• Связывание ДНК • Последовательно-специфичное связывание ДНК • Связывание со-SMAD • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Активность коактиватора транскрипции GO: 0001105 • Связывание иона цинка • фактор транскрипции связывание • хроматина связывания • активации связывания фактора транскрипции • ион металла связывания • GO: 0001948 связывание белка • ГО: 0001158 основной промотор проксимальная область ДНК последовательность-специфическое связывание • ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий активность фактора транскрипции , РНК-полимераза II-специфическая • РНК - полимераза регуляторной области последовательности специфических ДНК - II , связывание • РНК - полимераза II транскрипция фактора связывания • ГО: 0001077, ГО: 0001212, ГО: 0001213, ГО: 0001211, ГО: 0001205 ДНК-связывающий активатор активность транскрипции, РНК - полимераза II-специфический • Связывание с протеинкиназой • Связывание с белками NFAT • GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II Связывание ДНК, специфичное для последовательности
Сотовый компонент
• нуклеоплазма • комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II • ядро клетки • ядерное тело
Биологический процесс
• развитие энтодермы • развитие гонад мужчины • регуляция транскрипции ДНК-шаблонный • желудочковой перегородки развития • рост клеток участвует в развитии сердечной мышечной клетки • эмбриональной передней кишки морфогенез • эндокарда развитие подушки • сердечной дифференцировки мышечных клеток • сигнализации клетка-клетка • ответ на механическое стимул • свертывание крови • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция ангиогенеза • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • петля сердца • морфогенез межпредсердной перегородки • ответ на витамин А • регуляция сокращения клеток сердечной мышцы • морфогенез вторичной перегородки предсердий • морфогенез первичной перегородки предсердий • дифференцировка эпителиальных клеток кишечника • передний / задний паттерн эмбриональной сердечной трубки спецификация • позитивная регуляция сигнального пути BMP • позитивная регуляция дифференцировки кардиобластов • позитивная регуляция продукции фактора роста эндотелия сосудов • отрицательная регуляция аутофагии • морфогенез сердечного желудочка • морфогенез правого желудочка сердца • ответ на лекарство • клеточный ответ на стимул глюкозы • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • трансдифференцировка • морфогенез аортального клапана • развитие сердца • морфогенез органов животных • гистогенез • клетки развитие • формирование анатомической структуры, участвующее в морфогенезе • развитие пищеварительного тракта • развитие ткани сердечной мышцы • формирование атриовентрикулярного клапана • негативная регуляция апоптотического процесса клеток сердечной мышцы • регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • регенерация ткани сердечной мышцы • позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • негативная регуляция гибели клеток, вызванной окислительным стрессом • негативная регуляция сигнального пути апоптоза
Фактор транскрипции GATA4 является белком , который в организме человека кодируется GATA4 геном . [5]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Формирование атриовентрикулярного клапана
3 взаимодействия
4 Клиническая значимость
5 См. Также
6 Ссылки
7 Дальнейшее чтение
8 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует член семейства факторов транскрипции « цинковые пальцы» GATA . Члены этого семейства узнают мотив GATA, который присутствует в промоторах многих генов. Считается, что этот белок регулирует гены, участвующие в эмбриогенезе, а также в дифференцировке и функции миокарда. Мутации в этом гене были связаны с дефектами сердечной перегородки, а также с дефектами репродукции. [6] [7]
GATA4 является критическим фактором транскрипции для правильного сердечного развития млекопитающих и необходим для выживания эмбриона. GATA4 работает в сочетании с другими важными факторами сердечной транскрипции, такими как Nkx2-5 и Tbx5. GATA4 экспрессируется как в кардиомиоцитах эмбриона, так и в кардиомиоцитах взрослых, где он функционирует как регулятор транскрипции для многих сердечных генов, а также регулирует гипертрофический рост сердца. [8] GATA4 способствует морфогенезу сердца, выживанию кардиомиоцитов и поддерживает сердечную функцию во взрослом сердце. [8]Мутации или дефекты в гене GATA4 могут привести к множеству сердечных проблем, включая врожденные пороки сердца, аномальное вентральное складывание и дефекты сердечной перегородки, разделяющей предсердия и желудочки, а также гипоплазию миокарда желудочков. [9] Как видно из отклонений от делеции GATA4, он важен для формирования сердца и выживания эмбриона во время внутриутробного развития. [10]
GATA4 важен не только для сердечного развития, но также для развития и функции плодных яичников млекопитающих и вносит вклад в развитие мужских гонад у плода, а мутации могут приводить к дефектам репродуктивного развития. Также было обнаружено, что GATA4 играет важную роль в контроле ранних стадий развития поджелудочной железы и печени. [11]
GATA4 регулируется путем аутофагии-лизосомы в эукариотических клетках. При клеточном старении ATM и ATR ингибируют p62, адаптер аутофагии, ответственный за избирательную аутофагию GATA4. Ингибирование p62 приводит к увеличению уровней GATA4, что приводит к активации NF-kB и последующей индукции SASP . [12] [13]
Формирование атриовентрикулярного клапана [ править ]
Экспрессия GATA4 во время развития сердца, как было показано, важна для правильного формирования и функции атриовентрикулярных (АВ). [14] Эндокардиальные клетки претерпевают переходы от эпителия к мезенхиме (EMT) в атриовентрикулярные подушки во время развития. Их пролиферация и слияние приводят к разделению входа в желудочек на два разных прохода с двумя AV-клапанами, и считается, что они находятся под влиянием фактора транскрипции GATA4. [14] Инактивация GATA4 у GATA4-нулевых мышей приводит к подавлению регуляции Erbb3 и изменению экспрессии Erk, двух других важных молекул в EMT и разделении входных отверстий желудочков. [14]Было показано, что это приводит к перикардиальному выпоту и периферическому кровотечению у мышей E12.5, которые умирают из-за сердечной недостаточности до отъема от груди. [14] Эти данные могут иметь важное значение для медицины человека, предполагая, что мутации фактора транскрипции GATA4 могут быть ответственны за дефекты атриовентрикулярной подушки у людей с неправильным формированием перегородки, ведущие к врожденным порокам сердца. [14]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что GATA4 взаимодействует с NKX2-5 , [15] [16] [17] TBX5 , [18] Сывороточный фактор ответа [19] [20] HAND2 , [21] и HDAC2 . [22]
Также было показано, что GATA4 взаимодействует с Erbb3, FOG-1 и FOG-2. [14]
Клиническая значимость [ править ]
Мутации в этом гене были связаны со случаями врожденной диафрагмальной грыжи . [23] Дефекты межпредсердной перегородки, тетралгия Фалло и дефекты межжелудочковой перегородки, связанные с мутацией GATA4, также наблюдались у пациентов из Южной Индии. [24]
См. Также [ править ]
Фактор транскрипции GATA
Ссылки [ править ]
^ a b c ENSG00000285109 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000136574, ENSG00000285109 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021944 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ White RA, Dowler LL, Pasztor LM, Gatson LL, Adkison LR, Angeloni SV, Wilson DB (октябрь 1995 г.). «Присвоение гена фактора транскрипции GATA4 хромосоме 8 человека и хромосоме 14 мыши: Gata4 является геном-кандидатом для Ds (дезорганизация)». Геномика . 27 (1): 20–6. DOI : 10.1006 / geno.1995.1003 . PMID 7665171 .
^ "Entrez Gene: GATA4 GATA связывающий белок 4" .
^ Кёлер Б., Линь Л., Ферраз-де-Соуза Б., Виккер П., Хайдеманн П., Шредер В., Биберманн Н., Шнабель Д., Грютерс А., Ахерманн Дж. К. (январь 2008 г.). «Пять новых мутаций стероидогенного фактора 1 (SF1, NR5A1) у 46 пациентов XY с тяжелой недорандрогенизацией, но без надпочечниковой недостаточности» . Гм. Мутат . 29 (1): 59–64. DOI : 10.1002 / humu.20588 . PMC 2359628 . PMID 17694559 .
^ a b [Перрино, Чинция и Рокман, Говард А. GATA4 и две стороны перепрограммирования экспрессии генов. 2006. Circulation Research , 98: 837-845.]
^ Black BL, McCulley DJ. «Пути факторов транскрипции и врожденные пороки сердца. 2012». Актуальные темы биологии развития . 100 : 253–277.
^ Чжоу П. и др. (2012). «Регулирование транскрипционной активности GATA4 при сердечно-сосудистых заболеваниях и развитии. 2012». Актуальные темы биологии развития . 100 : 143–169. DOI : 10.1016 / B978-0-12-387786-4.00005-1 . PMID 22449843 .
^ [Перрино, Чинция и Рокман, Говард А. GATA4 и две стороны репрограммирования экспрессии генов. 2006. Circulation Research , 98: 837-845]
Перейти ↑ Cao X, Li M (2015). «Новый путь регуляции старения» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 13 (6): 333–335. DOI : 10.1016 / j.gpb.2015.11.002 . PMC 4747646 . PMID 26777575 .
^ Кан С, Сюй О, Мартином ТД, Ли М.З., Демария М, Арон л, Л Т, Yankner Б.А., Campisi J, SJ Elledge (2015). «Реакция на повреждение ДНК вызывает воспаление и старение, подавляя аутофагию GATA4» . Наука . 349 (6255): ааа5612. DOI : 10.1126 / science.aaa5612 . PMC 4942138 . PMID 26404840 .
^ a b c d e f Ривера-Феличиано, Хосе; Кю-Хо Ли; Сек Вон Конг; Сатиш Раджагопал; Цин Ма; Zhangli Springer; Сейго Идзумо; Клиффорд Дж. Табин; Уильям Т. Пу (15 сентября 2006 г.). «Развитие сердечных клапанов требует экспрессии GATA4 в эндотелиальных клетках» . Развитие . 133 (18): 3607–3618. DOI : 10.1242 / dev.02519 . PMC 2735081 . PMID 16914500 .
^ Garg V, Kathiriya IS, Barnes R, Schluterman MK, King IN, Butler CA, Rothrock CR, Ипен RS, Хираяма-Ямада K, Joo K, Мацуока R, Cohen JC, Шривастава D (июль 2003). «Мутации GATA4 вызывают врожденные пороки сердца человека и обнаруживают взаимодействие с TBX5». Природа . 424 (6947): 443–7. Bibcode : 2003Natur.424..443G . DOI : 10,1038 / природа01827 . PMID 12845333 . S2CID 4304709 .
^ Чжу Вт, Shiojima я, Hiroi Y, Цзоу Y, Аказава Н, Мидзуками М, токо Н, Язаки Y, R Нагаи, Комуро I (ноябрь 2000 года). «Функциональный анализ трех мутаций Csx / Nkx-2.5, вызывающих врожденные пороки сердца человека» . J. Biol. Chem . 275 (45): 35291–6. DOI : 10.1074 / jbc.M000525200 . PMID 10948187 .
Перейти ↑ Svensson EC, Tufts RL, Polk CE, Leiden JM (февраль 1999 г.). «Молекулярное клонирование FOG-2: модулятор фактора транскрипции GATA-4 в кардиомиоцитах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (3): 956–61. Bibcode : 1999PNAS ... 96..956S . DOI : 10.1073 / pnas.96.3.956 . PMC 15332 . PMID 9927675 .
Перейти ↑ Morin S, Paradis P, Aries A, Nemer M (февраль 2001 г.). «Сывороточный фактор ответа-GATA тройной комплекс, необходимый для ядерной передачи сигналов рецептором, связанным с G-белком» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1036–44. DOI : 10.1128 / MCB.21.4.1036-1044.2001 . PMC 99558 . PMID 11158291 .
^ Dai Ю.С., Cserjesi P, Маркхэй BE, Molkentin JD (июль 2002). «Факторы транскрипции GATA4 и dHAND физически взаимодействуют, чтобы синергетически активировать экспрессию сердечных генов через p300-зависимый механизм» . J. Biol. Chem . 277 (27): 24390–8. DOI : 10.1074 / jbc.M202490200 . PMID 11994297 .
^ Триведи CM, Чжу В., Ван Q, Цзя С., Ки Х. Дж., Ли Л., Ханненхалли С., Эпштейн Дж. А. (сентябрь 2010 г.). «Hopx и Hdac2 взаимодействуют, чтобы модулировать ацетилирование Gata4 и пролиферацию эмбриональных сердечных миоцитов» . Dev. Cell . 19 (3): 450–9. DOI : 10.1016 / j.devcel.2010.08.012 . PMC 2947937 . PMID 20833366 . Краткое содержание - Phys.Org .
^ Mattapally S, Низамуддин S, Мурти KS, Thangaraj K, Банерджи SK (декабрь 2015). «Мутация c.620C> T в GATA4 связана с врожденным пороком сердца в Южной Индии» . BMC Med. Genet . 16 (1): 7. DOI : 10,1186 / s12881-015-0152-7 . PMC 4422155 . PMID 25928801 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Эванс Т., Райтман М., Фельзенфельд Г. (1988). «ДНК-связывающий фактор, специфичный для эритроцитов, распознает регуляторную последовательность, общую для всех генов куриного глобина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 85 (16): 5976–80. Bibcode : 1988PNAS ... 85.5976E . DOI : 10.1073 / pnas.85.16.5976 . PMC 281888 . PMID 3413070 .
Хуанг В.Й., Цукерман Э., Лью С.К. (1995). «Идентификация мотива GATA в гене, кодирующем тяжелую цепь сердечного альфа-миозина, и выделение кДНК GATA-4 человека». Джин . 155 (2): 219–23. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 00893-W . PMID 7721094 .
Ямагата Т., Нишида Дж., Сакаи Р. и др. (1995). «Из GATA-связывающих белков только GATA-4 селективно регулирует промотор гена интерлейкина-5 человека в продуцирующих интерлейкин-5 клетках, которые экспрессируют несколько GATA-связывающих белков» . Мол. Клетка. Биол . 15 (7): 3830–9. DOI : 10,1128 / MCB.15.7.3830 . PMC 230622 . PMID 7791790 .
Арчечи Р.Дж., Кинг А.А., Саймон М.К. и др. (1993). «GATA-4 мыши: индуцируемый ретиноевой кислотой GATA-связывающий фактор транскрипции, экспрессируемый в тканях, происходящих из энтодермы, и в сердце» . Мол. Клетка. Биол . 13 (4): 2235–46. DOI : 10,1128 / MCB.13.4.2235 . PMC 359544 . PMID 8455608 .
Хуанг В.Й., Хенг Х.Х., Лью С.К. (1997). «Отнесение гена GATA4 человека к 8p23.1 → p22 с использованием флуоресцентного анализа гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet . 72 (2–3): 217–8. DOI : 10.1159 / 000134194 . PMID 8978781 .
Херциг Т.С., Джобе С.М., Аоки Х. и др. (1997). «Экспрессия гена рецептора ангиотензина II типа 1a в сердце: AP-1 и GATA-4 участвуют в реакции на перегрузку давлением» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (14): 7543–8. Bibcode : 1997PNAS ... 94.7543H . DOI : 10.1073 / pnas.94.14.7543 . PMC 23858 . PMID 9207128 .
Дюроше Д., Чаррон Ф., Уоррен Р. и др. (1997). «Факторы сердечной транскрипции Nkx2-5 и GATA-4 являются взаимными кофакторами» . EMBO J . 16 (18): 5687–96. DOI : 10.1093 / emboj / 16.18.5687 . PMC 1170200 . PMID 9312027 .
Молькентин Дж. Д., Лу Дж. Р., Антос К. Л. и др. (1998). «Зависимый от кальциневрина путь транскрипции для сердечной гипертрофии» . Cell . 93 (2): 215–28. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81573-1 . PMC 4459646 . PMID 9568714 .
Свенссон ЕС, Тафтс Р.Л., Полк С.Е., Лейден Дж. М. (1999). «Молекулярное клонирование FOG-2: модулятор фактора транскрипции GATA-4 в кардиомиоцитах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (3): 956–61. Bibcode : 1999PNAS ... 96..956S . DOI : 10.1073 / pnas.96.3.956 . PMC 15332 . PMID 9927675 .
Tremblay JJ, Viger RS (1999). «Фактор транскрипции GATA-4 усиливает транскрипцию гена мюллерова ингибирующего вещества посредством прямого взаимодействия с ядерным рецептором SF-1». Мол. Эндокринол . 13 (8): 1388–401. DOI : 10,1210 / me.13.8.1388 . PMID 10446911 .
Лин Л., Аггарвал С., Гловер Т.В. и др. (2000). «Минимальная критическая область ампликона 8p22-23 в аденокарциномах пищевода, определенная с помощью картирования участка-амплификации с меткой последовательностей и количественной полимеразной цепной реакции, включает ген GATA-4». Cancer Res . 60 (5): 1341–7. PMID 10728696 .
Чжу В., Сиодзима И., Хирои Ю. и др. (2001). «Функциональный анализ трех мутаций Csx / Nkx-2.5, вызывающих врожденные пороки сердца человека» . J. Biol. Chem . 275 (45): 35291–6. DOI : 10.1074 / jbc.M000525200 . PMID 10948187 .
Белагули Н.С., Сепульведа Дж. Л., Нигам В. и др. (2000). «Факторы, обогащенные сердечной тканью, сывороточный фактор ответа и GATA-4 являются взаимными корегуляторами» . Мол. Клетка. Биол . 20 (20): 7550–8. DOI : 10.1128 / MCB.20.20.7550-7558.2000 . PMC 86307 . PMID 11003651 .
Морин С., Паради П., Овен А., Немер М. (2001). «Сывороточный фактор ответа-GATA тройной комплекс, необходимый для ядерной передачи сигналов рецептором, связанным с G-белком» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1036–44. DOI : 10.1128 / MCB.21.4.1036-1044.2001 . PMC 99558 . PMID 11158291 .
Криспино Дж. Д., Лодиш М. Б., Турберг Б. Л. и др. (2001). «Правильное развитие коронарных сосудов и морфогенез сердца зависят от взаимодействия GATA-4 с кофакторами FOG» . Genes Dev . 15 (7): 839–44. DOI : 10,1101 / gad.875201 . PMC 312667 . PMID 11297508 .
Дай Ю.С., Маркхэм Б.Э. (2001). «p300 Функционирует как коактиватор фактора транскрипции GATA-4» . J. Biol. Chem . 276 (40): 37178–85. DOI : 10.1074 / jbc.M103731200 . PMID 11481322 .
Лян Кью, Визе Р.Дж., Буэно О.Ф. и др. (2001). «Фактор транскрипции GATA4 активируется посредством регулируемого внеклеточным сигналом киназы 1- и 2-опосредованного фосфорилирования серина 105 в кардиомиоцитах» . Мол. Клетка. Биол . 21 (21): 7460–9. DOI : 10.1128 / MCB.21.21.7460-7469.2001 . PMC 99918 . PMID 11585926 .
Внешние ссылки [ править ]
GATA4 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P43694 (фактор транскрипции GATA-4) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора