XRCC6 , исправление с помощью рентгеновских лучей, дополняющее дефектное восстановление в клетках китайского хомячка 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, перекрестное восстановление с помощью рентгеновских лучей 6
• нуклеотид связывание • связывание двухцепочечной ДНК теломерной • теломерной ДНК связывания • GO: 0008026 хеликазной активности • 5'-дезоксирибоза-5-фосфат - лиаза активности • ГО: 0004003 ДНК хеликаз активность • связывающего белок С-конец • каталитической активности • GO: 0001948 связывание белка • лиазы активности • гидролазы активности • связывание АТФ • связывание ДНК • двухцепочечной ДНК связывания • повреждения ДНК связывания • связывания РНК • циклин связывания • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса
Сотовый компонент
• цитозоль • комплекс ядерной крышки теломер • мембрана • комплекс регулятора транскрипции • хромосома • нуклеоплазма • негомологичный комплекс соединения концов • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • Ku70: комплекс Ku80 • цитоплазма • внеклеточная область • просвет секреторной гранулы • фиколин-1- богатый просвет гранул • комплекс белок-ДНК • ядрышко • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• репарация двухцепочечных разрывов посредством классического негомологичного соединения концов • гетеротетрамеризация белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • позитивная регуляция транскрипции, ДНК шаблонный • лигирование ДНК • установление интегрированного латентного периода провируса • метаболизм • негативная регуляция транскрипции, шаблонный ДНК • восстановление двухцепочечных разрывов посредством негомологичного соединения концов • поддержание теломер • положительная регуляция выработки интерферона типа I • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • раскручивание дуплекса ДНК • репарация ДНК • реакция гиперосмотической солености клеток • развитие мозга • рекомбинация ДНК • дегрануляция нейтрофилов • клеточный ответ на гамма-излучение • клеточный ответ на X- луч • положительная регуляция активности протеинкиназ • активация врожденного иммунного ответа • процессы иммунной системы • врожденная иммунная система
Ku70 является белком , который, в организме человека, кодируется XRCC6 геном . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Старение
3 Клиническая
4 Номенклатура
5 взаимодействий
6 Ссылки
7 Дальнейшее чтение
8 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Вместе Ku70 и Ku80 составляют гетеродимер Ku , который связывается с ДНК двухцепочечного перерыва концы и необходимо для не-гомологичного конечного присоединения (NHEJ) пути в репарации ДНК . Это также необходимо для рекомбинации V (D) J , которая использует путь NHEJ для обеспечения разнообразия антигенов в иммунной системе млекопитающих .
Помимо своей роли в NHEJ, Ku также необходим для поддержания длины теломер и подавления субтеломерного гена. [7]
Первоначально Ku был идентифицирован, когда у пациентов с системной красной волчанкой были обнаружены высокие уровни аутоантител к белку. [5]
Старение [ править ]
Эмбриональные стволовые клетки мыши с гомозиготными мутациями Ku70, то есть Ku70 - / - клетки, имеют заметно повышенную чувствительность к ионизирующему излучению по сравнению с гетерозиготными эмбриональными стволовыми клетками Ku70 +/- или Ku70 + / + дикого типа . [8] Мыши-мутанты с дефицитом Ku70 демонстрируют раннее старение. [9] Используя несколько конкретных критериев старения, у мутантных мышей были обнаружены те же признаки старения, что и у контрольных мышей, но в значительно более раннем хронологическом возрасте. Эти результаты предполагают, что снижение способности восстанавливать двухцепочечные разрывы ДНК вызывает преждевременное старение и что ген Ku70 дикого типа играет важную роль в обеспечении долголетия. [10] (См. Также теорию повреждения ДНК при старении..)
Клинический [ править ]
Мутация в этом гене была описана в группе из 24 семей с аутизмом . [11] Хотя это наводит на мысль, что этот ген может играть роль в развитии аутизма, необходимы дальнейшие исследования.
Номенклатура [ править ]
Ku70 упоминается под несколькими именами, включая:
Аутоантигенный белок р70 волчанки Ku
АТФ-зависимая ДНК-геликаза 2 субъединица 1
Восстановление с помощью рентгеновских лучей в дополнение к восстановлению дефектов в клетках китайского хомячка 6
Рентгеноремонтный кросс-комплемент 6 (XRCC6)
Взаимодействия [ править ]
Ku70 взаимодействует с:
CBX5 , [12]
ЧЕК1 , [13]
CREBBP , [14]
GCN5L2 , [14]
HOXC4 , [15]
Ku80 , [14] [16] [17] [18] [19]
MRE11A , [20]
NCOA6 , [21] [22]
NCF4 , [23]
PCNA , [24] [25]
PTTG1 , [26]
RPA2 , [27]
TERF2 , [19]
TERT [28]
VAV1 , [29] и
WRN . [30] [31]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196419 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022471 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ а б «Ген Entrez: XRCC6 рентгеновское восстановление, дополняющее дефектное восстановление в клетках китайского хомячка 6 (аутоантиген Ku, 70 кДа)» .
^ Пейс Р, Mosedale G, Hodskinson М.Р., Росадо И.В., Sivasubramaniam М, Пател КДж (июль 2010). «Ku70 нарушает репарацию ДНК в отсутствие пути анемии Фанкони». Наука . 329 (5988): 219–23. DOI : 10.1126 / science.1192277 . PMID 20538911 .
↑ Boulton SJ, Jackson SP (март 1998 г.). «Компоненты Ku-зависимого негомологичного пути соединения концов участвуют в поддержании длины теломера и заглушении теломеров» . Журнал EMBO . 17 (6): 1819–28. DOI : 10.1093 / emboj / 17.6.1819 . PMC 1170529 . PMID 9501103 .
↑ Gu Y, Jin S, Gao Y, Weaver DT, Alt FW (июль 1997 г.). «Ku70-дефицитные эмбриональные стволовые клетки обладают повышенной ионизирующей радиочувствительностью, дефектной активностью связывания концов ДНК и неспособностью поддерживать рекомбинацию V (D) J» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (15): 8076–81. DOI : 10.1073 / pnas.94.15.8076 . PMC 21559 . PMID 9223317 .
↑ Li H, Vogel H, Holcomb VB, Gu Y, Hasty P (декабрь 2007 г.). «Удаление Ku70, Ku80 или обоих вызывает преждевременное старение без существенного увеличения рака» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (23): 8205–14. DOI : 10.1128 / MCB.00785-07 . PMC 2169178 . PMID 17875923 .
^ Бернштейн Н, Payne СМ, Бернштейн С, Garewal Н, Дворжак К (2008). Рак и старение как последствия неремонтированного повреждения ДНК. В: Новое исследование повреждений ДНК (редакторы: Хонока Кимура и Аой Судзуки) Nova Science Publishers, Inc. , Нью-Йорк, Глава 1, стр. 1-47. открытый доступ, но только чтение https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=43247 Архивировано 25 октября2014 г. в ISBN Wayback Machine 978-1604565812
^ Sjaarda CP, S Wood, McNaughton AJ, Taylor S, Хадсон ML, Лю X, Guerin A, Аюб M (декабрь 2019). «Секвенирование экзома идентифицирует вариант сплайсинга de novo в XRCC6 в спорадических случаях аутизма». Журнал генетики человека . DOI : 10.1038 / s10038-019-0707-0 . PMID 31827253 .
↑ Song K, Jung Y, Jung D, Lee I (март 2001). «Человеческий Ku70 взаимодействует с гетерохроматиновым белком 1альфа» . Журнал биологической химии . 276 (11): 8321–7. DOI : 10.1074 / jbc.M008779200 . PMID 11112778 .
^ Goudelock DM, Jiang K, E Pereira, Russell B, Sanchez Y (август 2003). «Регуляторные взаимодействия между киназой контрольной точки Chk1 и белками ДНК-зависимого протеинкиназного комплекса» . Журнал биологической химии . 278 (32): 29940–7. DOI : 10.1074 / jbc.M301765200 . PMID 12756247 .
^ a b c Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Инь С., Лю Л., Уоркман Дж. Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Подавление активности гистонацетилтрансферазы GCN5 посредством связывания бромодомена и фосфорилирования Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1349–58. DOI : 10.1128 / mcb.18.3.1349 . PMC 108848 . PMID 9488450 .
^ Шильд-Полтер C, папа L, Гиффин W, Кочан JC, Ngsee JK, Трайков-Андонов M, Hache RJ (май 2001). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию ДНК-зависимой протеинкиназой» . Журнал биологической химии . 276 (20): 16848–56. DOI : 10.1074 / jbc.M100768200 . PMID 11279128 .
↑ Gell D, Jackson SP (сентябрь 1999 г.). «Картирование белок-белковых взаимодействий внутри ДНК-зависимого протеинкиназного комплекса» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (17): 3494–502. DOI : 10.1093 / NAR / 27.17.3494 . PMC 148593 . PMID 10446239 .
^ Ян CR, Yeh S, Лесков K, Odegaard E, Hsu HL, Chang C, Кинселла TJ, Chen DJ, Бутман DA (май 1999). «Выделение Ku70-связывающих белков (KUBs)» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (10): 2165–74. DOI : 10.1093 / NAR / 27.10.2165 . PMC 148436 . PMID 10219089 .
^ a b Song K, Jung D, Jung Y, Lee SG, Lee I (сентябрь 2000 г.). «Взаимодействие Ku70 человека с TRF2» . Письма FEBS . 481 (1): 81–5. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01958-X . PMID 10984620 .
^ Goedecke Вт, Eijpe М, Оффенберг НН, ван Aalderen М, гейтингова С (октябрь 1999 г.). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но по-разному экспрессируются в раннем мейозе». Генетика природы . 23 (2): 194–8. DOI : 10.1038 / 13821 . PMID 10508516 .
↑ Ko L, Cardona GR, Chin WW (май 2000 г.). «Белок, связывающий рецептор тироидного гормона, белок, содержащий мотив LXXLL, функционирует как общий коактиватор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (11): 6212–7. DOI : 10.1073 / pnas.97.11.6212 . PMC 18584 . PMID 10823961 .
↑ Ko L, Chin WW (март 2003 г.). «Коактиватор ядерного рецептора, рецептор-связывающий белок тироидного гормона (TRBP) взаимодействует с ассоциированной с ним ДНК-зависимой протеинкиназой и стимулирует его» . Журнал биологической химии . 278 (13): 11471–9. DOI : 10.1074 / jbc.M209723200 . PMID 12519782 .
^ Grandvaux N, S Grizot, Vignais П.В., Dagher МС (февраль 1999 г.). «Аутоантиген Ku70 взаимодействует с p40phox в B-лимфоцитах». Журнал клеточной науки . 112 (4): 503–13. PMID 9914162 .
↑ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
^ Balajee А.С., Geard CR (март 2001). «Образование связанного с хроматином комплекса PCNA, вызванное повреждением ДНК, происходит независимо от продукта гена ATM в клетках человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (6): 1341–51. DOI : 10.1093 / NAR / 29.6.1341 . PMC 29758 . PMID 11239001 .
^ Ромеро F, Мултон MC, Рамос-Моралес F, Домингес А, Бернал JA, Pintor-Торо JA, Тортолеро М (март 2001). «Секурин человека, hPTTG, связан с гетеродимером Ku, регуляторной субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (6): 1300–7. DOI : 10.1093 / NAR / 29.6.1300 . PMC 29753 . PMID 11238996 .
Перейти ↑ Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (март 1999). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . Журнал EMBO . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .
^ Chai W, Ford LP, Lenertz L, Райт WE, Shay JW (декабрь 2002). «Человеческий Ku70 / 80 физически связывается с теломеразой через взаимодействие с hTERT» . Журнал биологической химии . 277 (49): 47242–7. DOI : 10.1074 / jbc.M208542200 . PMID 12377759 .
^ Ромеро Р, Dargemont С, Поцо Ж, Ривз WH, Camonis Дж, Gisselbrecht S, S Фишер (январь 1996). «p95vav ассоциируется с ядерным белком Ku-70» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (1): 37–44. DOI : 10.1128 / mcb.16.1.37 . PMC 230976 . PMID 8524317 .
^ Кармакар P, Сноуден CM, Рамсден Д.А., Бор В.А. (август 2002). «Гетеродимер Ku связывается с обоими концами белка Вернера, и функциональное взаимодействие происходит на N-конце Вернера» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (16): 3583–91. DOI : 10.1093 / NAR / gkf482 . PMC 134248 . PMID 12177300 .
^ Li B, Comai L (сентябрь 2000). «Функциональное взаимодействие между Ku и белком синдрома Вернера в процессинге конца ДНК» . Журнал биологической химии . 275 (37): 28349–52. DOI : 10,1074 / jbc.C000289200 . PMID 10880505 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Smider V, Chu G (июнь 1997 г.). «Реакция присоединения концов в рекомбинации V (D) J». Семинары по иммунологии . 9 (3): 189–97. DOI : 10.1006 / smim.1997.0070 . PMID 9200330 .
Фезерстоун С., Джексон С.П. (май 1999 г.). «Ku, белок репарации ДНК с множеством клеточных функций?». Мутационные исследования . 434 (1): 3–15. DOI : 10.1016 / s0921-8777 (99) 00006-3 . PMID 10377944 .
Koike M (сентябрь 2002 г.). «Димеризация, транслокация и локализация белков Ku70 и Ku80» . Журнал радиационных исследований . 43 (3): 223–36. DOI : 10,1269 / jrr.43.223 . PMID 12518983 .
Внешние ссылки [ править ]
PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для перекрестно комплементарного белка 6 для репарации рентгеновскими лучами человека.
vтеPDB галерея
1jeq : Кристаллическая структура гетеродимера Ku
1jey : Кристаллическая структура гетеродимера Ku, связанного с ДНК
