Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FGFR4
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4QQ5 , 4QQC , 4QQJ , 4QQT , 4QRC , 4R6V , 4TYE , 4TYG , 4TYI , 4TYJ , 4UXQ , 4XCU

Идентификаторы
ПсевдонимыFGFR4 , CD334, JTK2, TKF, рецептор фактора роста фибробластов 4
Внешние идентификаторыOMIM : 134935 MGI : 95525 HomoloGene : 20461 GeneCards : FGFR4
Расположение гена ( человек )
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человека) [1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение FGFR4
Геномное расположение FGFR4
Группа5q35.2Начинать177 086 905 п.н. [1]
Конец177 098 144 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 13 (мышь)
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Хромосома 13 (мышь)
Геномное расположение FGFR4
Геномное расположение FGFR4
Группа13 B1 | 13 29,8 смНачинать55 152 640 п.н. [2]
Конец55 168 759 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• связывание нуклеотида
• активность протеинкиназы
• гепаринсвязывающего
• активность киназы
• ГО: связывание 0001948 белка
• белка активность тирозинкиназы трансмембранного рецептор
• активность киназы белка тирозина
• фибробластов фактора роста связывание
• фибробластов активности рецептора фактора активированного роста
• связывание АТФ
• Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов
• Активность фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназы
• Активность 1-фосфатидилинозитол-3-киназы
• рецепторная тирозинкиназа
• активность рецептора трансмембранной передачи сигналов
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• эндосома
• аппарат Гольджи
• мембрана
• межклеточное соединение
• клеточная мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• транспортный пузырь
• внеклеточная область
• эндоплазматический ретикулум
• цитоплазма
• рецепторный комплекс
Биологический процесс• гомеостаз глюкозы
• фосфорилирование
• гомеостаз фосфат-иона
• реакция на желчную кислоту
• регуляция разборки внеклеточного матрикса
• каскад MAPK
• регуляция процесса биосинтеза желчных кислот
• сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов
• регуляция липидного метаболического процесса
• фосфорилирование белков
• положительная регуляция экспрессия генов
• позитивная регуляция клеточной пролиферации
• позитивная регуляция процесса биосинтеза ДНК
• позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2
• положительное регулирование протеолиз
• автофосфорилирования
• пептидил-фосфорилирования тирозин
• клеточной миграции
• фосфатидилинозитолы фосфорилирование
• GO: 0048554 положительного регулирования каталитической активности
• фосфатидилинозитолы-3-фосфат - биосинтетический процесс
• положительного регулирования протеинкиназы сигнализации B
• гомеостаз холестерина
• ангиогенез
• негативной регуляции передачи сигнала
• дифференцировка клеток
• негативная регуляция апоптотического процесса
• сигнальный путь трансмембранного рецептора протеинтирозинкиназы
• развитие нервной системы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2264

14186

Ансамбль

ENSG00000160867

ENSMUSG00000005320

UniProt

P22455

Q03142

RefSeq (мРНК)

NM_001291980
NM_002011
NM_022963
NM_213647
NM_001354984

NM_008011

RefSeq (белок)

NP_001278909
NP_002002
NP_075252
NP_998812
NP_001341913

NP_032037

Расположение (UCSC)Chr 5: 177.09 - 177,1 МбChr 13: 55.15 - 55.17 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор роста фибробластов рецептора 4 представляет собой белок , который у человека кодируется FGFR4 гена . FGFR4 также был обозначен как CD334 ( кластер дифференцировки 334).

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства рецепторов фактора роста фибробластов, аминокислотная последовательность которого высококонсервативна между членами и на протяжении всей эволюции. Члены семейства FGFR отличаются друг от друга сродством к лигандам и тканевым распределением. Полноразмерный репрезентативный белок должен состоять из внеклеточной области, состоящей из трех иммуноглобулиноподобных доменов, одного гидрофобного трансмембранного сегмента и цитоплазматической тирозинкиназы.домен. Внеклеточная часть белка взаимодействует с факторами роста фибробластов, приводя в движение каскад нисходящих сигналов, в конечном итоге влияя на митогенез и дифференцировку. Геномная организация этого гена, по сравнению с членами 1-3, включает 18 экзонов, а не 19 или 20. Хотя наблюдался альтернативный сплайсинг , нет никаких доказательств того, что С-концевая половина домена IgIII этого белка варьирует между тремя. альтернативные формы, указанные для членов 1-3. Этот конкретный член семейства предпочтительно связывает кислый фактор роста фибробластов и, хотя его конкретная функция неизвестна, он сверхэкспрессируется в образцах гинекологических опухолей, что позволяет предположить его роль в онкогенезе груди и яичников.[5] В метааналитическом исследовании было обнаружено, что функциональный полиморфизм Gly388Arg (rs351855) FGFR4 в значительной степени связан с поражением узлов и общей выживаемостью у пациентов с различными типами рака. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что рецептор 4 фактора роста фибробластов взаимодействует с FGF1 . [7] [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000160867 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005320 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Энтрез Ген: рецептор 4 фактора роста фибробластов FGFR4» .
  6. ^ Frullanti, E (2011). «Мета и объединенный анализ полиморфизма FGFR4 Gly388Arg как фактора прогноза рака». Eur J Cancer Пред . 20 (4): 340–347. DOI : 10.1097 / CEJ.0b013e3283457274 . PMID 21412156 . S2CID 29668012 .  
  7. ^ Loo, BB; Дарвиш К.К.; Вайникка СС; Saarikettu JJ; Вихко П.П.; Hermonen JJ; Гольдман А.А.; Alitalo KK; Ялканен М.М. (май 2000 г.). «Производство и характеристика внеклеточного домена рецептора 4 рекомбинантного человеческого фактора роста фибробластов». Int. J. Biochem. Cell Biol . АНГЛИЯ. 32 (5): 489–97. DOI : 10.1016 / S1357-2725 (99) 00145-4 . ISSN 1357-2725 . PMID 10736564 .  
  8. ^ Кан, М; Wu X; Ван Ф; McKeehan WL (май 1999 г.). «Специфичность факторов роста фибробластов определяется по гепарансульфату в бинарном комплексе с рецепторной киназой» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (22): 15947–52. DOI : 10.1074 / jbc.274.22.15947 . ISSN 0021-9258 . PMID 10336501 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Доэрти П., Смит П., Уолш Ф. С. (1997). «Общие домены гомологии молекулы клеточной адгезии (CAM) указывают на передачу сигналов CAM через рецепторы FGF». Перспективы нейробиологии развития . 4 (2–3): 157–68. PMID  9168198 .
  • Уоррингтон Дж. А., Бейли С. К., Армстронг Э. и др. (1992). «Радиационная гибридная карта 18 факторов роста, рецепторов фактора роста, рецепторов гормонов или рецепторов нейротрансмиттеров в дистальной области длинного плеча хромосомы 5». Геномика . 13 (3): 803–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90156-M . PMID  1322355 .
  • Армстронг Э., Партанен Дж., Канниццаро ​​Л. и др. (1992). «Локализация гена рецептора-4 фактора роста фибробластов в области хромосомы 5q33-qter». Гены Хромосомы Рак . 4 (1): 94–8. DOI : 10.1002 / gcc.2870040116 . PMID  1377018 . S2CID  6377972 .
  • Вайникка С., Партанен Дж., Беллоста П. и др. (1992). «Рецептор-4 фактора роста фибробластов демонстрирует новые особенности в геномной структуре, связывании лиганда и передаче сигнала» . EMBO J . 11 (12): 4273–80. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05526.x . PMC  557000 . PMID  1385111 .
  • Партанен Дж., Мякеля Т.П., Эерола Э. и др. (1991). «FGFR-4, новый рецептор кислого фактора роста фибробластов с отчетливым паттерном экспрессии» . EMBO J . 10 (6): 1347–54. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07654.x . PMC  452793 . PMID  1709094 .
  • Holtrich U, Bräuninger A, Strebhardt K, Rübsamen-Waigmann H (1992). «Две дополнительные протеин-тирозинкиназы, экспрессируемые в легких человека: четвертый член семейства рецепторов фактора роста фибробластов и внутриклеточная протеин-тирозинкиназа» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 88 (23): 10411–5. Bibcode : 1991PNAS ... 8810411H . DOI : 10.1073 / pnas.88.23.10411 . PMC  52938 . PMID  1720539 .
  • Партанен Дж., Мякеля Т.П., Алитало Р. и др. (1991). «Предполагаемые тирозинкиназы, экспрессируемые в клетках лейкемии человека К-562» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (22): 8913–7. Bibcode : 1990PNAS ... 87.8913P . DOI : 10.1073 / pnas.87.22.8913 . PMC  55070 . PMID  2247464 .
  • Вайникка С., Жуков В., Веннстрём С. и др. (1994). «Передача сигнала рецептором-4 фактора роста фибробластов (FGFR-4). Сравнение с FGFR-1». J. Biol. Chem . 269 (28): 18320–6. PMID  7518429 .
  • Вен З, Чжун З, Дарнелл Дж. Э. (1995). «Максимальная активация транскрипции с помощью Stat1 и Stat3 требует фосфорилирования как тирозина, так и серина». Cell . 82 (2): 241–50. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90311-9 . PMID  7543024 . S2CID  6717533 .
  • Quelle FW, Thierfelder W., Witthuhn BA, et al. (1995). «Фосфорилирование и активация ДНК-связывающей активности очищенного Stat1 с помощью протеин-тирозинкиназ Janus и рецептора эпидермального фактора роста» . J. Biol. Chem . 270 (35): 20775–80. DOI : 10.1074 / jbc.270.35.20775 . PMID  7657660 .
  • Рон Д., Райх Р., Чедид М. и др. (1993). «Рецептор 4 фактора роста фибробластов представляет собой рецептор с высоким сродством как к кислому, так и к основному фактору роста фибробластов, но не к фактору роста кератиноцитов». J. Biol. Chem . 268 (8): 5388–94. PMID  7680645 .
  • Шуай К., Старк Г.Р., Керр И.М., Дарнелл Дж. Э. (1993). «Единственный фосфотирозиновый остаток Stat91, необходимый для активации гена гамма-интерфероном». Наука . 261 (5129): 1744–6. Bibcode : 1993Sci ... 261.1744S . DOI : 10.1126 / science.7690989 . PMID  7690989 .
  • Яаккола С., Салмикангас П., Нюлунд С. и др. (1993). «Амплификация гена fgfr4 при раке груди и гинекологии человека». Int. J. Рак . 54 (3): 378–82. DOI : 10.1002 / ijc.2910540305 . PMID  8099571 . S2CID  19513080 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Райх-Слотки Р., Шауль Э., Берман Б. и др. (1996). «Химерные молекулы между фактором роста кератиноцитов и основным фактором роста фибробластов определяют домены, которые придают специфичность связывания рецептора» . J. Biol. Chem . 270 (50): 29813–8. DOI : 10.1074 / jbc.270.50.29813 . PMID  8530375 .
  • Вайникка С., Жуков В., Клинт П., Алитало К. (1996). «Ассоциация серинкиназы массой 85 кДа с активированным рецептором-4 фактора роста фибробластов» . J. Biol. Chem . 271 (3): 1270–3. DOI : 10.1074 / jbc.271.3.1270 . PMID  8576110 .
  • Каптейн А., Пайяр В., Сондерс М. (1996). «Доминантно-отрицательный мутант stat3 ингибирует индуцированную интерлейкином-6 передачу сигнала Jak-STAT» . J. Biol. Chem . 271 (11): 5961–4. DOI : 10.1074 / jbc.271.11.5961 . PMID  8626374 .
  • Орниц Д.М., Сюй Дж., Колвин Дж. С. и др. (1996). «Рецепторная специфичность семейства факторов роста фибробластов» . J. Biol. Chem . 271 (25): 15292–7. DOI : 10.1074 / jbc.271.25.15292 . PMID  8663044 .
  • Аньес Ф, Ту ММ, Андре С, Галиберт Ф (1997). «Геномная организация внеклеточной кодирующей области генов FGFR4 и FLT4 человека: эволюция генов, кодирующих рецепторные тирозинкиназы с иммуноглобулин-подобными доменами». J. Mol. Evol . 45 (1): 43–9. Bibcode : 1997JMolE..45 ... 43A . DOI : 10.1007 / PL00006199 . PMID  9211733 . S2CID  34208733 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FGFR4 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .