489–92. DOI : 10.1074 / jbc.274.8.4489 . PMID 9988678 . S2CID 32175802 .  
  17. ^ Хильдебранд A, M Romaris, Расмуссен Л.М., Heinegård D, Twardzik DR, Border WA, Ruoslahti E (сентябрь 1994). «Взаимодействие малых интерстициальных протеогликанов бигликана, декорина и фибромодулина с трансформирующим фактором роста бета» . Биохимический журнал . 302 (Pt 2) (2): 527–34. DOI : 10.1042 / bj3020527 . PMC 1137259 . PMID 8093006 .  
  18. Перейти ↑ Takeuchi Y, Kodama Y, Matsumoto T (декабрь 1994). «Декорин костного матрикса связывает трансформирующий фактор роста бета и повышает его биоактивность». Журнал биологической химии . 269 (51): 32634–8. PMID 7798269 . 
  19. ^ а б Мерлин Р., Морет К., Бекманн Дж., Настасе М.В., Зенг-Брауэрс Дж., Тральхао Дж. Г. и др. (Ноябрь 2011 г.). «Передача сигналов матриксным протеогликановым декорином контролирует воспаление и рак через PDCD4 и MicroRNA-21» . Научная сигнализация . 4 (199): ra75. DOI : 10.1126 / scisignal.2001868 . PMC 5029092 . PMID 22087031 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Штендер М., Науманн Ю., Вик В., Веллер М. (май 1999 г.). «Трансформирующий фактор роста-бета и р-21: множественные молекулярные мишени опосредованного декорином подавления неопластического роста». Клеточные и тканевые исследования . 296 (2): 221–7. DOI : 10.1007 / s004410051283 . PMID  10382266 . S2CID  20282995 .
  • Fujisawa R (март 2002 г.). «[Последние достижения в исследованиях белков костного матрикса]». Нихон Риншо. Японский журнал клинической медицины . 60 Дополнение 3: 72–8. PMID  11979972 .
  • Krumdieck R, Höök M, Rosenberg LC, Volanakis JE (декабрь 1992 г.). «Протеогликан-декорин связывает C1q и подавляет активность комплекса C1». Журнал иммунологии . 149 (11): 3695–701. PMID  1431141 .
  • Winnemöller M, Schön P, Vischer P, Kresse H (октябрь 1992 г.). «Взаимодействие между тромбоспондином и мелким протеогликановым декорином: вмешательство в прикрепление клеток». Европейский журнал клеточной биологии . 59 (1): 47–55. PMID  1468447 .
  • Murphy-Ullrich JE, Schultz-Cherry S, Höök M (февраль 1992 г.). «Трансформирующие комплексы фактора роста-бета с тромбоспондином» . Молекулярная биология клетки . 3 (2): 181–8. DOI : 10.1091 / mbc.3.2.181 . PMC  275517 . PMID  1550960 .
  • Пулккинен Л., Алитало Т., Крузиус Т., Пелтонен Л. (1992). «Экспрессия декорина в тканях и клеточных линиях человека и определенная хромосомная принадлежность локуса гена (DCN)». Цитогенетика и клеточная генетика . 60 (2): 107–11. DOI : 10.1159 / 000133314 . PMID  1611907 .
  • Макбрайд О.В., Фишер Л.В., Янг М.Ф. (февраль 1990 г.). «Локализация генов PGI (бигликан, BGN) и PGII (декорин, DCN, PG-40) на хромосомах человека Xq13-qter и 12q соответственно» . Геномика . 6 (2): 219–25. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90560-H . PMID  1968422 .
  • Fleischmajer R, Fisher LW, MacDonald ED, Jacobs L, Perlish JS, Termine JD (февраль 1991 г.). «Декорин взаимодействует с фибриллярным коллагеном кожи эмбриона и взрослого человека» . Журнал структурной биологии . 106 (1): 82–90. DOI : 10.1016 / 1047-8477 (91) 90065-5 . PMID  2059554 .
  • Pulkkinen L, Kainulainen K, Krusius T., Mäkinen P, Schollin J, Gustavsson KH, Peltonen L (октябрь 1990 г.). «Недостаточная экспрессия гена, кодирующего декорин, при летальной форме синдрома Марфана». Журнал биологической химии . 265 (29): 17780–5. PMID  2211661 .
  • Ямагути Ю., Манн Д.М., Руослахти Е. (июль 1990 г.). «Отрицательная регуляция трансформирующего фактора роста-бета протеогликановым декорином». Природа . 346 (6281): 281–4. Bibcode : 1990Natur.346..281Y . DOI : 10.1038 / 346281a0 . PMID  2374594 . S2CID  4272333 .
  • Greve H, Blumberg P, Schmidt G, Schlumberger W, Rauterberg J, Kresse H (июль 1990 г.). «Влияние решетки коллагена на метаболизм малого протеогликана II культивированными фибробластами» . Биохимический журнал . 269 (1): 149–55. DOI : 10.1042 / bj2690149 . PMC  1131544 . PMID  2375748 .
  • Рафли П.Дж., Белый Р.Дж. (сентябрь 1989 г.). «Дерматансульфатные протеогликаны суставного хряща человека. Свойства дерматансульфатных протеогликанов I и II» . Биохимический журнал . 262 (3): 823–7. DOI : 10.1042 / bj2620823 . PMC  1133347 . PMID  2590169 .
  • Фишер Л.В., Термин Д.Д., Янг М.Ф. (март 1989 г.). «Выведенная белковая последовательность костного малого протеогликана I (бигликан) демонстрирует гомологию с протеогликаном II (декорином) и несколькими несвязными тканевыми белками у различных видов». Журнал биологической химии . 264 (8): 4571–6. PMID  2647739 .
  • Ямагути Ю., Руослахти Е. (ноябрь 1988 г.). «Экспрессия протеогликана человека в клетках яичников китайского хомячка подавляет пролиферацию клеток». Природа . 336 (6196): 244–6. Bibcode : 1988Natur.336..244Y . DOI : 10.1038 / 336244a0 . PMID  3194009 . S2CID  4338095 .
  • Крузиус Т., Руослахти Э. (октябрь 1986 г.). «Первичная структура белка ядра протеогликана внеклеточного матрикса, выведенная из клонированной кДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (20): 7683–7. Bibcode : 1986PNAS ... 83.7683K . DOI : 10.1073 / pnas.83.20.7683 . PMC  386785 . PMID  3484330 .
  • Фишер Л.В., Хокинс Г.Р., Туросс Н., Термин Д.Д. (июль 1987 г.). «Очистка и частичная характеристика малых протеогликанов I и II, костных сиалопротеинов I и II и остеонектина из минерального компартмента развивающейся кости человека». Журнал биологической химии . 262 (20): 9702–8. PMID  3597437 .
  • Лисиак Дж. Дж., Хант Дж., Прингл Г. А., Лала П. К. (апрель 1995 г.). «Локализация трансформирующего фактора роста бета и его естественного ингибитора декорина в плаценте и децидуальной оболочке человека на протяжении всей беременности». Плацента . 16 (3): 221–31. DOI : 10.1016 / 0143-4004 (95) 90110-8 . PMID  7638106 .
  • Такеучи Ю., Кодама Ю., Мацумото Т. (декабрь 1994 г.). «Декорин костного матрикса связывает трансформирующий фактор роста бета и повышает его биоактивность». Журнал биологической химии . 269 (51): 32634–8. PMID  7798269 .
  • Scholzen T, Solursh M, Suzuki S, Reiter R, Morgan JL, Buchberg AM и др. (Ноябрь 1994 г.). «Мышиный декорин. Полное клонирование кДНК, геномная организация, хромосомное назначение и экспрессия во время органогенеза и дифференцировки тканей». Журнал биологической химии . 269 (45): 28270–81. PMID  7961765 .
  • Danielson KG, Fazzio A, Cohen I, Cannizzaro LA, Eichstetter I, Iozzo RV (январь 1993 г.). «Ген декорина человека: организация интрон-экзон, открытие двух альтернативно сплайсированных экзонов в 5'-нетранслируемой области и картирование гена на хромосоме 12q23». Геномика . 15 (1): 146–60. DOI : 10.1006 / geno.1993.1022 . PMID  8432526 .
  • Бредруп Ч., Кнаппског П.М., Маевски Дж., Рёдаль Э., Боман Х. (февраль 2005 г.). «Врожденная стромальная дистрофия роговицы, вызванная мутацией в гене декорина». Исследовательская офтальмология и визуализация . 46 (2): 420–6. DOI : 10.1167 / iovs.04-0804 . PMID  15671264 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о врожденной стромальной дистрофии роговицы