Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Этот список секвенированных геномов протистов содержит все виды протистов, которые, как известно, имеют общедоступные полные последовательности генома, которые были собраны, аннотированы и опубликованы; не включены ни черновики геномов, ни последовательности органелл.

Этот список неполный ; вы можете помочь, добавив недостающие элементы из надежных источников .

Альвеолаты [ править ]

Альвеолаты - это группа простейших, в которую входят Ciliophora , Apicomplexa и Dinoflagellata . Члены этой группы представляют особый интерес для науки как причины серьезных заболеваний человека и домашнего скота.

ОрганизмТипАктуальностьРазмер геномаКоличество прогнозируемых геновОрганизацияГод окончанияСтатус сборкиСсылки
Babesia bovisАпикомплексанВозбудитель крупного рогатого скота8,2 Мб3 6712007 [1]
Бревиолум минутим ( Symbiodinium minutum; клада B1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1,5 Гб47 014Окинавский институт науки и технологий2013 [2]ПроектМорская геномика OIST [3]
Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui; Clade C1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.19 Гб35 913Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018 [4]ПроектReFuGe 2020 [5]
Cladocopium C92 штамм Y103 ( Symbiodinium sp. Clade C; предполагаемый тип C92)ДинофлагеллятаСимбионт фораминиферНеизвестно (размер сборки 0,70 Гб)65 832Окинавский институт науки и технологий2018 [6]ПроектМорская геномика OIST [3]
Cryptosporidium hominis
Штамм: TU502		АпикомплексанПатоген человека10,4 Мб3 994 [7]Университет Содружества Вирджинии2004 [7]
Cryptosporidium parvum
C- или изолят генотипа 2		АпикомплексанПатоген человека16,5 Мб3 807 [8]UCSF и Университет Миннесоты2004 [8]
Штамм Eimeria tenella
Houghton		АпикомплексанКишечный паразит домашней птицы55-60 Мб [9]Институт Wellcome Trust Sanger [10]Доступно для скачивания; [10] 2007 для Chr 1 [11]
Fugacium kawagutii CS156 = CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.07 Гб26 609Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018 [4]ПроектReFuGe 2020 [5]
Fugacium kawagutii CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.18 Гб36 850Университет Коннектикута / Сямэньский университет2015 [12]ПроектПроект генома S. kawagutii [13]
Neospora caninumАпикомплексанВозбудитель для крупного рогатого скота и собак62 Мб [14]Институт Wellcome Trust Sanger [15]Доступно для скачивания [15]
Paramecium tetraureliaИнфузорийМодельный организм72 Мб39 642 [16]Геноскоп2006 [16]
Поларелла ледниковая CCMP1383ДинофлагеллятаПсихрофил, Антарктика3,02 Гб (диплоид), 1,48 Гб (гаплоид)58 232Университет Квинсленда2020 [17]ПроектUQ eSpace [18]
Поларелла ледниковая CCMP2088ДинофлагеллятаПсихрофил, Арктика2,65 Гб (диплоид), 1,30 Гб (гаплоид)51 713Университет Квинсленда2020 [17]ПроектUQ eSpace [18]
Plasmodium berghei
Штамм: Anka		АпикомплексанКроличья малярия18,5 Мб [19]4900; [19] 11 654 (UniProt)
Плазмодий чабаудиАпикомплексанМалярия грызунов19,8 Мб [20]5,000 [20]
Клон Plasmodium falciparum
: 3D7		АпикомплексанПатоген человека ( малярия )22.9 Мб5 268 [21]Консорциум проекта "Геном малярии"2002 [21]
Plasmodium knowlesiАпикомплексанВозбудитель приматов (малярия)23,5 Мб5 188 [22]2008 [22]
Плазмодий виваксАпикомплексанПатоген человека (малярия)26,8 Мб5 433 [23]2008 [23]
Plasmodium yoelii yoelii
Штамм: 17XNL		АпикомплексанВозбудитель грызунов (малярия)23,1 Мб5 878 [24]TIGR и NMRC2002 [24]
Symbiodinium microadriaticum (клада А)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.1 Гб49 109Университет науки и технологий короля Абдаллы2016 [25]ПроектГеномика рифов [26]
Симбиодиниум A3 штамм Y106 ( Symbiodinium sp.CladeA3)ДинофлагеллятасимбионтНеизвестно (размер сборки 0,77 Гб)69 018Окинавский институт науки и технологий2018 [6]ПроектМорская геномика OIST [3]
Tetrahymena thermophilaИнфузорийМодельный организм104 Мб27 000 [27]2006 [27]
Theileria annulata
клон Анкары C9		АпикомплексанВозбудитель крупного рогатого скота8,3 Мб3792Sanger2005 [28]
Theileria parva
Штамм: Muguga		АпикомплексанВозбудитель крупного рогатого скота ( лихорадка восточного побережья Африки )8,3 Мб4 035 [29]ТИГР и Международный научно-исследовательский институт животноводства2005 [29]
Toxoplasma gondii
GT1, ME49, штаммы VEG		АпикомплексанМлекопитающий возбудитель63 Мб (RefSeq)8100 (UniProt) - 9000 (EuPathDB)J. Craig Venter Inst., ТИГР, UPenn.2008 [30]

Амебозоа [ править ]

Амёбозои - группа подвижных амебоидных протистов, члены этой группы передвигаются или питаются с помощью временных выступов, называемых псевдоножками . Самый известный представитель этой группы - это плесень слизи, которая изучалась веками; другие члены включают Archamoebae , Tubulinea и Flabellinea . Некоторые амебозы вызывают заболевание.

ОрганизмТипАктуальностьРазмер геномаКоличество прогнозируемых геновОрганизацияГод окончания
Dictyostelium discoideum
Штамм: AX4		Слизь плесеньМодельный организм34 Мб12 500 [31]Консорциум из Кельнского университета, Медицинского колледжа Бейлора и Центра Сангера2005 [31]
Entamoeba histolytica
HM1: IMSS		Паразитические простейшиеВозбудитель человека ( амебная дизентерия )23,8 Мб9 938 [32]TIGR, Институт Сангера и Лондонская школа гигиены и тропической медицины2005 [32]
Polysphondylium pallidum
Штамм: PN500		Слизь плесеньМодельный организм12 939, [33] 12350 (UniProt)Институт исследований возраста им. Лейбница2009 [33]

Хромиста [ править ]

Chromista представляет собой группа протистов , которая содержит водоросли фил Heterokontophyta ( stramenopiles ), гаптофитовые водоросли и Cryptophyta . Члены этой группы в основном изучаются с точки зрения эволюционного интереса.

ОрганизмТипАктуальностьРазмер геномаКоличество прогнозируемых геновОрганизацияГод окончания
Albugo laibachiiОомицетПаразит арабидопсиса, биотроф37 Мб [34]13 032 [34]2011 [34]
Штамм Aureococcus anophagefferens
: CCMP1984		ПелагофитОбъединенный институт генома DOE2011 [35]
Bigelowiella natansХлорарахниофитМодельный организмнуклеоморф : 0,331 Мб
ядер: 95 Мб		нуклеоморф : 373 [36]
ядерный:> 21 000 [37]		нуклеоморф : Институт Холла, Австралия , Univ. Мельбурн, Univ. BC
ядерная: Университет Далхаузи, Галифакс, Новая Шотландия, Канада		2006, [36] 2012 [37]
Chroomonas mesostigmatica CCMP1168.Криптофита2012 [38]
Cryptomonas ParameciumКриптофита2010 [39]
Эмилиания
Хаксли CCMP1516		Кокколитофора ( фитопланктон )141,7 Мб [40]30 569 [40]Объединенный институт генома2013 [40]
Эмилиания
Хаксли RCC1217		Кокколитофора ( фитопланктон )Доступно для скачивания [41]
Fragilariopsis cylindrusДиатомовый61,1 Мб [42]21 066 [42]Объединенный институт генома2017 [42]
Гиллардия тетаКриптомонадыМодельный организм0,551 МБ ( только нуклеоморфный геном)
87 МБ (ядерный геном)		нуклеоморф: 465 [43] 513, 598 (UniProt)
ядерный:> 21 000 [37]		нуклеоморф: Канадский институт перспективных исследований, Марбургский университет Филиппа и ядерный университет Британской Колумбии
: Университет Далхаузи, Галифакс, Новая Шотландия, Канада		2001, [43] 2012 [37]
Hemiselmis andersenii
CCMP7644		КриптомонадыМодельный организм0,572 МБ
( только нуклеоморфный геном)		472, [44] 502 (UniProt)Канадский институт перспективных исследований2007 [44]
Гиалопероноспора арабидопсидисОомицетоблигатный биотроф , возбудитель ArabidopsisWUGSC2010 [45]
Nannochloropis gaditana
Штамм: CCMP526		ЭустигматофитПроизводство липидов, биотехнологииИнститут биоинформатики Вирджинии2012 [46]
Phaeodactylum tricornutum
Штамм: CCAP1055 / 1		Диатомовый27,4 Мб10 402Объединенный институт генома2008 [47]
Phytophthora infestans
Штамм: T30-4		ОомицетВозбудитель Великого голода в ИрландииBroad Institute2009 [48]
Phytophthora ramorumОомицетВозбудитель внезапной смерти дуба65 Мб (7x)15 743Объединенный институт генома и др.2006 [49]
Phytophthora sojaeОомицетВозбудитель сои95 Мб (9x)19 027Объединенный институт генома и др.2006 [49]
Pseudo-nitzschia многосерийныйДиатомовыйОбъединенный институт генома
Plasmodiophora brassicaeПлазмодиофоридВозбудитель болезни косолапости25,5 Мб9 730SLU Uppsala et al.2015 [50]
Pythium ultimumОомицетповсеместный патоген растений42,8 Мб15 290Университет штата Мичиган и др.2010 [51]
Thalassiosira pseudonana
Штамм: CCMP 1335.		Диатомовый34,5 Мб11 242 [52]Объединенный институт генома и Вашингтонский университет2004 [52]

Экскавата [ править ]

Excavata - группа родственных свободноживущих и симбиотических протистов; он включает Metamonada , Loukozoa , Euglenozoa и Percolozoa . Их исследуют на предмет их роли в болезнях человека.

ОрганизмТипАктуальностьРазмер геномаКоличество прогнозируемых геновОрганизацияГод окончания
Giardia enterica (G. duodenalis Assemblage B)Паразитические простейшиеВозбудитель человека ( лямблиоз )11.7 Мб4 470 [53]многоцентровое сотрудничество2009 [53]
Giardia duodenalis
ATCC 50803
(комплекс A Giardia duodenalis )
Паразитические простейшиеВозбудитель человека ( лямблиоз )11.7 Мб6 470, [54] 7 153 (UniProt)Каролинский институт, Морская биологическая лаборатория2007 [54]
Leishmania braziliensis
MHOM / BR / 75M2904		Паразитические простейшиеВозбудитель человека ( лейшманиоз )33 Мб8 314 [55]Институт Сангера , Университет Сан-Паулу, Имперский колледж2007 [55]
Leishmania infantum
JPCM5		Паразитические простейшиеПатоген человека ( висцеральный лейшманиоз )33 Мб8 195 [55]Институт Сангера, Имперский колледж и Университет Глазго2007 [55]
Основной штамм Leishmania
: Friedlin		Паразитические простейшиеПатоген человека ( кожный лейшманиоз )32,8 Мб8 272 [56]Институт Сэнгера и Сиэтлский институт биомедицинских исследований2005 [56]
Naegleria gruberiамебофлагеллятаОтошли от других эукариот более 1 миллиарда лет назад.41 Мб [57]15 727 [57]2010 [57]
Влагалищная трихомонадаПаразитические простейшиеВозбудитель человека ( трихомониаз )160 Мб59 681 [58]ТИГР2007 [58]
Trypanosoma brucei
Штамм: TREU927 / 4 GUTat10.1		Паразитические простейшиеВозбудитель человека ( Сонная болезнь )26 Мб9 068 [59]Институт Сангера и ТИГР2005 [59]
Trypanosoma cruzi
Штамм: CL Brener TC3		Паразитические простейшиеПатоген человека ( болезнь Шагаса )34 Мб22 570 [60]TIGR, Сиэтлский институт биомедицинских исследований и Упсальский университет2005 [60]

Опистоконц, базальный [ править ]

Опистоконты - это группа эукариот, в которую входят как животные, так и грибы, а также базальные группы, не относящиеся к этим группам. Эти базальные опистоконты обоснованно классифицируются как протисты и включают хоанофлагелляты , которые являются сестринской или почти сестринской группой животных.

ОрганизмТипАктуальностьРазмер геномаКоличество прогнозируемых геновОрганизацияГод окончания
Monosiga brevicollisХоанофлагеллятаблизкий родственник многоклеточных41,6 Мб9 200 [61]Объединенный институт генома2007 [61]

См. Также [ править ]

  • Список секвенированных бактериальных геномов
  • Список секвенированных геномов животных
  • Список секвенированных эукариотических геномов
  • Список секвенированных геномов грибов
  • Список секвенированных геномов растений
  • Список секвенированных геномов водорослей

Ссылки [ править ]

  1. ^ Брайтон К.А., Лау АО, Херндон Д.Р., Хэнник Л., Каппмайер Л.С., Беренс С.Дж. и др. (Октябрь 2007 г.). «Последовательность генома Babesia bovis и сравнительный анализ apicomplexan hemoprotozoa» . PLOS Патогены . 3 (10): 1401–13. DOI : 10.1371 / journal.ppat.0030148 . PMC  2034396 . PMID  17953480 .
  2. ^ Сёгучи Э, Синдзато Ц., Кавасима Т., Гёджа Ф, Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (Август 2013). «Проект сборки ядерного генома Symbiodinium minutum показывает структуру гена динофлагеллат» . Текущая биология . 23 (15): 1399–408. DOI : 10.1016 / j.cub.2013.05.062 . PMID 23850284 . 
  3. ^ a b c "Морская геномика OIST" . marinegenomics.oist.jp . Проверено 22 августа 2018 .
  4. ^ а б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Белтран В.Х., Лапейр Б., Бонгаертс П. и др. (2018). «Геномы симбиодиниума показывают адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллат» . Биология коммуникации . 1 : 95. DOI : 10.1038 / s42003-018-0098-3 . PMC 6123633 . PMID 30271976 .  
  5. ^ a b «Сайт данных ReFuGe 2020» . Safety2020.reefgenomics.org . Проверено 7 сентября 2018 .
  6. ^ a b Сёгути Э, Бедесси Дж., Тада I, Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (Июнь 2018). «Два расходящихся генома Symbiodinium показывают сохранение кластера генов для биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов» . BMC Genomics . 19 (1): 458. DOI : 10,1186 / s12864-018-4857-9 . PMC 6001144 . PMID 29898658 .  
  7. ^ а б Сюй П, Видмер Дж., Ван И, Одзаки Л.С., Алвес Дж. М., Серрано М. Г. и др. (Октябрь 2004 г.). «Геном Cryptosporidium hominis» . Природа . 431 (7012): 1107–12. Bibcode : 2004Natur.431.1107X . DOI : 10,1038 / природа02977 . PMID 15510150 . 
  8. ^ a b Abrahamsen MS, Templeton TJ, Enomoto S, Abrahante JE, Zhu G, Lancto CA и др. (Апрель 2004 г.). «Полная последовательность генома апикомплексана, Cryptosporidium parvum» . Наука . 304 (5669): 441–5. Bibcode : 2004Sci ... 304..441A . DOI : 10.1126 / science.1094786 . PMID 15044751 . S2CID 26434820 .  
  9. ^ genedb
  10. ^ а б Сэнгер
  11. ^ Ling KH, Rajandream MA, Rivailler P, Ivens A, Yap SJ, Madeira AM и др. (Март 2007 г.). «Секвенирование и анализ хромосомы 1 Eimeria tenella показывает уникальную сегментарную организацию» . Геномные исследования . 17 (3): 311–9. DOI : 10.1101 / gr.5823007 . PMC 1800922 . PMID 17284678 .  
  12. ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W и др. (Ноябрь 2015 г.). «Геном Symbiodinium kawagutii освещает экспрессию гена динофлагеллат и коралловый симбиоз» . Наука . 350 (6261): 691–4. Bibcode : 2015Sci ... 350..691L . DOI : 10.1126 / science.aad0408 . PMID 26542574 . 
  13. ^ " Сайт данных S. kawagutii " . web.malab.cn/symka_new . Проверено 22 августа 2018 .
  14. ^ genedb
  15. ^ а б Сэнгер
  16. ^ а б Аури Дж. М., Джайон О, Дюре Л., Ноэль Б., Джубин С., Порсел Б. М. и др. (Ноябрь 2006 г.). «Глобальные тенденции полногеномных дупликаций инфузорий Paramecium tetraurelia» . Природа . 444 (7116): 171–8. Bibcode : 2006Natur.444..171A . DOI : 10,1038 / природа05230 . PMID 17086204 . 
  17. ^ а б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся гены с одним экзоном с адаптивными функциями» . BMC Biology . 18 (1): 56. DOI : 10,1186 / s12915-020-00782-8 . PMC 7245778 . PMID 32448240 .  
  18. ^ a b Стивенс, Тимоти; Раган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чеонг Синь (2020). " Информационный сайт Polarella ". DOI : 10.14264 / uql.2020.222 . Cite journal requires |journal= (help)
  19. ^ a b Запись в ансамбле
  20. ^ a b Запись в ансамбле
  21. ^ a b Гарднер MJ, Холл N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman RW и др. (Октябрь 2002 г.). «Последовательность генома малярийного паразита человека Plasmodium falciparum» . Природа . 419 (6906): 498–511. Bibcode : 2002Natur.419..498G . DOI : 10,1038 / природа01097 . PMC 3836256 . PMID 12368864 .  
  22. ^ а б Пейн А., Беме У., Берри А.Е., Мунгалл К., Финн Р.Д., Джексон А.П. и др. (Октябрь 2008 г.). «Геном обезьяно-малярийного паразита Plasmodium knowlesi» . Природа . 455 (7214): 799–803. Bibcode : 2008Natur.455..799P . DOI : 10,1038 / природа07306 . PMC 2656934 . PMID 18843368 .  
  23. ^ а б Карлтон Дж. М., Адамс Дж. Х., Сильва Дж. К., Бидвелл С. Л., Лоренци Х., Калер Э. и др. (Октябрь 2008 г.). «Сравнительная геномика запущенного малярийного паразита человека Plasmodium vivax» . Природа . 455 (7214): 757–63. Bibcode : 2008Natur.455..757C . DOI : 10,1038 / природа07327 . PMC 2651158 . PMID 18843361 .  
  24. ^ a b Карлтон Дж. М., Ангиуоли С. В., Сух ББ, Коой Т. В., Пертеа М., Сильва Дж. К. и др. (Октябрь 2002 г.). «Последовательность генома и сравнительный анализ модельного паразита малярии грызунов Plasmodium yoelii yoelii» . Природа . 419 (6906): 512–9. Bibcode : 2002Natur.419..512C . DOI : 10,1038 / природа01099 . PMID 12368865 . 
  25. ^ Аранда M, Ли Y, Лью YJ, Баумгартен S, Симаков O, Уилсон MC, и др. (Декабрь 2016 г.). «Геномы коралловых симбионтов с динофлагеллятами подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни» . Научные отчеты . 6 : 39734. Bibcode : 2016NatSR ... 639734A . DOI : 10.1038 / srep39734 . PMC 5177918 . PMID 28004835 .  
  26. ^ "Сайт данных геномики рифов" . smic.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 .
  27. ^ а б Эйзен Дж. А., Койн Р. С., Ву М., Ву Д., Тиагараджан М., Вортман Дж. Р. и др. (Сентябрь 2006 г.). «Макроядерная последовательность генома инфузории Tetrahymena thermophila, модельного эукариота» . PLOS Биология . 4 (9): e286. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0040286 . PMC 1557398 . PMID 16933976 .  
  28. ^ Пейн А, Рено Х, Берриман М., Мерфи Л., Йейтс КА, Вейр В. и др. (Июль 2005 г.). «Геном паразита, трансформирующего клетки-хозяева, Theileria annulata по сравнению с T. parva» . Наука . 309 (5731): 131–3. Bibcode : 2005Sci ... 309..131P . DOI : 10.1126 / science.1110418 . PMID 15994557 . 
  29. ^ a b Гарднер М.Дж., Бишоп Р., Шах Т., де Вильерс Е.П., Карлтон Дж. М., Холл Н. и др. (Июль 2005 г.). «Последовательность генома Theileria parva, патогена крупного рогатого скота, трансформирующего лимфоциты» . Наука . 309 (5731): 134–7. Bibcode : 2005Sci ... 309..134G . DOI : 10.1126 / science.1110439 . PMID 15994558 . 
  30. ^ NCBI Геном T. gondii ME49
  31. ^ a b Eichinger L, Pachebat JA, Glöckner G, Rajandream MA, Sucgang R, Berriman M, et al. (Май 2005 г.). «Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum» . Природа . 435 (7038): 43–57. Bibcode : 2005Natur.435 ... 43E . DOI : 10,1038 / природа03481 . PMC 1352341 . PMID 15875012 .  
  32. ^ а б Лофтус Б., Андерсон И., Дэвис Р., Олсмарк Калифорнийский университет, Самуэльсон Дж., Амедео П. и др. (Февраль 2005 г.). «Геном простейшего паразита Entamoeba histolytica» (PDF) . Природа . 433 (7028): 865–8. Bibcode : 2005Natur.433..865L . DOI : 10,1038 / природа03291 . PMID 15729342 . S2CID 14231289 .   
  33. ^ a b Присоединение к NCBI
  34. ^ a b c Кемен Э., Гардинер А., Шульц-Ларсен Т., Кемен А.С., Бальмут А.Л., Роберт-Сейланианц А. и др. (Июль 2011 г.). Осубель FM (ред.). «Прирост и потеря генов в процессе эволюции облигатного паразитизма у возбудителя белой ржавчины Arabidopsis thaliana» . PLOS Биология . 9 (7): e1001094. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1001094 . PMC 3130010 . PMID 21750662 .  
  35. ^ Gobler CJ, Берри DL, Dyhrman ST, SW Вильгельма, Саламы А, Лобанов А.В., и др. (Март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens, выявленная с помощью экогеномики» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (11): 4352–7. Bibcode : 2011PNAS..108.4352G . DOI : 10.1073 / pnas.1016106108 . PMC 3060233 . PMID 21368207 .  
  36. ^ a b Gilson PR, Su V, Slamovits CH, Reith ME, Keeling PJ, McFadden GI (июнь 2006 г.). «Полная нуклеотидная последовательность нуклеоморфа хлорарахниофита: самое маленькое ядро ​​в природе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (25): 9566–71. Bibcode : 2006PNAS..103.9566G . DOI : 10.1073 / pnas.0600707103 . PMC 1480447 . PMID 16760254 .  
  37. ^ a b c d Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, et al. (Декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов» . Природа . 492 (7427): 59–65. Bibcode : 2012Natur.492 ... 59С . DOI : 10.1038 / nature11681 . PMID 23201678 . 
  38. ^ Мур CE, Кертис В, Т Миллс, Tanifuji G, Арчибальд JM (2012). «Нуклеоморфная геномная последовательность криптофитной водоросли Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 выявляет клон-специфическую потерю генов и сложность генома» . Геномная биология и эволюция . 4 (11): 1162–75. DOI : 10.1093 / GbE / evs090 . PMC 3514955 . PMID 23042551 .  
  39. ^ Tanifuji G, Онодера NT, Уилер TJ, Dlutek М, Donaher Н, Арчибальд JM (2012). «Полная последовательность нуклеоморфа генома нефотосинтетической водоросли Cryptomonas Paramecium выявляет основной набор генов нуклеоморфа» . Геномная биология и эволюция . 3 : 44–54. DOI : 10.1093 / GbE / evq082 . PMC 3017389 . PMID 21147880 .  
  40. ^ a b c Рид BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F, et al. (Июль 2013). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения» . Природа . 499 (7457): 209–13. Bibcode : 2013Natur.499..209. . DOI : 10,1038 / природа12221 . PMID 23760476 . 
  41. ^ Запись
  42. ^ a b c Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J, et al. (Январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомеи Fragilariopsis cylindrus» . Природа . 541 (7638): 536–540. Bibcode : 2017Natur.541..536M . DOI : 10,1038 / природа20803 . PMID 28092920 . 
  43. ^ а б Дуглас С., Заунер С., Фраунхольц М., Битон М., Пенни С., Дэн Л. Т. и др. (Апрель 2001 г.). «Сильно восстановленный геном порабощенного ядра водорослей» . Природа . 410 (6832): 1091–6. Bibcode : 2001Natur.410.1091D . DOI : 10.1038 / 35074092 . PMID 11323671 . 
  44. ^ a b Lane CE, van den Heuvel K, Kozera C, Curtis BA, Parsons BJ, Bowman S, Archibald JM (декабрь 2007 г.). «Нуклеоморфный геном Hemiselmis andersenii показывает полную потерю и уплотнение интронов как движущую силу структуры и функции белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (50): 19908–13. Bibcode : 2007PNAS..10419908L . DOI : 10.1073 / pnas.0707419104 . PMC 2148396 . PMID 18077423 .  
  45. ^ Baxter L, Tripathy S, Ishaque N, Boot N, Cabral A, Kemen E и др. (Декабрь 2010 г.). «Сигнатуры адаптации к облигатной биотрофии в геноме Hyaloperonospora arabidopsidis» . Наука . 330 (6010): 1549–1551. Bibcode : 2010Sci ... 330.1549B . DOI : 10.1126 / science.1195203 . PMC 3971456 . PMID 21148394 .  
  46. ^ Radakovits R, Jinkerson RE, Fuerstenberg SI, Tae H, Settlage RE, Boore JL, Posewitz MC (февраль 2012). «Проект последовательности генома и генетической трансформации маслянистой водоросли Nannochloropis gaditana» . Nature Communications . 3 (2): 686. Bibcode : 2012NatCo ... 3..686R . DOI : 10.1038 / ncomms1688 . PMC 3293424 . PMID 22353717 .  
  47. ↑ Bowler C, Allen AE, Badger JH, Grimwood J, Jabbari K, Kuo A и др. (Ноябрь 2008 г.). «Геном Phaeodactylum раскрывает эволюционную историю геномов диатомовых водорослей» . Природа . 456 (7219): 239–44. Bibcode : 2008Natur.456..239B . DOI : 10,1038 / природа07410 . PMID 18923393 . 
  48. ^ Haas BJ, Kamoun S, Zody MC, Jiang RH, Handsaker RE, Кано Л.М., и др. (Сентябрь 2009 г.). «Последовательность генома и анализ ирландского возбудителя картофельного голода Phytophthora infestans» (PDF) . Природа . 461 (7262): 393–8. Bibcode : 2009Natur.461..393H . DOI : 10,1038 / природа08358 . PMID 19741609 . S2CID 4385549 .   
  49. ^ a b Тайлер Б.М., Трипати С., Чжан Х, Дехал П., Цзян Р. Х., Аэртс А. и др. (Сентябрь 2006 г.). «Последовательности генома фитофторы раскрывают эволюционное происхождение и механизмы патогенеза» . Наука . 313 (5791): 1261–6. Bibcode : 2006Sci ... 313.1261T . DOI : 10.1126 / science.1128796 . PMID 16946064 . S2CID 21287860 .  
  50. ^ Швельм А, Fogelqvist Дж, Knaust А, Jülke S, Т Lilja, Бонилья-Россо G, и др. (Июнь 2015 г.). «Геном Plasmodiophora brassicae раскрывает понимание его жизненного цикла и происхождения хитинсинтаз» . Научные отчеты . 5 : 11153. Bibcode : 2015NatSR ... 511153S . DOI : 10.1038 / srep11153 . PMC 4471660 . PMID 26084520 .  
  51. ^ Carbone A, Siu A, Patel R (сентябрь 2010). «Детский атопический дерматит: обзор лечения». Летопись фармакотерапии . 44 (9): 1448–58. DOI : 10.1345 / aph.1P098 . PMID 20628042 . S2CID 44649671 .  
  52. ^ a b Армбраст Э.В., Бергес Дж. А., Боулер С., Грин Б. Р., Мартинес Д., Патнэм Н. Э. и др. (Октябрь 2004 г.). «Геном диатомовой водоросли Thalassiosira pseudonana: экология, эволюция и метаболизм». Наука . 306 (5693): 79–86. Bibcode : 2004Sci ... 306 ... 79A . CiteSeerX 10.1.1.690.4884 . DOI : 10.1126 / science.1101156 . PMID 15459382 . S2CID 8593895 .   
  53. ^ a b Франзен О, Йерлстрём-Хультквист Дж., Кастро Э., Шервуд Э., Анкарклев Дж., Райнер Д.С. и др. (Август 2009 г.). Петри В (ред.). "Проект секвенирования генома изолята GS группы B giardia Кишечник: вызван ли лямблиоз человека двумя разными видами?" . PLOS Патогены . 5 (8): e1000560. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1000560 . PMC 2723961 . PMID 19696920 .  
  54. ^ а б Моррисон Х.Г., МакАртур АГ, Гиллин Ф.Д., Алей С.Б., Адам Р.Д., Олсен Г.Дж. и др. (Сентябрь 2007 г.). «Геномный минимализм у ранних кишечных паразитов Giardia lamblia». Наука . 317 (5846): 1921–6. Bibcode : 2007Sci ... 317.1921M . DOI : 10.1126 / science.1143837 . PMID 17901334 . S2CID 29299317 .  
  55. ^ a b c d Павлин С.С., Сигер К., Харрис Д., Мерфи Л., Руис Дж. К., Перепел М. А. и др. (Июль 2007 г.). «Сравнительный геномный анализ трех видов Leishmania, вызывающих различные заболевания человека» . Генетика природы . 39 (7): 839–47. DOI : 10.1038 / ng2053 . PMC 2592530 . PMID 17572675 .  
  56. ^ а б Ivens AC, Peacock CS, Worthey EA, Murphy L, Aggarwal G, Berriman M и др. (Июль 2005 г.). «Геном кинетопластидного паразита Leishmania major» . Наука . 309 (5733): 436–42. Bibcode : 2005Sci ... 309..436I . DOI : 10.1126 / science.1112680 . PMC 1470643 . PMID 16020728 .  
  57. ^ а б в Фриц-Лейлин Л.К., Прочник С.Е., Джинджер М.Л., Дакс Дж.Б., Карпентер М.Л., Филд М.К. и др. (Март 2010 г.). «Геном Naegleria gruberi свидетельствует о ранней универсальности эукариот» . Cell . 140 (5): 631–42. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.01.032 . PMID 20211133 . S2CID 13901186 .  
  58. ^ а б Карлтон Дж. М., Хирт Р. П., Сильва Дж. К., Делчер А. Л., Шац М., Чжао К. и др. (Январь 2007 г.). «Проект последовательности генома возбудителя, передающегося половым путем, Trichomonas vaginalis» . Наука . 315 (5809): 207–12. Bibcode : 2007Sci ... 315..207C . DOI : 10.1126 / science.1132894 . PMC 2080659 . PMID 17218520 .  
  59. ^ а б Берриман М., Гедин Э, Герц-Фаулер С., Бландин Г., Рено Х., Бартоломеу, округ Колумбия, и др. (Июль 2005 г.). «Геном африканской трипаносомы Trypanosoma brucei». Наука . 309 (5733): 416–22. Bibcode : 2005Sci ... 309..416B . DOI : 10.1126 / science.1112642 . PMID 16020726 . S2CID 18649858 .  
  60. ^ а б Эль-Сайед Н.М., Майлер П.Дж., Бартоломеу Д.К., Нильссон Д., Аггарвал Г., Тран А.Н. и др. (Июль 2005 г.). «Последовательность генома Trypanosoma cruzi, этиологического агента болезни Шагаса» . Наука . 309 (5733): 409–15. Bibcode : 2005Sci ... 309..409E . DOI : 10.1126 / science.1112631 . PMID 16020725 . S2CID 3830267 .  
  61. ^ а б Кинг Н., Уэстбрук М.Дж., Янг С.Л., Куо А., Абедин М., Чепмен Дж. и др. (Февраль 2008 г.). «Геном хоанофлагелляты Monosiga brevicollis и происхождение многоклеточных животных» . Природа . 451 (7180): 783–8. Bibcode : 2008Natur.451..783K . DOI : 10,1038 / природа06617 . PMC 2562698 . PMID 18273011 .