GRIA3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
3LSW , 3LSX

Идентификаторы

Псевдонимы

GRIA3 , GLUR-C, GLUR-K3, GLUR3, GLURC, GluA3, MRX94, субъединица 3 типа глутамат-ионотропного рецептора AMPA

Внешние идентификаторы

OMIM: 305915 MGI: 95810 HomoloGene: 37353 Генные карты : GRIA3

Расположение гена (человек)

Chr.	Х-хромосома (человека) ^[1]

Группа	Xq25	Начинать	123 184 153 п.н. ^[1]
Группа	Xq25	Конец	123 490 915 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Х-хромосома (мышь) ^[2]

Группа	X A4 \| X 23,19 см	Начинать	41 400 854 п.н. ^[2]
Группа	X A4 \| X 23,19 см	Конец	41 678 601 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• активности ионных каналов • ионотропическая активность рецептора глутамата • внеклеточного глутамата закрытой активность канала ион • активность рецептора глутамата АМРА • возбуждающим внеклеточного лиганд-закрытого тип активность ионы канала • связывание амилоид-бета • сигнализации активности рецептора • активность канала иона передатчика закрытого участвует в регуляция постсинаптического мембранного потенциала
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоцитарных везикул • постсинаптическая мембрана • мембрана • синапс • соединение клеток • комплекс рецепторов глутамата AMPA • клеточная мембрана • волокно, параллельное синапсу клеток Пуркинье
Биологический процесс	• путь передачи сигнала рецептора глутамата • транспорт ионов • трансмембранный перенос ионов • путь передачи сигнала ионотропного рецептора глутамата • транспорт • возбуждающий постсинаптический потенциал • постсинаптический потенциал • регуляция активности рецептора NMDA
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


2892


53623

Ансамбль


ENSG00000125675


ENSMUSG00000001986

UniProt


P42263


Q9Z2W9

RefSeq (мРНК)


NM_181894 NM_000828 NM_001256743 NM_007325


NM_001281929 NM_016886 NM_001290451 NM_001358361

RefSeq (белок)


NP_000819 NP_001243672 NP_015564


NP_001268858 NP_001277380 NP_058582 NP_001345290

Расположение (UCSC)

Chr X: 123.18 - 123.49 Мб

Chr X: 41,4 - 41,68 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Глутамат рецептора 3 представляет собой белок , который у человека кодируется GRIA3 гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Рецепторы глутамата являются преобладающими рецепторами возбуждающих нейротрансмиттеров в головном мозге млекопитающих и активируются во множестве нормальных нейрофизиологических процессов. Эти рецепторы представляют собой гетеромерные белковые комплексы с множеством субъединиц, каждая из которых обладает трансмембранными областями, и все они расположены так, что образуют лиганд-зависимый ионный канал. Классификация рецепторов глутамата основана на их активации различными фармакологическими агонистами. Этот ген принадлежит к семейству рецепторов альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазолпропионата (AMPA). Альтернативный сплайсинг в этом локусе приводит к нескольким различным изоформам, которые могут различаться по своим свойствам передачи сигнала. ^[7]

Исследования генома выявили предварительную связь между дефектными вариантами GRIA3 и очень повышенным риском шизофрении .

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GRIA3 взаимодействует с GRIP1 ^[8] и PICK1 . ^[8]

Редактирование РНК [ править ]

Некоторые ионные каналы и рецепторы нейротрансмиттеров пре- мРНК в качестве субстратов для ADAR . ^[9] Сюда входят 5 субъединиц рецептора глутамата: субъединицы ионотропного рецептора глутамата AMPA ( Glur2 , Glur3 , Glur4 ) и субъединицы каинатного рецептора ( Glur5 , Glur6 ). Ионные каналы, управляемые глутаматом, состоят из четырех субъединиц на канал, каждая субъединица вносит свой вклад в структуру петли поры. Структура петли поры связана со структурой, обнаруженной в каналах K ⁺ (например, канал K v 1.1 человека ). ^[10] Человек K _v1.1-канальная пре-мРНК также подлежит редактированию РНК от A до I. ^[11] Функция рецепторов глутамата заключается в обеспечении быстрой нейротрансмиссии в мозг. Разнообразие субъединиц определяется, а также сплайсинг РНК событиями редактирования РНК отдельных субъединиц. Это приводит к неизбежно высокому разнообразию этих рецепторов. GluR3 является генным продуктом гена GRIA3, и его пре-мРНК подлежит редактированию РНК.

Тип [ редактировать ]

Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина . Инозины распознаются как гуанозин механизмом трансляции клеток. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR1 и ADAR2 являются единственными ферментативно активными членами. ADAR3считается, что играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, близкой к области редактирующего сайта, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS).

Местоположение [ править ]

Пре-мРНК этой субъединицы редактируется в одной позиции. Сайт редактирования R / G расположен в экзоне 13 между областями M3 и M4. Редактирование приводит к замене кодона с аргинина (AGA) на глицин (GGA). Место редактирования соответствует двудольному домену взаимодействия лиганда рецептора. Сайт R / G находится у аминокислоты 769 непосредственно перед модулями flip and flop длиной 38 аминокислот, введенными путем альтернативного сплайсинга. Формы Flip и Flop присутствуют как в отредактированных, так и в неотредактированных версиях этого белка. ^[12]Редактирующая комплементарная последовательность (ECS) находится в интронной последовательности рядом с экзоном. Интронная последовательность включает 5'-сайт сплайсинга. Предсказанная двухцепочечная область имеет длину 30 пар оснований. Остаток аденозина несовместим в кодируемом геномом транскрипте, однако это не так после редактирования. Несмотря на сходные последовательности с сайтом Q / R GluR-B, редактирование на этом сайте не происходит в пре-мРНК GluR-3. Редактирование приводит к тому, что целевой аденозин, который не соответствует до редактирования в структуре двухцепочечной РНК, становится согласованным после редактирования. Участвующая интронная последовательность содержит 5'-донорный сайт сплайсинга. ^[12]^[13]

Сохранение [ править ]

Редактирование также происходит у крысы. ^[12]

Регламент [ править ]

Редактирование GluR-3 регулируется в мозге крысы от низких уровней на эмбриональной стадии до значительного увеличения уровней редактирования при рождении. У человека редактируется 80-90% транскриптов GRIA3. ^[12] Отсутствие редактирования сайта Q / R в этой субъединице рецептора глутамата связано с отсутствием необходимой интронной последовательности, необходимой для образования дуплекса. ^[14]

Последствия [ править ]

Структура [ править ]

Редактирование приводит к изменению кодона с (AGA) на (GGA), замене R на G на сайте редактирования. ^[12]

Функция [ править ]

Редактирование на сайте R / G позволяет быстрее избавиться от десенсибилизации. Неотредактированный Glu-R на этом сайте имеет более медленную скорость восстановления. Таким образом, редактирование позволяет устойчиво реагировать на быстрые стимулы. Здесь вероятно возникновение перекрестных помех между редактированием и склейкой. Редактирование происходит перед склейкой. Все рецепторы AMPA встречаются в альтернативно сплайсированных вариантах flip and flop. Рецепторы AMPA, которые присутствуют в форме Flop, теряют чувствительность быстрее, чем в обратной форме. ^[12] Также считается, что редактирование влияет на сварку на этом сайте.

См. Также [ править ]

Рецептор AMPA

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125675 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001986 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ McNamara JO, Eubanks JH, McPherson JD, Wasmuth JJ, Evans GA, Heinemann SF (июль 1992 г.). «Хромосомная локализация генов рецепторов глутамата человека» . J Neurosci . 12 (7): 2555–62. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.12-07-02555.1992 . PMC 6575855 . PMID 1319477 .
^ Gecz Дж, Барнетта S, Лю Дж, Hollway G, Доннелли А, Эйр Н, Эшкевари HS, Балтазар R, Grunn А, Нагараджа R, Гиллиам С, Peltonen л, Сазерленд ГР, барон М, Mulley JC (март 2000). «Характеристика гена субъединицы 3 рецептора глутамата человека (GRIA3), кандидата на биполярное расстройство и неспецифическую X-связанную умственную отсталость». Геномика . 62 (3): 356–68. DOI : 10.1006 / geno.1999.6032 . PMID 10644433 .
^ a b «Ген Entrez: рецептор глутамата GRIA3, ионотрофный, AMPA 3» .
^ а б Хирбек, Элен; Перестенко Ольга; Нисимуне Ацуши; Мейер Гвидо; Наканиши Шигетада; Хенли Джереми М; Дев Кумлеш К. (май 2002 г.). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200112200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11891216 .
Перейти ↑ Bass BL (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК» . Анну. Rev. Biochem . 71 : 817–46. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501 . PMC 1823043 . PMID 12045112 .
^ Seeburg РН, Одиночный Р, Т Кунера, Хигутите М, Спренгел R (июль 2001 г.). «Генетические манипуляции с ключевыми детерминантами потока ионов в каналах рецептора глутамата у мышей». Brain Res . 907 (1–2): 233–43. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (01) 02445-3 . PMID 11430906 .
^ Bhalla Т, Розенталь JJ, Хольмгрен М, Reenan Р (октябрь 2004 г.). «Контроль инактивации калиевых каналов человека путем редактирования маленькой шпильки мРНК». Nat. Struct. Мол. Биол . 11 (10): 950–6. DOI : 10.1038 / nsmb825 . PMID 15361858 .
^ Б с д е е Lomeli H, J, Mosbacher Мелчер T, T, Hoger Гейгера JR, Кунер T, H, Monyer Хигучи M, A, Bach Seeburg PH (декабрь 1994). «Контроль кинетических свойств каналов рецептора AMPA путем редактирования ядерной РНК». Наука . 266 (5191): 1709–13. Bibcode : 1994Sci ... 266.1709L . DOI : 10.1126 / science.7992055 . PMID 7992055 .
^ Seeburg PH, Хигути M, Спренгел R (май 1998). «Редактирование РНК каналов рецепторов глутамата мозга: механизм и физиология». Brain Res. Brain Res. Ред . 26 (2–3): 217–29. DOI : 10.1016 / S0165-0173 (97) 00062-3 . PMID 9651532 .
↑ Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (март 1996 г.). «Редактирование Q / R сайта в пре-мРНК каинатного рецептора GluR5 и GluR6 требует удаленных интронных последовательностей» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (5): 1875–80. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1875H . DOI : 10.1073 / pnas.93.5.1875 . PMC 39875 . PMID 8700852 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Холлманн М, Хартли М, Хайнеманн С (1991). «Са2 + проницаемость каналов глутаматных рецепторов, управляемых КА-АМРА, зависит от субъединичного состава». Наука . 252 (5007): 851–3. Bibcode : 1991Sci ... 252..851H . DOI : 10.1126 / science.1709304 . PMID 1709304 .
Рамперсад V, Эллиотт С.Э., Натт С.Л. и др. (1994). «Изоформы flip and flop человеческого рецептора глутамата hGluR3: клонирование и секвенирование кДНК и первичной структуры белков». Биохим. Биофиз. Acta . 1219 (2): 563–6. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (94) 90090-6 . PMID 7918660 .
Роджерс С.В., Эндрюс П.И., Гаринг Л.С. и др. (1994). «Аутоантитела к рецептору глутамата GluR3 при энцефалите Расмуссена». Наука . 265 (5172): 648–51. Bibcode : 1994Sci ... 265..648R . DOI : 10.1126 / science.8036512 . PMID 8036512 .
Томияма М., Родригес-Пуэртас Р., Кортес Р. и др. (1997). «Дифференциальное региональное распределение матричных РНК субъединицы рецептора AMPA в спинном мозге человека, визуализированное с помощью гибридизации in situ». Неврология . 75 (3): 901–15. DOI : 10.1016 / 0306-4522 (96) 00321-1 . hdl : 10261/112658 . PMID 8951883 .
Остен П., Шривастава С., Инман Г. Дж. И др. (1998). «С-конец GluR2 рецептора AMPA может опосредовать обратимое, АТФ-зависимое взаимодействие с NSF и альфа- и бета-SNAP». Нейрон . 21 (1): 99–110. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80518-8 . PMID 9697855 .
Шривастава С., Остен П., Вилим Ф.С. и др. (1998). «Новое закрепление GluR2 / 3 на постсинаптической плотности с помощью AMPA рецептор-связывающего белка ABP». Нейрон . 21 (3): 581–91. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80568-1 . PMID 9768844 .
Хаяси Т, Умемори Х, Мишина М, Ямамото Т (1999). «Рецептор AMPA взаимодействует и передает сигналы через протеинтирозинкиназу Lyn». Природа . 397 (6714): 72–6. Bibcode : 1999Natur.397 ... 72H . DOI : 10.1038 / 16269 . PMID 9892356 .
Амир Р., Дале Э.Дж., Ториоло Д., Зогби Х.Ю. (2000). «Анализ генов-кандидатов при синдроме Ретта и идентификация 21 SNP в Xq». Являюсь. J. Med. Genet . 90 (1): 69–71. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8628 (20000103) 90: 1 <69 :: AID-AJMG12> 3.0.CO; 2-W . PMID 10602120 .
Aruscavage PJ, Bass BL (2000). «Филогенетический анализ показывает необычную консервацию последовательностей внутри интронов, участвующих в редактировании РНК» . РНК . 6 (2): 257–69. DOI : 10.1017 / S1355838200991921 . PMC 1369911 . PMID 10688364 .
Гаринг Л., Карлсон Н.Г., Мейер Е.Л., Роджерс С.В. (2001). «Протеолиз нейронального рецептора глутамата гранзимом B генерирует аутоантиген и модулируется гликозилированием» . J. Immunol . 166 (3): 1433–8. DOI : 10.4049 / jimmunol.166.3.1433 . PMID 11160179 .
Лю QJ, Gong YQ, Chen BX и др. (2001). «[Анализ сцепления и обнаружение мутаций GRIA3 при синдроме Смита-Файнмана-Майерса]». И Чуань Сюэ Бао . 28 (11): 985–90. PMID 11725645 .
Хирбек Х., Перестенко О., Нишимуне А. и др. (2002). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200112200 . PMID 11891216 .
Вышински М., Ким Э., Дуна А.В. и др. (2002). «Взаимодействие между GRIP и липрин-альфа / SYD2 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA». Нейрон . 34 (1): 39–52. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (02) 00640-2 . PMID 11931740 .
Томияма М., Родригес-Пуэртас Р., Кортес Р. и др. (2002). «Флип и флоп варианты сплайсинга субъединиц рецептора AMPA в спинном мозге при боковом амиотрофическом склерозе». Синапс . 45 (4): 245–9. CiteSeerX 10.1.1.575.9300 . DOI : 10.1002 / syn.10098 . PMID 12125045 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ганор Ю., Бессер М., Бен-Закай Н. и др. (2003). «Человеческие Т-клетки экспрессируют функциональный ионотропный глутаматный рецептор GluR3, а глутамат сам по себе запускает интегрин-опосредованную адгезию к ламинину и фибронектину и хемотаксическую миграцию» . J. Immunol . 170 (8): 4362–72. DOI : 10.4049 / jimmunol.170.8.4362 . PMID 12682273 .
Flajolet M, Rakhilin S, Wang H, et al. (2004). «Протеиновая фосфатаза 2С избирательно связывается и дефосфорилирует метаботропный рецептор глутамата 3» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 100 (26): 16006–11. Bibcode : 2003PNAS..10016006F . DOI : 10.1073 / pnas.2136600100 . PMC 307683 . PMID 14663150 .
Коллекер А., Чжу Дж. Дж., Шупп Б. Дж. И др. (2004). «Глутаматергическая пластичность за счет синаптической доставки GluR-B (длинных) -содержащих рецепторов AMPA» . Нейрон . 40 (6): 1199–212. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (03) 00722-0 . PMID 14687553 .

Внешние ссылки [ править ]

GRIA3 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
«ПРОШЛОЕ» .
http://darned.ucc.ie
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9Z2W9 (рецептор глутамата 3) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125675 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001986 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1319477-5] McNamara JO, Eubanks JH, McPherson JD, Wasmuth JJ, Evans GA, Heinemann SF (июль 1992 г.). «Хромосомная локализация генов рецепторов глутамата человека» . J Neurosci . 12 (7): 2555–62. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.12-07-02555.1992 . PMC 6575855 . PMID 1319477 .

[pmid10644433-6] Gecz Дж, Барнетта S, Лю Дж, Hollway G, Доннелли А, Эйр Н, Эшкевари HS, Балтазар R, Grunn А, Нагараджа R, Гиллиам С, Peltonen л, Сазерленд ГР, барон М, Mulley JC (март 2000). «Характеристика гена субъединицы 3 рецептора глутамата человека (GRIA3), кандидата на биполярное расстройство и неспецифическую X-связанную умственную отсталость». Геномика . 62 (3): 356–68. DOI : 10.1006 / geno.1999.6032 . PMID 10644433 .

[entrez-7] «Ген Entrez: рецептор глутамата GRIA3, ионотрофный, AMPA 3» .

[pmid11891216-8] а б Хирбек, Элен; Перестенко Ольга; Нисимуне Ацуши; Мейер Гвидо; Наканиши Шигетада; Хенли Джереми М; Дев Кумлеш К. (май 2002 г.). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200112200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11891216 .

[pmid12045112-9] Перейти ↑ Bass BL (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК» . Анну. Rev. Biochem . 71 : 817–46. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501 . PMC 1823043 . PMID 12045112 .

[pmid11430906-10] Seeburg РН, Одиночный Р, Т Кунера, Хигутите М, Спренгел R (июль 2001 г.). «Генетические манипуляции с ключевыми детерминантами потока ионов в каналах рецептора глутамата у мышей». Brain Res . 907 (1–2): 233–43. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (01) 02445-3 . PMID 11430906 .

[pmid15361858-11] Bhalla Т, Розенталь JJ, Хольмгрен М, Reenan Р (октябрь 2004 г.). «Контроль инактивации калиевых каналов человека путем редактирования маленькой шпильки мРНК». Nat. Struct. Мол. Биол . 11 (10): 950–6. DOI : 10.1038 / nsmb825 . PMID 15361858 .

[pmid7992055-12] Б с д е е Lomeli H, J, Mosbacher Мелчер T, T, Hoger Гейгера JR, Кунер T, H, Monyer Хигучи M, A, Bach Seeburg PH (декабрь 1994). «Контроль кинетических свойств каналов рецептора AMPA путем редактирования ядерной РНК». Наука . 266 (5191): 1709–13. Bibcode : 1994Sci ... 266.1709L . DOI : 10.1126 / science.7992055 . PMID 7992055 .

[pmid9651532-13] Seeburg PH, Хигути M, Спренгел R (май 1998). «Редактирование РНК каналов рецепторов глутамата мозга: механизм и физиология». Brain Res. Brain Res. Ред . 26 (2–3): 217–29. DOI : 10.1016 / S0165-0173 (97) 00062-3 . PMID 9651532 .

[pmid8700852-14] Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (март 1996 г.). «Редактирование Q / R сайта в пре-мРНК каинатного рецептора GluR5 и GluR6 требует удаленных интронных последовательностей» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (5): 1875–80. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1875H . DOI : 10.1073 / pnas.93.5.1875 . PMC 39875 . PMID 8700852 .

[1]