Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
МЕРТК
Белок MERTK PDB 2dbj.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2DBJ , 2P0C , 3BPR , 3BRB , 3TCP , 4M3Q , 4MH7 , 4MHA

Идентификаторы
ПсевдонимыMERTK , MER, RP38, c-mer, Tyro12, c-Eyk, протоонкоген MER, тирозинкиназа
Внешние идентификаторыOMIM : 604705 MGI : 96965 HomoloGene : 4626 GeneCards : MERTK
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномная локация для MERTK
Геномная локация для MERTK
Группа2к13Начинать111 898 607 п.н. [1]
Конец112 029 561 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномная локация для MERTK
Геномная локация для MERTK
Группа2 | 2 F1Начинать128 698 956 п.н. [2]
Конец128 802 894 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• АТФ связывания
• протеин - тирозин - киназа
• протеинкиназы активность
• ГО: связывание белка 0001948
• трансмембранного рецептора протеин - тирозин - киназа
• активности киназы
• связывание нуклеотида
• трансферазной активности
• рецептор тирозинкиназа
• трансмембранная сигнализация активность в отношении рецепторов
• связывание Wnt-белок
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• внешний сегмент фоторецептора
• рабдомер
• мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• клеточная мембрана
• цитоплазма
• внеклеточный
• рецепторный комплекс
Биологический процесс• сперматогенез
• развитие влагалища
• передача сигналов протеинкиназы B
• естественная дифференцировка клеток- киллеров
• сигнальный путь рецепторов клеточной поверхности
• фосфорилирование белков
• активация тромбоцитов
• передача сигналов между клетками
• положительная регуляция фагоцитоза
• клиренс апоптотических клеток
• распространение клеток в зависимости от адгезии субстрата
• лейкоциты миграция
• негативная регуляция активации лимфоцитов
• фосфорилирование
• развитие сетчатки глаза камерного типа
• отрицательная регуляция процесса апоптоза лейкоцитов
• фагоцитоз
• секреция клеткой
• фосфорилирование пептидил-тирозина
• негативная регуляция продукции цитокинов
• клиренс нейтрофилов
• негативная регуляция передачи сигнала
• сигнальный путь Wnt
• дифференцировка клеток
• негативная регуляция апоптотического процесса
• позитивная регуляция ERK1 и каскад ERK2
• сигнальный путь трансмембранного рецептора протеинтирозинкиназы
• развитие нервной системы
• миграция клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10461

17289

Ансамбль

ENSG00000153208

ENSMUSG00000014361

UniProt

Q12866

Q60805

RefSeq (мРНК)

NM_006343

NM_008587

RefSeq (белок)

NP_006334

NP_032613

Расположение (UCSC)Chr 2: 111.9 - 112.03 МбChr 2: 128,7 - 128,8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Прото-онкоген-тирозин протеинкиназы МЕР является ферментом , который в организме человека кодируется MERTK гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген является членом семейства киназ рецептора TYRO3 / AXL / MER (TAM) и кодирует трансмембранный белок с двумя доменами фибронектина типа III , двумя Ig-подобными доменами C2-типа (иммуноглобулиноподобными) и одним доменом тирозинкиназы. . Мутации в этом гене были связаны с нарушением пути фагоцитоза пигментного эпителия сетчатки (RPE) и возникновением аутосомно-рецессивного пигментного ретинита (RP). [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000153208 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014361 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Graham DK, Dawson TL, Mullaney DL, Snodgrass HR, Эрп HS (июнь 1994). «Клонирование и анализ экспрессии мРНК нового протоонкогена человека, c-mer». Рост и дифференциация клеток . 5 (6): 647–57. PMID 8086340 . 
  6. ^ Уэьер HU, Fung J, Lersch РА за июнь (1999). «Отнесение протоонкогена MERTK (он же c-mer) к хромосоме 2q14.1 человека путем гибридизации in situ» . Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (1–2): 91–2. DOI : 10.1159 / 000015223 . PMID 10343112 . S2CID 43714175 .  
  7. ^ a b «Ген Entrez: тирозинкиназа протоонкогена MERTK c-mer» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ивасе Т., Танака М., Судзуки М., Наито Ю., Сугимура Х., Кино I. (июль 1993 г.). «Идентификация генов протеин-тирозинкиназ, преимущественно экспрессируемых при эмбриональном желудке и раке желудка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 194 (2): 698–705. DOI : 10.1006 / bbrc.1993.1878 . hdl : 10271/1029 . PMID  7688222 .
  • Марк М.Р., Чен Дж., Хаммондс Р.Г., Садик М., Годовск П.Дж. (апрель 1996 г.). «Характеристика Gas6, члена суперсемейства белков, содержащих домен G, в качестве лиганда для Rse и Axl» . Журнал биологической химии . 271 (16): 9785–9. DOI : 10.1074 / jbc.271.16.9785 . PMID  8621659 .
  • Линг Л., Темплтон Д., Кунг Х. Дж. (Август 1996 г.). «Идентификация основных сайтов аутофосфорилирования Nyk / Mer, NCAM-родственной рецепторной тирозинкиназы» . Журнал биологической химии . 271 (31): 18355–62. DOI : 10.1074 / jbc.271.31.18355 . PMID  8702477 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Нагата К., Охаши К., Накано Т., Арита Х., Зонг К., Ханафуса Х., Мизуно К. (ноябрь 1996 г.). «Идентификация продукта гена 6, специфичного для остановки роста, в качестве общего лиганда для тирозинкиназ рецепторов Axl, Sky и Mer» . Журнал биологической химии . 271 (47): 30022–7. DOI : 10.1074 / jbc.271.47.30022 . PMID  8939948 .
  • Георгеску М.М., Кирш К.Х., Шишидо Т., Зонг С., Ханафуса Х. (февраль 1999 г.). «Биологические эффекты тирозинкиназы рецептора c-Mer в гемопоэтических клетках зависят от сайта связывания Grb2 в рецепторе и активации NF-kappaB» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (2): 1171–81. DOI : 10.1128 / mcb.19.2.1171 . PMC  116046 . PMID  9891051 .
  • Гал А., Ли И, Томпсон Д.А., Вейр Дж., Орт У., Якобсон С.Г., Апфельштедт-Силла Э, Фоллрат Д. (ноябрь 2000 г.). «Мутации в MERTK, человеческом ортологе гена дистрофии сетчатки крыс RCS, вызывают пигментный ретинит». Генетика природы . 26 (3): 270–1. DOI : 10.1038 / 81555 . PMID  11062461 . S2CID  2812292 .
  • Томпсон Д.А., МакГенри К.Л., Ли Й., Ричардс Дж. Э., Отман М. И., Швингер Э., Воллрат Д., Якобсон С. Г., Гал А (январь 2002 г.). «Дистрофия сетчатки из-за отцовской изодизомии хромосомы 1 или хромосомы 2 с гомоаллелизмом мутаций в RPE65 или MERTK, соответственно» . Американский журнал генетики человека . 70 (1): 224–9. DOI : 10,1086 / 338455 . PMC  384890 . PMID  11727200 .
  • Инь Дж. Л., Хэмбли Б. Д., Бао СС, Художник Д., Бишоп Г. А., Эрис Дж. М. (сентябрь 2003 г.). «Экспрессия гена 6, специфичного для остановки роста, и его рецепторов в дисфункциональных почечных аллотрансплантатах человека». Transplant International . 16 (9): 681–8. DOI : 10.1007 / s00147-003-0593-3 . PMID  12768229 . S2CID  13419387 .
  • McHenry CL, Liu Y, Feng W., Nair AR, Feathers KL, Ding X, Gal A, Vollrath D, Sieving PA, Thompson DA (май 2004 г.). «MERTK аргинин-844-цистеин у пациента с тяжелой дистрофией палочки-шишки: потеря функции мутантного белка в трансфицированных клетках» . Исследовательская офтальмология и визуализация . 45 (5): 1456–63. DOI : 10.1167 / iovs.03-0909 . PMID  15111602 .
  • Чен С., Ли К., Дэрроу А.Л., Ван И, Дериан К.К., Ян Дж., Де Гаравилья Л., Андраде-Гордон П., Дамиано Б.П. (июнь 2004 г.). «Передача сигналов тирозинкиназы рецептора Mer участвует в функции тромбоцитов» . Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов . 24 (6): 1118–23. DOI : 10.1161 / 01.ATV.0000130662.30537.08 . PMID  15130911 .
  • Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих ES-клеток». Природа Биотехнологии . 22 (6): 707–16. DOI : 10,1038 / NBT971 . PMID  15146197 . S2CID  27764390 .
  • Ли И, Махаджан Н.П., Вебстер-Сириак Дж., Бхенде П., Хонг Г.К., Эрп Х.С., Кенни С. (ноябрь 2004 г.). «Ген C-mer индуцируется немедленным ранним белком вируса Эпштейна-Барра BRLF1» . Журнал вирусологии . 78 (21): 11778–85. DOI : 10,1128 / JVI.78.21.11778-11785.2004 . PMC  523243 . PMID  15479819 .
  • Гулд В. Р., Бакси С. М., Шредер Р., Пэн Ю. В., Лидли Р. Дж., Петерсон Дж. Т., Перрин Л. А. (апрель 2005 г.). «Рецепторы Gas6 Axl, Sky и Mer усиливают активацию тромбоцитов и регулируют тромботические реакции» . Журнал тромбоза и гемостаза . 3 (4): 733–41. DOI : 10.1111 / j.1538-7836.2005.01186.x . PMID  15733062 . S2CID  20373626 .
  • Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А., Лагерь Д.Г., Монро М.Э., Мур Р.Дж., Смит Р.Д. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . Журнал протеомных исследований . 4 (6): 2070–80. DOI : 10.1021 / pr0502065 . PMC  1850943 . PMID  16335952 .
  • Грэм Д.К., Зальцберг Д.Б., Курцберг Дж., Сатер С., Мацусима Г.К., Китинг А.К., Лян Х, Ловелл М.А., Уильямс С.А., Доусон Т.Л., Шелл М.Дж., Анвар А.А., Снодграсс HR, Эрп Х.С. (май 2006 г.). «Эктопическая экспрессия протоонкогена Mer в педиатрической Т-клеточной острой лимфобластной лейкемии» . Клинические исследования рака . 12 (9): 2662–9. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2208 . PMID  16675557 .
  • Тада А., Вада Й, Сато Х., Итабаши Т., Кавамура М., Тамай М., Нисида К. (май 2006 г.). «Скрининг гена MERTK на мутации у японских пациентов с аутосомно-рецессивным пигментным ретинитом». Молекулярное зрение . 12 : 441–4. PMID  16710167 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись об обзоре пигментного ретинита
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q12866 (тирозин-протеинкиназа Mer) в PDBe-KB .


  • v
  • т
  • е