Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HLA-DRB5
1FV1.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1FV1 , 1H15 , 1HQR , 1ZGL

Идентификаторы
ПсевдонимыHLA-DRB5 , HLA-DRB, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DR beta 5, HLA-DRB5 *
Внешние идентификаторыOMIM : 604776 MGI : 95901 HomoloGene : 101524 GeneCards : HLA-DRB5
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение HLA-DRB5
Геномное расположение HLA-DRB5
Группа6п21.32Начинать32 517 353 п.н. [1]
Конец32 530 287 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 17 (мышь)
Chr.Хромосома 17 (мышь) [2]
Хромосома 17 (мышь)
Геномное расположение HLA-DRB5
Геномное расположение HLA-DRB5
Группа17 B1 | 17 17,98 смНачинать34 305 867 п.н. [2]
Конец34 316 674 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание пептидного антигена
Сотовый компонент• интегральный компонент мембраны
• мембрана эндоцитарных везикул
• мембрана эндоцитарных везикул, покрытая клатрином
• эндосома
• аппарат Гольджи
• мембрана сети транс-Гольджи
• мембрана эндоплазматического ретикулума
• мембрана
• мембрана поздней эндосомы
• мембрана Гольджи
• клеточная мембрана
• мембрана транспортных везикул
• класс MHC II белковый комплекс
• лизосомальная мембрана
• эндоплазматический ретикулум
• ER в мембрану транспортных пузырьков Гольджи
• лизосома
• неотъемлемый компонент просветной стороны мембраны эндоплазматического ретикулума
• мембрана эндосомы
• внеклеточная экзосома
Биологический процесс• антиген обработка и представление
• обработка антигена и представление экзогенных пептидного антигена через МНС класса II
• интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь
• системного процесс иммунной
• Т - клетки костимуляции
• антиген обработки и представление пептида или полисахарид антиген с помощью МНС класса II ,
• иммунного ответ
• сигнальный путь Т-клеточного рецептора
• адаптивный иммунный ответ
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3127

14969

Ансамбль

ENSG00000198502

ENSMUSG00000060586

UniProt

Q30154

P04231
P04230
P18468
P18469
O78196

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_002125

NM_010382

RefSeq (белок)

NP_002116

NP_034512

Расположение (UCSC)Chr 6: 32,52 - 32,53 МбChr 17: 34.31 - 34.32 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

HLA класса II , антиген гистосовместимости, DRB5 бета - цепь представляет собой белок , который у человека кодируется HLA-DRB5 гена . [5]

Функция [ править ]

Белок , кодируемый этим геном относится к HLA класса II бета - цепи паралогов . Молекула класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа (DRA) и бета-цепи (DRB), которые закреплены в мембране. Он играет центральную роль в иммунной системе , представляя пептиды, полученные из внеклеточных белков. Молекулы класса II экспрессируются в антигенпрезентирующих клетках (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги). [5]

Структура гена и полиморфизмы [ править ]

Бета-цепь составляет приблизительно 26-28 кДа. Он кодируется 6 экзонами , экзон один кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домена , экзон 4 кодирует трансмембранный домен, а экзон 5 кодирует цитоплазматический хвост. Внутри молекулы DR бета-цепь содержит все полиморфизмы, определяющие специфичность связывания пептида. Были описаны сотни аллелей DRB1 , и типирование этих полиморфизмов обычно проводится при трансплантации костного мозга и почек. [5]

Экспрессия гена [ править ]

DRB1 экспрессируется на уровне в пять раз выше, чем его паралоги DRB3 , DRB4 и DRB5. DRB1 присутствует у всех людей. Аллельные варианты DRB1 не связаны ни с одним из генов DRB3, DRB4 и DRB5, либо с одним из них. Наличие DRB5 связано с аллельными вариантами DRB1, в противном случае оно опускается. Есть 4 связанных псевдогена: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 и DRB9. [5]

См. Также [ править ]

  • HLA-DR

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000198502 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060586 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b c d "Ген Entrez: главный комплекс гистосовместимости HLA-DRB5, класс II, DR beta 5" .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Лау М., Терасаки П.И., Парк М.С. (1995). «Международный сотовый обмен, 1994». Клинические трансплантаты : 467–88. PMID  7547576 .
  • Донг Р.П., Кимура А., Сасадзуки Т. (1992). «Анализ последовательности трех новых аллелей DRw14-DRB1». Иммуногенетика . 36 (2): 130–3. DOI : 10.1007 / BF00215291 . PMID  1612646 . S2CID  32928324 .
  • Пьятье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблар Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика . 34 (2): 121–8. DOI : 10.1007 / BF00211424 . PMID  1869305 . S2CID  10116507 .
  • Нонг Й., Кандил О., Тобин Э. Х. и др. (1991). «Коровой белок p24 ВИЧ ингибирует индуцированное гамма-интерфероном повышение уровней мРНК тяжелой цепи HLA-DR и цитохрома b в линии человеческих моноцитоподобных клеток THP1». Клетка. Иммунол . 132 (1): 10–6. DOI : 10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-S . PMID  1905983 .
  • Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную МНС CD4-класса II». J. Immunol . 144 (2): 526–31. PMID  1967269 .
  • Каллахан К.М., Форт М.М., Обах Е.А. и др. (1990). «Генетическая изменчивость gp120 ВИЧ-1 влияет на взаимодействие с молекулами HLA и рецептором Т-клеток». J. Immunol . 144 (9): 3341–6. PMID  1970352 .
  • Петерсдорф Э.В., Гриффит Р.Л., Эрлих Х.А. и др. (1990). «Уникальные последовательности для двух генов HLA-DRB1, экспрессируемых на разных гаплотипах DRw6». Иммуногенетика . 32 (2): 96–103. DOI : 10.1007 / BF00210446 . PMID  1975801 . S2CID  28007432 .
  • Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки вируса иммунодефицита человека gp120 и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (22): 9052–6. DOI : 10.1073 / pnas.87.22.9052 . PMC  55099 . PMID  1978941 .
  • Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). «Аллельное разнообразие генерируется обменом последовательностей внутри экзона в локусе DRB1 приматов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 88 (9): 3686–90. Bibcode : 1991PNAS ... 88.3686G . DOI : 10,1073 / pnas.88.9.3686 . PMC  51517 . PMID  2023919 .
  • Ли К.В., Джонсон А.Х., Херли К.К. (1990). «Два расходящихся пути эволюции привели к гаплотипам DRw13». J. Immunol . 145 (9): 3119–25. PMID  2212675 .
  • Горский J (1989). «Полиморфизм бета-цепи HLA-DR. Полиморфизм второго домена отражает эволюционное родство аллелей и может объяснять общедоступные серологические эпитопы». J. Immunol . 143 (1): 329–33. PMID  2471740 .
  • Клейтон Л.К., Сие М., Благочестивый Д.А., Рейнхерц Е.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1». Природа . 339 (6225): 548–51. Bibcode : 1989Natur.339..548C . DOI : 10.1038 / 339548a0 . PMID  2543930 . S2CID  4246781 .
  • Херли К.К., Грегерсен П.К., Горски Дж. И др. (1989). «Гаплотип DR3 (w18), DQw4 отличается от гаплотипов DR3 (w17), DQw2 по множеству локусов класса II». Гм. Иммунол . 25 (1): 37–50. DOI : 10.1016 / 0198-8859 (89) 90068-2 . PMID  2565895 .
  • Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T. и др. (1988). «Ингибирование функции CD4 + Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120». J. Immunol . 141 (11): 3715–7. PMID  2846691 .
  • Фриман С.М., Сондерс Т.Л., Мэдден М. и др. (1987). «Сравнение аллелей DR beta 1 от диабетиков и здоровых людей». Гм. Иммунол . 19 (1): 1–6. DOI : 10.1016 / 0198-8859 (87) 90033-4 . PMID  2884201 .
  • Ли Б.С., Ржавчина Н.А., МакМайкл А.Дж., Макдевитт ХО (1987). «Подтипы HLA-DR2 образуют дополнительное супертипическое семейство аллелей бета DR» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 84 (13): 4591–5. Bibcode : 1987PNAS ... 84.4591L . DOI : 10.1073 / pnas.84.13.4591 . PMC  305136 . PMID  2885840 .
  • Овербах Д., Рич К., Танежа К. (1986). «Характеристика трех генов бета HLA-DR, выделенных у пациента с инсулинозависимым диабетом HLA-DR 3/4». Иммуногенетика . 24 (1): 41–6. DOI : 10.1007 / BF00372296 . PMID  3015788 . S2CID  19599710 .
  • Ву С., Сондерс Т.Л., Бах Ф.Х. (1987). «Полиморфизм человеческих антигенов Ia, вызванный взаимным межгенным обменом между двумя локусами DR бета». Природа . 324 (6098): 676–9. DOI : 10.1038 / 324676a0 . PMID  3099214 . S2CID  4365990 .
  • Лю КП, Бах ФХ, Ву СК (1988). «Молекулярные исследования редкого гаплотипа DR2 / LD-5a / DQw3 HLA класса II. Множественные генетические механизмы в генерации полиморфных генов HLA класса II». J. Immunol . 140 (10): 3631–9. PMID  3129499 .
  • Steimle V, Hinkkanen A, Schlesier M, Epplen JT (1988). «Новая последовательность бета I HLA-DR из гаплотипа DRw11». Иммуногенетика . 28 (3): 208–10. DOI : 10.1007 / BF00375861 . PMID  3137159 . S2CID  2712069 .
  • v
  • т
  • е