Глипикан-1 представляет собой белка , который у человека кодируется GPC1 геном . [5] [6]
GPC1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | GPC1 , глипикан , глипикан 1 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 600395 MGI : 1194891 HomoloGene : 20477 GeneCards : GPC1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 2: 240,44 - 240,47 Мб | Chr 1: 92,83 - 92,86 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Гепарансульфатные протеогликаны клеточной поверхности состоят из ассоциированного с мембраной белкового ядра, замещенного переменным числом гепарансульфатных цепей. Члены глипикана о связанных интегральных мембранных протеогликанах семьи (захваты) содержат центральную часть белка , закрепленный в цитоплазматическую мембрану через гликозильную фосфатидилинозитол связи. Эти белки могут играть роль в контроле клеточного деления и регуляции роста. [6]
Взаимодействия
Было показано, что глипикан 1 взаимодействует с SLIT2 . [7]
Клиническое значение
Этот белок участвует в неправильном сворачивании нормальных прионных белков в клеточной мембране в инфекционную прионную форму. [8]
В 2015 году сообщалось, что присутствие этого белка в экзосомах крови пациентов позволяет обнаруживать рак поджелудочной железы на ранней стадии с абсолютной специфичностью и чувствительностью. [9] Однако этот вывод оспаривается. [10] и в более поздних обзорах потенциальных маркеров рака поджелудочной железы Глипикан 1 не упоминается. [11] [12]
Смотрите также
- Глипикан
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000063660 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034220 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Vermeesch JR, Mertens G, David G, Marynen P (июль 1995 г.). «Отнесение гена глипикана человека (GPC1) к 2q35-q37 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 25 (1): 327–9. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-C . PMID 7774946 .
- ^ а б «Энтрез Ген: GPC1 глипикан 1» .
- ^ Ронка Ф., Андерсен Дж. С., Паеч В., Марголис РУ (август 2001 г.). «Характеристика взаимодействия белка Slit с глипиканом-1» . J. Biol. Chem . 276 (31): 29141–7. DOI : 10.1074 / jbc.M100240200 . PMID 11375980 .
- ^ Тейлор Д.Р., Уайтхаус И.Дж., Хупер Н.М. (ноябрь 2009 г.). «Глипикан-1 опосредует как ассоциацию прионных белков с липидными рафтами, так и образование изоформ болезни» . PLOS Патогены . 5 (11): e1000666. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1000666 . PMC 2773931 . PMID 19936054 .
- ^ Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandez AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (июль 2015 г.) . «Глипикан-1 идентифицирует экзосомы рака и обнаруживает ранний рак поджелудочной железы» . Природа . 523 (7559): 177–82. DOI : 10,1038 / природа14581 . PMC 4825698 . PMID 26106858 .
- ^ Обсуждения на www.pubpeer.com; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888
- ^ Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (август 2017 г.). «Панель плазменных биомаркеров для выявления хирургически резектабельного рака поджелудочной железы на ранней стадии» . Журнал Национального института рака . 109 (8). DOI : 10,1093 / JNCI / djw341 . PMC 6059209 . PMID 28376184 .
- ^ Чанг Дж. К., Кундранда М. (март 2017 г.). «Новые диагностические и прогностические биомаркеры аденокарциномы поджелудочной железы» . Международный журнал молекулярных наук . 18 (3): 667. DOI : 10,3390 / ijms18030667 . PMC 5372679 . PMID 28335509 .
дальнейшее чтение
- Картикеян Л; Maurel P; Rauch U; и другие. (1992). «Клонирование главного протеогликана гепарансульфата из мозга и идентификация как крысиная форма глипикана». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 188 (1): 395–401. DOI : 10.1016 / 0006-291X (92) 92398-H . PMID 1417860 .
- Дэвид Джи; Lories V; Декок B; и другие. (1991). «Молекулярное клонирование закрепленного на фосфатидилинозите мембранного гепарансульфат протеогликана из фибробластов легких человека» . J. Cell Biol . 111 (6 Pt 2): 3165–76. DOI : 10,1083 / jcb.111.6.3165 . PMC 2116352 . PMID 2148568 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Suzuki Y; Ёситомо-Накагава К.; Маруяма К; и другие. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Kleeff J; Ishiwata T; Кумбасар А; и другие. (1998). «Гепарансульфат-протеогликан-1 на клеточной поверхности регулирует действие фактора роста в клетках карциномы поджелудочной железы и сверхэкспрессируется при раке поджелудочной железы человека» . J. Clin. Инвестируйте . 102 (9): 1662–73. DOI : 10.1172 / JCI4105 . PMC 509114 . PMID 9802880 .
- Генгринович С; Берман Б; Дэвид Джи; и другие. (1999). «Глипикан-1 представляет собой протеогликан, связывающий VEGF165, который действует как внеклеточный шаперон для VEGF165» . J. Biol. Chem . 274 (16): 10816–22. DOI : 10.1074 / jbc.274.16.10816 . PMID 10196157 .
- Liang Y; Annan RS; Carr SA; и другие. (1999). «Гомологи млекопитающих щелевого белка дрозофилы являются лигандами гепарансульфатного протеогликана глипикана-1 в головном мозге» . J. Biol. Chem . 274 (25): 17885–92. DOI : 10.1074 / jbc.274.25.17885 . PMID 10364234 .
- Шофилд КП, Галлахер Дж. Т., Дэвид Дж. (2000). «Экспрессия белков ядра протеогликана в строме костного мозга человека» . Biochem. Дж . 343 Pt 3 (3): 663–8. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3430663 . PMC 1220599 . PMID 10527946 .
- Каруманчи С.А.; Jha V; Рамчандран Р; и другие. (2001). «Глипиканы клеточной поверхности представляют собой рецепторы эндостатина с низким сродством» (PDF) . Мол. Cell . 7 (4): 811–22. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00225-8 . PMID 11336704 .
- Matsuda K; Маруяма Х; Guo F; и другие. (2001). «Глипикан-1 сверхэкспрессируется при раке груди человека и модулирует митогенные эффекты множества гепарин-связывающих факторов роста в клетках рака груди». Cancer Res . 61 (14): 5562–9. PMID 11454708 .
- Альварес К., Фадич Р., Брандан Е. (2002). «Расширенный синтез и дифференциальная локализация протеогликанов гепарансульфата при мышечной дистрофии Дюшенна». J. Cell. Биохим . 85 (4): 703–13. DOI : 10.1002 / jcb.10184 . hdl : 10533/173369 . PMID 11968010 . S2CID 20243469 .
- Дин К; Mani K; Cheng F; и другие. (2002). «Медь-зависимое авторасщепление гепарансульфата глипикан-1 оксидом азота, полученным из собственных нитрозотиолов» . J. Biol. Chem . 277 (36): 33353–60. DOI : 10.1074 / jbc.M203383200 . PMID 12084716 .
- Штраусберг Р.Л .; Feingold EA; Рябчик LH; и другие. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Бельтинг М; Mani K; Jönsson M; и другие. (2004). «Глипикан-1 является носителем для поглощения полиамина в клетках млекопитающих: основная роль оксида азота, производного от нитрозотиола» . J. Biol. Chem . 278 (47): 47181–9. DOI : 10.1074 / jbc.M308325200 . PMID 12972423 .
- Ота Т; Suzuki Y; Nishikawa T; и другие. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
- Watanabe N; Araki W; Чуйский DH; и другие. (2004). «Глипикан-1 как Abeta-связывающий HSPG в мозге человека: его локализация в доменах DIG и возможные роли в патогенезе болезни Альцгеймера». FASEB J . 18 (9): 1013–5. DOI : 10,1096 / fj.03-1040fje . PMID 15084524 . S2CID 83560098 .
- Ли Дж; Kleeff J; Kayed H; и другие. (2004). «Антисмысловая трансфекция глипикан-1 модулирует TGF-бета-зависимую передачу сигналов в клетках рака поджелудочной железы Colo-357». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 320 (4): 1148–55. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.06.063 . PMID 15249209 .
- Дэвис Э.Дж.; Блэкхолл Ф.Х .; Шанкс JH; и другие. (2005). «Распространение и клиническое значение протеогликанов гепарансульфата при раке яичников» . Clin. Cancer Res . 10 (15): 5178–86. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0103 . PMID 15297422 .