Эрез Либерман Эйден (1980 г.р., урожденный Эрез Либерман) - американский ученый-исследователь, работающий в различных областях, связанных с прикладной математикой . [1] Он является доцентом Медицинского колледжа Бейлора , а ранее был научным сотрудником Гарвардского общества стипендиатов и приглашенным преподавателем в Google . Он является адъюнкт-профессором информатики в Университете Райса . Используя математические и вычислительные подходы, он изучал эволюцию в различных контекстах, в том числе в сетях с помощью теории эволюционных графов и языков в областикультуромика . Он опубликовал научные статьи по различным дисциплинам.
Эрез Либерман Эйден | |
---|---|
Родившийся | Эрез Либерман 1980 (40–41 лет) |
Альма-матер | Принстонский университет (BS) Университет Иешива (MA) Гарвардский университет (PhD) |
Супруг (а) | Авива Прессер Эйден ( м. 2005 г.) |
Награды | Студенческая премия Лемельсона – Массачусетского технологического института , Technology Review TR35 [ когда? ] |
Научная карьера | |
Поля | Прикладная математика Молекулярная биология Биофизика [1] |
Учреждения | Медицинский колледж Бейлора |
Тезис | Эволюция и появление структуры (2010) |
Докторант | Эрик Ландер, Мартин Новак [2] |
Веб-сайт | erez |
Либерман Эйден получил награды, в том числе студенческую премию Лемельсона – Массачусетского технологического института и премию Американского физического общества за выдающиеся исследования докторской диссертации по биологической физике. В 2009 году Либерман Эйден был назван журналом Technology Review одним из 35 ведущих новаторов в возрасте до 35 лет , а в 2011 году он стал одним из получателей Президентской премии за раннюю карьеру для ученых и инженеров .
ранняя жизнь и образование
Либерман вырос в Бруклине с тремя братьями и сестрами. Он начал программировать в возрасте семи лет. [3] Его отец, Аарон Либерман, был технологом и владел фабрикой в Нью-Джерси . [4] [5] В детстве Либерман Эйден говорил на иврите и венгерском , что сделало английский своим третьим языком. [5]
Либерман Эйден изучал математику, физику и философию в Принстоне и получил степень магистра истории в университете ешива . Он продолжил работу над докторской степенью по математике и биоинженерии в отделении медицинских наук и технологий Гарвардского технологического института , где его консультировали [2] Эрик Ландер и Мартин Новак . [6]
Исследования и карьера
Либерман Эйден внес свой вклад в создание теории эволюционных графов вместе со своим научным руководителем Мартином Новаком . [7] [8] С тех пор он участвует в исследовании трехмерной структуры генома человека и в области культуромики .
3D-структура генома
Либерман Эйден был частью группы ученых из Медицинской школы Массачусетского университета и Массачусетского технологического института, которые впервые предположили, что ДНК человека складывается во фрактальную глобулу, а не в равновесную глобулу. [4] Это открытие объясняет, как геном каждой клетки может сильно уплотняться без образования узла . Либерман Эйден с соавторами изобрели вариант захвата конформации хромосом, названный «Hi-C», который производит общегеномную меру вероятностей контакта, указывающую на трехмерную структуру генома. Этот метод сочетает в себе существующую методологию захвата хромосом с секвенированием следующего поколения , что позволяет проводить комплексную оценку контактов хроматина. [9]
В 2009 году эта работа была опубликована в журнале Science и использовалась в качестве обложки. [10] После публикации Либерман Эйден сказал: [11]
Мы давно знаем, что в малых масштабах ДНК представляет собой двойную спираль ... Но если бы двойная спираль не складывалась дальше, геном в каждой клетке был бы длиной два метра. Ученые так и не поняли, как двойная спираль складывается, чтобы вписаться в ядро клетки человека, диаметр которого составляет всего одну сотую миллиметра. Этот новый подход позволил нам исследовать именно этот вопрос. [11]
В 2014 году он работал старшим автором статьи в Cell, в которой описывался усовершенствованный метод Hi-C, который его команда использовала для описания фундаментальной организации ДНК. [12]
Культуромика
Либерман Эйден принимал участие в анализе корпуса из около 5 миллионов оцифрованных книг, применяя методы интеллектуального анализа данных для продвижения новой области культуромики. [13] [14] Лейберман Эйден участвовал в проекте по оцифровке англосаксонских текстов в 2004 году, анализ которого предоставил подтверждающие доказательства регуляризации глаголов, процесса, в результате которого неправильные глаголы со временем становятся все более регулярными . [15]
После объявления о Google Книгах Либерман Эйден обратился к директору по исследованиям Google Питеру Норвигу и получил разрешение на статистический анализ их данных. [16] Его работа внесена в программу просмотра Google Ngram Viewer , выпущенную в декабре 2010 года, которая использует идеи культуромики для получения нормализованных исторических тенденций для любой последовательности букв. [13] В рамках этого проекта в журнале Science был опубликован ряд результатов, в том числе об изменении динамики известности и случаях литературной цензуры во время Второй мировой войны . [17]
Награды и почести
В 2008 году Либерман Эйден был награжден студенческой премией Lemelson-MIT за свою работу над iShoe, призванной помочь пожилым людям с проблемами равновесия и предотвратить падения, которые могут привести к травмам. [18] [19] В следующем году iShoe был внесен в список «20 новых биотехнологических прорывов, которые изменят медицину» по версии Popular Mechanics . [20] Годом позже Либерман Эйден был назван журналом MIT Technology Review одним из 35 ведущих новаторов в возрасте до 35 лет ( TR35 ) . [21]
В 2010 году Американское физическое общество вручило Либерману Эйдену премию за выдающиеся исследования докторской диссертации по биологической физике за диссертацию на тему «Эволюция и возникновение структуры». [22] Его докторская диссертация была также удостоена премии Герца . [23] Либерман Эйден также был удостоен награды директора NIH за новаторство и был назван вместе с 95 другими американскими исследователями лауреатом Президентской премии за раннюю карьеру для ученых и инженеров в 2011 году. [24]
Личная жизнь
Эрез Либерман женился на Авиве Прессер в 2005 году; после свадьбы муж и жена добавили к своим фамилиям «Айден», что на иврите означает «Эдем», а на гэльском - «маленький огонь». [13] У них есть сын по имени Габриэль Галилей, дочь по имени Мааян Амара и еще один мальчик по имени Иуда Авраам. [4] [10] Помимо научных интересов, Либерман Эйден участвовал в сотрудничестве с Николасом Каном и Ричардом Селезником в области современного искусства, которое выставлялось в галереях США и Европы. [18]
Либерман Эйден и его жена основали некоммерческую организацию Bears Without Borders, которая занимается распространением мягких игрушек в развивающихся странах. [6] [13]
Рекомендации
- ^ a b Публикации Эреза Либермана Эйдена, проиндексированные Google Scholar
- ^ a b Эрез Либерман Эйден в проекте « Математическая генеалогия»
- ^ Карагианис, Лиз (2010). «Празднование инноваций» . Spectrvm . Массачусетский технологический институт . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ а б в Йонг, Эд (8 июня 2011 г.). «Человек эпохи Возрождения: как снова и снова становиться ученым» . Не совсем ракетостроение . Откройте для себя журнал . Проверено 3 января 2013 года .
- ^ а б Кайзер, Джоселин (6 июня 2012 г.). «Человек эпохи Возрождения» . Еженедельник выпускников Принстона . Принстон . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ а б Барт, Эми (24 марта 2010 г.). «5 вопросов для человека, вложившего три D в ДНК» . Откройте для себя журнал . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ Форрест, Сара. «Пионер вычислительной техники Эрез Либерман объясняет, как развивается Интернет и спам» . Компьютерный мир . Архивировано из оригинального 2 - го марта 2007 года . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ Либерман, E .; Hauert, C .; Новак, Массачусетс (2005). «Эволюционная динамика на графах». Природа . 433 (7023): 312–316. Bibcode : 2005Natur.433..312L . CiteSeerX 10.1.1.398.4515 . DOI : 10,1038 / природа03204 . PMID 15662424 . S2CID 4386820 .
- ^ Lieberman-Aiden, E .; Ван Беркум, Нидерланды; Уильямс, L .; Имакаев, М .; Ragoczy, T .; Рассказывая, А .; Амит, I .; Lajoie, BR; Сабо, П.Дж.; Доршнер, Миссури; Sandstrom, R .; Bernstein, B .; Бендер, Массачусетс; Groudine, M .; Гнирке, А .; Stamatoyannopoulos, J .; Мирный, ЛА; Lander, ES; Деккер, Дж. (2009). «Комплексное картирование дальних взаимодействий раскрывает принципы складывания человеческого генома» (PDF) . Наука . 326 (5950): 289–293. Bibcode : 2009Sci ... 326..289L . DOI : 10.1126 / science.1181369 . PMC 2858594 . PMID 19815776 .[ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ а б Кейм, Брандом (20 августа 2012 г.). «Самый запрограммированный биофизик в мире» . Проводной . Проверено 29 января 2013 года .
- ^ а б «Ученый UMMS помогает расшифровать трехмерную структуру генома человека» . Фокус UMMS . 12 (4). Ноябрь 2009 Архивировано из оригинального 26 января 2013 года . Проверено 29 января 2013 года .
- ^ Рао, SSP; Хантли, MH; Дюран, Северная Каролина; Стаменова Э.К .; Бочков, И.Д .; Робинсон, JT; Sanborn, AL; Machol, I .; Омер, AD; Lander, ES; Эйден, EL (2014). "Трехмерная карта генома человека при разрешении килобаз раскрывает принципы образования петель хроматина" . Cell . 159 (7): 1665–1680. DOI : 10.1016 / j.cell.2014.11.021 . PMC 5635824 . PMID 25497547 .
- ^ а б в г Рука, Эрик (2011). «Культуромика: Игра слов» . Природа . 474 (7352): 436–440. DOI : 10.1038 / 474436a . PMID 21697925 .
- ^ Michel, J. -B .; Shen, YK; Aiden, AP; Верес, А .; Серый, МК; Google Книги, JP; Пикетт, Д .; Hoiberg, D .; Clancy, P .; Norvig, J .; Orwant, S .; Пинкер, Массачусетс; Новак, Э.Л .; Эйден, EL (2011). «Количественный анализ культуры с использованием миллионов оцифрованных книг» . Наука . 331 (6014): 176–182. Bibcode : 2011Sci ... 331..176M . DOI : 10.1126 / science.1199644 . PMC 3279742 . PMID 21163965 .
- ^ Холмс, Боб (11 октября 2007 г.). "Языковые" мутации "влияют на наименее употребляемые слова" . Новый ученый . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ Коэн, Патрисия (16 декабря 2010 г.). «500 миллиардов слов, новое окно в культуру» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 7 января 2013 года .
- ^ Хотц, Роберт Ли (17 декабря 2010 г.). «Запуск Интернета» . The Wall Street Journal . Проверено 29 января 2013 года .
- ^ а б "Эрез Либерман-Эйден: Лауреат студенческой премии Лемельсона-Массачусетского технологического института 2010 г." . Lemelson-MIT. 2010. Архивировано из оригинального 10 марта 2010 года . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ ScienceDaily (24 июля 2008). Проблемы с балансом? Шагните в iShoe , Science Daily .
- ^ Веннер, Мелинда (18 декабря 2009 г.). «20 новых биотехнологических достижений, которые изменят медицину» . Популярная механика . Проверено 4 января 2013 года .
- ↑ MIT (10 сентября 2009 г.). 2009 Молодые новаторы до 35 лет, Эрез Либерман-Эйден, 29 лет, Гарвардский университет / Массачусетский технологический институт. , Обзор технологий .
- ^ «Премия за выдающиеся исследования докторской диссертации по биологической физике» . Американское физическое общество. 2010 . Проверено 4 января 2013 года .
- ^ Фонд Герца. «Стипендиаты Фонда Герца: Эрез Либерман Эйден» . Проверено 23 января 2013 года .
- ^ Офис пресс-секретаря. «Президент Обама чествует выдающихся ученых, начинающих свою карьеру» . whitehouse.gov . Проверено 29 января 2013 г. - из Национального архива .