Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
«LTBR» перенаправляется сюда. Чтобы узнать об аэропорте в Турции с этим кодом ИКАО, см. Аэропорт Енишехир .
LTBR
Лимфотоксин B рецептор.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1RF3 , 4MXW

Идентификаторы
ПсевдонимыLTBR , CD18, D12S370, LT-BETA-R, TNF-R-III, TNFCR, TNFR-RP, TNFR2-RP, TNFR3, TNFRSF3, рецептор лимфотоксина бета
Внешние идентификаторыOMIM : 600979 MGI : 104875 HomoloGene : 1753 GeneCards : LTBR
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение LTBR
Геномное расположение LTBR
Группа12п13.31Начинать6 375 045 п.н. [1]
Конец6 391 571 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 6 (мышь)
Chr.Хромосома 6 (мышь) [2]
Хромосома 6 (мышь)
Геномное расположение LTBR
Геномное расположение LTBR
Группа6 F3 | 6 59,32 смНачинать125 306 571 п.н. [2]
Конец125 313 ​​885 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE LTBR 203005 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
• активность рецептора, активируемого фактором некроза опухоли
• идентичное связывание с белками
• связывание убиквитин-протеин-лигазы
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• мембрана
• клеточная мембрана
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• аппарат Гольджи
Биологический процесс• дифференцировка миелоидных дендритных клеток
• сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли
• позитивная регуляция каскада JNK
• развитие многоклеточного организма
• клеточный ответ на механический стимул
• ответ на липополисахарид
• регуляция клеточной пролиферации
• позитивная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути
• воспалительный ответ
• GO: 0022415 вирусный процесс
• передача сигнала
• апоптотический процесс
• иммунный ответ
• положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB
• развитие кроветворных или лимфоидных органов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4055

17000

Ансамбль

ENSG00000111321

ENSMUSG00000030339

UniProt

P36941

P50284

RefSeq (мРНК)

NM_001270987
NM_002342

NM_010736

RefSeq (белок)

NP_001257916
NP_002333

NP_034866

Расположение (UCSC)Chr 12: 6.38 - 6.39 МбChr 6: 125.31 - 125.31 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Лимфотоксин бета - рецептора ( LTBR ), также известный как фактор некроза опухоли рецепторов суперсемейства элемента 3 ( TNFRSF3 ), представляет собой рецептор клеточной поверхности для лимфотоксина , участвующих в апоптоза и цитокиновой высвобождения. [5] [6] [7] Он является членом суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей .

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNF). Он экспрессируется на поверхности большинства типов клеток, включая клетки эпителиального и миелоидного происхождения, но не экспрессируется на Т- и В- лимфоцитах . Белок специфически связывает мембранную форму лимфотоксина (комплекс лимфотоксина-альфа и лимфотоксина-бета). Кодируемый белок и его лиганд играют роль в развитии и организации лимфоидной ткани и трансформированных клеток. Активация кодируемого белка может вызвать апоптоз. [5]

LTBR не только помогает запускать апоптоз, но и может привести к высвобождению цитокина интерлейкина 8 . Сверхэкспрессия LTBR в клетках HEK293 увеличивает активность промотора IL-8 и приводит к высвобождению IL-8. LTBR также важен для развития и организации вторичных лимфоидных органов и высвобождения хемокинов. [8]

Структура [ править ]

Графики Рамачандрана показывают, что 64,6% всех остатков находились в предпочтительной области. Эта структура была обнаружена с помощью дифракции рентгеновских лучей. Разрешение составляет 3,50 ангстрем. Углы альфа и бета составляют 90 градусов, а угол гаммы - 120 градусов. [9]

Взаимодействия [ править ]

Бета-рецептор лимфотоксина взаимодействует с гомологом Diablo [10] и TRAF3 . [11] [12] [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111321 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030339 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: рецептор бета-лимфотоксина LTBR (надсемейство TNFR, член 3)» .
  6. ^ Baens М, Chaffanet МЫ, Cassiman JJ, ван ден Берге Н, MARYNEN Р (апрель 1993 г.). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибированных последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика . 16 (1): 214–8. DOI : 10.1006 / geno.1993.1161 . PMID 8486360 . 
  7. ^ Crowe PD, VanArsdale TL, Walter BN, Ware CF, Hession C, Ehrenfels B, Browning JL, Дин WS, Гудвин RG, Smith CA (апрель 1994). «Бета-специфический рецептор лимфотоксина». Наука . 264 (5159): 707–10. Bibcode : 1994Sci ... 264..707C . DOI : 10.1126 / science.8171323 . PMID 8171323 . 
  8. ^ Чанг YH, Се SL, Чэнь MC, Лин WW (август 2002). «Рецептор лимфотоксина бета индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Exp. Cell Res . 278 (2): 166–74. DOI : 10.1006 / excr.2002.5573 . PMID 12169272 . 
  9. ^ "Анализ MolProbity Ramachandran" (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 12 октября 2012 года.
  10. ^ Куай, июнь; Никбарг Эллиотт; Вутерс Джо; Цю Юнчан; Ван Джек; Линь Лих-Линг (апрель 2003 г.). «Эндогенная ассоциация TRAF2, TRAF3, cIAP1 и Smac с рецептором лимфотоксина бета раскрывает новый механизм апоптоза» . J. Biol. Chem . Соединенные Штаты. 278 (16): 14363–9. DOI : 10.1074 / jbc.M208672200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12571250 .  
  11. ^ VanArsdale, TL; VanArsdale SL; Force WR; Вальтер Б.Н.; Mosialos G; Kieff E ; Рид JC; Ware CF (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль рекрутирования фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора kappaB» . Proc. Natl. Акад. Sci. США СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 94 (6): 2460–5. Bibcode : 1997PNAS ... 94.2460V . DOI : 10.1073 / pnas.94.6.2460 . ISSN 0027-8424 . PMC 20110 . PMID 9122217 .   
  12. ^ Ву, МОЙ; Wang PY; Хан Ш; Hsieh SL (апрель 1999 г.). «Цитоплазматический домен рецептора лимфотоксина-бета опосредует гибель клеток в клетках HeLa» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (17): 11868–73. DOI : 10.1074 / jbc.274.17.11868 . ISSN 0021-9258 . PMID 10207006 .  
  13. ^ Марстерс, SA; Ayres TM; Скубач М; Серый CL; Rothe M; Ашкенази А (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства TNFR-ассоциированных факторов и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (22): 14029–32. DOI : 10.1074 / jbc.272.22.14029 . ISSN 0021-9258 . PMID 9162022 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Elewaut D, Ware CF (2007). «Нетрадиционная роль LT-альфа-бета в дифференцировке Т-клеток». Trends Immunol . 28 (4): 169–75. DOI : 10.1016 / j.it.2007.02.005 . PMID  17336158 .
  • Браунинг Дж. Л., Нгамэк А., Лоутон П. и др. (1993). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Cell . 72 (6): 847–56. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (93) 90574-А . PMID  7916655 . S2CID  28961163 .
  • Кроу П.Д., ВанАрсдейл Т.Л., Уолтер Б.Н. и др. (1994). «Бета-специфический рецептор лимфотоксина». Наука . 264 (5159): 707–10. Bibcode : 1994Sci ... 264..707C . DOI : 10.1126 / science.8171323 . PMID  8171323 .
  • Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж. Дж. И др. (1993). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибированных последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика . 16 (1): 214–8. DOI : 10.1006 / geno.1993.1161 . PMID  8486360 .
  • Баенс М., Аерсенс Дж., Ван Занд К. и др. (1996). «Выделение и региональное распределение кДНК хромосомы 12р человека». Геномика . 29 (1): 44–52. DOI : 10.1006 / geno.1995.1213 . PMID  8530100 .
  • Ван X, Bornslaeger EA, Haub O и др. (1996). «Ген-кандидат для мутации мыши на стадии гаструляции без амниона кодирует TRAF-родственный белок». Dev. Биол . 177 (1): 274–90. DOI : 10,1006 / dbio.1996.0162 . PMID  8660894 .
  • Накано Х., Осима Х., Чунг В. и др. (1996). «TRAF5, активатор NF-kappaB и предполагаемый преобразователь сигнала для рецептора лимфотоксина-бета» . J. Biol. Chem . 271 (25): 14661–4. DOI : 10.1074 / jbc.271.25.14661 . PMID  8663299 .
  • Мацумото М., Се Т.Ю., Чжу Н. и др. (1997). «Основной белок вируса гепатита С взаимодействует с цитоплазматическим хвостом рецептора лимфотоксина-бета» . J. Virol . 71 (2): 1301–9. DOI : 10,1128 / JVI.71.2.1301-1309.1997 . PMC  191185 . PMID  8995654 .
  • ВанАрсдейл Т.Л., ВанАрсдейл С.Л., Force WR и др. (1997). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль рекрутирования фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора kappaB» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (6): 2460–5. Bibcode : 1997PNAS ... 94.2460V . DOI : 10.1073 / pnas.94.6.2460 . PMC  20110 . PMID  9122217 .
  • Wu MY, Hsu TL, Lin WW и др. (1997). «Серин / треонинкиназная активность, связанная с цитоплазматическим доменом рецептора лимфотоксина-бета в клетках HepG2» . J. Biol. Chem . 272 (27): 17154–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.27.17154 . PMID  9202035 .
  • Чен СМ, Ю Л.Р., Хван Л.Х., Ли Ю.Х. (1997). «Прямое взаимодействие корового белка вируса гепатита С с клеточным рецептором лимфотоксина-бета модулирует сигнальный путь рецептора лимфотоксина-бета» . J. Virol . 71 (12): 9417–26. DOI : 10,1128 / JVI.71.12.9417-9426.1997 . PMC  230246 . PMID  9371602 .
  • Мидзусима С., Фудзита М., Исида Т. и др. (1998). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей человеческий гомолог фактора 5, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF5)». Джин . 207 (2): 135–40. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00616-1 . PMID  9511754 .
  • Krajewska M, Krajewski S, Zapata JM, et al. (1998). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого, плода и опухоли» . Являюсь. J. Pathol . 152 (6): 1549–61. PMC  1858434 . PMID  9626059 .
  • Буссо В., Солер П., Моро Дж. И др. (1999). «Экспрессия трех членов семейства рецепторов TNF-R (4-1BB, рецептор лимфотоксина-бета и Fas) в легких человека» . Евро. Респир. Дж . 12 (4): 926–31. DOI : 10.1183 / 09031936.98.12040926 . PMID  9817170 .
  • Мерфи М., Уолтер Б.Н., Пайк-Нобиле Л. и др. (1999). «Экспрессия рецептора лимфотоксина бета на фолликулярных стромальных клетках в лимфоидных тканях человека» . Смерть клетки отличается . 5 (6): 497–505. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400374 . PMID  10200501 .
  • Wu MY, Wang PY, Han SH, Hsieh SL (1999). «Цитоплазматический домен рецептора лимфотоксина-бета опосредует гибель клеток в клетках HeLa» . J. Biol. Chem . 274 (17): 11868–73. DOI : 10.1074 / jbc.274.17.11868 . PMID  10207006 .
  • Yu KY, Kwon B, Ni J и др. (1999). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз» . J. Biol. Chem . 274 (20): 13733–6. DOI : 10.1074 / jbc.274.20.13733 . PMID  10318773 .
  • Руни И.А., Бутрович К.Д., Гласс А.А. и др. (2000). «Рецептор лимфотоксина-бета необходим и достаточен для LIGHT-опосредованного апоптоза опухолевых клеток» . J. Biol. Chem . 275 (19): 14307–15. DOI : 10.1074 / jbc.275.19.14307 . PMID  10799510 .
  • Лангегген H, Берге KE, Джонсон E, Hetland G (2003). «Эндотелиальные клетки пупочной вены человека экспрессируют рецептор комплемента 1 (CD35) и рецептор комплемента 4 (CD11c / CD18) in vitro». Воспаление . 26 (3): 103–10. DOI : 10,1023 / A: 1015585530204 . PMID  12083416 . S2CID  54700 .
  • Чанг Й.Х., Се С.Л., Чен М.С., Лин У.В. (2002). «Рецептор лимфотоксина бета индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Exp. Cell Res . 278 (2): 166–74. DOI : 10.1006 / excr.2002.5573 . PMID  12169272 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Лимфотоксин + бета + рецептор в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)