• остановка клеточного цикла • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток • негативная регуляция перехода G0 в G1 • сигнальный путь рецептора инсулина • негативная регуляция ангиогенеза • развитие многоклеточного организма • позитивная регуляция остановки клеточного цикла • дифференциация клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие мышечных органов • дифференциация стволовых клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • контрольная точка митотического повреждения ДНК G2 • клеточный цикл • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция клеточной пролиферации • реакция на стресс, сдерживающий погружение в воду • реакция на уровни питательных веществ • старение • позитивная регуляция миграции гладкомышечных клеток • деубиквитинирование белков • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • гомеостаз глюкозы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
4303
54601
Ансамбль
ENSG00000184481
ENSMUSG00000042903
UniProt
P98177
Q9WVH3
RefSeq (мРНК)
NM_001170931 NM_005938
NM_018789
RefSeq (белок)
NP_001164402 NP_005929
NP_061259
Расположение (UCSC)
Chr X: 71,1 - 71,1 Мб
Chr X: 101,25 - 101,26 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Forkhead коробка белок О4 пептид представляет собой белок , который у человека кодируется FOXO4 пептида гена . [5] [6] Он расположен на длинном плече Х-хромосомы от пары оснований от 71 096 148 до 71 103 533. [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура и функции
2 Клиническое значение
2.1 Ассоциации с долголетием
2.2 Рак
3 взаимодействия
4 См. Также
5 ссылки
6 Дальнейшее чтение
7 Внешние ссылки
Структура и функции [ править ]
FOXO4 является членом подкласса O транскрипционных факторов семейства вилкоголовых, который характеризуется доменом крылатой спирали, используемым для связывания ДНК. [8] [9] Есть 4 члена семейства FOXO, включая FOXO1 , FOXO3 и FOXO6 . Их активность модифицируется многими посттрансляционными действиями, такими как фосфорилирование, убиквитинирование и ацетилирование. [10] В зависимости от этого модифицированного состояния изменяется аффинность связывания FOXO4 с ДНК, что позволяет FOXO4 регулировать многие клеточные пути, включая передачу сигналов окислительного стресса, продолжительность жизни, передачу сигналов инсулина, развитие клеточного цикла и апоптоз. [11] [12] [13] [14] [15]Двумя основными вышестоящими регуляторами активности FOXO4 являются фосфоинозитид-3-киназа (PI3K) и серин / треонинкиназа AKT / PKB . [16] [17] И PI3K, и AKT модифицируют FOXO4 и предотвращают его перемещение в ядро, эффективно предотвращая транскрипцию нижестоящих мишеней FOXO.
Клиническое значение [ править ]
Ассоциации с долголетием [ править ]
Было показано, что факторы транскрипции FOXO являются нижестоящими эффекторными молекулами сигнального пути инсулиноподобного фактора роста (IGF) . В отсутствие инсулина PI3K неактивен, поэтому гомолог FOXO daf-16 способен перемещаться в ядро и включать многие генетические пути, связанные с долголетием у круглого червя Caenorhabditis elegans . [18] Активация этих путей FOXO увеличивает продолжительность жизни червей, мух, мышей; аналогичные варианты FOXO3a также связаны с более продолжительной жизнью человека. [19] [20]
FOXO4 может связываться с белком p53, вызывая клеточное старение . [21] Пептид, конкурирующий с FOXO4, может действовать как сенолитик , исключая p53 из ядра. [21]
Рак [ править ]
Было обнаружено, что многие различные виды рака содержат мутации, которые способствуют фосфорилированию AKT и, таким образом, инактивации FOXO, эффективно препятствуя правильной регуляции клеточного цикла. [22] [23] [24] FOXO4 активирует зависимый от клеточного цикла ингибитор киназы P27 , который, в свою очередь, предотвращает прогрессирование опухолей в G1 . [25] В HER-2- положительных опухолевых клетках увеличение активности FOXO4 уменьшает размер опухоли. [25] Было показано, что хромосомные транслокации FOXO4 являются причиной острого лейкоза. [26] Слитые белки, образованные в результате этих транслокаций, лишены ДНК-связывающего домена, что приводит к потере функции белка. [26]
При раке желудка (РЖ) было замечено, что уровни мРНК FOXO4 были ниже при раке, который уже прогрессировал до поражения лимфатических узлов, по сравнению с раком, который оставался in situ. [27] По сравнению с нормальной тканью, все GC эпителии имели более низкие уровни FOXO4, локализованного в ядре, что согласуется с меньшей эффекторной активностью FOXO4 и функцией FOXO4 как супрессора канцерогенных свойств. Он делает это, вызывая остановку клеточного цикла между фазами Go и S, предотвращая пролиферацию клеток, а также подавляя метастазирование путем подавления виментина . [28] Эти результаты согласуются с тем, что FOXO4 играет роль в ингибировании мезенхимального перехода эпителия (EMT).
При немелкоклеточной карциноме легкого существуют различные уровни экспрессии FOXO4, которые соответствуют стадийности рака; в худших случаях было наименьшее количество FOXO4, в то время как в менее тяжелых случаях - более высокие уровни FOXO4. [29] Как и в случае рака желудка, эти виды рака с самым низким уровнем FOXO4 также имели самые низкие уровни E-кадгерина и самые высокие уровни виментина, что согласуется с FOXO4, действующим как супрессор фенотипа EMT. [29]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что FOXO4 взаимодействует с PIN1 [30] и Mdm2 . [31]
См. Также [ править ]
FOX белки
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184481 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042903 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Parry P, Wei Y, Evans G (февраль 1995 г.). «Клонирование и характеристика точки останова t (X; 11) из линии лейкозных клеток позволяет идентифицировать нового члена семейства генов вилки». Гены Хромосомы Рак . 11 (2): 79–84. DOI : 10.1002 / gcc.2870110203 . PMID 7529552 . S2CID 19965473 .
^ Вейгель Д, Jäckle Н (ноябрь 1990). «Домен головы вилки: новый ДНК-связывающий мотив факторов транскрипции эукариот?». Cell . 63 (3): 455–456. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90439-л . PMID 2225060 . S2CID 1986657 .
^ Kaestner KH, Knochel W, Martinez DE (январь 2000). «Единая номенклатура факторов транскрипции крылатой спирали / вилки». Гены и развитие . 14 (2): 142–146. doi : 10.1101 / gad.14.2.142 (неактивный 2021-01-10). PMID 10702024 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
^ Ван дер Хорст A, Burgering BM (июнь 2007). «Подчеркивая роль белков FoxO в продолжительности жизни и болезнях». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 8 (6): 440–450. DOI : 10.1038 / nrm2190 . PMID 17522590 . S2CID 31546098 .
^ van der Heide LP, Jacobs FM, Burbach JP, Hoekman MF, Smidt MP (ноябрь 2005 г.). «Транскрипционная активность FoxO6 регулируется Thr26 и Ser184, независимо от ядерно-цитоплазматического перемещения» . Биохимический журнал . 391 (Pt 3): 623–629. DOI : 10.1042 / BJ20050525 . PMC 1276963 . PMID 15987244 .
^ Мацудзаки Н, Daitoku Н, Хатта М, Аояма Н, Yoshimochi К, Fukamizu А (август 2005). «Ацетилирование Foxo1 изменяет его ДНК-связывающую способность и чувствительность к фосфорилированию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (32): 11278–11283. Bibcode : 2005PNAS..10211278M . DOI : 10.1073 / pnas.0502738102 . PMC 1183558 . PMID 16076959 .
^ Boura Е, Silhan J, Герман Р, večer Дж, Шульц М, Teisinger Дж, Obsilova В, Обзил Т (март 2007). «Как N-концевая петля, так и крыло W2 домена вилки транскрипционного фактора Foxo4 важны для связывания ДНК». Журнал биологической химии . 282 (11): 8265–8275. DOI : 10.1074 / jbc.M605682200 . PMID 17244620 . S2CID 22561455 .
↑ Tsai KL, Sun YJ, Huang CY, Yang JY, Hung MC, Hsiao CD (2007). «Кристаллическая структура человеческого комплекса FOXO3a-DBD / ДНК предполагает эффекты посттрансляционной модификации» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (20): 6984–6994. DOI : 10.1093 / NAR / gkm703 . PMC 2175300 . PMID 17940099 .
↑ Brent MM, Anand R, Marmorstein R (сентябрь 2008 г.). «Структурная основа распознавания ДНК FoxO1 и ее регуляция посттрансляционной модификацией» . Структура . 16 (9): 1407–16. DOI : 10.1016 / j.str.2008.06.013 . PMC 2597217 . PMID 18786403 .
^ Нейман-Haefelin Е, й Вт, Финкбейнер Е, Уолз G, R Баумейстера, Hertweck М (октябрь 2008 г.). «SHC-1 / p52Shc нацелен на сигнальные пути инсулина / IGF-1 и JNK, чтобы модулировать продолжительность жизни и стрессовую реакцию у C. elegans» . Гены и развитие . 22 (19): 2721–2735. DOI : 10,1101 / gad.478408 . PMC 2559911 . PMID 18832074 .
^ Кеньон С, Чанг Дж, Gensch Е, Раднер А, Tabtiang Р (декабрь 1993). «Мутант C. elegans, который живет вдвое дольше, чем дикий тип». Природа . 366 (6454): 461–464. Bibcode : 1993Natur.366..461K . DOI : 10.1038 / 366461a0 . PMID 8247153 . S2CID 4332206 .
^ Willcox BJ, Донлон TA, Он Q, R Chen, Grove JS, Яно K, Masaki KH, Willcox DC, Родригес B, Снаряженная JD (Sep 2008). «Генотип FOXO3A прочно связан с долголетием человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (37): 13987–13992. Bibcode : 2008PNAS..10513987W . DOI : 10.1073 / pnas.0801030105 . PMC 2544566 . PMID 18765803 .
^ a b Baar MP, Brandt RM, Putavet DA, Klein JD, Derks KW, Bourgeois BR, Stryeck S, Rijksen Y, van Willigenburg H, Feijtel DA, van der Pluijm I, Essers J, van Cappellen WA, van IJcken WF, Houtsmuller AB, Pothof J, de Bruin RW, Madl T, Hoeijmakers JH, Campisi J, de Keizer PL (2017). «Целевой апоптоз стареющих клеток восстанавливает гомеостаз тканей в ответ на химиотоксичность и старение» . Cell . 169 (1): 132–147. DOI : 10.1016 / j.cell.2017.02.031 . PMC 5556182 . PMID 28340339 .
^ Li J, Yen C, Liaw D, Podsypanina K, Bose S, Wang SI, Puc J, Miliaresis C, Rodgers L, McCombie R, Bigner SH, Giovanella BC, Ittmann M, Tycko B, Hibshoosh H, Wigler MH, Парсонс R (март 1997 г.). «PTEN, предполагаемый ген протеинтирозинфосфатазы, мутировавший при раке человеческого мозга, груди и простаты». Наука . 275 (5308): 1943–1947. DOI : 10.1126 / science.275.5308.1943 . PMID 9072974 . S2CID 23093929 .
↑ Samuels Y, Wang Z, Bardelli A, Silliman N, Ptak J, Szabo S, Yan H, Gazdar A, Powell SM, Riggins GJ, Willson JK, Markowitz S, Kinzler KW, Vogelstein B, Velculescu VE (апрель 2004 г.). «Высокая частота мутаций гена PIK3CA при раке человека». Наука . 304 (5670): 554. DOI : 10.1126 / science.1096502 . PMID 15016963 . S2CID 10147415 .
^ Саал ЛГ, Holm К, М Maurer, Memeo л, Су Т, Ван Х, Ю. И. С., Мальстром ПО, Mansukhani М, Enoksson Дж, Hibshoosh Н, Борг А, Парсонс Р (апрель 2005 г.). «Мутации PIK3CA коррелируют с рецепторами гормонов, метастазами в узел и ERBB2 и являются взаимоисключающими с потерей PTEN при карциноме груди человека». Исследования рака . 65 (7): 2554–2559. DOI : 10.1158 / 0008-5472-CAN-04-3913 . PMID 15805248 .
^ a b Ян Х, Чжао Р., Ян Х.Й., Ли М. Х. (март 2005 г.). «Постоянно активный FOXO4 ингибирует активность Akt, регулирует стабильность p27 Kip1 и подавляет HER2-опосредованную онкогенность». Онкоген . 24 (11): 1924–35. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208352 . PMID 15688030 . S2CID 20360440 .
^ a b Paik JH, Kollipara R, Chu G, Ji H, Xiao Y, Ding Z, Miao L, Tothova Z, Horner JW, Carrasco DR, Jiang S, Gilliland DG, Chin L, Wong WH, Castrillon DH, DePinho RA (Январь 2007 г.). «FoxOs являются избыточными опухолевыми супрессорами с ограниченным клонированием и регулируют гомеостаз эндотелиальных клеток» . Cell . 128 (2): 309–323. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.029 . PMC 1855089 . PMID 17254969 .
↑ Лю Х, Чжан З, Сун Л, Чай Н, Тан С, Джин Дж, Ху Х, Не Y, Ван Х, Ву К, Джин Х, Фан Д (декабрь 2011 г.). «MicroRNA-499-5p способствует клеточной инвазии и метастазированию опухолей при колоректальном раке, воздействуя на FOXO4 и PDCD4». Канцерогенез . 32 (12): 1798–1805. DOI : 10.1093 / carcin / bgr213 . PMID 21934092 .
^ Су Л, Лю Х, Чай Н, Ур Л, Ван Р, Ли Икс, Не Y, Ши И, Фан Д (2014). «Фактор транскрипции FOXO4 подавляется и подавляет пролиферацию опухоли и метастазирование при раке желудка» . BMC Рак . 14 : 378. DOI : 10.1186 / 1471-2407-14-378 . PMC 4063225 . PMID 24886657 .
^ а б Сюй ММ, Мао GX, Лю Дж, Ли Дж.С., Хуан Х, Лю ЮФ, Лю ДжХ (2014). «Низкая экспрессия гена FoxO4 может способствовать феномену EMT при немелкоклеточном раке легкого». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 15 (9): 4013–4018. DOI : 10,7314 / apjcp.2014.15.9.4013 . PMID 24935588 .
^ Brenkman AB, де Кейзер PL, ван ден Брука Нью - Джерси, ван - дер - Groep P, ван Diest PJ, ван дер Хорст А, Смитс AM, Burgering BM (сен 2008). «Пептидилизомераза Pin1 регулирует экспрессию p27kip1 посредством ингибирования опухолевых супрессоров Forkhead box O». Cancer Res . 68 (18): 7597–605. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1059 . PMID 18794148 .
^ Brenkman AB, де Кейзер PL, ван ден Брук, штат Нью - Джерси Jochemsen AG, Burgering BM (2008). Куксон М.Р. (ред.). «Mdm2 индуцирует моноубиквитинирование FOXO4» . PLOS ONE . 3 (7): e2819. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2819B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002819 . PMC 2475507 . PMID 18665269 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Боркхардт А., Репп Р., Хаас О.А., Лейс Т., Харботт Дж., Кройдер Дж., Хаммерманн Дж., Хенн Т., Ламперт Ф. (1997). «Клонирование и характеристика AFX, гена, который сливается с MLL при острых лейкозах с at (X; 11) (q13; q23)». Онкоген . 14 (2): 195–202. DOI : 10.1038 / sj.onc.1200814 . PMID 9010221 . S2CID 19818372 .
Петерс Ю., Хаберхаузен Г., Костшева М., Нолте Д., Мюллер Ю. (1997). «AFX1 и p54nrb: точное картирование, геномная структура и исключение в качестве генов-кандидатов Х-сцепленной дистонии паркинсонизма». Гм. Genet . 100 (5–6): 569–72. DOI : 10.1007 / s004390050553 . PMID 9341872 . S2CID 35332593 .
Копс Г.Дж., де Руйтер Н.Д., Де Фрис-Смитс А.М., Пауэлл Д.Р., Бос Д.Л., Бургеринг Б.М. (1999). «Прямой контроль фактора транскрипции AFX Forkhead с помощью протеинкиназы B». Природа . 398 (6728): 630–4. Bibcode : 1999Natur.398..630K . DOI : 10.1038 / 19328 . PMID 10217147 . S2CID 4394066 .
Такаиси Х., Кониси Х., Мацудзаки Х., Оно Й, Шираи Й, Сайто Н, Китамура Т, Огава В., Касуга М, Киккава У, Нисизука Й (1999). «Регулирование ядерной транслокации фактора транскрипции AFX вилки с помощью протеинкиназы B» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (21): 11836–41. Bibcode : 1999PNAS ... 9611836T . DOI : 10.1073 / pnas.96.21.11836 . PMC 18373 . PMID 10518537 .
Medema RH, Kops GJ, Bos JL, Burgering BM (2000). «AFX-подобные факторы транскрипции Forkhead опосредуют регуляцию клеточного цикла с помощью Ras и PKB через p27kip1». Природа . 404 (6779): 782–7. Bibcode : 2000Natur.404..782M . DOI : 10.1038 / 35008115 . PMID 10783894 . S2CID 205005804 .
Фуруяма Т., Накадзава Т., Накано И., Мори Н. (2000). «Идентификация паттернов дифференциального распределения мРНК и консенсусных связывающих последовательностей для гомологов DAF-16 мыши» . Биохим. Дж . 349 (Pt 2): 629–34. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3490629 . PMC 1221187 . PMID 10880363 .
Weigelt J, Climent I, Dahlman-Wright K, Wikström M (2000). «Резонансные отнесения 1H, 13C и 15N ДНК-связывающего домена человеческого фактора транскрипции AFX». J. Biomol. ЯМР . 17 (2): 181–2. DOI : 10,1023 / A: 1008358816478 . PMID 10921784 . S2CID 91193730 .
Насрин Н., Огг С., Кэхилл С.М., Биггс В., Нуи С., Доре Дж., Кальво Д., Ши И., Рувкун Г., Александр-Бриджес М.С. (2000). «DAF-16 привлекает коактиваторный комплекс CREB-связывающего белка к промотору белка 1 связывания инсулиноподобного фактора роста в клетках HepG2» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (19): 10412–7. Bibcode : 2000PNAS ... 9710412N . DOI : 10.1073 / pnas.190326997 . PMC 27038 . PMID 10973497 .
Weigelt J, Climent I, Dahlman-Wright K, Wikström M (2001). «Структура раствора ДНК-связывающего домена человеческого фактора транскрипции вилки AFX (FOXO4)». Биохимия . 40 (20): 5861–9. DOI : 10.1021 / bi001663w . PMID 11352721 .
Шур Э. Р., Локтев А. В., Шарма М., Сан З., Рот Р. А., Вейгель Р. Дж. (2001). «Лиганд-зависимое взаимодействие рецептора эстрогена-альфа с членами семейства факторов транскрипции вилки». J. Biol. Chem . 276 (36): 33554–60. DOI : 10.1074 / jbc.M105555200 . PMID 11435445 . S2CID 11652289 .
Де Руйтер Н.Д., Бургеринг Б.М., Бос Д.Л. (2001). «Регулирование фактора транскрипции Forkhead AFX с помощью Ral-зависимого фосфорилирования треонинов 447 и 451» . Мол. Клетка. Биол . 21 (23): 8225–35. DOI : 10.1128 / MCB.21.23.8225-8235.2001 . PMC 99987 . PMID 11689711 .
Тан Т.Т., Доубенко Д., Джексон А., Тони Л., Левин Д.А., Дент А.Л., Ласки Л.А. (2002). «Фактор транскрипции AFX активирует апоптоз путем индукции репрессора транскрипции BCL-6». J. Biol. Chem . 277 (16): 14255–65. DOI : 10.1074 / jbc.M110901200 . PMID 11777915 . S2CID 22501049 .
Ян З., Уилан Дж, Бабб Р., Боуэн Б.Р. (2002). «Вариант сплайсинга мРНК гена AFX с измененной транскрипционной активностью». J. Biol. Chem . 277 (10): 8068–75. DOI : 10.1074 / jbc.M106091200 . PMID 11779849 . S2CID 22605434 .
Копс Г.Дж., Медема Р.Х., Глассфорд Дж., Эссерс М.А., Дейкерс П.Ф., Коффер П.Дж., Лам Э.В., Бургеринг Б.М. (2002). «Контроль выхода и входа в клеточный цикл с помощью факторов транскрипции вилки, регулируемых протеинкиназой B» . Мол. Клетка. Биол . 22 (7): 2025–36. DOI : 10.1128 / MCB.22.7.2025-2036.2002 . PMC 133681 . PMID 11884591 .
Итак, CW, Cleary ML (2002). «MLL-AFX требует, чтобы эффекторные домены транскрипции AFX трансформировали миелоидные предшественники и трансдоминантно вмешивались в функцию белка вилки» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6542–52. DOI : 10.1128 / MCB.22.18.6542-6552.2002 . PMC 135648 . PMID 12192052 .
Тан Т.Т., Ласки Л.А. (2003). «Фактор транскрипции вилки FOXO4 индуцирует подавление индуцируемого гипоксией фактора 1 альфа с помощью независимого от белка механизма фон Хиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 278 (32): 30125–35. DOI : 10.1074 / jbc.M302042200 . PMID 12761217 . S2CID 43919271 .
Кроссли LJ (2003). «Активация нейтрофилов с помощью fMLP регулирует факторы транскрипции FOXO (вилка) множеством путей, один из которых включает связывание FOXO с фактором выживания Mcl-1». J. Leukoc. Биол . 74 (4): 583–92. DOI : 10,1189 / jlb.0103020 . PMID 12960271 . S2CID 15199594 .
Внешние ссылки [ править ]
MLLT7 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P98177 (белок коробки Forkhead O4) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .
vтеPDB галерея
1e17 : СТРУКТУРА РЕШЕНИЯ ДОМЕНА СВЯЗИ ДНК ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО ФАКТОРА ТРАНСКРИПЦИИ AFX (FOXO4)
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также недостаточность фактора транскрипции / корегулятора