• подавление хроматина • негативная регуляция метилирования гистона H3-K4 • регуляция молчания хроматина на рДНК • дозовая компенсация • негативная регуляция фазового перехода G2 / M клеточного цикла • позитивная регуляция экспрессии генов, эпигенетика • регуляция роста клеток • позитивная регуляция дифференцировка кератиноцитов • отрицательное регулирование гистона фосфорилирования • отрицательного регулирование белки серин / треонин киназа • отрицательная регуляция транскрипции с РНК - полимераза II , промотор • нуклеосомы сборки • отрицательная регуляция локализации белка в хромосоме, теломерной области • негативная регуляция экспрессии гена, эпигенетика • негативная регуляция метилирования гистона H3-K27 • эпигенетическая регуляция экспрессии гена • позитивная регуляция поддержания митотической слипчивости сестринских хроматид • установление локализации белка в хроматине • негативная регуляция транскрипции ядерного транскрипта большой рРНК с промотора РНК-полимеразы I • регуляция липидного метаболического процесса • ковалентная модификация хроматина • регуляция ответа на окислительный стресс • отрицательная регуляция ответа на окислительный стресс • положительная регуляция ответа на окислительный стресс • организация хроматина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
9555
26914
Ансамбль
ENSG00000113648
ENSMUSG00000015937
UniProt
O75367
Q9QZQ8
RefSeq (мРНК)
NM_001040158 NM_004893 NM_138609 NM_138610
NM_001159513 NM_001159514 NM_001159515 NM_012015
RefSeq (белок)
NP_001035248 NP_004884 NP_613075 NP_613258
NP_001152985 NP_001152986 NP_001152987 NP_036145
Расположение (UCSC)
Chr 5: 135,33 - 135,4 Мб
Chr 13: 56.07 - 56.14 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Ядро гистона макро-H2A.1 является белком , который в организме человека кодируется H2AFY гена . [5] [6] [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 ссылки
3 Дальнейшее чтение
4 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Гистоны - это основные ядерные белки , которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Нуклеосомы состоят приблизительно из 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Хроматина волокно дополнительно уплотнены за счет взаимодействия линкера гистона, H1 , с ДНК между нуклеосом с образованием высших хроматина структуры порядка. Этот ген кодирует член семейства гистонов H2A. Он заменяет обычные гистоны H2A в подмножестве нуклеосом, где репрессирует транскрипцию.и участвует в стабильной инактивации Х-хромосомы . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. [7] Экспрессия этих изоформ связана с несколькими видами рака, такими как гепатоцеллюлярная карцинома. [8]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113648 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015937 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мао М, Фу Г, Ву JS, Чжан QH, Чжоу Дж, Кан LX, Хуан QH, Хе KL, Гу Ч.В., Хан З.Г., Шен Y, Гу Дж, Юй Ю, Сюй Ш, Ван YX, Чен SJ, Чен Z (июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гематопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8175–80. DOI : 10.1073 / pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
↑ Lee Y, Hong M, Kim JW, Hong YM, Choe YK, Chang SY, Lee KS, Choe IS (июль 1998 г.). «Выделение клонов кДНК, кодирующих подтипы человеческого гистона macroH2A1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена . 1399 (1): 73–7. DOI : 10.1016 / s0167-4781 (98) 00098-0 . PMID 9714746 .
^ a b «Ген Энтреса: семейство гистонов H2AFY H2A, член Y» .
^ Rappa Р, Греко А, Podrini С, Cappello Ж, Foti М, Бургуэн л, Peyrou М, Марино А, Scibetta N, R Williams, Mazzoccoli G, Federici М, Pazienza В, Винчигерра М (2013). «Иммунопозитивность к изоформам гистона macroH2A1 указывает на ассоциированную со стеатозом гепатоцеллюлярную карциному» . PLOS ONE . 8 (1): e54458. DOI : 10.1371 / journal.pone.0054458 . PMC 3553099 . PMID 23372727 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (май 1998 г.). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2535–44. DOI : 10.1128 / mcb.18.5.2535 . PMC 110633 . PMID 9566873 .
Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. DOI : 10.1101 / gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П., Ван Л., Доннелли Р., Уэйд Д. Д., Ламберт П., Ли Х., Ли К. Г., Кашанчи Ф. (ноябрь 2000 г.). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология . 277 (2): 278–95. DOI : 10.1006 / viro.2000.0593 . PMID 11080476 .
Чедвик Б.П., Уиллард Х.Ф. (май 2001 г.). «Варианты гистона H2A и неактивная Х-хромосома: идентификация второго варианта macroH2A» . Молекулярная генетика человека . 10 (10): 1101–13. DOI : 10,1093 / hmg / 10.10.1101 . PMID 11331621 .
Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С., Ван Л., Ли Х., Ли К. Г., Доннелли Р., Уэйд Д. Д., Ламберт П., Кашанчи Ф. (октябрь 2001 г.). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология . 289 (2): 312–26. DOI : 10.1006 / viro.2001.1129 . PMID 11689053 .
Chadwick BP, Willard HF (июнь 2002 г.). «Зависимая от клеточного цикла локализация macroH2A в хроматине неактивной Х-хромосомы» . Журнал клеточной биологии . 157 (7): 1113–23. DOI : 10.1083 / jcb.200112074 . PMC 2173542 . PMID 12082075 .
Такахаши И., Камеока Ю., Хашимото К. (август 2002 г.). «MacroH2A1.2 связывает ядерный белок Spop». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1591 (1–3): 63–8. DOI : 10.1016 / S0167-4889 (02) 00249-5 . PMID 12183056 .
Ганесан С., Сильвер Д.П., Гринберг Р.А., Авни Д., Драпкин Р., Мирон А., Мок С.К., Рандрианарисон В., Броди С., Салстром Дж., Расмуссен Т.П., Климке А., Маррез К., Мараренс И., Дэн С.Х., Фунтюн Дж., Ливингстон Д.М. (Ноябрь 2002 г.). «BRCA1 поддерживает концентрацию РНК XIST на неактивной Х-хромосоме». Cell . 111 (3): 393–405. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 01052-8 . PMID 12419249 . S2CID 372211 .
Ангелов Д., Молла А., Перше П. Я., Ханс Ф., Коте Дж., Хохбин С., Буве П., Димитров С. (апрель 2003 г.). «Гистоновый вариант macroH2A препятствует связыванию фактора транскрипции и ремоделированию нуклеосом SWI / SNF». Молекулярная клетка . 11 (4): 1033–41. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00100-X . PMID 12718888 .
Берендс У, Шнайдер I, Рёсслер С, Фрауенкнехт Х, Голбек А, Лехнер Б, Айгенштеттер Г, Зобывальски С, Мюллер-Вейрих С, Граубнер У, Шмид I, Сакерер Д, Шпэт М, Гетц С, Прантл Ф, Асм Бисе К., Маутнер Дж. (Август 2003 г.). «Новые опухолевые антигены, идентифицированные путем скрининга аутологичных антител в библиотеках кДНК медуллобластомы детского возраста» . Международный журнал рака . 106 (2): 244–51. DOI : 10.1002 / ijc.11208 . PMID 12800201 . S2CID 36836051 .
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (декабрь 2003 г.). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промотор LTR» . Журнал EMBO . 22 (24): 6550–61. DOI : 10,1093 / emboj / cdg631 . PMC 291826 . PMID 14657027 .
Асин-Перес Р., Байона-Бафалуй член парламента, Фернандес-Силва П., Морено-Лошуэртос Р., Перес-Мартос А., Бруно С., Мораес К. Т., Энрикес Д. А. (март 2004 г.). «Респираторный комплекс III необходим для поддержания комплекса I в митохондриях млекопитающих» . Молекулярная клетка . 13 (6): 805–15. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (04) 00124-8 . PMC 3164363 . PMID 15053874 .
Чжан Р., Пустовойтов М.В., Е X, Сантос Х.А., Чен В., Даганзо С.М., Эрцбергер Дж. П., Серебряский И.Г., Канутеску А.А., Данбрак Р.Л., Пехрсон Дж. Р., Бергер Дж. М., Кауфман П.Д., Адамс П.Д. (январь 2005 г.). «Формирование MacroH2A-содержащих гетерохроматиновых фокусов, связанных со старением, и старение, вызванное ASF1a и HIRA». Клетка развития . 8 (1): 19–30. DOI : 10.1016 / j.devcel.2004.10.019 . PMID 15621527 .
Эрнандес-Муньос I, Лунд А.Х., ван дер Ступ П., Баутсма Э., Муйрерс И., Верховен Э., Нусинов Д.А., Паннинг Б., Марахренс Ю., ван Лохуизен М. (май 2005 г.). «Стабильная инактивация Х-хромосомы включает комплекс PRC1 Polycomb и требует гистона MACROH2A1 и лигазы убиквитина E3 CULLIN3 / SPOP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7635–40. DOI : 10.1073 / pnas.0408918102 . PMC 1140410 . PMID 15897469 .
Юдинкова Е.С., Барат А., Пичугин А., Маркова Е., Скляр И., Пирожкова И., Робин С., Липинский М., Огрызко В., Вассецкий Ю.С., Разин С.В. (2012). «Отчетливое распределение эктопически экспрессируемых вариантов гистона H2A.Bbd и MacroH2A в открытых и закрытых доменах хроматина» . PLOS ONE . 7 (10): e47157. DOI : 10.1371 / journal.pone.0047157 . PMC 3484066 . PMID 23118866 .
Внешние ссылки [ править ]
PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого гистонового макро-H2A.
