Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ND5
Идентификаторы
ПсевдонимыND5 , митохондриально кодируемая NADH-дегидрогеназа 5, MTNADH-дегидрогеназа, субъединица 5 (комплекс I), субъединица NADH-дегидрогеназы 5
Внешние идентификаторыOMIM : 516005 MGI : 102496 HomoloGene : 36212 GeneCards : ND5
Расположение гена ( человек )
Митохондриальная ДНК (человека)
Chr.Митохондриальная ДНК (человека) [1]
Группан / дНачинать12 337 п.н. [1]
Конец14 148 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Митохондриальная ДНК (мышь)
Chr.Митохондриальная ДНК (мышь) [2]
Группан / дНачинать11 742 п.н. [2]
Конец13 565 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• Активность НАДН-дегидрогеназы (убихинона)
• Активность оксидоредуктазы
• Активность НАДН-дегидрогеназы
Сотовый компонент• интегральный компонент мембраны
• внутренняя мембрана митохондрий
• проекция нейрона
• комплекс I дыхательной цепи митохондрий
• транспорт электронов
• мембрана
• митохондрия
Биологический процесс• транспорт электронов, связанный с синтезом АТФ
• ответ на гипоксию
• окислительно-восстановительный процесс
• ответ на перекись водорода
• ответ на азоторганическое соединение
• сборка комплекса I дыхательной цепи митохондрий
• транспорт электронов митохондрий, НАДН в убихинон
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4540

17721

Ансамбль

ENSG00000198786

ENSMUSG00000064367

UniProt

P03915

P03921

RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

NP_904338

Расположение (UCSC)Chr M: 0,01 - 0,01 МбChr M: 0,01 - 0,01 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Расположение гена MT-ND5 в митохондриальном геноме человека. MT-ND5 - один из семи митохондриальных генов НАДН-дегидрогеназы (желтые прямоугольники).

МТ-ND5 является геном из митохондриального генома , кодирующий НАДН-убихинон оксидоредуктазы цепи 5 белка (ND5). [5] Белок ND5 является субъединицей НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [6] Вариации MT-ND5 человека связаны с митохондриальной энцефаломиопатией, лактоацидозом и эпизодами инсульта (MELAS), а также с некоторыми симптомами синдрома Ли и наследственной оптической нейропатии Лебера (LHON).[7] [8]

Структура [ править ]

MT-ND5 находится в митохондриальной ДНК от пары оснований от 12,337 до 14,148. [5] Ген MT-ND5 продуцирует белок 67 кДа, состоящий из 603 аминокислот. [9] [10] MT-ND5 - один из семи митохондриальных генов, кодирующих субъединицы фермента NADH-дегидрогеназы (убихинона) , вместе с MT-ND1 , MT-ND2 , MT-ND3 , MT-ND4 , MT-ND4L и MT. -ND6 . Этот фермент, также известный как Комплекс I , является крупнейшим из респираторных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильнымдомен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH. MT-ND5 и остальные субъединицы, кодируемые митохондриями, являются наиболее гидрофобными из субъединиц Комплекса I и образуют ядро ​​трансмембранной области. [6]

Функция [ править ]

Продукт MT-ND5 является субъединицей Комплекса I дыхательной цепи, который, как предполагается, принадлежит к минимальной сборке ядерных белков, необходимых для катализирования дегидрирования NADH и переноса электронов на убихинон (кофермент Q10). [11] Первоначально NADH связывается Complex I и передает два электрона в isoalloxazine кольцо из флавинмононуклеотида (ФМНО) протеза с образованием FMNH 2 . Электроны передаются через серию кластеров железо-сера (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH).2 ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. [6]

Клиническое значение [ править ]

Небольшой процент митохондриальной энцефаломиопатии, лактоацидоза и эпизодов, подобных инсульту (MELAS), вызван мутацией G> A в паре оснований 13513 в гене MT-ND5. Мутации в гене MT-ND5 вызывают нарушение функции Комплекса I митохондриальной системы транспорта электронов, нарушая те ткани, которые требуют значительных затрат энергии, такие как мозг и мышцы. Также могут наблюдаться поражение сердца и почек, а также такие симптомы, как миопатия и лактоацидоз . [12] Пациенты с мутациями MT-ND5 могут демонстрировать основные черты MELAS и MERRF у некоторых пациентов, а также симптомы синдрома Ли и / илиНаследственная оптическая нейропатия Лебера (LHON) у других. [7] [8] [13] [14]

Взаимодействия [ править ]

MT-ND5 взаимодействует с глутамин синтетазой (GLUL), LIG4 и YME1L1 . [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000198786 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: Версия Ensembl 89: ENSMUSG00000064367 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b c «Ген Entrez: субъединица 5 НАДН-дегидрогеназы MT-ND5» .
  6. ^ a b c Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
  7. ^ а б Эль-Хаттаб, AW; Almannai, M .; Scaglia, F .; Адам, депутат; Ardinger, HH; Пагон, РА; Уоллес, ЮВ; Bean LJH; Стивенс, К .; Амемия, А. (1993). «МЕЛАС» . GeneReviews . PMID 20301411 . 
  8. ^ а б «МТ-НД5» . Домашний справочник по генетике . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 23 марта 2015 года .
  9. ↑ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss Дж., Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний» . Циркуляционные исследования . 113 (9): 1043–53. DOI : 10,1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .  
  10. ^ "Цепь 5 НАДН-убихинон оксидоредуктазы" . Атлас кардиоорганических белков (COPaKB) .
  11. ^ "MT-ND5 - NADH-убихинон оксидоредуктаза цепь 5 - Homo sapiens (человек)" . UniProt.org: центр информации о белках . Консорциум UniProt.
  12. ^ Альстон CL, Морак M, Reid C, Hargreaves IP, папа SA, Land JM, Heales SJ, Хорват R, Манди H, Taylor RW (февраль 2010). «Новая митохондриальная мутация сдвига рамки считывания MTND5, вызывающая изолированный дефицит комплекса I, почечную недостаточность и миопатию». Нервно-мышечные расстройства . 20 (2): 131–5. DOI : 10.1016 / j.nmd.2009.10.010 . PMID 20018511 . S2CID 13122341 .  
  13. ^ Тейлор RW, Моррис А. А., Хатчинсон М, Тернбулл ДМ (февраль 2002 г.). «Болезнь Ли, связанная с новой мутацией ND5 митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 10 (2): 141–4. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200773 . PMID 11938446 . 
  14. ^ Naini АВ, Лу Дж, Кауфман Р, Бернштейн Р.А., Манкузо М, Бонилья Е, Хирано М, DiMauro S (март 2005 г.). «Новая мутация митохондриальной ДНК ND5 у пациента с клиническими признаками MELAS и MERRF» . Архив неврологии . 62 (3): 473–6. DOI : 10,1001 / archneur.62.3.473 . PMID 15767514 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Масс-спектрометрическая характеристика MT-ND5 на COPaKB
  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о митохондриальном ДНК-ассоциированном синдроме Ли и NARP

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .