Kruppel-подобный фактор 14 , также известный как базовый элемент транскрипции-связывающего белка 5 (BTEB5) представляет собой белок , который у человека кодируется KLF14 гена . [5] Соответствующий ген мыши Klf14 известен как Sp6. [6]
Содержание
1 Функция
2 Белковая структура
3 Клиническое значение
4 ссылки
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
KLF14 является членом семейства факторов транскрипции Krüppel-подобных . Он регулирует транскрипцию различных генов, включая TGFβRII (рецептор типа II для TGFβ ). [7] KLF14 экспрессируется во многих тканях [8], в нем отсутствуют интроны и он подвержен родительской экспрессии . [9]
KLF14, по-видимому, является главным регулятором экспрессии генов в жировой ткани . [10]
Структура белка [ править ]
Как и другие члены семейства KLF, KLF14 имеет три домена с цинковыми пальцами около С-конца , все три из которых относятся к классическому типу C 2 H 2 . У человека они состоят из аминокислот 195–219, 225–249 и 255–277. [11]
KLF14 человека состоит из 323 аминокислот в длину с молекулярной массой 33,124; [11] у мыши его длина составляет 325. [12]
Клиническое значение [ править ]
По-видимому, существует связь между KLF14 и ишемической болезнью сердца , гиперхолестеринемией и диабетом 2 типа . [13] [14]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000266265 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000073209 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Truty MJ, Lomberk G, Fernandez-Zapico ME, Уррутиа R (март 2009). «Молчание рецептора трансформирующего фактора роста-бета (TGFbeta) с помощью Kruppel-подобного фактора 14 подчеркивает важность механизма отрицательной обратной связи в передаче сигналов TGFbeta» . Журнал биологической химии . 284 (10): 6291–300. DOI : 10.1074 / jbc.M807791200 . PMC 2649086 . PMID 19088080 .
^ Swamynathan SK (апрель 2010). «Факторы типа Крюппеля: контроль тремя пальцами» . Геномика человека . 4 (4): 263–70. DOI : 10.1186 / 1479-7364-4-4-263 . PMC 2975451 . PMID 20511139 .
^ Паркер-Katiraee л, Карсон Р., Ямада Т, Арно Р, Файль Р, Абу-амеро С.Н., Мур GE, Канэда М, Перри GH, камень переменного тока, Ли С, Мегуро-Horike М, Сасаки Н, Кобаяши К, Nakabayashi К., Шерер С.В. (май 2007 г.). «Идентификация импринтированного фактора транскрипции KLF14, претерпевающего специфическую для человека ускоренную эволюцию» . PLOS Genetics . 3 (5): e65. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0030065 . PMC 1865561 . PMID 17480121 .
^ Малый К.С., Hedman А.К., Грюндберг E, Nica AC, Thorleifsson G, Kong A, Thorsteindottir U, Шин SY, Ричардс HB, Соранцо N, Ахмади KR, Линдгрен CM, Stefansson K, Dermitzakis ET, Deloukas P, Spector TD, McCarthy MI (июнь 2011 г.). «Идентификация импринтированного главного трансрегулятора в локусе KLF14, связанного с множественными метаболическими фенотипами» . Генетика природы . 43 (6): 561–4. DOI : 10.1038 / ng.833 . PMC 3192952 . PMID 21572415 .
^ a b «Фактор Крюппеля 14» . Справочная база данных белков человека . Университет Джона Хопкинса . Проверено 18 мая 2011 .
^ Интернет Менделирующее наследование в человеке (OMIM): фактор Крюппеля 14-609393
^ Войт Б.Ф., Скотт Л.Дж., Стейнторсдоттир V, Моррис А.П., Дина С., Уэлч Р.П. и др. (Июль 2010 г.). «Двенадцать локусов восприимчивости к диабету 2 типа идентифицированы с помощью крупномасштабного анализа ассоциации» . Генетика природы . 42 (7): 579–89. DOI : 10.1038 / ng.609 . PMC 3080658 . PMID 20581827 .
^ Grarup N, Sparsø T, T Hansen (декабрь 2010). «Физиологическая характеристика локусов, связанных с диабетом 2 типа» . Текущие отчеты о диабете . 10 (6): 485–97. DOI : 10.1007 / s11892-010-0154-у . PMC 2955912 . PMID 20886378 .
Внешние ссылки [ править ]
Huffington Post: Ученые нашли генетический «переключатель» ожирения
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) TEA домен
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТ
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53
p53
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
TP63
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также недостаточность фактора транскрипции / корегулятора
Эта статья о гене в хромосоме 7 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .