Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF6
Идентификаторы
ПсевдонимыKLF6 , BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, фактор типа Круппеля 6, фактор типа Круппеля 6
Внешние идентификаторыOMIM: 602053 MGI: 1346318 HomoloGene: 996 GeneCards: KLF6
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человека) [1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение KLF6
Геномное расположение KLF6
Группа10п15.2Начинать3 775 996 п.н. [1]
Конец3 785 281 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 13 (мышь)
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Хромосома 13 (мышь)
Геномное расположение KLF6
Геномное расположение KLF6
Группа13 | 13 A1Начинать5 861 482 п.н. [2]
Конец5 870 394 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF6 208961 s в формате fs.png

PBB GE KLF6 211610 в формате fs.png

PBB GE KLF6 208960 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• ГО: 0001948 связывание белка
• ион металла связывания
• связывание нуклеиновой кислоты
• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области ДНК последовательность-специфическое связывание
• ГО: 0001077, ГО: 0001212, ГО: 0001213, ГО: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Связывание с двухцепочечной ДНК
Сотовый компонент• фибриллярный центр
• ядро клетки
• ядрышко
• цитозоль
• внутриклеточная мембраносвязанная органелла
Биологический процесс• положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• Дифференцировка В-клеток
• регуляция транскрипции, шаблонная ДНК
• транскрипция, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• регулирование транскрипции с РНК промотор полимеразы II
• цитокин-опосредованный сигнальный путь
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1316

23849

Ансамбль

ENSG00000067082

ENSMUSG00000000078

UniProt

Q99612

O08584
Q8BPQ2

RefSeq (мРНК)

NM_001008490
NM_001160124
NM_001160125
NM_001300

NM_011803

RefSeq (белок)

NP_001153596
NP_001153597
NP_001291

NP_035933

Расположение (UCSC)Chr 10: 3.78 - 3.79 МбChr 13: 5,86 - 5,87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Krueppel-подобный фактор 6 представляет собой белок , который у человека кодируется KLF6 гена . [5]

Это ген-супрессор опухоли . [6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует ядерный белок, который имеет три цинковых пальца на конце его C-концевого домена, богатую серином / треонином центральную область и кислый домен, лежащий в N-концевой области. Цинковые пальцы этого белка отвечают за специфическое связывание ДНК с богатыми гуанином коровыми промоторными элементами. Центральная область может участвовать в активации или посттрансляционных регуляторных путях, а кислотный N-концевой домен может играть важную роль в процессе активации транскрипции. Он способен активировать транскрипцию примерно в 4 раза на гомологичных или гетерологичных промоторах. Связывание ДНК и транскрипционная активность этого белка в сочетании с характером его экспрессии,предполагает, что этот белок может участвовать в регуляции и / или поддержании базальной экспрессии генов гликопротеинов, специфичных для беременности, и, возможно, других генов без ТАТА-боксов. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что KLF6 взаимодействует с фактором транскрипции Sp1 . [8]

См. Также [ править ]

  • Факторы типа Круппеля

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000067082 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000078 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ониянго Р, Koritschoner Н.П., Patrito ЛК, Zenke М, Weith А (февраль 1998). «Отнесение гена, кодирующего белок, связывающий основной промоторный элемент (COPEB), хромосоме 10p15 человека с помощью соматического гибридного анализа и флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 48 (1): 143–4. DOI : 10.1006 / geno.1997.5124 . PMID 9503030 . 
  6. ↑ Li D, Yea S, Dolios G, Martignetti JA, Narla G, Wang R, Walsh MJ, Friedman SL (октябрь 2005 г.). «Регулирование активности супрессора опухолевого фактора Kruppel-подобного фактора 6 путем ацетилирования» . Исследования рака . 65 (20): 9216–25. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1040 . PMID 16230382 . 
  7. ^ "Entrez Gene: KLF6 Kruppel-подобный фактор 6" .
  8. ^ Ботелла Л.М., Санчес-Элснер Т, Санс-Родригес Р, кой S, Shimada J, Герреро-Esteo М, Cooreman МП, Ratziu В, Ланг С, Vary CP, Ramirez JR, Фридман S, Бернабеу C (Dec 2002). «Активация транскрипции эндоглина и компонентов передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на повреждение сосудов» . Кровь . 100 (12): 4001–10. DOI : 10.1182 / blood.V100.12.4001 . PMID 12433697 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Нарла Г., Фридман С.Л., Мартинетти Дж. А. (апрель 2003 г.). "Krüppel калечит рак простаты: прогресс и перспективы KLF6" . Американский журнал патологии . 162 (4): 1047–52. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63901-6 . PMC  1851219 . PMID  12651597 .
  • Эль-Руби С., Ньюкомб Е.В. (декабрь 1996 г.). «Идентификация Bcd, нового протоонкогена, экспрессируемого в B-клетках». Онкоген . 13 (12): 2623–30. PMID  9000136 .
  • Коричонер Н.П., Бокко Д.Л., Панцетта-Дутари Г.М., Думур К.И., Флури А., Патрито Л.С. (апрель 1997 г.). «Новый белок цинкового пальца человека, который взаимодействует с основным промоторным элементом гена без бокса ТАТА» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9573–80. DOI : 10.1074 / jbc.272.14.9573 . PMID  9083102 .
  • Судзуки Т., Ямамото Т., Курабаяши М., Нагай Р., Ядзаки Ю., Хорикоши М. (август 1998 г.). «Выделение и начальная характеристика GBF, нового ДНК-связывающего белка с цинковыми пальцами, который связывается с GC-богатыми сайтами связывания промотора ВИЧ-1». Журнал биохимии . 124 (2): 389–95. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022124 . PMID  9685731 .
  • Ратциу В., Лалазар А., Вонг Л., Данг К., Коллинз С., Шаулиан Е., Дженсен С., Фридман С.Л. (август 1998 г.). «Zf9, фактор транскрипции, подобный Круппелю, активируемый in vivo во время раннего фиброза печени» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (16): 9500–5. DOI : 10.1073 / pnas.95.16.9500 . PMC  21367 . PMID  9689109 .
  • Окано Дж., Опиц О.Г., Накагава Х., Дженкинс Т.Д., Фридман С.Л., Растги А.К. (май 2000 г.). «Подобные Krüppel транскрипционные факторы Zf9 и GKLF коактивируют промотор кератина 4 человека и физически взаимодействуют» . Письма FEBS . 473 (1): 95–100. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01468-X . PMID  10802067 . S2CID  34923598 .
  • Нарла Джи, Хит К.Э., Ривз Х.Л., Ли Д., Жионо Л.Э., Киммельман А.С., Глюксман М.Дж., Нарла Дж., Энг Ф.Дж., Чан А.М., Ferrari AC, Мартинетти Дж.А., Фридман С.Л. (декабрь 2001 г.). «KLF6, кандидатный ген-супрессор опухоли, мутировавший при раке простаты». Наука . 294 (5551): 2563–6. DOI : 10.1126 / science.1066326 . PMID  11752579 . S2CID  31619019 .
  • Ботелла Л.М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М.П., ​​Ратциу В., Ланга С., Вари С.П., Рамирес Дж. Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Активация транскрипции эндоглина и компонентов передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на повреждение сосудов» . Кровь . 100 (12): 4001–10. DOI : 10.1182 / blood.V100.12.4001 . PMID  12433697 .
  • Чен Х.К., Лю XQ, Лин Дж., Чен Т.Ю., Фэн QS, Цзэн YX (октябрь 2002 г.). «[Мутационный анализ гена KLF6 при карциноме носоглотки человека]». AI Zheng = Aizheng = Китайский журнал рака . 21 (10): 1047–50. PMID  12508640 .
  • Варке В.Г., Намбиар М.П., ​​Кришнан С., Тенброк К., Геллер Д.А., Коричонер Н.П., Аткинс Дж.Л., Фарбер Д.Л., Цокос Г.К. (апрель 2003 г.). «Активация транскрипции человеческого промотора индуцибельной синтазы оксида азота с помощью фактора Kruppel-подобного 6» . Журнал биологической химии . 278 (17): 14812–9. DOI : 10.1074 / jbc.M300787200 . PMID  12590140 .
  • Chen C, Hyytinen ER, Sun X, Helin HJ, Koivisto PA, Frierson HF, Vessella RL, Dong JT (апрель 2003 г.). «Делеция, мутация и потеря экспрессии KLF6 при раке простаты человека» . Американский журнал патологии . 162 (4): 1349–54. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63930-2 . PMC  1851229 . PMID  12651626 .
  • Jeng YM, Hsu HC (июль 2003 г.). «KLF6, предполагаемый ген-супрессор опухоли, мутирует в астроцитарных глиомах» . Международный журнал рака . 105 (5): 625–9. DOI : 10.1002 / ijc.11123 . PMID  12740910 . S2CID  25600692 .
  • Баят А., Уотсон Дж. С., Стэнли Дж. К., Фергюсон М. В., Оллиер В. Е. (июнь 2003 г.). «Генетическая предрасположенность к болезни Дюпюитрена: ассоциация гена фактора транскрипции Zf9». Пластическая и реконструктивная хирургия . 111 (7): 2133–9. DOI : 10,1097 / 01.PRS.0000060531.98180.32 . PMID  12794452 . S2CID  22210744 .
  • Ривз Х.Л., Нарла Г., Огунбийи О., Хак А.И., Кац А., Бензено С., Ход Э, Харпаз Н., Голдберг С., Тал-Кремер С., Энг Ф. Дж., Артур М. Дж., Мартинетти Д. А., Фридман С. Л. (апрель 2004 г.). «Kruppel-подобный фактор 6 (KLF6) представляет собой ген-супрессор опухоли, часто инактивируемый при колоректальном раке». Гастроэнтерология . 126 (4): 1090–103. DOI : 10,1053 / j.gastro.2004.01.005 . PMID  15057748 .
  • Kimmelman AC, Qiao RF, Narla G, Banno A, Lau N, Bos PD, Nuñez Rodriguez N, Liang BC, Guha A, Martignetti JA, Friedman SL, Chan AM (июнь 2004 г.). «Подавление онкогенности глиобластомы с помощью фактора транскрипции Kruppel-подобного KLF6» . Онкоген . 23 (29): 5077–83. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207662 . PMID  15064720 .
  • Глинский Г.В., Глинский А.Б., Стивенсон А.Дж., Хоффман Р.М., Джеральд В.Л. (март 2004 г.). «Профилирование экспрессии генов предсказывает клинический исход рака простаты» . Журнал клинических исследований . 113 (6): 913–23. DOI : 10.1172 / JCI20032 . PMC  362118 . PMID  15067324 .
  • Рубинштейн М., Идельман Г., Плимат С.Р., Нарла Г., Фридман С.Л., Вернер Х. (август 2004 г.). «Транскрипционная активация гена рецептора инсулиноподобного фактора роста I белком-супрессором опухолевого фактора Kruppel-подобного фактора 6 (KLF6): потенциальные взаимодействия между KLF6 и p53» . Эндокринология . 145 (8): 3769–77. DOI : 10.1210 / en.2004-0173 . PMID  15131018 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KLF6 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .