Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GRIA4
Идентификаторы
ПсевдонимыGRIA4 , GLUR4, GLUR4C, GLURD, GluA4, глутамат-ионотропный рецептор, субъединица 4 типа AMPA, NEDSGA
Внешние идентификаторыOMIM : 138246 MGI : 95811 HomoloGene : 20227 GeneCards : GRIA4
Расположение гена ( человек )
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение GRIA4
Геномное расположение GRIA4
Группа11q22.3Начинать105 609 994 п.н. [1]
Конец105 982 092 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 9 (мышь)
Chr.Хромосома 9 (мышь) [2]
Хромосома 9 (мышь)
Геномное расположение GRIA4
Геномное расположение GRIA4
Группа9 A1 | 9 2,46 смНачинать4 417 896 п.н. [2]
Конец4 796 234 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• активность ионного канала
• активность ионотропного рецептора глутамата
• активность внеклеточного глутаматного ионного канала
• активность возбуждающего внеклеточного ионного канала, управляемого лигандом
• активность рецептора глутамата AMPA
• связывание белка GO: 0001948
• связывание бета-амилоида
• активность сигнального рецептора
Сотовый компонент• внеклеточная везикула
• неотъемлемый компонент мембраны
• мембрана эндоцитарных везикул
• постсинаптическая мембрана
• проекция клетки
• мембрана
• плазматическая мембрана
• синапс
• соединение клеток
• дендрит
• комплекс рецепторов глутамата AMPA
• тело нейрональной клетки
• дендритный шип
Биологический процесс• путь передачи сигналов рецептора глутамата
• транспорт ионов
• трансмембранный транспорт ионов
• путь передачи сигнала ионотропного рецептора глутамата
• возбуждающий постсинаптический потенциал
• транспорт
• регулирование активности рецептора NMDA
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2893

14802

Ансамбль

ENSG00000152578

ENSMUSG00000025892

UniProt

P48058

Q9Z2W8

RefSeq (мРНК)

NM_000829
NM_001077243
NM_001077244
NM_001112812

NM_001113180
NM_001113181
NM_019691

RefSeq (белок)

NP_000820
NP_001070711
NP_001070712
NP_001106283

NP_001106651
NP_001106652
NP_062665

Расположение (UCSC)Chr 11: 105.61 - 105.98 МбChr 9: 4.42 - 4.8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Глутамат рецептора 4 представляет собой белок , который у человека кодируется GRIA4 гена . [5]

Этот ген является членом семейства ионных каналов, управляемых L-глутаматом, которые обеспечивают быструю синаптическую возбуждающую нейротрансмиссию. Эти каналы также реагируют на агонист глутамата, альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазолпропионат (AMPA). Некоторые гаплотипы этого гена показывают положительную связь с шизофренией. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GRIA4 взаимодействует с CACNG2 , [6] GRIP1 , [7] PICK1 [7] и PRKCG . [8]

Редактирование РНК [ править ]

Некоторые ионные каналы и рецепторы нейротрансмиттеров пре-мРНК являются субстратами для ADAR. Сюда входят 5 субъединиц глутаматного рецептора, ионотропные субъединицы глутаматного рецептора AMPA (Glur2, Glur3, Glur4) и субъединицы каинатного рецептора (Glur5, Glur6). Ионные каналы, управляемые глутаматом, состоят из четырех субъединиц на канал. Их функция заключается в обеспечении быстрой нейротрансмиссии в мозг. Разнообразие субъединиц определяется, как и сплайсинг РНК, событиями редактирования РНК отдельных субъединиц. Это приводит к необходимому разнообразию рецепторов. GluR4 является продуктом гена GRIA4, и его пре-мРНК подлежит редактированию РНК.

Тип [ редактировать ]

Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина . Инозины известны как гуанозин.трансляционной машиной клеток. ADAR 1-3 состоит из трех членов семейства ADAR, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, тогда как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, близкой к области редактирующего сайта, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS).

Местоположение [ править ]

Пре-мРНК этой субъединицы редактируется в одной позиции. Сайт редактирования R / G расположен в экзоне 13 между областями от M3 до M4. Редактирование приводит к замене кодона с аргинина (AGA) на глицин (GGA). Местоположение редактирования соответствует двудольному домену взаимодействия лиганда рецептора. ((((((37)))))) Сайт R / G находится в аминокислоте 769 непосредственно перед переворотом длиной 3 аминокислоты. и флоп-модули, представленные альтернативным соединением. Формы Flip и Flop присутствуют как в отредактированных, так и в неотредактированных версиях этого белка. [9]Редактирующая комплементарная последовательность (ECS) находится в интронной последовательности, близкой к экзону. Интронная последовательность включает 5'-сайт сплайсинга, а предполагаемая двухцепочечная область имеет длину 30 пар оснований. Остаток аденозина несовместим в кодируемом геномом транскрипте, однако это не так после редактирования. Несмотря на сходные последовательности с сайтом Q / R GluR-B, редактирование этого сайта не происходит в пре-мРНК GluR-3. Редактирование приводит к тому, что целевой аденозин, который не соответствует до редактирования в структуре двухцепочечной РНК, становится согласованным после редактирования. Используемая интронная последовательность содержит 5'-донорный сайт сплайсинга. [9] [10]

Сохранение [ править ]

Редактирование также происходит у крысы. [9]

Регламент [ править ]

Редактирование GluR-3 регулируется в головном мозге крысы от низких уровней в эмбриональной стадии до значительного увеличения уровней редактирования при рождении. У человека редактируется 80-90% транскриптов GRIA3. [9] Отсутствие редактирования сайта Q / R в этой субъединице рецептора глутамата связано с отсутствием необходимой интронной последовательности, необходимой для образования дуплекса. [11]

Последствия [ править ]

Структура [ править ]

Редактирование приводит к изменению кодона с (AGA) на (GGA), замене R на G на сайте редактирования. [9]

Функция [ править ]

Редактирование на сайте R / G позволяет быстрее избавиться от десенсибилизации. Неотредактированный Glu-R на этом сайте имеет более медленную скорость восстановления. Таким образом, редактирование позволяет устойчиво реагировать на быстрые раздражители. Здесь вероятно возникновение перекрестных помех между редактированием и склейкой. Редактирование происходит перед склейкой. Все рецепторы AMPA встречаются в альтернативно сплайсированных вариантах flip and flop. Рецепторы AMPA, которые встречаются в форме Flop, теряют чувствительность быстрее, чем в обратной форме. [9] Считается, что редактирование также влияет на сварку на этом сайте.

См. Также [ править ]

  • Рецептор AMPA

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000152578 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025892 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: рецептор глутамата GRIA4, ионотрофный, AMPA 4» .
  6. ^ Чен, L; Четкович Д.М.; Petralia RS; Суини NT; Кавасаки Y; Wenthold RJ; Bredt DS; Николл Р.А. (2000). «Старгазин регулирует синаптическое нацеливание на рецепторы AMPA с помощью двух различных механизмов». Природа . 408 (6815): 936–43. DOI : 10.1038 / 35050030 . ISSN 0028-0836 . PMID 11140673 . S2CID 4427689 .   
  7. ^ а б Хирбек, Элен; Перестенко Ольга; Нисимуне Ацуши; Мейер Гвидо; Наканиши Шигетада; Хенли Джереми М; Дев Кумлеш К. (май 2002 г.). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200112200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11891216 .  
  8. ↑ Correia, Susana Santos; Дуарте Карлос Бандейра; Фаро Карлос Хосе; Пирес Эвклид Виейра; Карвалью Ана Луиса (февраль 2003 г.). «Гамма-протеинкиназа C напрямую связывается с субъединицей рецептора альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазол пропионата GluR4. Влияние на фосфорилирование рецептора» . J. Biol. Chem . 278 (8): 6307–13. DOI : 10.1074 / jbc.M205587200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12471040 .  
  9. ^ Б с д е е Lomeli H, J, Mosbacher Мелчер T, и др. (Декабрь 1994 г.). «Контроль кинетических свойств каналов рецепторов AMPA путем редактирования ядерной РНК». Наука . 266 (5191): 1709–13. Bibcode : 1994Sci ... 266.1709L . DOI : 10.1126 / science.7992055 . PMID 7992055 . 
  10. ^ Seeburg PH, Хигути M, Спренгел R (май 1998). «Редактирование РНК каналов рецепторов глутамата мозга: механизм и физиология». Brain Res. Brain Res. Откр. 26 (2–3): 217–29. DOI : 10.1016 / S0165-0173 (97) 00062-3 . PMID 9651532 . S2CID 12147763 .   
  11. ↑ Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (март 1996). «Редактирование Q / R сайта в пре-мРНК каинатного рецептора GluR5 и GluR6 требует удаленных интронных последовательностей» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 93 (5): 1875–80. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1875H . DOI : 10.1073 / pnas.93.5.1875 . PMC 39875 . PMID 8700852 .   

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Макнамара Дж.О., Юбэнкс Дж. Х., Макферсон Дж. Д. и др. (1992). «Хромосомная локализация генов рецепторов глутамата человека» . J. Neurosci . 12 (7): 2555–62. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.12-07-02555.1992 . PMC  6575855 . PMID  1319477 .
  • Харди М., Юнкин Д., Тан С.М. и др. (1994). «Экспрессия генов не-NMDA глутаматных рецепторных каналов клональными человеческими нейронами». J. Neurochem . 63 (2): 482–9. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.1994.63020482.x . PMID  7518497 . S2CID  19882589 .
  • Рош К.В., Раймонд Л.А., Блэкстоун С., Хуганир Р.Л. (1994). «Трансмембранная топология субъединицы рецептора глутамата GluR6». J. Biol. Chem . 269 (16): 11679–82. PMID  8163463 .
  • Флетчер Э.Дж., Натт С.Л., Ху К.Х. и др. (1996). «Клонирование, экспрессия и фармакологическая характеристика рецептора глутамата человека: hGluR4». Прием. Каналы . 3 (1): 21–31. PMID  8589990 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Рипеллино Дж. А., Неве Р. Л., Хау Дж. Р. (1998). «Экспрессия и гетеромерные взаимодействия субъединиц рецептора глутамата не-N-метил-D-аспартата в развивающемся и взрослом мозжечке». Неврология . 82 (2): 485–97. DOI : 10.1016 / S0306-4522 (97) 00296-0 . PMID  9466455 . S2CID  23219004 .
  • Карвалью А.Л., Камеяма К., Хуганир Р.Л. (1999). «Характеристика сайтов фосфорилирования на субъединице рецептора глутамата 4 AMPA рецепторов» . J. Neurosci . 19 (12): 4748–54. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.19-12-04748.1999 . PMC  6782640 . PMID  10366608 .
  • Чен Л., Четкович Д.М., Петралиа Р.С. и др. (2001). «Старгазин регулирует синаптическое нацеливание на рецепторы AMPA с помощью двух различных механизмов». Природа . 408 (6815): 936–43. DOI : 10.1038 / 35050030 . PMID  11140673 . S2CID  4427689 .
  • Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, et al. (2002). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200112200 . PMID  11891216 .
  • Томияма М., Родригес-Пуэртас Р., Кортес Р. и др. (2002). «Флип и флоп варианты сплайсинга субъединиц рецептора AMPA в спинном мозге при боковом амиотрофическом склерозе». Синапс . 45 (4): 245–9. CiteSeerX  10.1.1.575.9300 . DOI : 10.1002 / syn.10098 . PMID  12125045 . S2CID  28604714 .
  • Пастернак А., Коулман С.К., Джуппила А. и др. (2003). «Каналы рецептора альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазолепропионовой кислоты (AMPA), лишенные N-концевого домена» . J. Biol. Chem . 277 (51): 49662–7. DOI : 10.1074 / jbc.M208349200 . PMID  12393905 .
  • Коррейа С.С., Дуарте С.Б., Фаро С.Дж. и др. (2003). «Гамма-протеинкиназа C напрямую связывается с субъединицей рецептора альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазол пропионата GluR4. Влияние на фосфорилирование рецептора» . J. Biol. Chem . 278 (8): 6307–13. DOI : 10.1074 / jbc.M205587200 . PMID  12471040 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Макино С., Фуджи Ю., Кикута Р. и др. (2003). «Положительная ассоциация гаплотипа гаплотипа субъединицы рецептора AMPA GluR4 (GRIA4) с шизофренией: картирование неравновесного сцепления с использованием SNP, равномерно распределенных по области гена». Являюсь. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet . 116 (1): 17–22. DOI : 10.1002 / ajmg.b.10041 . PMID  12497607 . S2CID  24883590 .
  • Коулман С.К., Цай С., Моттерсхед Д.Г. и др. (2003). «Поверхностная экспрессия рецептора GluR-D AMPA зависит от взаимодействия между его С-концевым доменом и белком 4.1» . J. Neurosci . 23 (3): 798–806. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.23-03-00798.2003 . PMC  6741938 . PMID  12574408 .
  • Пастернак А., Коулман С.К., Фетьер Дж. И др. (2003). «Характеристика функциональной роли N-гликанов в лиганд-связывающем домене рецептора AMPA» . J. Neurochem . 84 (5): 1184–92. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.2003.01611.x . PMID  12603841 . S2CID  11350496 .
  • Кавахара Ю., Ито К., Сан Х. и др. (2004). «GluR4c, альтернативная изоформа сплайсинга GluR4, обильно экспрессируется в мозге взрослого человека». Brain Res. Мол. Brain Res . 127 (1–2): 150–5. DOI : 10.1016 / j.molbrainres.2004.05.020 . PMID  15306133 .
  • Ли Дж, Шэн З, Хуанг З, Ню Л. (2005). «Кинетический механизм открытия канала рецептора GluRDflip AMPA». Биохимия . 44 (15): 5835–41. DOI : 10.1021 / bi047413n . PMID  15823042 .
  • Нурия М, О С, Хуганир Р.Л. (2005). «Зависимые от фосфорилирования взаимодействия альфа-актинина-1 / IQGAP1 с субъединицей рецептора AMPA GluR4». J. Neurochem . 95 (2): 544–52. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.2005.03410.x . PMID  16190873 . S2CID  9517535 .
  • Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Белок GRIA4 +, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .