IRF3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
3QU6 , 1J2F , 1QWT , 1T2K , 1ZOQ , 2O61 , 2O6G , 2PI0 , 3A77 , 5JEO , 5JEK , 5JER , 5JEM , 5JEL , 5JEJ

Идентификаторы

Псевдонимы

IRF3 , entrez: 3661, IIAE7, фактор регуляции интерферона 3

Внешние идентификаторы

OMIM : 603734 MGI : 1859179 HomoloGene : 1208 GeneCards : IRF3

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 19 (человека) ^[1]

Группа	19q13.33	Начинать	49 659 569 п.н. ^[1]
Группа	19q13.33	Конец	49 665 875 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 7 (мышь) ^[2]

Группа	7 \| 7 B3	Начинать	44 997 648 п.н. ^[2]
Группа	7 \| 7 B3	Конец	45 002 848 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК • Активность гомодимеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Активность корегулятора транскрипции GO: 0001104 • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК- связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II • Связывание с белком GO: 0001948 • связывание с белковым доменом • Связывание ДНК с цис-регуляторной областью GO: 0000980, специфичное для последовательности цис-регуляторной области • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Последовательно-специфическое связывание ДНК • идентичное связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент	• цитоплазма • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль
Биологический процесс	• апоптотический процесс • позитивная регуляция сигнального пути, опосредованного интерфероном I типа • апоптотический процесс макрофагов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ответ на бактерию • ответ на экзогенную дцРНК • позитивная регуляция продукции интерферона-альфа • сигнальный путь MDA-5 • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • процесс иммунной системы • позитивная регуляция секреции цитокинов • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на дцРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов • ответ на липополисахарид • защитный ответ на вирус • сигнальный путь интерферона типа I • положительная регуляция I-kappaB киназы Передача сигналов / NF-kappaB • негативная регуляция продукции интерферона I типа • запрограммированная некротическая гибель клеток • вирусный процесс GO: 0022415 • клеточный ответ на липополисахарид • позитивная регуляция выработки интерферона I типа • липополисахаридный сигнальный путь • позитивная регуляция продукции интерферона-бета • врожденная иммунная система • регуляция продукции интерферона I типа • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция защитного ответа на вирус со стороны хозяина • регуляция экспрессии генов • регуляция воспалительного ответа • клеточный ответ на экзогенную дцРНК • позитивную регуляцию транскрипции, ДНК-шаблон
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


3661


54131

Ансамбль


ENSG00000126456


ENSMUSG00000003184

UniProt


Q14653


P70671

RefSeq (мРНК)

NM_001197122 NM_001197123 NM_001197124 NM_001197125 NM_001197126
NM_001197127 NM_001197128 NM_001571


NM_016849

RefSeq (белок)

NP_001184051 NP_001184052 NP_001184053 NP_001184054 NP_001184055
NP_001184056 NP_001184057 NP_001562 NP_001184053.1 NP_001184056.1 NP_001184057.1


NP_058545

Расположение (UCSC)

Chr 19: 49.66 - 49.67 Мб

Chr 7: 45 - 45 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фактор регуляции интерферона 3 , также известный как IRF3 , является регуляторным фактором интерферона . ^[5]

Функция [ править ]

IRF3 является членом семейства факторов регуляции транскрипции интерферона (IRF). ^[5] IRF3 был первоначально обнаружен как гомолог из irf1 и irf2 . IRF3 был дополнительно охарактеризован и показал, что он содержит несколько функциональных доменов, включая ядерный экспортный сигнал, ДНК-связывающий домен , C-концевой домен ассоциации IRF и несколько сайтов регуляторного фосфорилирования . ^[6] IRF3 находится в неактивной цитоплазматической форме, которая при фосфорилировании серина / треонина образует комплекс с CREBBP . ^[7] Комплекс перемещаетв ядро для транскрипционной активации интерферонов альфа и бета и других генов, индуцированных интерфероном. ^[8]

IRF3 играет важную роль в реакции врожденной иммунной системы на вирусную инфекцию . ^[9] Было обнаружено, что агрегированные MAVS активируют димеризацию IRF3. ^[10] Исследование 2015 года показывает, что фосфорилирование адапторных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF по консервативному мотиву pLxIS привлекает и специфицирует фосфорилирование IRF3 и активацию серин / треонин-протеинкиназой TBK1, тем самым активируя выработку интерферонов типа I. ^[11] Другое исследование показало, что нокаут IRF3 - / - защищают от инфаркта миокарда. ^[12] В том же исследовании был идентифицирован IRF3 и IFN-ответ типа I как потенциальная терапевтическая мишень для лечения постинфарктного периода миокарда.кардиопротекция. ^[12]

Сигнальный путь толл-подобных рецепторов. Пунктирные серые линии представляют неизвестные ассоциации

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что IRF3 взаимодействует с IRF7 . ^[13]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000126456 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003184 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Хискотт Дж., Питха П., Генин П., Нгуен Х., Хейлброк С., Маман Й., Алгарте М., Лин Р. (1999). «Запуск интерферонового ответа: роль фактора транскрипции IRF-3». J. Interferon Cytokine Res . 19 (1): 1–13. DOI : 10,1089 / 107999099314360 . PMID 10048763 .
^ Лин R, Heylbroeck С, Р Генин, Pitha ЛС, Hiscott J (февраль 1999 г.). «Существенная роль фактора регуляции интерферона 3 в прямой активации транскрипции хемокинов RANTES» . Mol Cell Biol . 19 (2): 959–66. DOI : 10,1128 / MCB.19.2.959 . PMC 116027 . PMID 9891032 .
^ Йониам М, Suhara Вт, Фуджит Т (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 73–6. DOI : 10,1089 / 107999002753452674 . PMID 11846977 .
^ «Энтрез Ген: фактор регуляции интерферона IRF3 3» .
Перейти ↑ Collins SE, Noyce RS, Mossman KL (февраль 2004 г.). «Врожденный клеточный ответ на проникновение вирусной частицы требует IRF3, но не репликации вируса» . J Virol . 78 (4): 1706–17. DOI : 10,1128 / JVI.78.4.1706-1717.2004 . PMC 369475 . PMID 14747536 .
Перейти ↑ Hou F, Sun L, Zheng H, Skaug B, Jiang QX, Chen ZJ (5 августа 2011 г.). «MAVS формирует функциональные прионоподобные агрегаты для активации и распространения противовирусного врожденного иммунного ответа» . Cell . 146 (3): 448–61. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.06.041 . PMC 3179916 . PMID 21782231 .
↑ Лю С, Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3» . Наука . 347 (6227): ааа2630. DOI : 10.1126 / science.aaa2630 . PMID 25636800 .
^ a b King KR, Aguirre AD, Ye YX, Sun Y, Roh JD, Ng Jr RP, Kohler RH, Arlauckas SP, Iwamoto Y, Savol A, Sadreyev RI, Kelly M, Fitzgibbons TP, Fitzgerald KA, Mitchison T, Libby П., Нахрендорф М., Вайследер Р. (6 ноября 2017 г.). «Интерфероны IRF3 и типа I вызывают фатальный ответ на инфаркт миокарда» . Природная медицина . 23 (12): 1481–1487. DOI : 10.1038 / nm.4428 . PMC 6477926 . PMID 29106401 .
^ Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология . 280 (2): 273–82. DOI : 10.1006 / viro.2000.0782 . PMID 11162841 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия . 80 (8–9): 651–8. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2 . PMID 9865487 .
Йонеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 73–6. DOI : 10,1089 / 107999002753452674 . PMID 11846977 .
Au WC, Мур PA, Lowther W., Juang YT, Pitha PM (1996). «Идентификация члена семейства факторов регуляции интерферона, который связывается с элементом ответа, стимулированным интерфероном, и активирует экспрессию генов, индуцированных интерфероном» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (25): 11657–61. DOI : 10.1073 / pnas.92.25.11657 . PMC 40461 . PMID 8524823 .
Йонеяма М., Сухара В., Фукухара И., Фукуда М., Нисида Е., Фудзита Т. (1998). «Прямой запуск системы интерферона типа I вирусной инфекцией: активация комплекса факторов транскрипции, содержащего IRF-3 и CBP / p300» . EMBO J . 17 (4): 1087–95. DOI : 10.1093 / emboj / 17.4.1087 . PMC 1170457 . PMID 9463386 .
Weaver BK, Kumar KP, Reich NC (1998). «Интерферон-регуляторный фактор 3 и CREB-связывающий белок / p300 являются субъединицами двухцепочечного РНК-активированного транскрипционного фактора DRAF1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1359–68. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1359 . PMC 108849 . PMID 9488451 .
Лин Р., Хейлбрук С., Питха П.М., Хискотт Дж. (1998). «Вирус-зависимое фосфорилирование фактора транскрипции IRF-3 регулирует ядерную транслокацию, потенциал трансактивации и деградацию, опосредованную протеасомами» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2986–96. DOI : 10,1128 / MCB.18.5.2986 . PMC 110678 . PMID 9566918 .
Ронко Л.В., Карпова А.Ю., Видаль М., Хоули П.М. (1998). «Онкобелок Е6 вируса папилломы человека 16 связывается с регуляторным фактором-3 интерферона и подавляет его транскрипционную активность» . Genes Dev . 12 (13): 2061–72. DOI : 10.1101 / gad.12.13.2061 . PMC 316980 . PMID 9649509 .
Беллингхэм Дж., Грегори-Эванс К., Грегори-Эванс С.Ю. (1999). «Картирование человеческого фактора регуляции интерферона 3 (IRF3) на хромосоме 19q13.3-13.4 с помощью внутригенного полиморфного маркера» . Анналы генетики человека . 62 (Pt 3): 231–4. DOI : 10.1046 / j.1469-1809.1998.6230231.x . PMID 9803267 . S2CID 46070705 .
Лоутер WJ, Мур PA, Картер KC, Pitha PM (1999). «Клонирование и функциональный анализ промотора человеческого IRF-3». ДНК Cell Biol . 18 (9): 685–92. DOI : 10.1089 / 104454999314962 . PMID 10492399 .
Ким Т., Ким Т., Сон Й.Х., Мин И.М., Йим Дж., Ким Т.К. (1999). «Активация фактора регуляции интерферона 3 в ответ на ДНК-повреждающие агенты» . J. Biol. Chem . 274 (43): 30686–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.43.30686 . PMID 10521456 .
Кумар КП, Макбрайд К.М., Уивер Б.К., Дингуолл К., Рейх, Северная Каролина (2000). «Регулируемая ядерно-цитоплазматическая локализация фактора регуляции интерферона 3, субъединица двухцепочечного РНК-активированного фактора 1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (11): 4159–68. DOI : 10.1128 / MCB.20.11.4159-4168.2000 . PMC 85785 . PMID 10805757 .
Сухара В., Йонеяма М., Ивамура Т., Йошимура С., Тамура К., Намики Н., Аймото С., Фудзита Т. (2000). «Анализ вирус-индуцированных гомомерных и гетеромерных белковых ассоциаций между IRF-3 и коактиватором CBP / p300». J. Biochem . 128 (2): 301–7. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022753 . PMID 10920266 .
Слуга MJ, ten Oever B, LePage C, Conti L, Gessani S, Julkunen I, Lin R, Hiscott J (2001). «Идентификация отдельных сигнальных путей, ведущих к фосфорилированию фактора регуляции интерферона 3» . J. Biol. Chem . 276 (1): 355–63. DOI : 10.1074 / jbc.M007790200 . PMID 11035028 .
Смит Э.Дж., Мари I, Пракаш А., Гарсия-Састре А., Леви Д.Е. (2001). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или Ikappa B киназы, но блокируется белком E3L вируса осповакцины» . J. Biol. Chem . 276 (12): 8951–7. DOI : 10.1074 / jbc.M008717200 . PMID 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM (2001). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология . 280 (2): 273–82. DOI : 10.1006 / viro.2000.0782 . PMID 11162841 .
Барнс Б.Дж., Мур PA, Pitha PM (2001). «Вирус-специфическая активация нового фактора регуляции интерферона, IRF-5, приводит к индукции различных генов интерферона альфа» . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382–90. DOI : 10.1074 / jbc.M101216200 . PMID 11303025 .
Mach CM, Hargrove BW, Kunkel GR (2002). «Белок-активатор гена малой РНК, фактор, связывающий гомологию постоктамера SphI / фактор активации транскрипции гена тРНК селеноцистеина, стимулирует транскрипцию гена фактора-3 регулирующего фактора интерферона человека» . J. Biol. Chem . 277 (7): 4853–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108308200 . PMID 11724783 .
Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А (2002). «Предпочтительные сайты связывания для факторов регуляции интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». J. Mol. Биол . 316 (5): 1009–22. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.5401 . PMID 11884139 .
Данг О, Наварро Л., Андерсон К., Дэвид М. (2004). «Передний край: летальный токсин сибирской язвы подавляет активацию IFN-регуляторного фактора 3 липополисахаридом» . Журнал иммунологии . 172 (2): 747–51. DOI : 10.4049 / jimmunol.172.2.747 . PMID 14707042 .

Внешние ссылки [ править ]

Викискладе есть медиафайлы, связанные с регуляторным фактором интерферона 3, IRF-3 .

Интерферон + Регулятор + Фактор-3 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
FactorBook IRF3

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000126456 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003184 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10048763-5] Хискотт Дж., Питха П., Генин П., Нгуен Х., Хейлброк С., Маман Й., Алгарте М., Лин Р. (1999). «Запуск интерферонового ответа: роль фактора транскрипции IRF-3». J. Interferon Cytokine Res . 19 (1): 1–13. DOI : 10,1089 / 107999099314360 . PMID 10048763 .

[Lin-1999-6] Лин R, Heylbroeck С, Р Генин, Pitha ЛС, Hiscott J (февраль 1999 г.). «Существенная роль фактора регуляции интерферона 3 в прямой активации транскрипции хемокинов RANTES» . Mol Cell Biol . 19 (2): 959–66. DOI : 10,1128 / MCB.19.2.959 . PMC 116027 . PMID 9891032 .

[pmid11846977-7] Йониам М, Suhara Вт, Фуджит Т (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 73–6. DOI : 10,1089 / 107999002753452674 . PMID 11846977 .

[8] «Энтрез Ген: фактор регуляции интерферона IRF3 3» .

[Collins-2004-9] Перейти ↑ Collins SE, Noyce RS, Mossman KL (февраль 2004 г.). «Врожденный клеточный ответ на проникновение вирусной частицы требует IRF3, но не репликации вируса» . J Virol . 78 (4): 1706–17. DOI : 10,1128 / JVI.78.4.1706-1717.2004 . PMC 369475 . PMID 14747536 .

[10] Перейти ↑ Hou F, Sun L, Zheng H, Skaug B, Jiang QX, Chen ZJ (5 августа 2011 г.). «MAVS формирует функциональные прионоподобные агрегаты для активации и распространения противовирусного врожденного иммунного ответа» . Cell . 146 (3): 448–61. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.06.041 . PMC 3179916 . PMID 21782231 .

[11] Лю С, Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3» . Наука . 347 (6227): ааа2630. DOI : 10.1126 / science.aaa2630 . PMID 25636800 .

[pmid29106401-12] King KR, Aguirre AD, Ye YX, Sun Y, Roh JD, Ng Jr RP, Kohler RH, Arlauckas SP, Iwamoto Y, Savol A, Sadreyev RI, Kelly M, Fitzgibbons TP, Fitzgerald KA, Mitchison T, Libby П., Нахрендорф М., Вайследер Р. (6 ноября 2017 г.). «Интерфероны IRF3 и типа I вызывают фатальный ответ на инфаркт миокарда» . Природная медицина . 23 (12): 1481–1487. DOI : 10.1038 / nm.4428 . PMC 6477926 . PMID 29106401 .

[pmid11162841-13] Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология . 280 (2): 273–82. DOI : 10.1006 / viro.2000.0782 . PMID 11162841 .

[1]