Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа A-L1085
Возможное время происхождения140 000 YBP, [1] 125 000 - 382 000 YBP [2]
Возможное место происхожденияЦентральная - Северо-Западная Африка [1]
ПредокHomo Y-MRCA
ПотомкиA-V148 (A0), A-P305 (A1)
Самые высокие частотыНамибия (Цумкве Сан, Нама ) 60-70%
Южный Судан ( Динка , Шиллук , Нуэр ) 33% -61,5%
Эфиопия ( Бета Израиль ) 41% -46%

Гаплогруппа A-L1085 , также известная как гаплогруппа A0-T, является гаплогруппой Y-ДНК человека . Это часть отцовской линии почти всех живущих сегодня людей. SNP L1085 играет две роли в популяционной генетике : во - первых, большинство гаплогрупп Y-ДНК - отклонялись от него и; во-вторых, он определяет нерасчлененную базальную кладу A-L1085 *.

A0-T имеет две основные ветви: A-V148 (также известную как гаплогруппа A0) и гаплогруппа A-P305 (гаплогруппа A1).

Происхождение [ править ]

Гаплогруппа А распространена среди койсанцев .

Многие предположения о происхождении гаплогруппы A-L1085 предполагают, что она была связана с исконным населением южноафриканских охотников-собирателей. Это связано с тем, что родословная гаплогруппы A-L1085 часто встречается у народа сан .

Однако линии передачи A-L1085 из Южной Африки являются субкладами линии передачи A, обнаруженной в других частях Африки. Это говорит о том, что линии передачи A-L1085 прибыли в Южную Африку из других мест. [3] Две основные линии гаплогруппы A-L1085, A-V148 и A-P305, были обнаружены в Западной Африке, Северо-Западной Африке и Центральной Африке. Cruciani et al. 2011 предполагает, что эти линии могли возникнуть где-то между Центральной и Северо-Западной Африкой, хотя такая интерпретация все еще предварительная из-за неполного географического охвата африканских y-хромосом. [1]

Первоначальные исследования показали, что линии гаплогруппы A-L1085 возникли около 60000 лет назад, что значительно позже TMRCA для линий митохондриальной ДНК, которые сливаются между 150-200 тыс. Лет назад. Cruciani et al. 2011 год с серьезной реструктуризацией ветвей отодвинул корень дерева Y-хромосомы на 142 000 лет назад. [1]

В ноябре 2012 года новое исследование Scozzari et al. укрепили "гипотезу происхождения гаплогруппы A1b в северо-западном квадранте африканского континента и вместе с недавними открытиями древних линий Y-хромосомы в центрально-западной Африке предоставили новые доказательства географического происхождения человеческого MSY разнообразие". [4]

Географическое распространение [ править ]

Центральная Африка [ править ]

Гаплогруппа А-М13 наблюдается в популяциях северного Камеруна (2/9 = 22% Tupuri , [5] 4/28 = 14% Мандара , [5] 2/17 = 12% фульбе [6] ) и восточная ДРК ( 2/9 = 22% Alur , [5] 1/18 = 6% Hema , [5] 1/47 = 2% Mbuti [5] ).

Гаплогруппа A-M91 (xA-M31, A-M6, A-M32) наблюдалась у народа бакола на юге Камеруна (3/33 = 9%). [5]

Без тестирования на какой-либо субклад гаплогруппа A-L1085 наблюдалась в выборках нескольких популяций Габона , включая 9% (3/33) выборки бака , 3% (1/36) выборки ндуму , 2% (1/46) выборки Думы , 2% (1/57) выборки Нзеби и 2% (1/60) выборки Цого . [7]

Восточная Африка [ править ]

Гаплогруппа A-M13 распространена среди южных суданцев (53%) [8], особенно у динка (61,5%). [9] Гаплогруппа A-M13 также наблюдалась в другой выборке населения Южного Судана с частотой 45% (18/40), включая 1/40 A-M171. [10] О гаплогруппе А также сообщалось в 14,6% (7/48) образцов Амхара , [11] 10,3% (8/78) образцов оромо , [11] 13,6% (12/88) из другого образца. из Эфиопии, [10] и 41% выборки Бета-Израиль(Cruciani et al. 2002), и важные проценты также разделяют банту в Кении (14%, Луис и др. 2004) и Ирак в Танзании (от 3/43 = 7,0% (Луис и др. 2004) до 1/6 = 17% (Knight et al. 2003)).

Северная Африка [ править ]

Субклад A1 наблюдается у ливийских берберов , а субклад A-M13 наблюдается примерно у 3% египетских мужчин.

Южная Африка [ править ]

В одном исследовании было обнаружено гаплогруппа А на образцах различных койсанских -speaking колен с частотой в диапазоне от 10% до 70%. [5] Удивительно, но эта конкретная гаплогруппа не была обнаружена в образце хадзабе из Танзании, населения, которое традиционно считалось древним остатком койсанов из-за присутствия щелкающих согласных в их языке.

Европа [ править ]

Гаплогруппа A наблюдалась как A1 у европейских мужчин в Англии. Хромосома AY также с низкой частотой наблюдалась в Малой Азии, на Ближнем Востоке и на некоторых островах Средиземноморья, среди эгейских греков, сицилийцев (0,2% A1a на Капо-д'Орландо и 0,5% A1b на всем острове ), палестинцев. , Иорданцы и йеменцы. Без тестирования на какой-либо субклад гаплогруппа A1b наблюдалась в выборке греков из Митилини на Эгейском острове Лесбос [12], а A1b наблюдалась также у 0,1% иберийских евреев . Авторы одного исследования сообщили об обнаружении того, что , как представляется, гаплогруппа А на 3,1% (2/65) образец из киприотов , [13] хотя они окончательно не исключили возможность того, что любой из этих людей может принадлежать к гаплогруппе B.

Распределение субкладов [ править ]

Диверсия гаплогруппы A (Y-ДНК) и ее потомков.

A-V148 * (A0) *) [ редактировать ]

A-V148 - одно из двух основных ответвлений в A0-T. [1]

A-P305 * (A1 *) [ редактировать ]

Гаплогруппа A-P305 * в основном ограничена некоторыми частями Африки , хотя несколько случаев были зарегистрированы в Европе и Западной Азии .

Самый высокий уровень A-P305 обнаружен у пигмеев бакола (Южный Камерун ) - 8,3%, берберов из Алжира - 1,5% [1] и в Гане . [4] Клада также достигает высоких частот в популяциях бушменов- охотников-собирателей в Южной Африке , за которыми следуют многие нилотские группы в Восточной Африке . Однако, гаплогруппа старейших суб-клады исключительно найдены в Центральном - Северо - Западной Африке , где он, и , следовательно , Y-хромосомный Адам, как полагают, возникла около 140000 лет назад.[1] Клада такжедовольночасто наблюдалась в определенных популяциях в Эфиопии , а также в некоторыхгруппах пигмеев в Центральной Африке.

Гаплогруппа A-L1085 менее распространена среди носителей языка Нигер-Конго , которые в значительной степени принадлежат к кладе E1b1a . Гаплогруппа E в целом, как полагают, возникла в Северо-Восточной Африке [14], а позже была завезена в Западную Африку, откуда она распространилась около 5000 лет назад в Центральную, Южную и Юго-Восточную Африку с расширением банту . [15] [7]Согласно Wood et al. (2005) и Rosa et al. (2007), такие относительно недавние перемещения населения из Западной Африки изменили ранее существовавшее популяционное Y-хромосомное разнообразие в Центральной, Южной и Юго-Восточной Африке, заменив предыдущие гаплогруппы в этих областях доминирующими в настоящее время линиями E1b1a. Однако следы предковых жителей сегодня можно наблюдать в этих регионах по присутствию гаплогрупп ДНК Y A-M91 и B-M60 , которые распространены в определенных реликтовых популяциях, таких как пигмеи мбути и койсаны . [16] [5] [17]

Частоты гаплогруппы А
Африке
Исследуемая популяцияFreq.
(в %)
[5]Цумкве Сан (Намибия)66%
[5]Нама (Намибия)64
[8]Динка (Судан)62
[8]Шиллук (Судан)53
[8]Нуба (Судан)46
[10]Хойсан44 год
[6] [18]Эфиопские евреи41 год
[5] [6]! Кунг / Секеле~ 40
[8]Боргу (Судан)35 год
[8]Нуэр (Судан)33
[8]Мех (Судан)31 год
[5]Масаи (Кения)27
[19]Нара (Эритрея)20
[8]Масалит (Судан)19
[5] [11]Амхара (Эфиопия)~ 16
[10]Эфиопы14
[20]Банту (Кения)14
[5]Мандара (Камерун)14
[8]Хауса (Судан)13
[6]Кхве (Южная Африка)12
[6]Фульбе (Камерун)12
[5]Дама (Намибия)11
[11]Оромо (Эфиопия)10
[19]Кунама (Эритрея)10
[5]Южно-семитский (Эфиопия)10
[20]Арабы (египет)3

В составной выборке из 3551 африканского мужчины гаплогруппа А имела частоту 5,4%. [21] Самые высокие частоты гаплогруппы А были зарегистрированы среди койсанов Южной Африки, бета-Израиля и нило-сахарцев .

A-M31 [ править ]

Субклад A-M31 был обнаружен примерно в 2,8% (8/282) из ​​семи выборок различных этнических групп в Гвинее-Бисау , особенно среди Папель-Манджако-Манканья (5/64 = 7,8%). [16] В более раннем исследовании Gonçalves et al. В 2003 г. сообщалось об обнаружении A-M31 в 5,1% (14/276) образцов из Гвинеи-Бисау и в 0,5% (1/201) пары образцов из Кабо-Верде . [22] Авторы другого исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A-M31 у 5% (2/39) образца мандинка из Сенегамбии и 2% (1/55) образца догонов из Мали . [5]Гаплогруппа A-M31 также была обнаружена у 3% (2/64) выборки берберов из Марокко [6] и у 2,3% (1/44) выборки неустановленной этнической принадлежности из Мали . [10]

По крайней мере, семь мужчин с наследственными корнями в Йоркшире , Англия и носящими отличительную фамилию Ревис, были идентифицированы как принадлежащие к субкладу A-M31. В новостях говорилось, что мужчины были фенотипически «европейцами» и не знали об африканском происхождении. Последующие исследования показали, что в 18 веке у них был общий предок по отцовской линии. [21]

A-M6 [ править ]

A-M6 (ранее A2) обычно встречается у койсанских народов. Авторы одного исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A-M6 (xA-P28) у 28% (8/29) выборки Цумкве Сан и 16% (5/32) выборки ! Kung / Sekele и гаплогруппы A-P28 в 17% (5/29) образца Tsumkwe San, 9% (3/32) образца ! Kung / Sekele, 9% (1/11) образца Nama и 6% (1/18) образца Dama . [5] Авторы другого исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A-M6 у 15,4% (6/39) выборки койсанских мужчин, включая 5/39 A-M6 (xA-M114) и 1/39 A-M114. [10]

A-M32 [ править ]

Клада A-M32 (ранее A3) содержит самые густонаселенные ветви гаплогруппы A-L1085 и в основном встречается в Восточной Африке и Южной Африке .

A-M28 [ править ]

Субклад A-M28 (ранее A3a) редко наблюдался в районе Африканского Рога . В 5% (1/20) смешанной выборки носителей южносемитских языков из Эфиопии [5] 1,1% (1/88) выборки эфиопов [10] и 0,5% (1/201) сомалийцев. . [23]

A-M51 [ править ]

Субклад A-M51 (ранее A3b1) чаще всего встречается у койсанских народов (6/11 = 55% нама , [5] 11/39 = 28% койсан, [10] 7/32 = 22% ! Кунг / секеле, [ 5] 6/29 = 21% Цумкве Сан, [5] 1/18 = 6% Дама [5] ). Тем не менее, это также было обнаружено с меньшей частотой среди народов банту в южной части Африки , в том числе 2/28 = 7% сото-тсвана , [5] 3/53 = 6% некойсанских южноафриканцев, [10] 4/80 = 5% Кос , [5] и 1/29 = 3% Зулу . [5]

A-M13 [ править ]

Субклад A-M13 (ранее A3b2), который обычно встречается в Восточной Африке и северном Камеруне, отличается от субкладов, обнаруженных в койсанских образцах, и лишь отдаленно связан с ними. Это открытие предполагает древнее расхождение.

В Судане гаплогруппа A-M13 была обнаружена у 28/53 = 52,8% жителей Южного Судана , 13/28 = 46,4% нубийцев центрального Судана, 25/90 = 27,8% жителей Западного Судана , 4/32 = 12,5%. местных жителей хауса и 5/216 = 2,3% жителей Северного Судана. [24]

В Эфиопии одно исследование показало, что гаплогруппа A-M13 обнаружена у 14,6% (7/48) выборки амхара и 10,3% (8/78) выборки оромо . [11] В другом исследовании сообщалось об обнаружении гаплогруппы A-M118 у 6,8% (6/88) и гаплогруппы A-M13 (xA-M171, A-M118) у 5,7% (5/88) смешанной выборки эфиопов, что составляет всего 12,5% (11/88) A-M13. [10]

Гаплогруппа A-M13 также наблюдается иногда за пределами Центральной и Восточной Африке, как и в Эгейском регионе в Турции (2/30 = 6,7% [25] ), йеменские евреи (1/20 = 5% [18] ), Египет (4/147 = 2,7%, [20] 3/92 = 3,3% [5] ), палестинские арабы (2/143 = 1,4% [26] ), Сардиния (1/77 = 1,3%, [27] 1 / 22 = 4,5% [10] ), столица Иордании , Аммана (1/101 = 1% [28] ) и Омана (1/121 = 0,8% [20] ).

Филогенетика [ править ]

Филогенетическая история [ править ]

Основная статья: Таблица преобразования для гаплогрупп Y-хромосомы

До 2002 г. в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
А-М317я1А1-H1АA1A1A1A1aA1A1A1aA1aA1aA1aA1a
А-М627я23-H1АA2 *A2A2A2A2A2A2A2A2A2A1b1a1a
А-М11427я23-H1АA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA1b1a1a1a
A-P2827я24-H1АA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA1b1a1a1b
А-М32********A3A3A3A3A3A3A3A3A3A1b1b
А-М287я1А1-H1АA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA1b1b1
A-M517я1А1-H1АA3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A1b1b2a
А-М137я1А2Eu1H1АA3b2 *A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A1b1b2b
A-M1717я1А2Eu1H1АA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aудаленный
A-M1187я1А2Eu1H1АA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA1b1b2b1

Оригинальные исследовательские публикации [ править ]

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Hammer 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ вс 1999
  • η Капелли 2001

Cruciani 2011 [ править ]

Пересмотренное генеалогическое древо y-хромосомы Cruciani et al. 2011 по сравнению с генеалогическим древом из Karafet et al. 2008. A1b теперь известен как A0 согласно ISOGG.

Существенный сдвиг в понимании дерева гаплогруппы А произошел с публикацией ( Cruciani 2011 ) . Первоначальное секвенирование Y-хромосомы человека показало, что первое расщепление в генеалогическом дереве Y-хромосомы произошло из-за мутации M91, которая отделила гаплогруппу A от гаплогруппы BT . [29] Однако теперь известно, что самый глубокий раскол в дереве Y-хромосомы обнаруживается между двумя ранее описанными субкладами гаплогруппы A, а не между гаплогруппой A и гаплогруппой BT. Субклады A1b и A1a-T теперь спускаются непосредственно от корня дерева. Перестройка генеалогического древа Y-хромосомы подразумевает, что линии, классифицируемые как гаплогруппа A, не обязательно образуют монофилетическую кладу.[1] Гаплогруппа A, таким образом, относится к набору родословных, которые не обладают маркерами, которые определяют гаплогруппу BT, хотя многие родословные внутри гаплогруппы A связаны лишь очень отдаленно.

Мутации M91 и P97 отличают гаплогруппу A от гаплогруппы BT . В хромосомах гаплогруппы A маркер M91 состоит из участка из 8 единиц нуклеотидных оснований T. В хромосомах гаплогруппы BT и шимпанзе этот маркер состоит из 9 единиц нуклеиновых оснований T. Этот паттерн предполагал, что участок 9T гаплогруппы BT был предковой версией и что гаплогруппа A образовалась в результате делеции одного азотистого основания . [1] [29]

Но согласно Cruciani et al. 2011 г., область, окружающая маркер M91, является горячей точкой мутаций, склонной к повторяющимся мутациям. Следовательно, возможно, что участок 8T гаплогруппы A может быть наследственным состоянием M91, а 9T гаплогруппы BT может быть производным состоянием, которое возникло при вставке 1T. Это могло бы объяснить, почему субклады A1b и A1a-T, самые глубокие ветви гаплогруппы A, оба обладают 8T-отрезком. Кроме того, Cruciani et al. 2011 определил, что маркер P97, который также используется для идентификации гаплогруппы A, обладал наследственным состоянием в гаплогруппе A, но производным состоянием в гаплогруппе BT . [1]

Филогенетические деревья [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве консорциума Y-хромосом (YCC) [30], дереве гаплогруппы Y-ДНК ISOGG [15] и последующих опубликованных исследованиях.

Y-хромосомный Адам

  • A0 (ранее A1b) (P305, V148, V149, V154, V164, V166, V172, V173, V177, V190, V196, V223, V225, V229, V233, V239)
  • A1 (A1a-T согласно Cruciani 2011) (L985, L989, L990, L1002, L1003, L1004, L1009, L1013, L1053, V161, V168, V171, V174, V203, V238, V241, V250, V238, V241, V250 )
    • A1a (M31, P82, V4, V14, V15, V25, V26, V28, V30, V40, V48, V53, V57, V58, V63, V76, V191, V201, V204, V214, V215, V236)
    • A1b (A2-T согласно Cruciani 2011) (P108, V221)
      • A1b1 (L419)
        • A1b1a (V50, V82, V198, V224)
          • A1b1a1 ранее A2 (M14, M23, L968 / M29 / P3 / PN3, M71, M135, M141, M206, M276 / P247, M277 / P248, MEH1, P4, P5, P36.1, Page71, Page87, Page95)
            • A1b1a1a (M6, M196)
              • A1b1a1a1 (M212)
                • A1b1a1a1a ранее A2a (M114)
                • A1b1a1a1b ранее A2b (P28)
                • A1b1a1a1c ранее A2c (P262)
        • A1b1b ранее A3 (M32)
          • A1b1b1 ранее A3a (M28, M59)
          • A1b1b2 ранее A3b (M144, M190, M220, P289)
            • A1b1b2a ранее A3b1 (M51, P100, P291)
              • A1b1b2a1 ранее A3b1a (P71, P102)
            • A1b1b2b ранее A3b2 (M13, M127, M202, M219, M305):
              • A1b1b2b1 (M118)
      • BT (M42, M94, M139, M299, M60, M181 / страница 32, P85, P90, P97, страница 65.1 / SRY1532.1 / SRY10831.1, V21, V29, V31, V59, V64, V102, V187, V202, V216, V235)

См. Также [ править ]

Генетика [ править ]

  • Африканская примесь в Европе
  • Генетическая генеалогия
  • Гаплогруппа
  • Гаплотип
  • Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
  • Молекулярная филогенетика
  • Парагруппа
  • Субклад
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Африки к югу от Сахары

Субклады Y-ДНК A [ править ]

  • А-М114
  • A-M118
  • А-М13
  • A-M171
  • А-М28
  • А-М31
  • А-М32
  • A-M51
  • А-М6
  • A-P28

Основное дерево Y-ДНК [ править ]

Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )
« Y-хромосомный Адам »
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    Т   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]П  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NOQр
Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски  ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID  24166809 . ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». Это имя с тех пор было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из последовательностей по всему миру 1244 Y-хромосома» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 .   В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее название Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее название Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e f g h i j Cruciani F, Trombetta B, Massaia A, Destro-Bisol G, Sellitto D, Scozzari R (июнь 2011 г.). «Пересмотренный корень филогенетического дерева Y-хромосомы человека: происхождение отцовского разнообразия в Африке» . Американский журнал генетики человека . 88 (6): 814–8. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2011.05.002 . PMC 3113241 . PMID 21601174 .  
  2. ↑ Mendez FL, Krahn T, Schrack B, Krahn AM, Veeramah KR, Woerner AE, Fomine FL, Bradman N, Thomas MG, Karafet TM, Hammer MF (март 2013 г.). «Афроамериканская отцовская линия добавляет чрезвычайно древний корень к филогенетическому дереву Y-хромосомы человека» . Американский журнал генетики человека . 92 (3): 454–9. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2013.02.002 . PMC 3591855 . PMID 23453668 .  
  3. ^ Батини С, Ферри О, Дестро-Bisol G, Brisighelli Ж, Luiselli Д, Санчес-Диз Р, Роча Дж, Саймонсон Т, Брем А, В Монтано, Elwali Н.Е., Spedini G, D'Amato ME, Майрс N, Эббесен П., Комас Д., Капелли С. (сентябрь 2011 г.). «Сигнатуры процессов заселения до сельскохозяйственных культур в Африке к югу от Сахары, выявленные филогеографией ранних линий Y-хромосомы» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 28 (9): 2603–13. DOI : 10.1093 / molbev / msr089 . PMID 21478374 .  
  4. ^ a b Scozzari R, Massaia A, D'Atanasio E, Myres NM, Perego UA, Trombetta B, Cruciani F (2012). «Молекулярное рассечение базальных клад в филогенетическом дереве Y-хромосомы человека» . PLOS ONE . 7 (11): e49170. Bibcode : 2012PLoSO ... 749170S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0049170 . PMC 3492319 . PMID 23145109 .  
  5. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa Wood ET, Stover DA, Ehret C, Destro-Bisol G, Spedini G, McLeod H, Louie L , Бамшад М., Штрассманн Б.И., Судьял Х., Хаммер М.Ф. (июль 2005 г.). «Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства предвзятых по полу демографических процессов» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–76. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201408. PMID  15856073 . ср. Приложение A: Частоты гаплотипов Y-хромосомы
  6. ^ Б с д е е Cruciani F, P, Santolamazza Shen P, V, Маколея Морального P, Olckers A, D, Модиано Holmes S, Destro-Bisol G, Coia V, DC, Wallace Oefner PJ, Torroni A, Cavalli- Sforza LL, Scozzari R, Underhill PA (май 2002 г.). «Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением» . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1197–214. DOI : 10.1086 / 340257 . PMC 447595 . PMID 11910562 .  
  7. ^ a b Берниелл-Ли Г., Калафель Ф, Бош Е, Хейер Е., Сика Л., Мугияма-Дауда П., ван дер Вин Л., Хомберт Дж. М., Кинтана-Мурси Л., Комас Д. (июль 2009 г.). «Генетические и демографические последствия экспансии банту: понимание отцовских линий человека» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (7): 1581–9. DOI : 10.1093 / molbev / msp069 . PMID 19369595 . 
  8. ^ a b c d e f g h i 28/53 (Динка, Нуэр и Шиллук), Hassan HY, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Ibrahim ME (ноябрь 2008 г.). «Вариации Y-хромосомы среди суданцев: ограниченный поток генов, соответствие языку, географии и истории» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 137 (3): 316–23. DOI : 10.1002 / ajpa.20876 . PMID 18618658 . Архивировано из оригинального (PDF) 04.03.2009.  
  9. ^ 16/26, Hassan et al. 2008 г.
  10. ^ a b c d e f g h i j k Андерхилл П.А., Шен П., Линь А.А., Джин Л., Пассарино Г., Ян У.Х., Кауфман Э., Бонне-Тамир Б., Бертранпетит Дж., Франкалаччи П., Ибрагим М., Дженкинс Т. Kidd JR, Mehdi SQ, Seielstad MT, Wells RS, Piazza A, Davis RW, Feldman MW, Cavalli-Sforza LL, Oefner PJ (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Генетика природы . 26 (3): 358–61. DOI : 10.1038 / 81685 . PMID 11062480 . S2CID 12893406 .  
  11. ^ a b c d e Semino O, Santachiara-Benerecetti AS, Falaschi F, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA (январь 2002 г.). «Эфиопы и койсаны разделяют самые глубокие клады филогении Y-хромосомы человека» . Американский журнал генетики человека . 70 (1): 265–8. DOI : 10.1086 / 338306 . PMC 384897 . PMID 11719903 .  
  12. ^ Ди Джакомо Ф, Лука Ф, Ананьоу Н., Чаварелла Джи, Корбо Р.М., Креста М, Куччи Ф., Ди Стази Л., Агостиано В., Гипараки М., Лутрадис А., Мамми 'С., Михалодимитракис Е. Н., Папола Ф, Педичини Дж, Плата E, Терренато Л., Тофанелли С., Маласпина П., Новеллетто А. (сентябрь 2003 г.). «Клинические паттерны человеческого Y-хромосомного разнообразия в континентальной Италии и Греции во власти дрейфа и эффектов основателя». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 387–95. DOI : 10.1016 / S1055-7903 (03) 00016-2 . PMID 12927125 . 
  13. ^ Капелли С, рыжим Н, Романен V, Калите F, Лефранк G, Delague В, Megarbane А, Феличе А.Е., Pascali В.Л., Неофит П.И., Poulli Z, Novelletto А, Маласпин Р, Terrenato л, Berebbi А, Фелла М, Томас MG, Goldstein DB (март 2006 г.). «Структура населения в бассейне Средиземного моря: перспектива Y-хромосомы». Анналы генетики человека . 70 (Pt 2): 207–25. DOI : 10.1111 / j.1529-8817.2005.00224.x . ЛВП : 2108/37090 . PMID 16626331 . S2CID 25536759 .  
  14. ^ Абу-амеро KK, Hellani A, Гонсалес AM, Larruga JM, Кабрер В.М., Андерхилл П. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с соседними регионами» . BMC Genetics . 10 (59): 59. DOI : 10.1186 / 1471-2156-10-59 . PMC 2759955 . PMID 19772609 .  
  15. ^ a b Международное общество генетической генеалогии. «Дерево гаплогруппы Y-ДНК» . Проверено 2012 . Проверить значения даты в: |access-date=( помощь )
  16. ^ а б Роза А., Орнелас С., Джоблинг М.А., Брем А., Виллемс Р. (2007). «Разнообразие Y-хромосомы в популяции Гвинеи-Бисау: мультиэтническая перспектива» . BMC Evolutionary Biology . 7 : 124. DOI : 10.1186 / 1471-2148-7-124 . PMC 1976131 . PMID 17662131 .  
  17. ^ Андерхилл П., Passarino G, Lin AA, Shen P, Mirazón Лар M, Foley RA, Oefner PJ, Cavalli-Sforza LL (январь 2001). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций» . Анналы генетики человека . 65 (Pt 1): 43–62. DOI : 10.1046 / j.1469-1809.2001.6510043.x . PMID 11415522 . S2CID 9441236 .  
  18. ^ а б Шен П., Лави Т., Кивисилд Т., Чжоу В., Сенгун Д., Гефель Д., Шпирер И., Вульф Е., Хиллель Дж., Фельдман М. В., Офнер П. Джей (сентябрь 2004 г.) «Реконструкция отцовства и материнства самаритян и других израильских популяций на основе вариаций последовательности ДНК Y-хромосомы и митохондрий». Мутация человека . 24 (3): 248–60. DOI : 10.1002 / humu.20077 . PMID 15300852 . S2CID 1571356 .  
  19. ^ a b Cruciani F, Trombetta B, Sellitto D, Massaia A, Destro-Bisol G, Watson E, Beraud Colomb E, Dugoujon JM, Moral P, Scozzari R (июль 2010 г.). «Человеческая гаплогруппа Y хромосомы R-V88: отцовская генетическая запись раннего среднего голоцена транссахарских связей и распространение чадских языков» . Европейский журнал генетики человека . 18 (7): 800–7. DOI : 10.1038 / ejhg.2009.231 . PMC 2987365 . PMID 20051990 .  
  20. ^ a b c d Луис Дж. Р., Роулд Д. Д., Регейро М., Цейро Б., Синниоглу С., Роземан С., Андерхилл, Пенсильвания, Кавалли-Сфорца, LL, Эррера, Р. Дж. (март 2004 г.) «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей» . Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–44. DOI : 10.1086 / 382286 . PMC 1182266 . PMID 14973781 .  
  21. ^ a b King TE, Parkin EJ, Swinfield G, Cruciani F, Scozzari R, Rosa A, Lim SK, Xue Y, Tyler-Smith C, Jobling MA (март 2007 г.). «Африканцы в Йоркшире? Наиболее глубоко укоренившаяся ветвь филогении Y в английской генеалогии» . Европейский журнал генетики человека . 15 (3): 288–93. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201771 . PMC 2590664 . PMID 17245408 .  
    Новостная статья: «Клан Йоркшир связан с Африкой» . BBC News . 2007-01-24 . Проверено 27 января 2007 .
  22. ↑ Gonçalves R, Rosa A, Freitas A, Fernandes A, Kivisild T, Villems R, Brehm A (ноябрь 2003 г.). «Линия Y-хромосомы на островах Кабо-Верде свидетельствует о разнообразном географическом происхождении первых поселенцев мужского пола». Генетика человека . 113 (6): 467–72. DOI : 10.1007 / s00439-003-1007-4 . ЛВП : 10400,13 / 3047 . PMID 12942365 . S2CID 63381583 .  
  23. ^ Абу-амеро KK, Hellani A, Гонсалеса AM, Larruga JM, Кабрера В.М., Андерхилл PA (22 сентября 2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с соседними регионами» . BMC Genetics . 10 : 59. DOI : 10.1186 / 1471-2156-10-59 . PMC 2759955 . PMID 19772609 .  
  24. ^ Хишам Ю. Хассан и др. (2008). «Южный суданец» включает 26 динка, 15 шиллуков и 12 нуэр. «Западный суданец» включает 26 боргу, 32 масалита и 32 фура. «Северный суданец» включает 39 нубийцев, 42 беджа, 33 копта, 50 гаалинцев, 28 месерий и 24 аракина.
  25. ^ Cinnioglu С, король R, Кивисильд Т, и др. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–148. DOI : 10.1007 / s00439-003-1031-4 . PMID 14586639 . S2CID 10763736 .  
  26. Перейти ↑ Nebel A, Filon D, Brinkmann B, Majumder PP, Faerman M, Oppenheim A (ноябрь 2001 г.). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока» . Американский журнал генетики человека . 69 (5): 1095–112. DOI : 10.1086 / 324070 . PMC 1274378 . PMID 11573163 .  
  27. ^ Семино О, Пассарино Г., Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Э., Де Бенедиктис Дж., Франкалаччи П., Коуватси А., Лимборска С., Маркикиа М., Мика А., Мика Б., Приморак Д., Сантачиара-Бенерецетти А.С., Кавалли -Sforza LL, Андерхилл, Пенсильвания (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолита Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива Y-хромосомы». Наука . 290 (5494): 1155–9. Bibcode : 2000Sci ... 290.1155S . DOI : 10.1126 / science.290.5494.1155 . PMID 11073453 . 
  28. ^ Флорес С, маки-Мейера N, Larruga Ю.М., Кабрера В.М., Karadsheh Н, Гонсалес М. (2005). «Изоляты в коридоре миграций: анализ вариации Y-хромосомы в Иордании с высоким разрешением» . Журнал генетики человека . 50 (9): 435–41. DOI : 10.1007 / s10038-005-0274-4 . PMID 16142507 . 
  29. ^ a b Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .  
  30. ^ Krahn, Томас. "YCC Tree" . Хьюстон, Техас: FTDNA. Архивировано из оригинального 26 июля 2011 года . Проверено 16 мая 2011 года .