Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Элемент вставки (также известный как IS , элемент последовательности вставки или элемент IS ) - это короткая последовательность ДНК , которая действует как простой мобильный элемент . Последовательности вставки имеют две основные характеристики: они малы по сравнению с другими мобильными элементами (обычно в длину от 700 до 2500 п.н. ) и кодируют только белки, участвующие в активности транспозиции (таким образом, они отличаются от других транспозонов , которые также несут дополнительные гены, например как гены устойчивости к антибиотикам ). Эти белки обычно представляют собой транспозазу.который катализирует ферментативную реакцию, позволяющую перемещаться IS, а также один регуляторный белок, который либо стимулирует, либо ингибирует активность транспозиции. Кодирующая область в инсерционной последовательности обычно фланкируется инвертированными повторами . Например, хорошо известный IS 911 (1250 п.н.) фланкирован двумя конечностями инвертированного повтора по 36 п.н., а кодирующая область имеет два гена, частично перекрывающихся orfA и orfAB , кодирующих транспозазу (OrfAB) и регуляторный белок (OrfA). Конкретная последовательность вставки может быть названа в соответствии с формой IS n , где n - число (например, IS 1 , IS 2 , IS 3, IS 10 , IS 50 , IS 911 , IS 26 и т. Д.); Однако это не единственная используемая схема именования. Хотя инсерционные последовательности обычно обсуждаются в контексте прокариотических геномов , определенные эукариотические последовательности ДНК, принадлежащие к семейству мобильных элементов Tc1 / mariner, могут рассматриваться как инсерционные последовательности. [1]

Диаграмма, иллюстрирующая роль инсерционных последовательностей («IS») в составном транспозоне.

Помимо того, что они происходят автономно, вставочные последовательности могут также возникать как части составных транспозонов ; в составном транспозоне две последовательности вставки фланкируют один или несколько дополнительных генов, таких как ген устойчивости к антибиотикам (например, Tn10 , Tn 5 ). Тем не менее, существует другой вид транспозонов, называемых единичными транспозонами, которые не несут инсерционные последовательности на своих концах (например, Tn 7 ).

Сложный транспозон не зависит от фланкирующих последовательностей вставок для резольвазы. Резольваза является частью генома tns и разрезает фланкирующие инвертированные повторы.

Частота транспозиции IS-элементов зависит от множества параметров, включая фазу роста культуры, состав среды, напряжение кислорода, масштаб роста и структурную конформацию сайтов-мишеней (например, кривизну, присутствие определенных мотивов, состав ДНК). [2]

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Махийон, Жак; Чендлер, Майкл (1998-09-01). «Последовательности вставки» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 62 (3): 725–774. DOI : 10.1128 / MMBR.62.3.725-774.1998 . ISSN  1092-2172 . PMC  98933 . PMID  9729608 .
  2. ^ Гонсалвес Г.А., Оливейра PH, Gomes AG, Prather KL, Льюис Л., Parzeres DM Монтейро GA (2014). «Доказательства того, что события вставки транспозиции IS2 смещены в сторону резких композиционных сдвигов в целевой ДНК и модулируются разнообразным набором параметров культуры» (PDF) . Appl Microbiol Biotechnol . 98 (15): 6609–6619. DOI : 10.1007 / s00253-014-5695-6 . PMID 24769900 .  
  • Кэмпбелл, Нил А. и Рис, Джейн Б. (2002). Биология (6-е изд.), Стр. 345–346. Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс. ISBN 0-8053-6624-5 . 
  • Махиллон Жак, Чендлер Майкл (1998). «Последовательности вставки» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 62 (3): 725–774. DOI : 10.1128 / MMBR.62.3.725-774.1998 .
  • Прескотт, Лансинг М .; Харли, Джон П .; и Кляйн, Дональд А. (2002). Микробиология (5-е изд.), Стр. 298–299. Нью-Йорк: Макгроу-Хилл. ISBN 0-07-232041-9 . 
  • Шулер, Майкл Л. и Карги, Фикрет (2002). Биопроцессная инженерия: основные концепции (2-е изд.), Стр. 220. Верхняя река Сэдл, Нью-Джерси: Prentice Hall PTR. ISBN 0-13-081908-5 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • IS Finder