Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GRB7
Белок GRB7 PDB 1mw4.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3PQZ , 1MW4 , 1WGR , 2L4K , 2QMS , 4WWQ , 4X6S , 5EEL , 5EEQ , 5D0J

Идентификаторы
ПсевдонимыGRB7 , Entrez: 2886, рецептор фактора роста белок 7 связан
Внешние идентификаторыOMIM : 601522 MGI : 102683 HomoloGene : 3881 GeneCards : GRB7
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение GRB7
Геномное расположение GRB7
Группа17q12Начинать39 737 927 п.н. [1]
Конец39 747 291 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение GRB7
Геномное расположение GRB7
Группа11 D | 11 61,75 смНачинать98 446 394 п.н. [2]
Конец98 455 373 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белками GO: 0001948
• Связывание с фосфатидилинозитолом
• Идентичное связывание с белками
• Связывание РНК
• Связывание с протеинкиназой
• Связывание липидов
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• проекция клетки
• мембрана
• очаговая адгезия
• клеточная мембрана
• соединение клеток
• стрессовая гранула
Биологический процесс• негативная регуляция трансляции
• сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста
• позитивная регуляция миграции клеток
• миграция лейкоцитов
• сигнальная трансдукция
• сборка стрессовых гранул
• сигнальный путь ERBB2
• позитивная регуляция передачи сигнала
• ведение аксонов
• сигнальный путь инсулинового рецептора
• негативная регуляция сигнальный путь рецептора инсулина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2886

14786

Ансамбль

ENSG00000141738

ENSMUSG00000019312

UniProt

Q14451

Q03160

RefSeq (мРНК)

NM_001030002
NM_001242442
NM_001242443
NM_005310
NM_001330207

NM_010346

RefSeq (белок)

NP_001025173
NP_001229371
NP_001229372
NP_001317136
NP_005301

NP_034476

Расположение (UCSC)Chr 17: 39.74 - 39.75 МбChr 11: 98.45 - 98.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Рецептор фактора роста-связанный белок 7 , также известный как GRB7 , является белком , который в организме человека кодируется GRB7 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Продукт этого гена принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, которые, как известно, взаимодействуют с рядом рецепторных тирозинкиназ и сигнальных молекул. Этот ген кодирует белок, связывающий рецептор фактора роста, который взаимодействует с рецептором эпидермального фактора роста (EGFR) и рецепторами эфрина . Белок играет роль в сигнальном пути интегрина и миграции клеток, связываясь с киназой фокальной адгезии (FAK). Альтернативный сплайсинг приводит к множественным вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы , хотя к настоящему времени определена полноразмерная природа только двух вариантов. [5]

Клиническое значение [ править ]

GRB7 представляет собой адаптерный белок SH2-домена, который связывается с рецепторными тирозинкиназами и обеспечивает прямую внутриклеточную связь с протоонкогеном Ras . GRB7 человека расположен на длинном плече хромосомы 17 , рядом с протоонкогеном ERBB2 (псевдоним HER2 / neu ).

Эти два гена обычно коамплифицируются (присутствуют в избыточных копиях) при раке груди . GRB7 полагают, участвует в миграции [ править ] , хорошо известно, что чрезмерно выраженная в тестикулярной опухоли зародышевых клеток , рака пищевода и рака желудка .

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GRB7 взаимодействует с:

  • EPH рецептор B1 , [7]
  • Рецептор инсулина , [8]
  • ПТК2 , [9]
  • Протоонкоген RET , [10] и
  • Rnd1 [11]

Модельные организмы [ править ]

Модельные организмы использовались при изучении функции GRB7. Линия условно нокаутных мышей под названием Grb7 tm1b (EUCOMM) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [12] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [13] для определения эффектов делеции. [14] [15] [16] [17] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [18]

Фенотип мыши с нокаутом Grb7
Характерная чертаФенотип
Все данные доступны на сайте. [13] [18]
Лейкоциты периферической крови 6 недельОбычный
Гематология 6 недельОбычный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Обычный
Гомозиготная фертильностьОбычный
Масса телаОбычный
Неврологическое обследованиеОбычный
Сила захватаОбычный
ДисморфологияОбычный
Косвенная калориметрияОбычный
Тест толерантности к глюкозеОбычный
Слуховой ответ ствола мозгаОбычный
DEXAОбычный
Морфология глазаОбычный
Клиническая химияОбычный
Гематология 16 недельОбычный
Лейкоциты периферической крови 16 недельОбычный
Вес сердцаОбычный
Сальмонеллезная инфекцияОбычный
Функция цитотоксических Т-клетокОбычный
Иммунофенотипирование селезенкиОбычный
Иммунофенотипирование брыжеечных лимфатических узловОбычный
Иммунофенотипирование костного мозгаОбычный
Состав эпидермального иммунитетаОбычный
Тричурис ВызовОбычный

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000141738 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019312 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: белок 7, связанный с рецептором фактора роста GRB7» .
  6. ^ Танака S, Мори М, Акиёси Т, Танака У, Mafune К, жезлы JR, Sugimachi К (август 1998 г.). «Новый вариант человеческого Grb7 связан с инвазивной карциномой пищевода» . Журнал клинических исследований . 102 (4): 821–7. DOI : 10.1172 / JCI2921 . PMC 508945 . PMID 9710451 .  
  7. Перейти ↑ Han DC, Shen TL, Miao H, Wang B, Guan JL (ноябрь 2002 г.). «EphB1 связывается с Grb7 и регулирует миграцию клеток» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45655–61. DOI : 10.1074 / jbc.M203165200 . PMID 12223469 . 
  8. ^ KASUS-Якоби А, Березья В, Perdereau D, Girard J, Burnol АФ (апрель 2000 г.). «Доказательства взаимодействия между рецептором инсулина и Grb7. Роль двух из его связывающих доменов, PIR и SH2» . Онкоген . 19 (16): 2052–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203469 . PMID 10803466 . 
  9. Перейти ↑ Han DC, Guan JL (август 1999). «Ассоциация киназы фокальной адгезии с Grb7 и ее роль в миграции клеток» . Журнал биологической химии . 274 (34): 24425–30. DOI : 10.1074 / jbc.274.34.24425 . PMID 10446223 . 
  10. ^ Пандей А, Лю X, Dixon JE, Di Fiore PP, Диксит В.М. (май 1996). «Прямая ассоциация между тирозинкиназой рецептора Ret и адаптерным белком Grb7, содержащим гомологию Src 2» . Журнал биологической химии . 271 (18): 10607–10. DOI : 10.1074 / jbc.271.18.10607 . PMID 8631863 . 
  11. ^ Vayssière В, Г Зальцман, Маэ Y, Мирей G, Ligensa Т, Вайднер КМ, Шарден Р, Camonis J (февраль 2000 г.). «Взаимодействие адапторного белка Grb7 с Rnd1, новым членом семейства Rho». Письма FEBS . 467 (1): 91–6. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (99) 01530-6 . PMID 10664463 . S2CID 4901644 .  
  12. ^ Gerdin AK (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  13. ^ a b «Международный консорциум фенотипирования мышей» .
  14. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  15. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  16. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  17. ^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Таннахилл D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .  
  18. ^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Гуань Д.Л. (октябрь 2001 г.). «Белки семейства Grb7: структура, взаимодействие с другими сигнальными молекулами и потенциальные клеточные функции» . Онкоген . 20 (44): 6315–21. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204775 . PMID  11607834 .
  • Марголис Б., Сильвеннойнен О, Комольо Ф, Рунпрапунт С., Скольник Э., Ульрих А., Шлессингер Дж. (Октябрь 1992 г.). «Высокоэффективная экспрессия / клонирование белков, связывающих рецептор эпидермального фактора роста с доменами 2 гомологии Src» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (19): 8894–8. Bibcode : 1992PNAS ... 89.8894M . DOI : 10.1073 / pnas.89.19.8894 . PMC  50030 . PMID  1409582 .
  • Скотейм Р.И., Абелер В.М., Несланд Дж.М., Фосса С.Д., Холм Р., Вагнер Ю., Флоренес В.А., Аасс Н., Каллиониеми О.П., Лоте Р.А. (2003). «Гены-кандидаты для рака яичек, оцененные с помощью анализов экспрессии белка in situ на тканевых микроматрицах» . Неоплазия . 5 (5): 397–404. DOI : 10.1016 / s1476-5586 (03) 80042-8 . PMC  1502610 . PMID  14670177 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Панди А., Лю X, Диксон Дж. Э., Ди Фиоре П. П., Диксит В. М. (май 1996 г.). «Прямая ассоциация между тирозинкиназой рецептора Ret и адаптерным белком Grb7, содержащим гомологию Src 2» . Журнал биологической химии . 271 (18): 10607–10. DOI : 10.1074 / jbc.271.18.10607 . PMID  8631863 .
  • Йокоте К., Марголис Б., Хелдин С.Х., Клаессон-Валлийский Л. (ноябрь 1996 г.). «Grb7 является нижестоящим сигнальным компонентом альфа- и бета-рецепторов тромбоцитов фактора роста» . Журнал биологической химии . 271 (48): 30942–9. DOI : 10.1074 / jbc.271.48.30942 . PMID  8940081 .
  • Танака С., Мори М., Акиёси Т., Танака Ю., Мафуне К., Жезлы Дж. Р., Сугимачи К. (январь 1997 г.). «Коэкспрессия Grb7 с рецептором эпидермального фактора роста или Her2 / erbB2 при прогрессирующей карциноме пищевода человека». Исследования рака . 57 (1): 28–31. PMID  8988034 .
  • Джейнс П.В., Лакманн М., Черч В.Б., Сандерсон Г.М., Сазерленд Р.Л., Дейли Р.Дж. (март 1997 г.). «Структурные детерминанты взаимодействия между рецептором erbB2 и доменом гомологии 2 Src Grb7» . Журнал биологической химии . 272 (13): 8490–7. DOI : 10.1074 / jbc.272.13.8490 . PMID  9079677 .
  • Киши Т., Сасаки Х., Акияма Н., Исидзука Т., Сакамото Х., Айзава С., Сугимура Т., Терада М. (март 1997 г.). «Молекулярное клонирование человеческого GRB-7, коамплифицированного с CAB1 и c-ERBB-2 при первичном раке желудка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 232 (1): 5–9. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.6218 . PMID  9125150 .
  • Донг Л.К., Ду Х, Портер С.Г., Колаковски Л.Ф., Ли А.В., Мандарино Л.Дж., Фан Дж., Йи Д., Лю Ф., Мандарино Дж. (Ноябрь 1997 г.). «Клонирование, хромосомная локализация, экспрессия и характеристика Src-гомологии 2 и гомологии плекстрина, содержащего домен, связывающий рецептор инсулина hGrb10gamma» . Журнал биологической химии . 272 (46): 29104–12. DOI : 10.1074 / jbc.272.46.29104 . PMID  9360986 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Фиддес Р.Дж., Кэмпбелл Д.Х., Джейн П.В., Сивертсен С.П., Сасаки Х., Уоллаш С., Дейли Р.Дж. (март 1998 г.). «Анализ рекрутирования Grb7 с помощью рецепторов erbB, активируемых герегулином, показывает новую селективность по отношению к erbB3» . Журнал биологической химии . 273 (13): 7717–24. DOI : 10.1074 / jbc.273.13.7717 . PMID  9516479 .
  • Танака С., Мори М., Акиёси Т., Танака Ю., Мафуне К., Жезлы Дж. Р., Сугимачи К. (август 1998 г.). «Новый вариант человеческого Grb7 связан с инвазивной карциномой пищевода» . Журнал клинических исследований . 102 (4): 821–7. DOI : 10.1172 / JCI2921 . PMC  508945 . PMID  9710451 .
  • Томмес К., Леннартссон Дж., Карлберг М., Рённстранд Л. (июль 1999 г.). «Идентификация Tyr-703 и Tyr-936 в качестве первичных сайтов ассоциации для Grb2 и Grb7 в рецепторе фактора c-Kit / стволовых клеток» . Биохимический журнал . 341 (1): 211–6. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3410211 . PMC  1220349 . PMID  10377264 .
  • Хан, округ Колумбия, Гуань Дж. Л. (август 1999 г.). «Ассоциация киназы фокальной адгезии с Grb7 и ее роль в миграции клеток» . Журнал биологической химии . 274 (34): 24425–30. DOI : 10.1074 / jbc.274.34.24425 . PMID  10446223 .
  • Джонс Н., Мастер З., Джонс Дж., Бушар Д., Гунджи Ю., Сасаки Н., Дейли Р., Алитало К., Дюмон диджей (октябрь 1999 г.). «Идентификация партнеров связывания Tek / Tie2. Связывание с многофункциональным сайтом стыковки опосредует выживание и миграцию клеток» . Журнал биологической химии . 274 (43): 30896–905. DOI : 10.1074 / jbc.274.43.30896 . PMID  10521483 .
  • Вайссьер Б., Залькман Дж., Маэ И., Мирей Дж., Лигенса Т., Вайднер К. М., Шарден П., Камонис Дж. (Февраль 2000 г.). «Взаимодействие адапторного белка Grb7 с Rnd1, новым членом семейства Rho». Письма FEBS . 467 (1): 91–6. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01530-6 . PMID  10664463 . S2CID  4901644 .
  • Kasus-Jacobi A, Béréziat V, Perdereau D, Girard J, Burnol AF (апрель 2000 г.). «Доказательства взаимодействия между рецептором инсулина и Grb7. Роль двух из его связывающих доменов, PIR и SH2» . Онкоген . 19 (16): 2052–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203469 . PMID  10803466 .
  • Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Гуань Д.Л. (сентябрь 2000 г.). «Роль нацеливания Grb7 на фокальные контакты и его фосфорилирование киназой фокальной адгезии в регуляции миграции клеток» . Журнал биологической химии . 275 (37): 28911–7. DOI : 10.1074 / jbc.M001997200 . PMID  10893408 .
  • Ли Х, Волонте Д., Гальбиати Ф., Айенгар П., Люблин Д. М., Брегман Д. Б., Уилсон М. Т., Кампос-Гонсалес Р., Бузаза Б., Пестелл Р. Г., Шерер П. Э., Лисанти МП (ноябрь 2000 г.). «Конститутивное и регулируемое факторами роста фосфорилирование кавеолина-1 происходит в одном и том же сайте (Tyr-14) in vivo: идентификация сигнальной кассеты c-Src / Cav-1 / Grb7» . Молекулярная эндокринология . 14 (11): 1750–75. DOI : 10,1210 / me.14.11.1750 . PMID  11075810 .
  • Скотейм Р.И., Абелер В.М., Несланд Дж.М., Фосса С.Д., Холм Р., Вагнер Ю., Флоренес В.А., Аасс Н., Каллиониеми О.П., Лоте Р.А. (2003). «Гены-кандидаты для рака яичек, оцененные с помощью анализов экспрессии белка in situ на тканевых микроматрицах» . Неоплазия . 5 (5): 397–404. DOI : 10.1016 / s1476-5586 (03) 80042-8 . PMC  1502610 . PMID  14670177 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GRB7 + адаптер + белок в предметных заголовках медицинской тематики Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)