Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Домен линкера F-box
PDB 1fs2 EBI.jpg
Структура линкерного домена LRR Skp2 в комплексе Skp1-Skp2. [1]
Идентификаторы
СимволF-бокс
PfamPF00646
Клан пфамCL0271
ИнтерПроIPR001810
УМНАЯSM00256
PROSITEPS50181
SCOP21fs2 / SCOPe / SUPFAM
Мембранома630
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Белки F-бокса представляют собой белки, содержащие по крайней мере один домен F-бокса. Первый идентифицированный белок F-бокса является одним из трех компонентов комплекса SCF , который опосредует убиквитинирование белков, нацеленных на деградацию протеасомой 26S .

Основные компоненты [ править ]

F-box домен представляет собой структурный мотив белка, состоящий примерно из 50 аминокислот, который опосредует межбелковые взаимодействия . Он имеет консенсусную последовательность и варьируется в нескольких положениях. Впервые он был обнаружен в циклине F . [2] Мотив F-бокса Skp2, состоящий из трех альфа-спиралей, напрямую взаимодействует с SCF-белком Skp1 . [3] F-box домены обычно существуют в белках во взаимодействии с другими мотивами белок-белкового взаимодействия, такими как богатые лейцином повторы (проиллюстрированы на рисунке) и повторы WD , которые, как считается, опосредуют взаимодействия с субстратами SCF. [4]

Функция [ править ]

Белки F-бокса также связаны с клеточными функциями, такими как передача сигналов и регуляция клеточного цикла . [5] В растениях многие белки F-бокса представлены в генных сетях, широко регулируемых с помощью микроРНК- опосредованного подавления генов посредством РНК-интерференции . [6] Белки F-бокса участвуют во многих вегетативных и репродуктивных процессах роста и развития растений. Например, белок F-бокса-FOA1 участвует в передаче сигналов абсцизовой кислоты (ABA), влияющей на прорастание семян. [7]ACRE189 / ACIF1 может регулировать гибель клеток и защиту, когда патоген распознается в растении табак и помидоры. [8]

В клетках человека в условиях высокого содержания железа два атома железа стабилизируют F-Box FBXL5, а затем комплекс опосредует убиквитинирование IRP2 . [9]

Регламент [ править ]

Уровни белка F-бокса можно регулировать разными механизмами. Регулирование может происходить посредством процесса деградации белка и ассоциации с комплексом SCF. Например, в дрожжах белок F-бокса Met30 можно убиквитинировать куллин-зависимым образом. [10] [11]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д. и др. (Ноябрь 2000 г.). «Понимание SCF ubiquitin ligases из структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6. Bibcode : 2000Natur.408..381S . DOI : 10.1038 / 35042620 . PMID  11099048 . S2CID  4300503 .
  2. ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ. «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-бокс». Ячейка 86 263-74 1996 .
  3. ^ Bai С, Сен Р, Хофман К, М л, Goebl М, Harper JW, SJ Elledge (июль 1996 года). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-бокс». Cell . 86 (2): 263–74. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 . 
  4. ^ Kipreos ET, Пагано M (2000). «Семейство белков F-бокса» . Genome Biol . 1 (5): ОБЗОРЫ 3002. DOI : 10.1186 / GB-2000-1-5-reviews3002 . PMC 138887 . PMID 11178263 .  
  5. ^ Craig KL, Tyers M (1999). «F-бокс: новый мотив убиквитин-зависимого протеолиза в регуляции клеточного цикла и передаче сигнала» . Прог. Биофиз. Мол. Биол . 72 (3): 299–328. DOI : 10.1016 / S0079-6107 (99) 00010-3 . PMID 10581972 . 
  6. ^ Джонс-Роудс МВт, Бартель DP, Бартель B (2006). «MicroRNAS и их регуляторные роли в растениях». Annu Rev Plant Biol . 57 : 19–53. DOI : 10.1146 / annurev.arplant.57.032905.105218 . PMID 16669754 . 
  7. ^ Пэн, Хуан; Ю, Даши; Ван, Лицюнь; Се, Минминь; Юань, Цунъин; Ван, Ю; Тан, Дунъин; Чжао, Сяоин; Лю, Сюаньминь (июнь 2012 г.). «Ген F-box FOA1 арабидопсиса, участвующий в передаче сигналов ABA». Наука Китая. Науки о жизни . 55 (6): 497–506. DOI : 10.1007 / s11427-012-4332-9 . ISSN 1869-1889. PMID 22744179.
  8. ^ Ха, Ван Ден Бург; Цицигианнис, Д.И.; Роуленд, О; Lo, J; Раллапалли, G; Maclean, D; Таккен, Флорида; Джонс, JD (2008). «Белок F-бокса ACRE189 / ACIF1 регулирует гибель клеток и защитные реакции, активируемые во время распознавания патогенов в табаке и томате». Растительная клетка . 20 (3): 697.
  9. ^ Моройши, Т; Нишияма, М; Такеда, Й; Иваи, К; Накаяма, К.И. (2011). «Ось FBXL5-IRP2 является неотъемлемой частью контроля метаболизма железа in vivo». Клеточный метаболизм . 14 (3): 339.
  10. ^ Кайзер, Питер; Су, Нин-Юань; Йен, Джеймс Л .; Оуни, Икрам; Флик, Карин (2008-08-08). «Убиквитинлигаза дрожжей SCFMet30: соединение условий окружающей среды и внутриклеточных условий с делением клеток». Отделение клеток . 1 : 16. DOI : 10,1186 / 1747-1028-1-16 . ISSN 1747-1028 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хо М., Цай П., Цзянь С. (2006). «Белки F-бокса: ключ к деградации белков» . J Biomed Sci . 13 (2): 181–91. DOI : 10.1007 / s11373-005-9058-2 . PMID  16463014 .

Внешние ссылки [ править ]

  • F-Box + Proteins в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)
  • F-box + мотивы в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)