GGA1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1J2J , 1JWF , 1JWG , 1NA8 , 1NAF , 1NWM , 1O3X , 1OM9 , 1OXZ , 1PY1 , 1UJJ , 1UJK , 1X79 , 2DWX , 2DWY , 3G2S , 3G2T , 3G2U , 3G2V , 3G2W

Идентификаторы

Псевдонимы

GGA1 , связанный с Гольджи, гамма-адаптин ухо, содержащий, ARF-связывающий белок 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 606004 MGI : 2146207 HomoloGene : 39250 GeneCards : GGA1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 22 (человека) ^[1]

Группа	22q13.1	Начинать	37 608 725 п.н. ^[1]
Группа	22q13.1	Конец	37 633 564 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 15 (мышь) ^[2]

Группа	15 \| 15 E1	Начинать	78 877 190 п.н. ^[2]
Группа	15 \| 15 E1	Конец	78 894 585 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание с белками GO: 0001948 • Связывание с фактором ADP-рибозилирования • активность в отношении гетеродимеризации белков • молекулярная функция
Сотовый компонент	• эндосома • аппарат Гольджи • мембрана эндосомы • внутриклеточная • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • клатриновый адаптерный комплекс • нуклеоплазма • ранняя мембрана эндосомы • ранняя эндосома • цитозоль • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• транспортирование белка • клеточный процесс белка метаболические • внутриклеточный белок транспорт • Токсин транспорт • положительное регулирование процесса катаболического белка • везикулы-опосредованный транспорт • транспорт • Гольджи к плазматической мембранного транспорта • локализации белка • локализации белка клеточной поверхности • ретроградного транспорта, эндосома к Гольджи • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны • Локализация белка в цилиарной мембране
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


26088


106039

Ансамбль


ENSG00000100083


ENSMUSG00000033128

UniProt


Q9UJY5


Q8R0H9

RefSeq (мРНК)

NM_001001560 NM_001001561 NM_001172687 NM_001172688 NM_013365
NM_001363771


NM_145929

RefSeq (белок)


NP_001001560 NP_001166158 NP_001166159 NP_037497 NP_001350700


NP_666041

Расположение (UCSC)

Chr 22: 37.61 - 37.63 Мб

Chr 15: 78,88 - 78,89 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

АДФ-рибозилирование фактор-связывающий белок GGA1 представляет собой белок , который у человека кодируется GGA1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Этот ген кодирует члена семейства ARF-связывающих (GGA) белков, локализованных по Гольджи, содержащих ухо гамма-адаптин. Члены этого семейства являются повсеместно распространенными белками оболочки, которые регулируют перемещение белков между транс- сетью Гольджи и лизосомой . Эти белки имеют общий амино-концевой домен VHS, который опосредует сортировку маннозо-6-фосфатных рецепторов в транс-сети Гольджи. Они также содержат карбокси-концевую область, гомологичную ушному домену гамма-адаптинов. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GGA1 взаимодействует с сортилином 1 , ^[9] BACE2 , ^[10] RABEP1 ^[11] и ARF3 . ^[12]^[13]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100083 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033128 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (май 2000 г.). «Семейство белков с гамма-адаптином и доменами VHS, которые способствуют перемещению между сетью транс-Гольджи и вакуолью / лизосомой» . J Cell Biol . 149 (1): 67–80. DOI : 10,1083 / jcb.149.1.67 . PMC 2175106 . PMID 10747088 .
^ Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Агилар RC, Варгас JD, Hartnell Л.М., Bonifacino JS (май 2000). «GGAs: семейство белков, связывающих фактор рибозилирования АДФ, связанных с адаптерами и связанных с комплексом Гольджи» . J Cell Biol . 149 (1): 81–94. DOI : 10,1083 / jcb.149.1.81 . PMC 2175099 . PMID 10747089 .
↑ Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (март 2006 г.). «Внутриклеточное перемещение и секреция адипонектина зависит от везикул, покрытых GGA» . J Biol Chem . 281 (11): 7253–9. DOI : 10.1074 / jbc.M511313200 . PMID 16407204 .
^ «Ген Entrez: GGA1, связанный с Гольджи, содержащий гамма-адаптин, ARF-связывающий белок 1» .
^ Якобсен, Линда; Мэдсен Педер; Nielsen Morten S; Гераертс Вейнанд PM; Глиманн Йорген; Smit August B; Петерсен Клаус М (январь 2002 г.). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA». FEBS Lett . 511 (1–3): 155–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9 . ISSN 0014-5793 . PMID 11821067 .
↑ Он, Сянъюань; Чанг Ван-Пин; Кёльш Джеральд; Тан Джордан (июль 2002 г.). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2» . FEBS Lett . 524 (1–3): 183–7. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1 . ISSN 0014-5793 . PMID 12135764 .
^ Маттера, Рафаэль; Ариги Сесилия Н; Лодж Роберт; Зериал Марино; Бонифачино Хуан С (январь 2003 г.). «Двухвалентное взаимодействие GGA с комплексом Rabaptin-5-Rabex-5» . EMBO J . 22 (1): 78–88. DOI : 10,1093 / emboj / cdg015 . ISSN 0261-4189 . PMC 140067 . PMID 12505986 .
^ Боман, Аннетт L; Сало Пол Д; Хоглунд Мелисса Дж; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Жданкина Ольга (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействия АДФ-фактор рибозилирования (ARF) недостаточно для функции или локализации дрожжевого белка GGA» . Мол. Биол. Cell . 13 (9): 3078–95. DOI : 10.1091 / mbc.E02-02-0078 . ISSN 1059-1524 . PMC 124144 . PMID 12221117 .
^ Боман, AL; Zhang C j; Zhu X; Кан Р.А. (апрель 2000 г.). «Семейство эффекторов фактора ADP-рибозилирования, которые могут изменять мембранный транспорт через транс-Гольджи» . Мол. Биол. Cell . 11 (4): 1241–55. DOI : 10.1091 / mbc.11.4.1241 . ISSN 1059-1524 . PMC 14844 . PMID 10749927 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Данэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . DOI : 10.1038 / 990031 . PMID 10591208 .
Боман А.Л., Чжан С., Чжу Х, Кан Р.А. (2000). «Семейство эффекторов фактора ADP-рибозилирования, которые могут изменять мембранный транспорт через транс-Гольджи» . Мол. Биол. Cell . 11 (4): 1241–55. DOI : 10.1091 / mbc.11.4.1241 . PMC 14844 . PMID 10749927 .
Такацу Х, Йошино К., Накаяма К. (2000). «Адаптерный домен гомологии уха гамма, законсервированный в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 271 (3): 719–25. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2700 . PMID 10814529 .
Жданкина О., Стрэнд Н.Л., Редмонд Дж. М., Боман А. Л. (2001). «Белки GGA дрожжей взаимодействуют с GTP-связанным Arf и способствуют транспортировке через Гольджи». Дрожжи . 18 (1): 1–18. DOI : 10.1002 / 1097-0061 (200101) 18: 1 <1 :: АИД-YEA644> 3.0.CO; 2-5 . PMID 11124697 .
Пуэртоллано Р., Рандаццо П.А., Пресли Дж. Ф. и др. (2001). «GGAs способствуют ARF-зависимому рекрутированию клатрина в TGN». Cell . 105 (1): 93–102. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9 . PMID 11301005 .
Пуэртоллано Р., Агилар Р.К., Горшкова И. и др. (2001). «Сортировка маннозо-6-фосфатных рецепторов, опосредованных GGA». Наука . 292 (5522): 1712–6. Bibcode : 2001Sci ... 292.1712P . DOI : 10.1126 / science.1060750 . PMID 11387475 .
Такацу Х., Катох Й, Шиба Й, Накаяма К. (2001). «Гольджи-локализующийся домен гомологии уха гамма-адаптина, белки, связывающие фактор рибозилирования АДФ (GGA), взаимодействуют с кислыми дилейциновыми последовательностями в цитоплазматических доменах сортирующих рецепторов через их домены Vps27p / Hrs / STAM (VHS)» . J. Biol. Chem . 276 (30): 28541–5. DOI : 10.1074 / jbc.C100218200 . PMID 11390366 .
Якобсен Л., Мадсен П., Нильсен М.С. и др. (2002). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA». FEBS Lett . 511 (1–3): 155–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9 . PMID 11821067 .
Шиба Т., Такацу Х., Ноги Т. и др. (2002). «Структурная основа для распознавания последовательности кислотного кластера дилейцина GGA1». Природа . 415 (6874): 937–41. Bibcode : 2002Natur.415..937S . DOI : 10.1038 / 415937a . PMID 11859376 .
Такацу Х, Йошино К., Тода К., Накаяма К. (2002). «Белки GGA связываются с мембранами Гольджи посредством взаимодействия между их доменами GGAH и факторами ADP-рибозилирования» . Биохим. Дж . 365 (Pt 2): 369–78. DOI : 10.1042 / BJ20020428 . PMC 1222692 . PMID 11950392 .
Дорей Б., Брунс К., Гош П., Корнфельд С.А. (2002). «Аутоингибирование лиганд-связывающего сайта VHS-доменов GGA1 / 3 внутренним мотивом кислотный кластер-дилейцин» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (12): 8072–7. Bibcode : 2002PNAS ... 99.8072D . DOI : 10.1073 / pnas.082235699 . PMC 123022 . PMID 12060753 .
Он X, Чанг WP, Кёльш Дж, Тан Дж (2002). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2» . FEBS Lett . 524 (1–3): 183–7. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1 . PMID 12135764 .
Боман А.Л., Сало П.Д., Хауглунд М.Дж. и др. (2003). «Взаимодействия АДФ-фактор рибозилирования (ARF) недостаточно для функции или локализации дрожжевого белка GGA» . Мол. Биол. Cell . 13 (9): 3078–95. DOI : 10.1091 / mbc.E02-02-0078 . PMC 124144 . PMID 12221117 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Маттера Р., Ариги С. Н., Лодж Р. и др. (2003). «Двухвалентное взаимодействие GGA с комплексом Rabaptin-5-Rabex-5» . EMBO J . 22 (1): 78–88. DOI : 10,1093 / emboj / cdg015 . PMC 140067 . PMID 12505986 .
Миллс И.Г., Прэфке Г.Дж., Валлис Й. и др. (2003). «EpsinR: белок, взаимодействующий с AP1 / клатрином, участвующий в переносе везикул» . J. Cell Biol . 160 (2): 213–22. DOI : 10,1083 / jcb.200208023 . PMC 2172650 . PMID 12538641 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100083 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033128 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10747088-5] Перейти ↑ Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (май 2000 г.). «Семейство белков с гамма-адаптином и доменами VHS, которые способствуют перемещению между сетью транс-Гольджи и вакуолью / лизосомой» . J Cell Biol . 149 (1): 67–80. DOI : 10,1083 / jcb.149.1.67 . PMC 2175106 . PMID 10747088 .

[pmid10747089-6] Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Агилар RC, Варгас JD, Hartnell Л.М., Bonifacino JS (май 2000). «GGAs: семейство белков, связывающих фактор рибозилирования АДФ, связанных с адаптерами и связанных с комплексом Гольджи» . J Cell Biol . 149 (1): 81–94. DOI : 10,1083 / jcb.149.1.81 . PMC 2175099 . PMID 10747089 .

[pmid16407204-7] Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (март 2006 г.). «Внутриклеточное перемещение и секреция адипонектина зависит от везикул, покрытых GGA» . J Biol Chem . 281 (11): 7253–9. DOI : 10.1074 / jbc.M511313200 . PMID 16407204 .

[entrez-8] «Ген Entrez: GGA1, связанный с Гольджи, содержащий гамма-адаптин, ARF-связывающий белок 1» .

[pmid11821067-9] Якобсен, Линда; Мэдсен Педер; Nielsen Morten S; Гераертс Вейнанд PM; Глиманн Йорген; Smit August B; Петерсен Клаус М (январь 2002 г.). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA». FEBS Lett . 511 (1–3): 155–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9 . ISSN 0014-5793 . PMID 11821067 .

[pmid12135764-10] Он, Сянъюань; Чанг Ван-Пин; Кёльш Джеральд; Тан Джордан (июль 2002 г.). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2» . FEBS Lett . 524 (1–3): 183–7. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1 . ISSN 0014-5793 . PMID 12135764 .

[pmid12505986-11] Маттера, Рафаэль; Ариги Сесилия Н; Лодж Роберт; Зериал Марино; Бонифачино Хуан С (январь 2003 г.). «Двухвалентное взаимодействие GGA с комплексом Rabaptin-5-Rabex-5» . EMBO J . 22 (1): 78–88. DOI : 10,1093 / emboj / cdg015 . ISSN 0261-4189 . PMC 140067 . PMID 12505986 .

[pmid12221117-12] Боман, Аннетт L; Сало Пол Д; Хоглунд Мелисса Дж; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Жданкина Ольга (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействия АДФ-фактор рибозилирования (ARF) недостаточно для функции или локализации дрожжевого белка GGA» . Мол. Биол. Cell . 13 (9): 3078–95. DOI : 10.1091 / mbc.E02-02-0078 . ISSN 1059-1524 . PMC 124144 . PMID 12221117 .

[pmid10749927-13] Боман, AL; Zhang C j; Zhu X; Кан Р.А. (апрель 2000 г.). «Семейство эффекторов фактора ADP-рибозилирования, которые могут изменять мембранный транспорт через транс-Гольджи» . Мол. Биол. Cell . 11 (4): 1241–55. DOI : 10.1091 / mbc.11.4.1241 . ISSN 1059-1524 . PMC 14844 . PMID 10749927 .

[1]