Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
"EF2" и "EF-2" перенаправляют сюда. Для оценки интенсивности торнадо см. § Параметры расширенной шкалы Fujita .
Тройной комплекс EF-Tu (синий), тРНК (красный) и GTP (желтый). Взято из PDB Molecule of the Month Elongation Factors , сентябрь 2006 г.

Факторы элонгации представляют собой набор белков, которые функционируют на рибосоме во время синтеза белка , чтобы облегчить трансляционное удлинение от образования первой до последней пептидной связи растущего полипептида . Наиболее распространенными факторами удлинения у прокариот являются EF-Tu , EF-Ts , EF-G . [1] Бактерии и эукариоты используют факторы удлинения, которые в значительной степени гомологичны друг другу, но с разными структурами и разными исследовательскими номенклатурами. [2]

Удлинение - самый быстрый шаг в переводе. [3] У бактерий это происходит со скоростью от 15 до 20 аминокислот, добавляемых в секунду (примерно 45-60 нуклеотидов в секунду). [ необходима цитата ] У эукариот скорость составляет около двух аминокислот в секунду (около 6 нуклеотидов читается в секунду). [ необходима цитата ] Факторы удлинения играют роль в организации событий этого процесса и в обеспечении высокоточного перевода на этих скоростях. [ необходима цитата ]

Номенклатура гомологичных ЭФ [ править ]

Факторы удлинения
БактериальныйЭукариотические / археиФункция
EF-TueEF-1 субъединица α [2]опосредует вход аминоацил тРНК в свободный участок рибосомы . [4]
ЭФ-ЦeEF-1 субъединица β γ [2]служит фактором обмена гуаниновых нуклеотидов для EF-Tu, катализируя высвобождение GDP из EF-Tu. [2]
EF-GeEF-2катализирует транслокацию тРНК и мРНК вниз по рибосоме в конце каждого цикла элонгации полипептида. Вызывает большие изменения экстерьера. [5]
EF-PEIF5Aвозможно стимулирует образование пептидных связей и устраняет срывы. [6]
Обратите внимание, что EIF5A, архейный и эукариотический гомолог EF-P, был назван фактором инициации, но теперь также считается фактором элонгации. [6]

В дополнение к своему цитоплазматическому механизму митохондрии и пластиды эукариот имеют свой собственный механизм трансляции, каждый со своим собственным набором факторов элонгации бактериального типа. [7] [8] У человека они включают TUFM , TSFM , GFM1 , GFM2 . [ необходима цитата ]

У бактерий для селеноцистеинил-тРНК требуется специальный фактор элонгации SelB ( P14081 ), связанный с EF-Tu. Несколько гомологов также обнаружены у архей, но их функции неизвестны. [9]

В качестве цели [ править ]

Факторы удлинения являются мишенями для токсинов некоторых патогенов. Например, Corynebacterium diphtheriae производит свой токсин , который изменяет функцию белка в организме хозяина, инактивируя фактор элонгации (EF-2). Это приводит к патологии и симптомам, связанным с дифтерией . Точно так же экзотоксин А Pseudomonas aeruginosa инактивирует EF-2. [10]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Parker, J. (2001). «Факторы удлинения; перевод». Энциклопедия генетики . С. 610–611. DOI : 10,1006 / rwgn.2001.0402 . ISBN 9780122270802.
  2. ^ a b c d Sasikumar, Arjun N .; Perez, Winder B .; Кинзи, Терри Госс (июль 2012 г.). «Многие роли комплекса фактора удлинения эукариот 1» . Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 3 (4): 543–555. DOI : 10.1002 / wrna.1118 . ISSN 1757-7004 . PMC 3374885 . PMID 22555874 .   
  3. ^ Прабхакар, Арджун; Чой, Чжунхонг; Ван, Цзиньфань; Петров Алексей; Пуглиси, Джозеф Д. (июль 2017 г.). «Динамическая основа точности и скорости перевода: согласованные многоступенчатые механизмы удлинения и прекращения» . Белковая наука . 26 (7): 1352–1362. DOI : 10.1002 / pro.3190 . ISSN 0961-8368 . PMC 5477533 . PMID 28480640 .   
  4. ^ Weijland A, Harmark K, Охлаждают RH, Anborgh PH, Parmeggiani A (март 1992). «Фактор элонгации Tu: молекулярный переключатель в биосинтезе белка» . Молекулярная микробиология . 6 (6): 683–8. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01516.x . PMID 1573997 . 
  5. ^ Jørgensen, R; Ортис, Пенсильвания; Карр-Шмид, А; Nissen, P; Кинзи, Т.Г.; Андерсен, Г.Р. (май 2003 г.). «Две кристаллические структуры демонстрируют большие конформационные изменения в рибосомной транслоказе эукариот». Структурная биология природы . 10 (5): 379–85. DOI : 10.1038 / nsb923 . PMID 12692531 . 
  6. ^ а б Росси, D; Kuroshu, R; Zanelli, CF; Валентини, SR (2013). «eIF5A и EF-P: два уникальных фактора трансляции теперь движутся одним и тем же путем». Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 5 (2): 209–22. DOI : 10.1002 / wrna.1211 . PMID 24402910 . 
  7. ^ Мануэль, Андреа L; Киспе, Джоэл; Мэйфилд, Стивен П.; Петско, Григорий А (7 августа 2007 г.). «Структура рибосомы хлоропласта: новые домены для регуляции трансляции» . PLoS Биология . 5 (8): e209. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0050209 . PMC 1939882 . PMID 17683199 .  
  8. ^ GC Аткинсон; С.Л. Балдауф (2011). «Эволюция фактора удлинения G и происхождение митохондриальных и хлоропластных форм» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (3): 1281–92. DOI : 10.1093 / molbev / msq316 . PMID 21097998 . 
  9. ^ Аткинсон, Джемма C; Хаурылюк, Василий; Тенсон, Танель (21 января 2011 г.). «Древнее семейство белков, подобных фактору элонгации SelB, с широким, но неоднородным распределением по архее» . BMC Evolutionary Biology . 11 (1). DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-22 .
  10. ^ Ли H, Iglewski WJ (1984). «Клеточная АДФ-рибозилтрансфераза с тем же механизмом действия, что и дифтерийный токсин и токсин А Pseudomonas» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 81 (9): 2703–7. Bibcode : 1984PNAS ... 81.2703L . DOI : 10.1073 / pnas.81.9.2703 . PMC 345138 . PMID 6326138 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Alberts, B. et al. (2002). Молекулярная биология клетки , 4-е изд. Нью-Йорк: Наука о гирляндах. ISBN 0-8153-3218-1 . [ требуется страница ] 
  • Берг, Дж. М. и др. (2002). Биохимия , 5-е изд. Нью-Йорк: WH Freeman and Company. ISBN 0-7167-3051-0 . [ требуется страница ] 
  • Сингх, Б.Д. (2002). Основы генетики , Нью-Дели, Индия: Kalyani Publishers. ISBN 81-7663-109-4 . [ требуется страница ] 

Внешние ссылки [ править ]

  • nobelprize.org Объяснение функции факторов удлинения эукариот
  • Коэффициент удлинения + фактор по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Пептид + удлинение + фактор + G в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Пептид + удлинение + фактор + Tu в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • EC 3.6.5.3