Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен с гистоновых деацетилаз )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гистоновая деацетилаза
2vqj.png
Каталитический домен гистондеацетилазы 4 человека со связанным ингибитором. Рендеринг PDB на основе 2vqj . [1]
Идентификаторы
ЕС нет.3.5.1.98
№ CAS9076-57-7
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmigo / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки
Суперсемейство гистоновых деацетилаз
Идентификаторы
Условное обозначениеHist_deacetyl
PfamPF00850
ИнтерПроIPR000286
SCOP21c3s / СФЕРА / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Гистондезацетилаза ( EC 3.5.1.98 , HDAC ) представляет собой класс ферментов , которые удаляют ацетильные группы (O = С-СН 3 ) с й-N-ацетил - лизин аминокислоты на гистоне , позволяя гистоны , чтобы обернуть ДНК более плотно . [2] Это важно, потому что ДНК обернута вокруг гистонов, а экспрессия ДНК регулируется ацетилированием и деацетилированием. Его действие противоположно действию гистонацетилтрансферазы . Белки HDAC теперь также называют лизиндеацетилазами (KDAC), чтобы описать их функцию, а не их мишень, которая также включает негистоновые белки.[3]

Суперсемейство HDAC [ править ]

Вместе с ацетилполиаминамидогидролазами и белками утилизации ацетоина гистондеацетилазы образуют древнее суперсемейство белков, известное как суперсемейство гистондеацетилаз. [4]

Классы HDAC у высших эукариот [ править ]

HDAC подразделяются на четыре класса в зависимости от гомологии последовательности с исходными ферментами дрожжей и организации домена: [5]

Классификация HDAC у высших эукариот
КлассЧленыКаталитические сайтыСубклеточная локализацияРаспределение тканейСубстратыСвязующие партнерыНокаут-фенотип
яHDAC11ЯдроВездесущийРецептор андрогенов , SHP , p53 , MyoD , E2F1 , STAT3-Эмбриональная летальность, повышенное ацетилирование гистонов, увеличение p21 и p27
HDAC21ЯдроВездесущийГлюкокортикоидный рецептор , YY1 , BCL6 , STAT3-Сердечный дефект
HDAC31ЯдроВездесущийSHP , YY1 , GATA1 , RELA , STAT3 , MEF2D--
HDAC81Ядро / цитоплазмаВездесущий?-EST1B-
IIAHDAC41Ядро / цитоплазмасердце, скелетная мышца, мозгGCMA , GATA1 , HP1RFXANKДефекты в хондроцитов дифференциации
HDAC51Ядро / цитоплазмасердце, скелетная мышца, мозгGCMA , Smad7 , HP1REA , рецептор эстрогенаСердечный дефект
HDAC71Ядро / цитоплазма / митохондриисердце, скелетные мышцы, поджелудочная железа, плацентаPLAG1 , PLAG2HIF1A , BCL6 , рецептор эндотелина , ACTN1 , ACTN4 , рецептор андрогена , Tip60Поддержание целостности сосудов, увеличение MMP10
HDAC91Ядро / цитоплазмамозг, скелетная мышца-FOXP3Сердечный дефект
МИБHDAC62Преимущественно цитоплазмасердце, печень, почки, плацентаα-Тубулин , HSP90 , SHP , SMAD7RUNX2-
HDAC101Преимущественно цитоплазмапечень, селезенка, почки---
IIIсиртуины у млекопитающих ( SIRT1 , SIRT2 , SIRT3 , SIRT4 , SIRT5 , SIRT6 , SIRT7 )------
Sir2 в дрожжах S. cerevisiae------
IVHDAC112Ядро / цитоплазмамозг, сердце, скелетные мышцы, почки---

HDAC (кроме класса III) содержат цинк и известны как Zn 2+ -зависимые гистоновые деацетилазы. [6] Они имеют классическую складку аргиназы и структурно и механистически отличаются от сиртуинов (класс III), которые складываются в архитектуру Россмана и зависят от NAD + . [7]

Подтипы [ править ]

Белки HDAC сгруппированы в четыре класса (см. Выше) на основе функции и сходства последовательностей ДНК. Класс I, II и IV считаются «классическими» HDAC, активность которых ингибируется трихостатином A (TSA) и имеет цинк-зависимый активный центр, тогда как ферменты класса III представляют собой семейство NAD + -зависимых белков, известных как сиртуины, и на них не влияет компании TSA. [8] Гомологи этих трех групп обнаружены у дрожжей, имеющих следующие названия: пониженная калиевая зависимость 3 (Rpd3), что соответствует классу I; гистондеацетилаза 1 (hda1), соответствующая Классу II; и регулятор тихой информации 2 ( Sir2), соответствующий III классу. Класс IV содержит только одну изоформу (HDAC11), которая не является высокогомологичной ни с ферментами дрожжей Rpd3, ни с hda1 [9], и поэтому HDAC11 отнесен к собственному классу. Ферменты класса III считаются отдельным типом ферментов и имеют другой механизм действия; эти ферменты являются NAD + -зависимыми, тогда как HDAC в других классах требуют Zn 2+ в качестве кофактора. [10]

Эволюция [ править ]

HDAC сохраняются в процессе эволюции, ортологи обнаруживаются у всех эукариот и даже у архей . Все верхние эукариоты, включая позвоночных, растения и членистоногих, обладают по крайней мере одним HDAC на класс, в то время как большинство позвоночных несут 11 канонических HDAC, за исключением костных рыб, у которых отсутствует HDAC2, но, по-видимому, есть дополнительная копия HDAC11, получившая название HDAC12. . Растения несут дополнительные HDAC по сравнению с животными, предположительно для выполнения более сложной регуляции транскрипции, необходимой этим сидячим организмам. По-видимому, HDAC происходят из предкового ацетил-связывающего домена, поскольку гомологи HDAC были обнаружены у бактерий в форме белков утилизации ацетоина (AcuC). [2]

Топологическое филогенетическое древовидное представление 226 членов семейства белков HDAC. [2]

Субклеточное распределение [ править ]

Внутри HDAC класса I HDAC 1, 2 и 3 обнаруживаются в основном в ядре, тогда как HDAC8 обнаруживается как в ядре, так и в цитоплазме, а также ассоциирован с мембраной. HDAC класса II (HDAC4, 5, 6, 7, 9 и 10) способны перемещаться в ядро ​​и из него в зависимости от различных сигналов. [11] [12]

HDAC6 - это цитоплазматический фермент, связанный с микротрубочками. HDAC6 деацетилирует тубулин , Hsp90 и кортактин и образует комплексы с другими белками-партнерами и, следовательно, участвует во множестве биологических процессов. [13]

Функция [ править ]

Модификация гистона [ править ]

Хвосты гистонов обычно заряжены положительно из-за аминогрупп, присутствующих в их аминокислотах лизина и аргинина . Эти положительные заряды помогают гистоновым хвостам взаимодействовать и связываться с отрицательно заряженными фосфатными группами на основной цепи ДНК. Ацетилирование , которое обычно происходит в клетке, нейтрализует положительные заряды гистонов, превращая амины в амиды, и снижает способность гистонов связываться с ДНК. Это уменьшенное связывание позволяет расширять хроматин , разрешая генетическую транскрипциюиметь место. Гистоновые деацетилазы удаляют эти ацетильные группы, увеличивая положительный заряд гистоновых хвостов и способствуя связыванию с высоким сродством между гистонами и основной цепью ДНК. Повышенное связывание ДНК уплотняет структуру ДНК, предотвращая транскрипцию.

Гистоновая деацетилаза участвует в ряде путей в живой системе. Согласно Киотской энциклопедии генов и геномов ( KEGG ), это:

  • Обработка экологической информации; сигнальная трансдукция ; сигнальный путь notch PATH: ko04330
  • Клеточные процессы; рост и гибель клеток; ПУТЬ клеточного цикла : ko04110
  • Болезни человека; раковые образования; хронический миелоидный лейкоз ПУТЬ: ko05220

Ацетилирование гистонов играет важную роль в регуляции экспрессии генов. Гиперацетилированный хроматин транскрипционно активен, а гипоацетилированный хроматин молчит. Исследование на мышах показало, что конкретная подгруппа генов мыши (7%) не регулировалась в отсутствие HDAC1. [14] Их исследование также обнаружило регуляторные перекрестные помехи между HDAC1 и HDAC2 и предложило новую функцию HDAC1 в качестве коактиватора транскрипции. Было обнаружено, что экспрессия HDAC1 увеличена в префронтальной коре головного мозга пациентов с шизофренией [15], что отрицательно коррелирует с экспрессией мРНК GAD67 .

Негистоновые эффекты [ править ]

Ошибочно рассматривать HDACs исключительно в контексте регуляции транскрипции генов путем модификации гистонов и структуры хроматина, хотя это, по-видимому, является преобладающей функцией. Функцию, активность и стабильность белков можно контролировать с помощью посттрансляционных модификаций . Фосфорилирование белков, пожалуй, наиболее широко изученная и понятная модификация, при которой определенные аминокислотные остатки фосфорилируются под действием протеинкиназ или дефосфорилируются под действием фосфатаз . Ацетилирование остатков лизина становится аналогичным механизмом, в котором негистоновые белки с действием acetylases и деацетилазами. [16] Именно в этом контексте было обнаружено, что HDACs взаимодействуют с множеством негистоновых белков - некоторые из них являются факторами транскрипции и ко-регуляторами , некоторые - нет. Обратите внимание на следующие четыре примера:

  • HDAC6 связан с агресомами . Неправильно свернутые белковые агрегаты маркируются убиквитинированием и удаляются из цитоплазмы с помощью динеиновых моторов через сеть микротрубочек к органелле, называемой агресомой. HDAC 6 связывает полиубиквитинированные неправильно свернутые белки и связывается с динеиновыми моторами, тем самым позволяя физически транспортировать неправильно свернутый белковый груз к шаперонам и протеасомам для последующего разрушения. [17] HDAC6 является важным регулятором функции HSP90, и его ингибитор предлагается для лечения метаболических нарушений. [18]
  • PTEN является важной фосфатазой, участвующей в передаче клеточных сигналов через фосфоинозиты и киназный путь AKT / PI3 . PTEN подлежит сложному регуляторному контролю посредством фосфорилирования, убиквитинирования, окисления и ацетилирования. Ацетилирование PTEN гистонацетилтрансферазой p300 / CBP-ассоциированным фактором ( PCAF ) может подавлять его активность; наоборот, деацетилирование PTEN деацетилазой SIRT1 и HDAC1 может стимулировать его активность. [19] [20]
  • APE1 / Ref-1 ( APEX1 ) представляет собой многофункциональный белок, обладающий как активностью репарации ДНК (на сайтах абазических и однонитевых разрывов), так и активностью регуляции транскрипции, связанной с окислительным стрессом . APE1 / Ref-1 ацетилируется PCAF; напротив, он стабильно связывается и деацетилируется HDAC класса I. Состояние ацетилирования APE1 / Ref-1, по-видимому, не влияет на его активность репарации ДНК , но оно регулирует его транскрипционную активность, такую ​​как его способность связываться с промотором ПТГ и инициировать транскрипцию гена паратироидного гормона . [21] [22]
  • NF-κB является ключевым фактором транскрипции и эффекторной молекулой, участвующей в ответах на клеточный стресс, состоящей из гетеродимера p50 / p65. Субъединица p65 контролируется ацетилированием через PCAF и деацетилированием через HDAC3 и HDAC6. [23]

Это лишь некоторые примеры постоянно возникающих негистоновых и нехроматиновых ролей для HDAC.

Нейродегенеративные заболевания [ править ]

Унаследованные мутации в гене, кодирующем FUS , связывающий РНК / ДНК белок, причинно связаны с боковым амиотрофическим склерозом (БАС). [24] FUS играет ключевую роль в ответе на повреждение ДНК, включая его прямое взаимодействие с гистондеацетилазой 1 (HDAC1). Мутантные белки FUS по БАС дефектны в ответе на повреждение ДНК и в рекомбинационной репарации ДНК , а также демонстрируют сниженное взаимодействие с HDAC1. [24]

Атаксия-телеангиэктазия возникает из-за мутации в гене Atm . Atm дикого типа кодирует протеинкиназу, используемую в ремоделировании хроматина и в эпигенетических изменениях , которые необходимы для восстановления двухцепочечных разрывов ДНК . [25] Мутация Atm заставляет нейроны накапливать ядерную гистоновую деацетилазу 4 (HDAC4), что приводит к усилению деацетилирования гистонов и изменению экспрессии нейрональных генов, что, вероятно, способствует нейродегенерации, характерной для атаксии-телеангиэктазии. [26]

Ингибиторы HDAC [ править ]

Основная статья: Ингибитор гистон-деацетилазы

Ингибиторы гистондеацетилазы (ИГД) давно используются в психиатрии и неврологии в качестве стабилизаторов настроения и противоэпилептических средств, например, вальпроевая кислота . В последнее время HDI изучаются как средство смягчения или лечения нейродегенеративных заболеваний . [27] [28] Также в последние годы были предприняты попытки разработать HDI для лечения рака. [29] [30] Вориностат (SAHA) был одобрен FDA в 2006 году для лечения кожных проявлений у пациентов с кожной Т-клеточной лимфомой (CTCL), у которых предыдущее лечение было неэффективным. Второй HDI, Istodax ( ромидепсин), была одобрена в 2009 г. для пациентов с CTCL. Точные механизмы, с помощью которых могут работать соединения, неясны, но предполагаются эпигенетические пути. [31] Кроме того, в клинических испытаниях изучается влияние вальпроевой кислоты на скрытые пулы ВИЧ у инфицированных людей. [32] HDI в настоящее время исследуются в качестве хемосенсибилизаторов для цитотоксической химиотерапии или лучевой терапии или в сочетании с ингибиторами метилирования ДНК на основе синергии in vitro. [33] Были разработаны селективные изоформ HDI, которые могут помочь в выяснении роли отдельных изоформ HDAC. [34] [35] [36]

Ингибиторы HDAC действуют на негистоновые белки, связанные с ацетилированием. HDI могут изменять степень ацетилирования этих молекул и, следовательно, увеличивать или подавлять их активность. В четырех приведенных выше примерах (см. « Функция» ) HDAC, действующих на негистоновые белки, в каждом из этих случаев ингибитор HDAC трихостатин А (TSA) блокирует эффект. ИЧР было показано , что изменять активность многих факторов транскрипции, в том числе ACTR , cMyb , E2F1, EKLF , FEN 1 , GATA, HNF-4 , HSP90, Ku70 , NF - kB, PCNA , p53, RB , Runx, SF1 Sp3, STAT, TFIIE, TCF , YY1. [37] [38]

Кетон тела β-оксибутират было показано на мышах , чтобы увеличить экспрессию гена в Foxo3a путем ингибирования гистондезацетилазы. [39]

Ингибиторы гистон-деацетилазы могут модулировать латентный период некоторых вирусов, что приводит к реактивации. [40] Было показано, что это происходит, например, с латентной инфекцией вируса герпеса-6 человека .

Ингибиторы гистон-деацетилазы показали активность против определенных видов и стадий Plasmodium, что может указывать на их потенциал в лечении малярии. Было показано, что HDI накапливают ацетилированный гистон H3K9 / H3K14, нижестоящую мишень HDAC класса I. [41]

См. Также [ править ]

  • Гистонацетилтрансфераза (HAT)
  • Ингибитор гистон-деацетилазы
  • Гистон-метилтрансфераза (HMT)
  • Ферменты, модифицирующие гистоны
  • Контроль РНК-полимеразы структурой хроматина

Ссылки [ править ]

  1. ^ Боттомли М.Дж., Ло Сурдо П., Ди Джовин П., Чирилло А., Скарпелли Р., Ферриньо Ф., Джонс П., Неддерман П. и др. (Сентябрь 2008 г.). «Структурный и функциональный анализ каталитического домена HDAC4 человека выявляет регуляторный структурный цинк-связывающий домен» . Журнал биологической химии . 283 (39): 26694–704. DOI : 10.1074 / jbc.M803514200 . PMID  18614528 .
  2. ^ a b c Milazzo G, Mercatelli D, Di Muzio G, Triboli L, De Rosa P, Perini G, Giorgi FM (май 2020 г.). «Деацетилазы гистонов (HDAC): эволюция, специфичность, роль в транскрипционных комплексах и фармакологическая применимость» . Гены . 11 (5): 556–604. DOI : 10,3390 / genes11050556 . PMID 32429325 . 
  3. ^ Чудхари C, C Кумар, Gnad F, Nielsen ML, Rehman M, Walther TC, Olsen СП, Mann М (август 2009). «Ацетилирование лизина нацелено на белковые комплексы и ко-регулирует основные клеточные функции». Наука . 325 (5942): 834–40. DOI : 10.1126 / science.1175371 . PMID 19608861 . 
  4. ^ Leipe DD, Ландсман D (сентябрь 1997). «Гистоновые деацетилазы, белки утилизации ацетоина и амидогидролазы ацетилполиамина являются членами древнего суперсемейства белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (18): 3693–7. DOI : 10.1093 / NAR / 25.18.3693 . PMC 146955 . PMID 9278492 .  
  5. ^ Докманович M, C Clarke, Marks PA (октябрь 2007). «Ингибиторы гистондеацетилазы: обзор и перспективы» . Молекулярные исследования рака . 5 (10): 981–9. DOI : 10.1158 / 1541-7786.MCR-07-0324 . PMID 17951399 . 
  6. ↑ Marks PA, Xu WS (июль 2009 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы: потенциал в терапии рака» . Журнал клеточной биохимии . 107 (4): 600–8. DOI : 10.1002 / jcb.22185 . PMC 2766855 . PMID 19459166 .  
  7. ^ Бюргера М, Chory J (2018). «Структурная и химическая биология деацетилаз углеводов, белков, малых молекул и гистонов» . Биология коммуникации . 1 : 217. DOI : 10.1038 / s42003-018-0214-4 . PMC 6281622 . PMID 30534609 .  
  8. ^ Имаи S, Armstrong CM, Kaeberlein M, L Guarente (февраль 2000). «Белок подавления транскрипции и долголетия Sir2 представляет собой НАД-зависимую гистоновую деацетилазу». Природа . 403 (6771): 795–800. DOI : 10.1038 / 35001622 . PMID 10693811 . 
  9. ^ Ян XJ, Seto E (март 2008). «Семейство лизиндеацетилаз Rpd3 / Hda1: от бактерий и дрожжей до мышей и людей» . Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 9 (3): 206–18. DOI : 10.1038 / nrm2346 . PMC 2667380 . PMID 18292778 .  
  10. ^ Barneda-Zahonero B, Парра M (декабрь 2012). «Гистоновые деацетилазы и рак» . Молекулярная онкология . 6 (6): 579–89. DOI : 10.1016 / j.molonc.2012.07.003 . PMC 5528343 . PMID 22963873 .  
  11. ^ Де Ruijter AJ, ван Геннип AH, Caron HN, Кемп S, ван Kuilenburg AB (Mar 2003). «Гистоновые деацетилазы (HDAC): характеристика классического семейства HDAC» . Биохимический журнал . 370 (Pt 3): 737–49. DOI : 10.1042 / BJ20021321 . PMC 1223209 . PMID 12429021 .  
  12. ^ Longworth MS, Laimins LA (июль 2006). «Гистоновая деацетилаза 3 локализуется на плазматической мембране и является субстратом Src» . Онкоген . 25 (32): 4495–500. DOI : 10.1038 / sj.onc.1209473 . PMID 16532030 . 
  13. Перейти ↑ Valenzuela-Fernández A, Cabrero JR, Serrador JM, Sánchez-Madrid F (июнь 2008 г.). «HDAC6: ключевой регулятор цитоскелета, миграции клеток и межклеточных взаимодействий». Тенденции в клеточной биологии . 18 (6): 291–7. DOI : 10.1016 / j.tcb.2008.04.003 . PMID 18472263 . 
  14. ^ Zupkovitz G, J Tischler, Посх М, Sadzak я, Рамзауер К, Еггер G, R Grausenburger, Schweifer N, Chiocca S, Т Деккер, Сейсер С (ноябрь 2006 г.). «Отрицательная и положительная регуляция экспрессии генов с помощью гистондеацетилазы 1 мыши» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (21): 7913–28. DOI : 10.1128 / MCB.01220-06 . PMC 1636735 . PMID 16940178 .  
  15. ^ Шарма RP, Грейсон DR, Gavin DP (январь 2008). «Экспрессия гистон-деактилазы 1 повышена в префронтальной коре головного мозга пациентов с шизофренией: анализ коллекции микрочипов Национального банка данных мозга» . Исследование шизофрении . 98 (1–3): 111–7. DOI : 10.1016 / j.schres.2007.09.020 . PMC 2254186 . PMID 17961987 .  
  16. ^ Glozak М.А., Сенгупт N, Zhang X, Seto E (декабрь 2005). «Ацетилирование и деацетилирование негистоновых белков». Джин . 363 : 15–23. DOI : 10.1016 / j.gene.2005.09.010 . PMID 16289629 . 
  17. ^ Родригес Гонсалес А, Лин T, Ikeda А.К., Симмс-Уолдрип T, Fu C Сакамото KM (апрель 2008). «Роль агресомного пути в раке: нацеливание на гистондеацетилазу 6-зависимую деградацию белка» . Исследования рака . 68 (8): 2557–60. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-07-5989 . PMID 18413721 . 
  18. ^ Mahla RS (июль 2012). «Комментарий на: Winkler et al. Гистондеацетилаза 6 (HDAC6) является важным модификатором глюкокортикоид-индуцированного глюконеогенеза в печени. Диабет 2012; 61: 513-523» . Диабет . 61 (7): e10, ответ автора e11. DOI : 10,2337 / db12-0323 . PMC 3379673 . PMID 22723278 .  
  19. ^ Ikenoue Т, Иноки К, Чжао В, Гуань KL (сентябрь 2008). «Ацетилирование PTEN модулирует его взаимодействие с доменом PDZ» . Исследования рака . 68 (17): 6908–12. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1107 . PMID 18757404 . 
  20. ^ Яо XH, Nyomba BL (июнь 2008). «Резистентность к инсулину печени, индуцированная пренатальным воздействием алкоголя, связана со снижением ацетилирования PTEN и TRB3 у потомства взрослых крыс». Американский журнал физиологии. Регуляторная, интегративная и сравнительная физиология . 294 (6): R1797–806. DOI : 10,1152 / ajpregu.00804.2007 . PMID 18385463 . 
  21. ^ Bhakat KK, Izumi T, Ян SH, Hazra TK, Митра S (декабрь 2003). «Роль ацетилированной человеческой AP-эндонуклеазы (APE1 / Ref-1) в регуляции гена паратироидного гормона» . Журнал EMBO . 22 (23): 6299–309. DOI : 10,1093 / emboj / cdg595 . PMC 291836 . PMID 14633989 .  
  22. ^ Fantini D, Vascotto C, Deganuto M, N ночевок, Gustincich S, G Маркон, Quadrifoglio F, G Damante, Bhakat KK, Митра S, Сообщи G (Jan 2008). «APE1 / Ref-1 регулирует экспрессию PTEN, опосредованную Egr-1» . Свободно-радикальные исследования . 42 (1): 20–9. DOI : 10.1080 / 10715760701765616 . PMC 2677450 . PMID 18324520 .  
  23. ^ Hasselgren PO (декабрь 2007). «Убиквитинирование, фосфорилирование и ацетилирование - тройная угроза при истощении мышц» . Журнал клеточной физиологии . 213 (3): 679–89. DOI : 10.1002 / jcp.21190 . PMID 17657723 . 
  24. ^ a b Ван WY, Pan L, Su SC, Quinn EJ, Sasaki M, Jimenez JC, Mackenzie IR, Huang EJ, Tsai LH (октябрь 2013 г.). «Взаимодействие FUS и HDAC1 регулирует реакцию на повреждение ДНК и восстановление нейронов» . Nat. Neurosci . 16 (10): 1383–91. DOI : 10.1038 / nn.3514 . PMC 5564396 . PMID 24036913 .  
  25. ^ Бергер Н. Д., Стэнли Ф.К., Мур S, Goodarzi AA (октябрь 2017). «ATM-зависимые пути ремоделирования хроматина и ответов на окислительное повреждение ДНК» . Филос. Пер. R. Soc. Лонд., Б, Биол. Sci . 372 (1731 г.). DOI : 10,1098 / rstb.2016.0283 . PMC 5577461 . PMID 28847820 .  
  26. ^ Li J, Chen J, Рикуперо CL, Hart RP, Шварц MS, Kusnecov A, Herrup K (май 2012). «Ядерное накопление HDAC4 при дефиците ATM способствует нейродегенерации при атаксии и телеангиэктазии» . Nat. Med . 18 (5): 783–90. DOI : 10.1038 / nm.2709 . PMC 3378917 . PMID 22466704 .  
  27. ^ Hahnen Е, Хауке Дж, Tränkle С, Eyüpoglu И.Ю., вирт В, Blümcke я (февраль 2008 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы: возможные последствия для нейродегенеративных расстройств». Заключение эксперта по исследуемым препаратам . 17 (2): 169–84. DOI : 10.1517 / 13543784.17.2.169 . PMID 18230051 . 
  28. ^ "Ученые обратят потерю памяти" . BBC News . 2007-04-29 . Проверено 8 июля 2007 .
  29. ^ Mwakwari SC, Патил V, W Guerrant, Oyelere AK (2010). «Ингибиторы макроциклических гистондеацетилаз» . Curr Top Med Chem . 10 (14): 1423–40. DOI : 10.2174 / 156802610792232079 . PMC 3144151 . PMID 20536416 .  
  30. ↑ Miller TA, Witter DJ, Belvedere S (ноябрь 2003 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы». Журнал медицинской химии . 46 (24): 5097–116. DOI : 10.1021 / jm0303094 . PMID 14613312 . 
  31. ^ Monneret C (апрель 2007). «Ингибиторы гистон-деацетилазы для эпигенетической терапии рака». Противораковые препараты . 18 (4): 363–70. DOI : 10.1097 / CAD.0b013e328012a5db . PMID 17351388 . 
  32. ^ Истощение латентного ВИЧ в клетках CD4 - Полный текст - ClinicalTrials.gov
  33. ^ Бэтти N, Malouf GG, Исса JP (август 2009). «Ингибиторы гистон-деацетилазы как противоопухолевые средства». Письма о раке . 280 (2): 192–200. DOI : 10.1016 / j.canlet.2009.03.013 . PMID 19345475 . 
  34. ^ Патил V, Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M, Oyelere AK (май 2013). «3-гидроксипиридин-2-тион как новая группа, связывающая цинк для селективного ингибирования гистондеацетилазы» . Журнал медицинской химии . 56 (9): 3492–506. DOI : 10.1021 / jm301769u . PMC 3657749 . PMID 23547652 .  
  35. ^ Mwakwari SC, Guerrant W, V Патил, Хан С.И., Tekwani Б.Л., Gurard-Левин ZA, Mrksich M, Oyelere AK (август 2010). «Непептидные макроциклические ингибиторы гистондеацетилазы, полученные из трициклического кетолидного скелета» . Журнал медицинской химии . 53 (16): 6100–11. DOI : 10.1021 / jm100507q . PMC 2924451 . PMID 20669972 .  
  36. ^ Butler К. Калин J, Brochier C, Vistoli G, B Лэнгли, Kozikowski AP (август 2010). «Рациональный дизайн и простая химия позволяют получить превосходный нейрозащитный ингибитор HDAC6, тубастатин А» . Журнал Американского химического общества . 132 (31): 10842–6. DOI : 10.1021 / ja102758v . PMC 2916045 . PMID 20614936 .  
  37. Перейти ↑ Drummond DC, Noble CO, Kirpotin DB, Guo Z, Scott GK, Benz CC (2005). «Клиническая разработка ингибиторов гистондеацетилазы в качестве противоопухолевых средств». Ежегодный обзор фармакологии и токсикологии . 45 : 495–528. DOI : 10.1146 / annurev.pharmtox.45.120403.095825 . PMID 15822187 . 
  38. ^ Ян XJ, Seto E (август 2007). «HAT и HDAC: от структуры, функции и регуляции до новых стратегий терапии и профилактики». Онкоген . 26 (37): 5310–8. DOI : 10.1038 / sj.onc.1210599 . PMID 17694074 . 
  39. ^ Шимаза Т, Hirschey MD, Ньюмен - J, Вердин Е (2013). «Подавление окислительного стресса β-гидроксибутиратом, эндогенным ингибитором гистондеацетилазы» . Наука . 339 (6116): 211–214. DOI : 10.1126 / science.1227166 . PMC 3735349 . PMID 23223453 .  
  40. ↑ Arbuckle JH, Medveczky PG (август 2011 г.). «Молекулярная биология латентного периода вируса герпеса-6 человека и интеграции теломер» . Микробы и инфекции / Институт Пастера . 13 (8–9): 731–41. DOI : 10.1016 / j.micinf.2011.03.006 . PMC 3130849 . PMID 21458587 .  
  41. ^ Beus M, Rajić Z, Maysinger D, Mlinarić Z, Antunović M, Marijanović I и др. (Август 2018). "SAHAquines, новые гибриды на основе мотивов SAHA и Primaquine, как потенциальные цитостатические и антиплазмодиальные агенты" . ChemistryOpen . 7 (8): 624–638. DOI : 10.1002 / open.201800117 . PMC 6104433 . PMID 30151334 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Гистон + деацетилаза в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Анимация в Merck