Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Искорка, чистокровная кобыла, первая лошадь, чей геном был полностью секвенирован.

Лошадь геном был первым секвенировало в 2006 годе Хорс Genome Project сопоставляется 2,7 млрд ДНК базовых пар , [1] и выпустил полную карту в 2009 году [2] лошадь геном больше , чем геном собаки , но меньше , чем геном человека или геном крупного рогатого скота . [2] Он включает 31 пару аутосом и одну пару половых хромосом . [3]

Поскольку лошади имеют более 90 наследственных заболеваний, аналогичных тем, которые встречаются у людей, секвенирование генома лошади может иметь потенциальное применение как для здоровья лошадей, так и для здоровья человека. [2] Кроме того, почти половина хромосом в геноме лошади демонстрирует консервативную синтению с хромосомой человека, гораздо больше, чем между собаками и людьми. [2] Это высокая степень консервативной синтении, которая может помочь исследователям использовать идеи одного вида для освещения другого. Картирование генома лошади может также помочь в разработке массивов экспрессии для улучшения лечения хромоты лошадей , заболеваний легких, репродуктивной функции и иммунологии. [1] Исследования также предоставили новое понимание развития центромер . [2]

Проект стоимостью 15 миллионов долларов был профинансирован Национальным исследовательским институтом генома человека (NHGRI) Национального института здоровья (NIH). [4] Дополнительное финансирование было получено от Дороти Рассел Havemeyer фонда , в Volkswagen Фонда, Фонд Морриса и Programmi ди Ricerca Scientifica ди Rilevante Interesse Nazionale . [2]

В число исследователей этого проекта входили Керстин Линдблад-То из Института Эли и Эдит Л. Брод Массачусетского технологического института и Гарвардского университета , Оттмар Дистл и Тоссо Лееб из Университета ветеринарной медицины в Ганновере , Германия, и Хельмут Блекер из Гельмгольца. Центр исследования инфекций в Брауншвейге , Германия, и Дуг Антчак из Корнельского университета . [4]

Первой лошадью, чей геном был полностью секвенирован в 2006–2007 годах, была чистокровная кобыла по имени Сумерки, подаренная Корнельским университетом. Другие породы , используемые для содействия начальной карты лошади генетического изменения включали ахалтекинец , андалузский , Аравитянин , исландском , американские скакун , Стандардбред , [4] Бельгийский , ганноверский , Хоккайдо и фьорд лошадь . [2] Это позволило создать каталог из миллиона однонуклеотидных полиморфизмов.(SNP) для сравнения генетической изменчивости внутри и между разными породами. [2]

Пример секвенирования следующего поколения

В 2012 году вторая лошадь была полностью секвенирована в Техасском университете A&M - 18-летняя кобыла четвертой лошади по кличке Шугар. В геноме Сахара, секвенированном с помощью новейших методов, было 3 миллиона генетических вариантов Сумерек, в частности в генах, управляющих сенсорным восприятием, передачей сигналов и иммунитетом. Исследователи занимаются секвенированием генома еще семи лошадей. Одна из заявленных целей дополнительного секвенирования состоит в том, чтобы лучше понять генетическую основу заболевания и конкретных черт, отличающих отдельных лошадей и породы, чтобы лучше прогнозировать и управлять здоровьем лошадей. [5]

Одним из результатов картирования генома лошади было обнаружение мутации, которая создает паттерн пятен комплекса леопарда (Lp), наблюдаемый у таких пород, как Аппалуза . [2] Лошади, гомозиготные по гену Lp , также подвержены риску врожденной стационарной куриной слепоты (CSNB). [6] Исследования, проведенные в 2008 и 2010 годах, показали, что как CSNB, так и комплексные пятнистости леопарда связаны с TRPM1 . [7] [8] Поскольку это заболевание поражает также людей, исследователь и ведущий автор из Института Броуда заявил: «Это демонстрирует полезность лошади для картирования генов болезней». [2]

В 2012 году исследователи из Копенгагенского университета использовали секвенирование нового поколения для секвенирования четырех современных одомашненных лошадей разных пород, лошади Пржевальского и осла , сравнив их с ДНК трех ископаемых лошадей, датированных между 13 и 50 тысячами лет назад. [9] Поскольку лошадь была одомашнена только около 4000–3500 гг. До н.э., [10] это исследование было заявлено, чтобы «определить отправную точку для выбора лошади и сырой генетический материал, доступный нашим предкам». [9]

См. Также [ править ]

  • Энн Т. Боулинг
  • Геномный проект
  • Генетика окраса лошади

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b «Секвенированный геном лошади расширяет понимание лошадей и болезней человека» . Колледж ветеринарной медицины Корнельского университета. 2012-08-21 . Проверено 1 апреля 2013 .
  2. ^ a b c d e f g h i j «Секвенирование генома домашней лошади» . Наука . ScienceDaily, ООО. 2009-11-05. DOI : 10.1126 / science.1178158 . PMC 3785132 . Проверено 1 апреля 2013 . 
  3. ^ "Equus caballus (ID 145) - Геном - NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации. 2013-01-30 . Проверено 1 апреля 2013 .
  4. ^ a b c «Выпуск 2007 г .: Геном лошади собран» . Национальный институт исследования генома человека . Проверено 1 апреля 2013 .
  5. ^ «Четверть генома лошади» . Лошадь, интернет-издание . Публикации Кровавой Лошади. 2012-02-17 . Проверено 1 апреля 2013 .
  6. ^ "Ночная слепота в Аппалуза (CSNB)" . Проект Аппалуза. 15 ноября 2013 . Проверено 1 сентября 2017 .
  7. Перейти ↑ Oke, Stacey (31 августа 2008 г.). «Проливая свет на ночную слепоту в Аппалузах» . Лошадь . Проверено 7 февраля 2009 года .
  8. ^ Bellone, R .; Арчер, С .; Уэйд, СМ; Cuka-Lawson, C .; Haase, B .; Leeb, T .; Forsyth, G .; Sandmeyer, L .; Гран, Б. (декабрь 2010 г.). «Анализ ассоциации SNP-кандидатов в TRPM1 с комплексной пятнистостью леопарда (LP) и врожденной стационарной куриной слепотой (CSNB) у лошадей». Генетика животных . 41 (s2): 207. DOI : 10.1111 / j.1365-2052.2010.02119.x .
  9. ^ a b «Семинар по геному лошади 2012 г. увенчался успехом» . Лошадь, интернет-издание . Публикации Кровавой Лошади. 2012-02-15 . Проверено 3 апреля 2013 .
  10. ^ Энтони, Дэвид В. (2007). Лошадь, колесо и язык: как наездники бронзового века из евразийских степей сформировали современный мир . Принстон, Нью-Джерси: Издательство Принстонского университета. ISBN 978-0-691-05887-0.