База данных эукариотических патогенов
База данных эукариотических патогенов , или EuPathDB , представляет собой базу данных биоинформационных и экспериментальных данных, связанных с различными эукариотическими патогенами. Он был создан в 2006 году в рамках программы Национального института здравоохранения для создания ресурсных центров биоинформатики для содействия исследованиям патогенов, которые могут представлять угрозу для биозащиты. [ править ] EuPathDB хранит данные, связанные с интересующими его организмами, и предоставляет инструменты для поиска и анализа данных. В настоящее время он состоит из 14 компонентных баз данных, каждая из которых посвящена определенной теме исследования. EuPathDB включает: [ нужна ссылка ]
EuPathDB была создана в рамках программы Центров ресурсов биоинформатики NIH как ApiDB, ресурс, предназначенный для охвата паразитов Apicomplexan . [1] Первоначально ApiDB состояла из компонентов сайтов CryptoDB (для Cryptosporidium ), PlasmoDB (для Plasmodium ) и ToxoDB (для Toxoplasma gondii ). [2] Поскольку ApiDB расширилась, чтобы сосредоточиться на эукариотических патогенах помимо Apicomplexans, название было изменено на EuPathDB, чтобы поддержать его расширенную область применения. [3] EuPathDB стала результатом сотрудничества множества разных паразитологов, в том числе Дэвида Руса, Джессики Киссинджер и Дайанна Вирта . [4][5]
Это интегрированная база данных, охватывающая эукариотических патогенов нескольких родов. Это позволяет получить доступ к подробной информации о геноме , связанной с этими патогенами. EuPathDB ранее была известна как ApiDB и представляла собой интегрированные ресурсы для апикомплексов , охватывающих базы данных ассоциированных патогенов, ToxoDB, PiroplasmDB и CryptoDB. [2]
В настоящее время EuPathDB охватывает 11 баз данных, последней из которых является база данных Piroplasma , которая поддерживает Babesia и Theileria . Этот BRC является одним из пяти центров, финансируемых для оказания поддержки исследовательским организациям. EuPath поддерживает исследования эукариотических патогенов, а остальные четыре центра поддерживают исследования возбудителей других болезней. [6] Она разработала сложную систему поиска, оказывающую неоценимую помощь исследователям. [3]
