Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из LDHA )
Перейти к навигации Перейти к поиску
LDHA
Белок LDHA PDB 1i10.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1I10 , 4AJP , 4JNK , 4L4R , 4L4S , 4M49 , 4OJN , 4OKN , 4QO7 , 4QO8 , 4QSM , 4QT0 , 4R68 , 4R69 , 4RLS , 4ZVV

Идентификаторы
ПсевдонимыLDHA , GSD11, HEL-S-133P, LDH1, LDHM, PIG19, лактатдегидрогеназа A
Внешние идентификаторыOMIM : 150000 MGI : 96759 HomoloGene : 56495 GeneCards : LDHA
Расположение гена ( человек )
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение LDHA
Геномное расположение LDHA
Группа11п15.1Начинать18 394 560 п.н. [1]
Конец18 408 425 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Группа7 B3 | 7 30,6 смНачинать46 841 475 п.н. [2]
Конец46 855 627 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность оксидоредуктазы, действующая на группу CH-OH доноров, NAD или NADP в качестве акцептора
• связывание NAD
• активность лактатдегидрогеназы
• связывание киназы
• связывание с белком GO: 0001948
• каталитическая активность
• идентичное связывание с белками
• активность оксидоредуктазы
• L-лактатдегидрогеназа активность
• связывание кадгерина
Сотовый компонент• цитоплазма
• мембрана
• внеклеточная экзосома
• ядро клетки
• цитозоль
Биологический процесс• постэмбриональное развитие органов животных
• метаболический процесс лактата
• ответ на гипоксию
• гликолитический процесс
• ответ на органические циклические соединения
• развитие черной субстанции
• ответ на питательные вещества
• метаболический процесс карбоновых кислот
• ответ на глюкозу
• метаболический процесс NAD
• ответ на эстроген
• метаболический процесс пирувата
• положительная регуляция процесса апоптоза
• реакция на цАМФ
• окислительно-восстановительный процесс
• реакция на перекись водорода
• реакция на лекарство
• процесс углеводного обмена
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3939

16828

Ансамбль

ENSG00000134333
ENSG00000288299

ENSMUSG00000063229

UniProt

P00338

P06151

RefSeq (мРНК)

NM_001135239
NM_001165414
NM_001165415
NM_001165416
NM_005566

NM_001136069
NM_010699

RefSeq (белок)

NP_001128711
NP_001158886
NP_001158887
NP_001158888
NP_005557

NP_001129541
NP_034829

Расположение (UCSC)Chr 11: 18.39 - 18.41 МбChr 7: 46,84 - 46,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Лактатдегидрогеназы ( LDHA ) представляет собой фермент , который у человека кодируется LDHA гена . [5] Это мономер лактатдегидрогеназы b , которая существует в виде тетрамера. Другая основная субъединица - лактатдегидрогеназа B (LDHB).

Функция [ править ]

Лактатдегидрогеназа А катализирует взаимное превращение пирувата и L- лактата с сопутствующим взаимным превращением НАДН и НАД + . LDHA обнаруживается в большинстве соматических тканей, но преимущественно в мышечной ткани и опухолях, и принадлежит к семейству лактатдегидрогеназ . Давно известно, что многие виды рака человека имеют более высокие уровни LDHA по сравнению с нормальными тканями. Также было показано, что LDHA играет важную роль в развитии, инвазии и метастазировании злокачественных новообразований. Мутации в LDHA связаны с миоглобинурией при физической нагрузке . [6]

Интерактивная карта проезда [ править ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

  1. ^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: " GlycolysisGluconeogenesis_WP534 " .

Модельные организмы [ править ]

Фенотип мышей с нокаутом Ldha
ХарактеристикаФенотип
Жизнеспособность гомозиготАномальный
Рецессивное летальное исследованиеАномальный
ПлодородиеНормальный
Масса телаНормальный
БеспокойствоНормальный
Неврологическое обследованиеНормальный
Сила захватаНормальный
Горячая тарелкаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеАномальный [7]
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Температура телаНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияАномальный [8]
Плазменные иммуноглобулиныНормальный
ГематологияАномальный [9]
Лимфоциты периферической кровиНормальный
Микроядерный тестНормальный
Вес сердцаНормальный
Эпидермис хвоста цельныйНормальный
Гистопатология кожиНормальный
Гистопатология головного мозгаНормальный
Сальмонеллезная инфекцияНормальный [10]
Citrobacter инфекцияНормальный [11]
Все тесты и анализ из [12] [13]

Модельные организмы использовались при изучении функции LDHA. Линия условно нокаутных мышей , названная Ldha tm1a (EUCOMM) Wtsi [14] [15], была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых. [16] [17] [18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. [12] [19] Двадцать семь тестов были проведены на мутантных мышах, и было обнаружено пять значительных отклонений от нормы. [12] Во время беременности было идентифицировано несколько гомозиготных мутантных эмбрионов, и ни один из них не выжил до отъема . Остальные тесты были выполнены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах. Животные обоего пола имели аномальный химический состав плазмы, у самцов также улучшалась толерантность к глюкозе и увеличивалась ширина распределения эритроцитов . [12]

Ингибиторы LDHA [ править ]

Было продемонстрировано, что следующие соединения ингибируют фермент LDHA:

  • Оксамат [20]
  • Галлат эпигаллокатехина [21]
  • Хинолин-3-сульфонамид [22]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000288299 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134333, ENSG00000288299 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063229 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Chung ФЗ, Tsujibo H, Бхаттачариа U, Sharief FS, Li SS (ноябрь 1985). «Геномная организация гена лактатдегидрогеназы-А человека» . Биохимический журнал . 231 (3): 537–41. DOI : 10.1042 / bj2310537 . PMC 1152784 . PMID 3000353 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: ЛДГА лактатдегидрогеназа А» .
  7. ^ «Данные теста на толерантность к глюкозе для Ldha» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ «Данные клинической химии для Ldha» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Гематологические данные для Ldha" . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ « Данные инфекции сальмонеллы для Ldha» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ « Данные о заражении Citrobacter для Ldha» . Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ а б в г Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  13. ^ Портал ресурсов мыши , Wellcome Trust Sanger Institute.
  14. ^ "Международный Консорциум Нокаут-Мышей" .
  15. ^ "Информатика генома мыши" .
  16. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  17. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  18. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  19. ↑ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (июнь 2011 г.). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма» . Геномная биология . 12 (6): 224. DOI : 10.1186 / GB-2011-12-6-224 . PMC 3218837 . PMID 21722353 .  
  20. ^ Miskimins WK, Ahn HJ, Ким JY, Рю S, Юнг Ю.С., Choi JY (2014). «Синергетический противораковый эффект фенформина и оксамата» . PLOS ONE . 9 (1): e85576. Bibcode : 2014PLoSO ... 985576M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0085576 . PMC 3897486 . PMID 24465604 .  
  21. ^ Лу QY, Чжан L, Yee JK, Go VW, Ли WN (февраль 2015). «Метаболические последствия ингибирования LDHA эпигаллокатехином галлатом и оксаматом в раковых клетках поджелудочной железы MIA PaCa-2» . Метаболомика . 11 (1): 71–80. DOI : 10.1007 / s11306-014-0672-8 . PMC 4523095 . PMID 26246802 .  
  22. ↑ Billiard J, Dennison JB, Briand J, Annan RS, Chai D, Colón M, Dodson CS, Gilbert SA, Greshock J, Jing J, Lu H, McSurdy-Freed JE, Orband-Miller LA, Mills GB, Quinn CJ, Шнек Дж. Л., Скотт Г. Ф., Шоу А. Н., Уайтт Дж. М., Вустер Р.Ф., Даффи К.Дж. (сентябрь 2013 г.). «Хинолин-3-сульфонамиды ингибируют лактатдегидрогеназу А и обращают вспять аэробный гликолиз в раковых клетках» . Рак и метаболизм . 1 (1): 19. DOI : 10,1186 / 2049-3002-1-19 . PMC 4178217 . PMID 24280423 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Миядзима Х., Симидзу Т., Канеко Э. (октябрь 1992 г.). «[Экспрессия гена при дефиците субъединицы лактатдегидрогеназы-А]». Риншо Синкэйгаку . 32 (10): 1087–92. PMID  1297552 .
  • Судо К., Маэкава М., Сиоя М., Икеда К., Такахаши Н., Исогай И., Ли С.С., Канно Т., Мачида К., Торими Дж. (Сентябрь 1992 г.). «Молекулярный анализ генетической мутации в электрофоретическом варианте субъединицы A (M) лактатдегидрогеназы человека». Биохимия Интернэшнл . 27 (6): 1051–7. PMID  1445373 .
  • Маэкава М., Судо К., Ли СС, Канно Т. (октябрь 1991 г.). «Анализ генетических мутаций при дефиците лактатдегидрогеназы-A (M) человека с использованием полиморфизма конформации ДНК в сочетании с полиакриламидным градиентным гелем и окрашиванием серебром». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 180 (2): 1083–90. DOI : 10.1016 / S0006-291X (05) 81177-5 . PMID  1953713 .
  • Маэкава М., Судо К., Ли СС, Канно Т. (ноябрь 1991 г.). «Генотипический анализ семей с дефицитом лактатдегидрогеназы A (M) путем селективной амплификации ДНК». Генетика человека . 88 (1): 34–8. DOI : 10.1007 / BF00204925 . PMID  1959923 . S2CID  19321774 .
  • Scrable HJ, Johnson DK, Rinchik EM, Cavenee WK (март 1990 г.). «Локус, связанный с рабдомиосаркомой, и MYOD1 являются синтеническими, но отдельными локусами на коротком плече хромосомы 11 человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (6): 2182–6. Bibcode : 1990PNAS ... 87.2182S . DOI : 10.1073 / pnas.87.6.2182 . PMC  53650 . PMID  2315312 .
  • Маэкава М., Судо К., Канно Т., Ли СС (апрель 1990 г.). «Молекулярная характеристика генетической мутации при дефиците лактатдегидрогеназы-A (M) человека» . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях (Представленная рукопись). 168 (2): 677–82. DOI : 10.1016 / 0006-291X (90) 92374-9 . PMID  2334430 .
  • Гости Ф., Марти М.К., Курвалин Дж.С., Маунори Р., Борненс М. (февраль 1987 г.). «Центросомные белки и лактатдегидрогеназа обладают общим эпитопом в линиях клеток человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (4): 1000–4. Bibcode : 1987PNAS ... 84.1000G . DOI : 10.1073 / pnas.84.4.1000 . PMC  304349 . PMID  2434947 .
  • Чунг Ф.З., Цудзибо Х., Бхаттачарья У., Шариф Ф.С., Ли С.С. (ноябрь 1985 г.). «Геномная организация гена лактатдегидрогеназы-А человека» . Биохимический журнал . 231 (3): 537–41. DOI : 10.1042 / bj2310537 . PMC  1152784 . PMID  3000353 .
  • Цудзибо Х., Тиано Х. Ф., Ли СС (февраль 1985 г.). «Нуклеотидные последовательности кДНК и безинтронного псевдогена для изофермента лактатдегидрогеназы-А человека» . Европейский журнал биохимии . 147 (1): 9–15. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1985.tb08711.x . PMID  3838278 .
  • Гласс Р.Д., Дойл Д. (апрель 1972 г.). «Генетический контроль экспрессии лактатдегидрогеназы в тканях млекопитающих». Наука . 176 (4031): 180–1. Bibcode : 1972Sci ... 176..180G . DOI : 10.1126 / science.176.4031.180 . PMID  5014440 . S2CID  20224553 .
  • Маэкава М., Судо К., Кобаяси А., Сугияма Э., Ли СС, Канно Т. (апрель 1994 г.). «Электрофоретический вариант быстрого типа лактатдегидрогеназы M (A) и сравнение с другими миссенс-мутациями в генах лактатдегидрогеназы M (A) и H (B)». Клиническая химия . 40 (4): 665–8. DOI : 10.1093 / clinchem / 40.4.665 . PMID  7908613 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Миядзима Х, Такахаши Й, Судзуки М, Симидзу Т., Канеко Э. (июль 1993 г.). «Молекулярная характеристика экспрессии генов при дефиците лактатдегидрогеназы-A человека». Неврология . 43 (7): 1414–9. DOI : 10,1212 / wnl.43.7.1414 . PMID  8327147 . S2CID  41011165 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой» . Международный журнал рака . 83 (4): 456–64. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5 . PMID  10508479 .
  • Вила М.Р., Николас А., Мороте Дж, де I, Месегер А. (июль 2000 г.). «Повышенная экспрессия глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы в почечно-клеточной карциноме, идентифицированная с помощью основанной на РНК произвольно затравленной полимеразной цепной реакции». Рак . 89 (1): 152–64. DOI : 10.1002 / 1097-0142 (20000701) 89: 1 <152 :: АИД-CNCR20> 3.0.CO; 2-Т . PMID  10897012 .
  • Буте А, Альтмейер Р., Эри С., Тардье М. (декабрь 2000 г.). «Непосредственная роль gp120 / 41, экспрессируемого плазматической мембраной в токсичности для человеческих астроцитов, индуцированной ВИЧ-1-инфицированными макрофагами». СПИД . 14 (17): 2687–97. DOI : 10.1097 / 00002030-200012010-00008 . PMID  11125887 . S2CID  12747999 .
  • Прочтите JA, Winter VJ, Eszes CM, Sessions RB, Brady RL (май 2001 г.). «Структурные основы измененной активности М- и Н-изоферментных форм лактатдегидрогеназы человека». Белки . 43 (2): 175–85. DOI : 10.1002 / 1097-0134 (20010501) 43: 2 <175 :: АИД-PROT1029> 3.0.CO; 2- # . PMID  11276087 .
  • Сунг Дж. Х., Шин С. А., Пак Х. К., Монтеларо Р. К., Чонг Й. Х. (октябрь 2001 г.). «Защитный эффект глутатиона при гибели клеток, вызванной литическим пептидом 1 ВИЧ-1, в нейрональных клетках человека». Журнал нейровирологии . 7 (5): 454–65. DOI : 10.1080 / 135502801753170318 . PMID  11582518 . S2CID  12958486 .
  • Пиоли П.А., Гамильтон Б.Дж., Коннолли Д.Э., Брюер Г., Ригби В.Ф. (сентябрь 2002 г.). «Лактатдегидрогеназа - это AU-богатый элемент-связывающий белок, который напрямую взаимодействует с AUF1» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35738–45. DOI : 10.1074 / jbc.M204002200 . PMID  12107167 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P00338 (цепь A человеческой L-лактатдегидрогеназы) в PDBe-KB .