• ядерная мембрана • мембрана • периферия ядра • ядерная пора • трубчатая сеть эндоплазматического ретикулума • нуклеоплазма • внеклеточная экзосома • ядро клетки • ядерная оболочка • внеклеточная область • цитоплазма • цитозоль • просвет специфической гранулы • просвет гранулы, богатый фиколином-1 • клетка-хозяин • Стресс-гранула • высокомолекулярный комплекс
Биологический процесс
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • апоптотическая фрагментация ДНК • передача сигнала Ran-белка • установление локализации белка • сборка митотического веретена • транспорт белка • конгресс митотической метафазной пластинки • внутриклеточный транспорт белка • организация астральных микротрубочек • движение митотической хромосомы к полюсу веретена • установление локализации митотического веретена • импорт белка, несущего NLS, в ядро • модуляция вирусом процесса хозяина • импорт белка в ядро • импорт рибосомального белка в ядро • вирусный процесс GO: 0022415 • дегрануляция нейтрофилов • регуляция процесса биосинтеза холестерина • транспорт
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
3837
16211
Ансамбль
ENSG00000108424
ENSMUSG00000001440
UniProt
Q14974
P70168
RefSeq (мРНК)
NM_002265 NM_001276453
NM_008379
RefSeq (белок)
NP_001263382 NP_002256
NP_032405
Расположение (UCSC)
Chr 17: 47.65 - 47.69 Мб
Chr 11: 97.16 - 97.19 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Importin субъединица бета-1 представляет собой белок , который у человека кодируется KPNB1 гена . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Нуклеоцитоплазматический транспорт, процесс, зависящий от сигнала и энергии, происходит через комплексы ядерных пор, встроенных в ядерную оболочку. Импорт белков, содержащих классический сигнал ядерной локализации (NLS), требует рецептора импорта NLS, гетеродимера альфа- и бета-субъединиц импортина. Каждая из этих субъединиц является частью семейства белков кариоферинов . Импортин альфа связывает NLS-содержащий груз в цитоплазме, а импортин бета закрепляет комплекс на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. В присутствии нуклеозидтрифосфатов и небольшого GTP-связывающего белка Ran комплекс перемещается в комплекс ядерной поры, и субъединицы импортина диссоциируют. Импортин альфа входит внуклеоплазма с ее белком-пассажиром и импортином бета остается в поре. Взаимодействия между importin beta и FG-повторами нуклеопоринов важны для транслокации через поровый комплекс. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства importin beta. [7]
Взаимодействия [ править ]
KPNB1 взаимодействует с:
KPNA3 , [8] [9]
Кариоферин альфа 1 , [8] [10]
Кариоферин альфа 2 , [8] [11] [12]
Матери против декапентаплегического гомолога 3 , [13]
NUP153 [14] [15] [16]
NUP50 , [17]
NUP98 , [18] [19]
Нуклеопорин 62 , [10] [14]
P53 , [20]
Белок , связанный с паратироидным гормоном , [21] [22]
РАНБП1 , [23] [24]
РАНБП2 , [14] [23] [25]
Ран (биология) , [10] [24] [26] и
SMN1 . [27]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000108424 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001440 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чи NC, Адам EJ, Адам SA (август 1995). «Последовательность и характеристика фактора импорта цитоплазматического ядерного белка p97» . J. Cell Biol . 130 (2): 265–74. DOI : 10,1083 / jcb.130.2.265 . PMC 2199936 . PMID 7615630 .
^ Görlich D, Костко S, R Крафт, Дингуолл С, Laskey Р.А., Хартманн Е, Prehn S (сентябрь 1995). «Две разные субъединицы importin сотрудничают, чтобы распознавать сигналы ядерной локализации и связывать их с ядерной оболочкой». Curr. Биол . 5 (4): 383–92. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (95) 00079-0 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-002D-1CBD-2 . PMID 7627554 . S2CID 6055941 .
^ a b c Кёлер М., Спек С., Кристиансен М., Бишофф Ф. Р., Прен С., Халлер Г., Гёрлих Д., Хартманн Э. (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства importin альфа в импорте ядерного белка» . Мол. Клетка. Биол . 19 (11): 7782–91. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7782 . PMC 84838 . PMID 10523667 .
^ Nachury М.В., Ryder UW, Lamond А.И., Вайс K (январь 1998). «Клонирование и характеристика hSRP1 гамма, тканеспецифического фактора ядерного транспорта» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (2): 582–7. DOI : 10.1073 / pnas.95.2.582 . PMC 18463 . PMID 9435235 .
^ a b c Percipalle P, Кларксон В. Д., Кент Х. М., Родос Д., Стюарт М. (март 1997 г.). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол . 266 (4): 722–32. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0801 . PMID 9102465 .
^ Nagoshi E, Йонеды Y (апрель 2001). «Димеризация белка 2, связывающего регуляторный элемент стерола, через домен спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния является предпосылкой для его ядерной локализации, опосредованной импортином бета» . Мол. Клетка. Биол . 21 (8): 2779–89. DOI : 10.1128 / MCB.21.8.2779-2789.2001 . PMC 86908 . PMID 11283257 .
Перейти ↑ Ullman KS, Powers MA, Forbes DJ (сентябрь 1997 г.). «Ядерные рецепторы экспорта: от импортина к экспортину». Cell . 90 (6): 967–70. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80361-х . PMID 9323123 . S2CID 577884 .
^ a b c Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . J. Cell Biol . 152 (2): 411–7. DOI : 10,1083 / jcb.152.2.411 . PMC 2199621 . PMID 11266456 .
^ Nakielny S, S Шайх, Берк B, Дрейфус G (апрель 1999). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . EMBO J . 18 (7): 1982–95. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1982 . PMC 1171283 . PMID 10202161 .
^ Kehlenbach RH, Gerace L (июнь 2000). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма подавляет импорт ядерного белка in vitro» . J. Biol. Chem . 275 (23): 17848–56. DOI : 10.1074 / jbc.M001455200 . PMID 10749866 .
^ Морояну J, Блобель G, Radu A (сентябрь 1997). «Опосредованный RanGTP ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (18): 9699–704. DOI : 10.1073 / pnas.94.18.9699 . PMC 23253 . PMID 9275187 .
^ Bonifaci N, Мороян Дж, Рада А, Блобля G (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (10): 5055–60. DOI : 10.1073 / pnas.94.10.5055 . PMC 24630 . PMID 9144189 .
^ Akakura S, M Yoshida, Йонеды Y, Horinouchi S (май 2001). «Роль Hsc70 в регуляции ядерно-цитоплазматического транспорта чувствительного к температуре p53 (p53Val-135)» . J. Biol. Chem . 276 (18): 14649–57. DOI : 10.1074 / jbc.M100200200 . PMID 11297531 .
^ Cingolani G, J Бедненко, Gillespie MT, Gerace L (декабрь 2002). «Молекулярная основа для распознавания неклассического сигнала ядерной локализации импортином бета». Мол. Cell . 10 (6): 1345–53. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (02) 00727-X . PMID 12504010 .
^ a b Ясин Н.Р., Блобель Г. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358» . J. Biol. Chem . 274 (37): 26493–502. DOI : 10.1074 / jbc.274.37.26493 . PMID 10473610 .
^ a b Плафкер К., Макара И.Г. (май 2000 г.). «Облегченное ядерно-цитоплазматическое перемещение Ran-связывающего белка RanBP1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (10): 3510–21. DOI : 10.1128 / mcb.20.10.3510-3521.2000 . PMC 85643 . PMID 10779340 .
^ Delphin С, Гуань Т, Мельхиор Р, Джераче л (декабрь 1997). «RanGTP нацелен на p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор» . Мол. Биол. Cell . 8 (12): 2379–90. DOI : 10.1091 / mbc.8.12.2379 . PMC 25714 . PMID 9398662 .
^ Kutay U, Izaurralde E, Бишофф FR, Mattaj IW, Görlich D (март 1997). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор» . EMBO J . 16 (6): 1153–63. DOI : 10.1093 / emboj / 16.6.1153 . PMC 1169714 . PMID 9135132 .
Перейти ↑ Narayanan U, Ospina JK, Frey MR, Hebert MD, Matera AG (июль 2002 г.). «SMN, белок спинальной мышечной атрофии, образует предимпортный комплекс snRNP с snurportin1 и importin beta» . Гм. Мол. Genet . 11 (15): 1785–95. DOI : 10.1093 / HMG / 11.15.1785 . PMC 1630493 . PMID 12095920 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Букринский М.И., Хаффар О.К. (1997). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Фронт. Biosci . 2 (4): d578–87. DOI : 10.2741 / A213 . PMID 9366553 .
Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr» . Мол. Med . 4 (3): 138–43. DOI : 10.1007 / BF03401911 . PMC 2230352 . PMID 9562972 .
Кристоф Д., Кристоф-Хобертус С., Пишон Б. (2000). «Ядерное нацеливание белков: сколько разных сигналов?». Клетка. Сигнал . 12 (5): 337–41. DOI : 10.1016 / S0898-6568 (00) 00077-2 . PMID 10822175 .
Чук Ю.М., Блобель Г. (2001). «Кариоферины и ядерный импорт». Curr. Opin. Struct. Биол . 11 (6): 703–15. DOI : 10.1016 / S0959-440X (01) 00264-0 . PMID 11751052 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген» . Cell Res . 15 (11–12): 923–34. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (14): 6580–4. DOI : 10.1073 / pnas.89.14.6580 . PMC 49545 . PMID 1631159 .
Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа . 365 (6447): 666–9. DOI : 10.1038 / 365666a0 . PMID 8105392 . S2CID 25678 .
Лаунсбери К.М., Ричардс С.А., Перлунгер Р.Р., Макара И.Г. (1996). «Ran-связывающие домены способствуют взаимодействию Ran с p97 / бета-кариоферином, связывая этапы стыковки и транслокации ядерного импорта» . J. Biol. Chem . 271 (5): 2357–60. DOI : 10.1074 / jbc.271.5.2357 . PMID 8576188 .
Герлих Д., Хенкляйн П., Ласки Р.А., Хартманн Э. (1996). «Мотив из 41 аминокислоты в импортине-альфа обеспечивает связывание с импортином-бета и, следовательно, переход в ядро» . EMBO J . 15 (8): 1810–7. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00530.x . PMC 450097 . PMID 8617226 .
Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1996). «Импорт ядерного белка: Ran-GTP диссоциирует гетеродимер кариоферина алфавита за счет смещения альфа от перекрывающегося сайта связывания на бета» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (14): 7059–62. DOI : 10.1073 / pnas.93.14.7059 . PMC 38935 . PMID 8692944 .
Герлих Д., Панте Н., Кутай Ю., Эби Ю., Бишофф Ф. Р. (1996). «Идентификация различных ролей RanGDP и RanGTP в импорте ядерного белка» . EMBO J . 15 (20): 5584–94. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00943.x . PMC 452303 . PMID 8896452 .
Чи NC, Адам EJ, Адам С.А. (1997). «Различные связывающие домены для Ran-GTP и Ran-GDP / RanBP1 на ядерном импортном факторе p97» . J. Biol. Chem . 272 (10): 6818–22. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6818 . PMID 9045717 .
Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол . 266 (4): 722–32. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0801 . PMID 9102465 .
Кутай У., Изаурральде Э., Бишофф Ф.Р., Маттай И.В., Герлих Д. (1997). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор» . EMBO J . 16 (6): 1153–63. DOI : 10.1093 / emboj / 16.6.1153 . PMC 1169714 . PMID 9135132 .
Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (1997). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (10): 5055–60. DOI : 10.1073 / pnas.94.10.5055 . PMC 24630 . PMID 9144189 .
Герлих Д., Домбровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай У., Борк П., Хартманн Э., Прен С., Изаурральде Э. (1997). «Новый класс белков, связывающих RanGTP» . J. Cell Biol . 138 (1): 65–80. DOI : 10,1083 / jcb.138.1.65 . PMC 2139951 . PMID 9214382 .
Тиганис Т., Флинт А.Дж., Адам С.А., Тонкс Н.К. (1997). «Ассоциация Т-клеточного протеина тирозинфосфатазы с ядерным фактором импорта p97» . J. Biol. Chem . 272 (34): 21548–57. DOI : 10.1074 / jbc.272.34.21548 . PMID 9261175 .
vтеPDB галерея
1f59 : НУКЛЕОПОРИНОВЫЙ КОМПЛЕКС ИМПОРТИН-БЕТА-FXFG
1gcj : N-КОНЕЧНЫЙ ФРАГМЕНТ ИМПОРТИН-БЕТА
1ibr : КОМПЛЕКС RAN С ИМПОРТИН БЕТА
1m5n : Кристаллическая структура HEAT-повторов (1-11) импортина b, связанного с неклассическим NLS (67-94) PTHrP.
1o6o : IMPORTIN BETA AA1-442 ОБЯЗАНЫ ПЯТЬ ПОВТОРОВ FXFG ОТ YEAST NSP1P. ВТОРАЯ КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ ФОРМА
1o6p : ИМПОРТИН БЕТА, СВЯЗАННЫЙ С ПЕПТИДОМ НУКЛЕОПОРИНА GLFG
1qgk : СТРУКТУРА БЕТА ИМПОРТИНА, СВЯЗАННОГО С ДОМЕНОМ ИМПОРТИНА АЛЬФА IBB
1qgr : СТРУКТУРА ИМПОРТИНА БЕТА, СВЯЗАННОГО С ДОМЕНОМ ИМПОРТИНА АЛЬФА IBB (II КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ ФОРМА, РОСТ НА НИЗКОМ PH)
1ukl : Кристаллическая структура импортина -бета и комплекса SREBP-2.