Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с КПНА2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
KPNA2
Белок KPNA2 PDB 1ejl.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1EFX , 1QGK , 1QGR , 3FEX , 3FEY , 3WPT , 4E4V , 4WV6

Идентификаторы
ПсевдонимыKPNA2 , IPOA1 , QIP2, RCH1, SRP1alpha, Кариоферин альфа 2, SRP1-альфа, субъединица кариоферина альфа 2
Внешние идентификаторыOMIM : 600685 MGI : 103561 HomoloGene : 1708 GeneCards : KPNA2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение KPNA2
Геномное расположение KPNA2
Группа17q24.2Начинать68 035 636 п.н. [1]
Конец68 047 364 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение KPNA2
Геномное расположение KPNA2
Группа11 | 11 E1Начинать106 988 629 п.н. [2]
Конец106 999 541 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание гистондеацетилазы
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание с последовательностью ядерной локализации
• Связывание РНК
• Активность рецептора ядерного сигнала импорта
Сотовый компонент• мембрана
• ядерная пора
• нуклеоплазма
• ядро
• цитоплазма
• цитозоль
• клетка-хозяин
• внешний компонент мембраны постсинаптической специализации
• глутаматергический синапс
Биологический процесс• регуляция рекомбинации ДНК
• импорт белка в ядро
• метаболический процесс ДНК
• транспорт белка
• вирусный процесс GO: 0022415
• импорт NLS-несущего белка в ядро
• модуляция вирусом клеточного процесса хозяина
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• транспорт
• постсинапс к ядру сигнальный путь
• проникновение вирусного генома в ядро ​​хозяина через комплекс ядерных пор через импортин
• позитивная регуляция жизненного цикла вируса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3838

16647

Ансамбль

ENSG00000182481

ENSMUSG00000018362

UniProt

P52292

P52293

RefSeq (мРНК)

NM_002266
NM_001320611

NM_010655

RefSeq (белок)

NP_001307540
NP_002257

NP_034785

Расположение (UCSC)Chr 17: 68.04 - 68.05 МбChr 11: 106.99 - 107 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Importin субъединица альфа-2 представляет собой белок , который у человека кодируется KPNA2 гена . [5] [6]

Импорт белков в ядро - это процесс, который включает как минимум 2 этапа. Первый - это энергонезависимая стыковка белка с ядерной оболочкой, а второй - зависящая от энергии транслокация через комплекс ядерных пор . Импортируемые белки требуют последовательности ядерной локализации (NLS), которая обычно состоит из короткой области основных аминокислот или 2 таких областей, расположенных на расстоянии примерно 10 аминокислот друг от друга. Белки , участвующие в первой стадии ядерного импорта являются членами альфа импортина семейства karyopherins , такими как импортин субъединицы альфа-2. К ним относятсяXenopus белок импортина и его дрожжевого гомолога, SRP1 (супрессор некоторых чувствительных к температуре мутаций в РНК - полимеразы I в Saccharomyces CEREVISIAE ), которые связываются с NLS. Белок KPNA2 взаимодействует с NLS ДНК-геликазы Q1 и Т-антигеном SV40 и может участвовать в ядерном транспорте белков. KPNA2 также может играть роль в рекомбинации V (D) J [7]

Взаимодействия [ править ]

Кариоферин альфа 2 взаимодействует с:

  • ARL4A [8]
  • ИТК , [9]
  • КПНБ1 , [10] [11] [12]
  • PLAG1 , [13]
  • RECQL , [14] и
  • SGK . [15]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000182481 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018362 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Куомо СА, Кирч С.А., Gyuris Дж, Brent R, Эттингер М.А. июнь (1994). «Rch1, белок, который специфически взаимодействует с белком, активирующим рекомбинацию RAG-1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (13): 6156–60. DOI : 10.1073 / pnas.91.13.6156 . PMC 44157 . PMID 8016130 .  
  6. ^ Вайс K, Mattaj IW, Lamond AI (май 1995). «Идентификация hSRP1 альфа как функционального рецептора для последовательностей ядерной локализации». Наука . 268 (5213): 1049–53. Bibcode : 1995Sci ... 268.1049W . DOI : 10.1126 / science.7754385 . PMID 7754385 . 
  7. ^ «Энтрез Ген: KPNA2 кариоферин альфа 2 (когорта RAG 1, импортин альфа 1)» .
  8. ↑ Lin CY, Huang PH, Liao WL, Cheng HJ, Huang CF, Kuo JC, Patton WA, Massenburg D, Moss J, Lee FJ (декабрь 2000 г.). «ARL4, ARF-подобный белок, который регулируется в процессе развития и локализован в ядрах и ядрышках» . Журнал биологической химии . 275 (48): 37815–23. DOI : 10.1074 / jbc.M002470200 . PMID 10980193 . 
  9. ^ Perez-Вильяр JJ, O'Day K, Hewgill DH, Недлер SG, Каннер SB (октябрь 2001). «Ядерная локализация тирозинкиназы Itk и взаимодействие ее домена SH3 с кариоферином альфа (Rch1alpha)» . Международная иммунология . 13 (10): 1265–74. DOI : 10.1093 / intimm / 13.10.1265 . PMID 11581171 . 
  10. ^ Nagoshi E, Йонеды Y (апрель 2001). «Димеризация белка 2, связывающего регуляторный элемент стерола, через домен спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния является предпосылкой для его ядерной локализации, опосредованной импортином бета» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (8): 2779–89. DOI : 10.1128 / MCB.21.8.2779-2789.2001 . PMC 86908 . PMID 11283257 .  
  11. ^ Келер М, Спек С, Кристиэнсен М, Бишофф FR, Prehn S, Галлер Н, Görlich Д, Е Хартманн (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства importin альфа в импорте ядерного белка» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7782–91. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7782 . PMC 84838 . PMID 10523667 .  
  12. ^ Kutay U, Бишофф FR, Костко S, Крафт R, Görlich D (сентябрь 1997). «Экспорт импортина альфа из ядра опосредуется специфическим ядерным транспортным фактором». Cell . 90 (6): 1061–71. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80372-4 . PMID 9323134 . S2CID 16092404 .  
  13. ^ Braem CV, Kas K, E Мейен, Debiec-Rychter М, Ван Де Вен WJ, Вос ML (май 2002). «Идентификация сайта узнавания кариоферина альфа 2 в PLAG1, который функционирует как сигнал ядерной локализации» . Журнал биологической химии . 277 (22): 19673–8. DOI : 10.1074 / jbc.M112112200 . PMID 11882654 . 
  14. ^ Секи T, S Тада, Katada T, Эномото T (май 1997). «Клонирование кДНК, кодирующей новый гомолог импортина-альфа, Qip1: различение Qip1 и Rch1 от hSrp1 по их способности взаимодействовать с ДНК-геликазой Q1 / RecQL». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 234 (1): 48–53. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.6535 . PMID 9168958 . 
  15. ^ Maiyar AC, Леонг ML, GL Firestone (март 2003). «Импортин-альфа опосредует регулируемое ядерное нацеливание сывороточной и глюкокортикоид-индуцибельной протеинкиназы (Sgk) путем распознавания сигнала ядерной локализации в центральном домене киназы» . Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1221–39. DOI : 10.1091 / mbc.E02-03-0170 . PMC 151592 . PMID 12631736 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Букринский М.И., Хаффар О.К. (декабрь 1997 г.). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Границы биологических наук . 2 (4): d578-87. DOI : 10.2741 / A213 . PMID  9366553 .
  • Букринский М.И., Хаффар О.К. (март 1998 г.). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr» . Молекулярная медицина . 4 (3): 138–43. DOI : 10.1007 / BF03401911 . PMC  2230352 . PMID  9562972 .
  • Кино Т., Павлакис Г.Н. (апрель 2004 г.). «Молекулы-партнеры вспомогательного белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа» . ДНК и клеточная биология . 23 (4): 193–205. DOI : 10,1089 / 104454904773819789 . PMID  15142377 .
  • Teng SC, Wu KJ, Tseng SF, Wong CW, Kao L (сентябрь 2006 г.). «Импортин KPNA2, NBS1, репарация ДНК и онкогенез». Журнал молекулярной гистологии . 37 (5–7): 293–9. DOI : 10.1007 / s10735-006-9032-у . PMID  16752129 . S2CID  7281949 .
  • Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., ​​Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (июль 1992 г.). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (14): 6580–4. Bibcode : 1992PNAS ... 89.6580B . DOI : 10.1073 / pnas.89.14.6580 . PMC  49545 . PMID  1631159 .
  • Шарова Н, Букринская А (март 1991 г.). «p17 и p17-содержащие предшественники gag входящего вируса иммунодефицита человека транспортируются в ядра инфицированных клеток». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 7 (3): 303–6. DOI : 10,1089 / aid.1991.7.303 . PMID  2064827 .
  • Ди Марцио П., Чхве С., Эбрайт М., Ноблаух Р., Ландау Н.Р. (декабрь 1995 г.). «Мутационный анализ остановки клеточного цикла, ядерной локализации и упаковки вирионов вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpr» . Журнал вирусологии . 69 (12): 7909–16. DOI : 10,1128 / JVI.69.12.7909-7916.1995 . PMC  189735 . PMID  7494303 .
  • Кюссель П., Фраш М. (август 1995 г.). «Дрожжевой Srp1, ядерный белок, связанный с пендулином дрозофилы и мыши, необходим для нормальной миграции, деления и целостности ядер во время митоза». Молекулярная и общая генетика . 248 (3): 351–63. DOI : 10.1007 / BF02191602 . PMID  7565597 . S2CID  24877825 .
  • Gallay P, Swingler S, Song J, Bushman F, Trono D (ноябрь 1995 г.). «Ядерный импорт ВИЧ регулируется фосфотирозин-опосредованным связыванием матрицы с основным доменом интегразы». Cell . 83 (4): 569–76. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90097-7 . PMID  7585960 . S2CID  15536328 .
  • Морояну Дж., Хидзиката М., Блобель Дж., Раду А. (июль 1995 г.). «Гетеродимеры кариоферина альфа 1 бета и альфа 2 бета млекопитающих: субъединица альфа 1 или альфа 2 связывает сигнал ядерной локализации, а субъединица бета взаимодействует с нуклеопоринами, содержащими пептидные повторы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (14): 6532–6. Bibcode : 1995PNAS ... 92.6532M . DOI : 10.1073 / pnas.92.14.6532 . PMC  41552 . PMID  7604027 .
  • Фрид Е.О., Энглунд Дж., Мартин М.А. (июнь 1995 г.). «Роль основного домена матрицы вируса иммунодефицита человека 1 типа в макрофагальной инфекции» . Журнал вирусологии . 69 (6): 3949–54. DOI : 10,1128 / JVI.69.6.3949-3954.1995 . PMC  189124 . PMID  7745752 .
  • Галлай П., Свинглер С., Эйкен С., Троно Д. (февраль 1995 г.). «ВИЧ-1 инфекция неделящихся клеток: С-концевое фосфорилирование тирозина вирусного матричного белка является ключевым регулятором». Cell . 80 (3): 379–88. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90488-3 . PMID  7859280 . S2CID  15064293 .
  • von Schwedler U, Kornbluth RS, Trono D (июль 1994 г.). «Сигнал ядерной локализации матричного белка вируса иммунодефицита человека типа 1 позволяет установить инфекцию в макрофагах и покоящихся Т-лимфоцитах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (15): 6992–6. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6992V . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6992 . PMC  44324 . PMID  8041734 .
  • Хайнцингер Н.К., Букринский М.И., Хаггерти С.А., Рагланд А.М., Кевальрамани В., Ли М.А., Гендельман Х.Э., Ратнер Л., Стивенсон М., Эмерман М. (июль 1994 г.). «Белок Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа влияет на ядерную локализацию вирусных нуклеиновых кислот в неделящихся клетках-хозяевах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (15): 7311–5. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7311H . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.7311 . PMC  44389 . PMID  8041786 .
  • Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., ​​Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (октябрь 1993 г.). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа . 365 (6447): 666–9. Bibcode : 1993Natur.365..666B . DOI : 10.1038 / 365666a0 . PMID  8105392 . S2CID  25678 .
  • Дубровский Л., Ульрих П., Нуово Г. Дж., Маног К. Р., Керами А., Букринский М. (январь 1995 г.). «Сигнал ядерной локализации ВИЧ-1 как новая мишень для терапевтического вмешательства» . Молекулярная медицина . 1 (2): 217–30. DOI : 10.1007 / BF03401569 . PMC  2229944 . PMID  8529100 .
  • Галлай П., Ститт В., Манди С., Эттингер М., Троно Д. (февраль 1996 г.). «Роль кариоферинового пути в ядерном импорте вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Журнал вирусологии . 70 (2): 1027–32. DOI : 10,1128 / JVI.70.2.1027-1032.1996 . PMC  189908 . PMID  8551560 .
  • Букринская А.Г., Горпаде А., Хайнцингер Н.К., Смитгалл Т.Э., Льюис Р.Э., Стивенсон М. (январь 1996 г.). «Зависимая от фосфорилирования инфекция вируса иммунодефицита человека типа 1 и ядерное нацеливание вирусной ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (1): 367–71. Bibcode : 1996PNAS ... 93..367B . DOI : 10.1073 / pnas.93.1.367 . PMC  40239 . PMID  8552640 .