• цитоплазма • цитозоль • Гольджи • миелиновой оболочки • посредине тела • нейрон проекции • аксона • нейрональные клетки тела • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• Передача сигнала белка Rab • ответ на ион кальция • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • негативная регуляция аксоногенеза • негативная регуляция нацеливания белка на мембрану • белок транспорт • ГО: 0048552 регуляция каталитической активности • регулирование малого GTPase опосредованной сигнальной трансдукции • трансдукции сигнала • малая трансдукции ГТФаза опосредованного сигнала • положительное регулирование расширения аксонов • везикулы-опосредованный транспорт
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
2664
14567
Ансамбль
ENSG00000203879
ENSMUSG00000015291
UniProt
P31150
P50396
RefSeq (мРНК)
NM_001493
NM_010273
RefSeq (белок)
NP_001484
NP_034403
Расположение (UCSC)
Chr X: 154,44 - 154,44 Мб
Chr X: 74,3 - 74,31 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Rab ВВП ингибитор альфа - диссоциации является белком , который в организме человека кодируется GDI1 геном . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Ингибиторы диссоциации GDP представляют собой белки, которые регулируют реакцию обмена GDP-GTP членов семейства rab, небольшие GTP-связывающие белки суперсемейства ras, которые участвуют в везикулярном переносе молекул между клеточными органеллами. GDI замедляют скорость отделения GDP от кроличьих белков и высвобождают GDP из мембраносвязанных кроликов. GDI1 экспрессируется главным образом в нервных и сенсорных тканях. Мутации в GDI1 были связаны с Х-сцепленной неспецифической умственной отсталостью. [7]
Rab GTPases циклически перемещаются между цитозольным компартментом, где он связан с белком, называемым GDI (ингибитор диссоциации GDP), и мембраной, где он взаимодействует с рецептором, фактором обмена нуклеотидов, GAP (GTPase Activating Protein) и, возможно, другими факторами. которые связывают его с соответствующим SNARE. GDI неспецифичен по отношению к кролику, которого он связывает. Однако обменник, рецептор и GAP являются Rab-специфичными.
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что GDI1 взаимодействует с CDC42 . [8]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000203879 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015291 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бахнер D, Z Седлачек, Корн В, Hameister Н, Poustka А (сентябрь 1995). «Паттерны экспрессии двух генов человека, кодирующих различные ингибиторы GDP-диссоциации кролика (GDI), чрезвычайно консервативных белков, участвующих в клеточном транспорте». Гм. Мол. Genet . 4 (4): 701–8. DOI : 10.1093 / HMG / 4.4.701 . PMID 7543319 .
^ Седлачек Z, Konecki DS, Korn B, Klauck С.М., Poustka A (октябрь 1994). «Эволюционная консервация и геномная организация XAP-4, локализованного в Xq28 гена, кодирующего человеческий ингибитор GDP-диссоциации кролика (GDI)». Геном млекопитающих . 5 (10): 633–9. DOI : 10.1007 / BF00411459 . PMID 7849400 .
^ «Энтрез Ген: ингибитор диссоциации GDI1 GDP 1» .
^ Gibson RM, Wilson-Delfosse AL (октябрь 2001). «RhoGDI-дефектный по связыванию мутант Cdc42Hs нацеливается на мембраны и активирует образование филоподий, но не участвует в цикле с цитозолем клеток млекопитающих» . Биохим. Дж . 359 (Pt 2): 285–94. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3590285 . PMC 1222146 . PMID 11583574 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Calinisan V, Gravem D, Chen RP, Brittin S, Mohandas N, Lecomte MC, Gascard P (2006). «Новые сведения о потенциальных функциях суперсемейства белков 4.1 в эпителии почек» . Фронт. Biosci . 11 : 1646–66. DOI : 10.2741 / 1911 . PMID 16368544 .
Расмуссен Х. Х., ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж. Э., Вандекеркхов Дж. (1992). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. DOI : 10.1002 / elps.11501301199 . PMID 1286667 .
Мацуи Ю., Кикучи А., Араки С., Хата Ю., Кондо Дж., Тераниши Ю., Такай Ю. (1990). «Молекулярное клонирование и характеристика нового типа регуляторного белка (GDI) для smg p25A, ras p21-подобного GTP-связывающего белка» . Мол. Клетка. Биол . 10 (8): 4116–22. DOI : 10.1128 / mcb.10.8.4116 . PMC 360933 . PMID 2115118 .
Шишева А., Südhof TC, Чешский депутат (1994). «Клонирование, характеристика и экспрессия новой изоформы ингибитора диссоциации GDP из скелетных мышц» . Мол. Клетка. Биол . 14 (5): 3459–68. DOI : 10.1128 / mcb.14.5.3459 . PMC 358710 . PMID 7513052 .
Нисимура Н., Годжи Дж., Накамура Х., Орита С., Такай Й., Сано К. (1995). «Клонирование изоформы человеческого Rab GDI и ее экспрессия в клеточных линиях нейробластомы человека и образцах опухолей». Cancer Res . 55 (22): 5445–50. PMID 7585614 .
Шапиро А.Д., Пфеффер С.Р. (1995). «Количественный анализ взаимодействий между пренилом Rab9, ингибитором диссоциации GDP-альфа и гуаниновыми нуклеотидами» . J. Biol. Chem . 270 (19): 11085–90. DOI : 10.1074 / jbc.270.19.11085 . PMID 7744738 .
Беранже Ф., Кадвалладер К., Порфири Э., Пауэрс С., Эванс Т., де Гинцбург Дж., Хэнкок Дж. Ф. (1994). «Определение структурных требований для взаимодействия Rab6 с RabGDI и Rab геранилгеранилтрансферазой». J. Biol. Chem . 269 (18): 13637–43. PMID 8175798 .
Sedlacek Z, Korn B, Konecki DS, Siebenhaar R, Coy JF, Kioschis P, Poustka A (1993). «Построение транскрипционной карты области размером 300 т.п.н. вокруг локуса человеческого G6PD путем прямого отбора кДНК». Гм. Мол. Genet . 2 (11): 1865–189. DOI : 10,1093 / hmg / 2.11.1865 . PMID 8281148 .
Хэнкок Дж. Ф., зал А (1993). «Новая роль RhoGDI как ингибитора белков GAP» . EMBO J . 12 (5): 1915–21. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05840.x . PMC 413412 . PMID 8491184 .
Chen EY, Zollo M, Mazzarella R, Ciccodicola A, Chen CN, Zuo L, Heiner C, Burough F, Repetto M, Schlessinger D, D'Urso M (1996). «Анализ дальнейших последовательностей в Xq28: тринадцать известных и шесть генов-кандидатов в 219,4 т.п.н. ДНК с высоким содержанием GC между локусами RCP / GCP и G6PD» . Гм. Мол. Genet . 5 (5): 659–68. DOI : 10.1093 / HMG / 5.5.659 . PMID 8733135 .
Hamel BC, Kremer H, Wesby-van Swaay E, van den Helm B, Smits AP, Oostra BA, Ropers HH, Mariman EC (1996). «Ген неспецифической X-связанной умственной отсталости (MRX41) расположен в дистальном сегменте Xq28». Являюсь. J. Med. Genet . 64 (1): 131–3. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19960712) 64: 1 <131 :: AID-AJMG22> 3.0.CO; 2-N . hdl : 2066/23576 . PMID 8826463 .
Уилсон А.Л., Шеридан К.М., Эрдман Р.А., Мальтийский штат Вашингтон (1996). «Пренилирование мутанта Rab1B с измененной активностью GTPase нарушается в бесклеточных системах, но не в интактных клетках млекопитающих» . Биохим. Дж . 318 (3): 1007–14. DOI : 10.1042 / bj3181007 . PMC 1217717 . PMID 8836150 .
des Portes V, Billuart P, Carrié A, Bachner L, Bienvenu T, Vinet MC, Beldjord C, Ponsot G, Kahn A, Boué J, Chelly J (1997). «Ген доминантной неспецифической Х-связанной умственной отсталости находится в Xq28» . Являюсь. J. Hum. Genet . 60 (4): 903–9. PMC 1712488 . PMID 9106537 .
Горвел Дж. П., Чанг Т. С., Боретто Дж., Адзума Т., Шаврие П. (1998). «Отличительные свойства D4 / LyGDI по сравнению с RhoGDI: фосфорилирование и селективность rho GTPase». FEBS Lett . 422 (2): 269–73. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 00020-9 . PMID 9490022 .
Д'Адамо П., Менегон А., Ло Нигро С., Грассо М., Гулисано М., Таманини Ф, Бьенвену Т., Гедеон А. К., Оостра Б., Ву С. К., Тандон А., Валторта Ф, Балч В. Е., Челли Дж., Тониоло Д. (1998) . «Мутации в GDI1 ответственны за Х-сцепленную неспецифическую умственную отсталость». Nat. Genet . 19 (2): 134–9. DOI : 10,1038 / 487 . PMID 9620768 .
Бьенвеню Т., де Портес В., Сен-Мартен А., МакДонелл Н., Биллуарт П., Карри А., Винет М.С., Куверт П., Тониоло Д., Роперс Х. Х., Морейн С., ван Боховен Х., Фринс Дж. П., Кан А., Бельджорд С., Челли Дж. (1998). «Неспецифическая Х-сцепленная полудоминантная умственная отсталость в результате мутаций в ингибиторе диссоциации Rab GDP» . Гм. Мол. Genet . 7 (8): 1311–5. DOI : 10.1093 / HMG / 7.8.1311 . PMID 9668174 .
Ван М., Франк У. (1998). «Оценка двух генов-кандидатов Х-хромосомы для синдрома Ретта: глутаматдегидрогеназа-2 (GLUD2) и ингибитор GDP-диссоциации кролика (GDI1)». Являюсь. J. Med. Genet . 78 (2): 169–72. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19980630) 78: 2 <169 :: AID-AJMG14> 3.0.CO; 2-L . PMID 9674910 .
Хатт Д.М., Да-Силва Л.Ф., Чанг Л.Х., Проссер Д.К., Нгзее Дж. К. (2000). «PRA1 ингибирует экстракцию мембраносвязанной GTPase Rab с помощью GDI1» . J. Biol. Chem . 275 (24): 18511–9. DOI : 10.1074 / jbc.M909309199 . PMID 10751420 .
