Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EIF5
Белок EIF5 PDB 2g2k.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2Э9Х , 2Г2К , 2ИУ1

Идентификаторы
ПсевдонимыEIF5 , EIF-5, EIF-5A, фактор инициации трансляции эукариот 5, фактор инициации эукариот 5
Внешние идентификаторыOMIM : 601710 MGI : 95309 HomoloGene : 49610 GeneCard : EIF5
Расположение гена ( человек )
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человека) [1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение EIF5
Геномное расположение EIF5
Группа14q32.32Начинать103 333 544 п.н. [1]
Конец103 345 025 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 12 (мышь)
Chr.Хромосома 12 (мышь) [2]
Хромосома 12 (мышь)
Геномное расположение EIF5
Геномное расположение EIF5
Группа12 F1 | 12 61,03 смНачинать111 538 016 п.н. [2]
Конец111 546 752 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE EIF5 208290 s в формате fs.png

PBB GE EIF5 208706 s в формате fs.png

PBB GE EIF5 208705 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность фактора инициации трансляции
• связывание нуклеотидов
• активность фактора трансляции, связывание РНК
• связывание GTP
• активность GTPase
• связывание белка GO: 0001948
• связывание eIF2 фактора инициации эукариот
• связывание РНК
• связывание кадгерина
• активность ингибитора диссоциации GDP
Сотовый компонент• ядро клетки
• мембрана клетки
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• регуляция инициации трансляции
• биосинтеза белка
• GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности ГТФ
• образование комплекса перевод преиниационного
• инициации трансляции
• формирование цитоплазматической инициации трансляции комплекс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1983 г.

217869

Ансамбль

ENSG00000100664

ENSMUSG00000021282

UniProt

P55010

P59325

RefSeq (мРНК)

NM_183004
NM_001969

NM_173363
NM_178041

RefSeq (белок)

NP_001960
NP_892116

NP_775539
NP_829887

Расположение (UCSC)Chr 14: 103.33 - 103.35 МбChr 12: 111.54 - 111.55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эукариот перевод фактора инициации 5 представляет собой белок , который у человека кодируется eIF5 гена . [5] [6]

EIF5 - это белок, активирующий ГТФазу . [7]


Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100664 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021282 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Si K, Das K, Maitra U (август 1996). «Характеристика множества мРНК, которые кодируют фактор инициации трансляции 5 (eIF-5) млекопитающих» . J Biol Chem . 271 (28): 16934–8. DOI : 10.1074 / jbc.271.28.16934 . PMID 8663286 . 
  6. ^ "Энтрез Ген: фактор инициации эукариотической трансляции 5 EIF5" .
  7. ↑ Das S, Ghosh R, Maitra U (март 2001 г.). «Фактор инициации трансляции эукариот 5 функционирует как белок, активирующий ГТФазу» . J. Biol. Chem . 276 (9): 6720–6. DOI : 10.1074 / jbc.M008863200 . PMID 11092890 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Cap-зависимая инициация трансляции от Nature Reviews Microbiology. Хорошее изображение и обзор функции факторов инициирования
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого фактора инициации трансляции эукариот 5 (EIF5).

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Дас С., Маити Т., Дас К., Майтра У. (1998). «Специфическое взаимодействие фактора инициации трансляции эукариот 5 (eIF5) с бета-субъединицей eIF2» . J. Biol. Chem . 272 (50): 31712–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.50.31712 . PMID  9395514 .
  • Bandyopadhyay A, Maitra U (1999). «Клонирование и характеристика субъединицы p42 фактора инициации трансляции 3 (eIF3) млекопитающих: демонстрация того, что eIF3 взаимодействует с eIF5 в клетках млекопитающих» . Nucleic Acids Res . 27 (5): 1331–7. DOI : 10.1093 / NAR / 27.5.1331 . PMC  148320 . PMID  9973622 .
  • Дас С., Майтра У (2000). «Мутационный анализ фактора инициации трансляции 5 (eIF5) млекопитающих: роль взаимодействия между бета-субъединицей eIF2 и eIF5 в функции eIF5 in vitro и in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 20 (11): 3942–50. DOI : 10.1128 / MCB.20.11.3942-3950.2000 . PMC  85746 . PMID  10805737 .
  • Чой С.К., Олсен Д.С., Ролл-Мекак А. и др. (2000). «Физическое и функциональное взаимодействие между эукариотическими ортологами факторов инициации трансляции прокариот IF1 и IF2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (19): 7183–91. DOI : 10.1128 / MCB.20.19.7183-7191.2000 . PMC  86272 . PMID  10982835 .
  • Дас С., Гош Р., Майтра У. (2001). «Фактор инициации трансляции эукариот 5 функционирует как белок, активирующий ГТФазу» . J. Biol. Chem . 276 (9): 6720–6. DOI : 10.1074 / jbc.M008863200 . PMID  11092890 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .
  • Асано К., Шалев А., Фан Л. и др. (2001). «Множественные роли C-концевого домена eIF5 в сборке комплекса инициации трансляции и активации GTPase» . EMBO J . 20 (9): 2326–37. DOI : 10.1093 / emboj / 20.9.2326 . PMC  125443 . PMID  11331597 .
  • Маджумдар Р., Бандйопадхьяй А., Дэн Х., Майтра У. (2002). «Фосфорилирование фактора инициации трансляции 5 (eIF5) млекопитающих in vitro и in vivo» . Nucleic Acids Res . 30 (5): 1154–62. DOI : 10.1093 / NAR / 30.5.1154 . PMC  101238 . PMID  11861906 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Маринчев А, Колупаева В.Г., Пестова Т.В., Вагнер Г (2003). «Картирование интерфейса связывания между человеческими факторами инициации эукариот 1A и 5B: новое взаимодействие между старыми партнерами» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 100 (4): 1535–40. DOI : 10.1073 / pnas.0437845100 . PMC  149867 . PMID  12569173 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 .
  • Homma MK, Wada I, Suzuki T и др. (2005). «Фосфорилирование CK2 эукариотического фактора инициации трансляции 5 потенцирует развитие клеточного цикла» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (43): 15688–93. DOI : 10.1073 / pnas.0506791102 . PMC  1266118 . PMID  16227438 .
  • Конте М.Р., Келли Дж., Бабон Дж. И др. (2006). «Структура фактора инициации эукариот (eIF) 5 обнаруживает складку, общую для нескольких факторов трансляции». Биохимия . 45 (14): 4550–8. DOI : 10.1021 / bi052387u . PMID  16584190 .
  • Биениоссек С., Шютц П., Буманн М. и др. (2006). «Кристаллическая структура карбокси-концевого домена человеческого фактора инициации трансляции eIF5». J. Mol. Биол . 360 (2): 457–65. DOI : 10.1016 / j.jmb.2006.05.021 . PMID  16781736 .
  • Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 .