• SMAD белковый комплекс • транскрипция регулятор комплекс • внутриклеточный • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• развитие зародышевых клеток • развитие зачатка мочеточника • сокращение сердечной мышцы • регуляция транскрипции, шаблонная ДНК • передача сигнала белка SMAD • спецификация эмбрионального паттерна • оссификация • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • клеточный ответ на стимул BMP • сигнальный путь BMP • транскрипция , ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Регрессия мюллерова протока • фосфорилирование белка • развитие хряща • позитивная регуляция дифференцировки остеобластов • дифференцировка эритроцитов • развитие костей • сигнальный путь бета-рецептора трансформирующего фактора роста • сигнальная трансдукция • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в клеточном ответе на химический стимул • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Обязательство судьбы остеобластов • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
4090
17129
Ансамбль
ENSG00000113658
ENSMUSG00000021540
UniProt
Q99717
P97454
RefSeq (мРНК)
NM_005903 NM_001001419 NM_001001420
NM_001164041 NM_001164042 NM_008541
RefSeq (белок)
NP_001001419 NP_001001420 NP_005894
NP_001157513 NP_001157514 NP_032567
Расположение (UCSC)
Chr 5: 136.13 - 136.19 Мб
Chr 13: 56,7 - 56,74 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Матери против decapentaplegic гомолога 5 также известного как SMAD5 является белком , который в организме человека кодируется SMAD5 геном . [5]
SMAD5, как следует из названия, является гомологом гена дрозофилы : « Матери против декапентаплегии », что основано на традиции такого необычного наименования в сообществе исследователей генов. [6] Он принадлежит к семейству белков SMAD , которые принадлежат к суперсемейству модуляторов TGFβ . Как и многие другие члены семейства TGFβ, SMAD5 участвует в передаче клеточных сигналов и модулирует сигналы костных морфогенетических белков (BMP). Связывание лигандов вызывает олигомеризацию и фосфорилирование белка SMAD5. SMAD5 - это SMAD, регулируемый рецепторами ( R-SMAD) и активируется киназой рецептора костного морфогенетического белка типа 1. Он может играть роль в пути, в котором TGFβ является ингибитором гематопоэтических клеток-предшественников.
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113658 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021540 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Риггинс ГДж, Thiagalingam S, Розенблюм Е, Веинстеин CL, Керн SE, Гамильтон SR, Виллсон Ю.К., Маркоуиц С.Д., Кинзлер кВт, Фогельштейна В (июль 1996 года). «Безумные гены у человека». Nat. Genet . 13 (3): 347–9. DOI : 10.1038 / ng0796-347 . PMID 8673135 . S2CID 10124489 .
^ «Еж Соник, Dicer, и проблема с Именованием Генов» , 26 сентября 2014, Майкл Уайт. psmag.com
vтеПередача сигналов клеток : путь передачи сигналов TGFβ
Суперсемейство лигандов TGF beta
Лиганд ACVR или TGFBR
Бета-семейство TGF
TGF-β1
TGF-β2
TGF-β3
Активин и ингибин
INHA
INHBA
INHBB
INHBC
Узловой
Лиганд BMPR
Костные морфогенетические белки
BMP2
BMP3
BMP4
BMP5
BMP6
BMP7
BMP8a
BMP8b
BMP10
BMP15
Факторы дифференциации роста
GDF1
GDF2
GDF3
GDF5
GDF6
GDF7
Миостатин / GDF8
GDF9
GDF10
GDF11
GDF15
Антимюллеров гормон
Бета-рецепторы TGF ( активин , BMP , семейство )
TGFBR1:
Рецепторы активина 1 типа
ACVR1
ACVR1B
ACVR1C
ACVRL1
BMPR1
BMPR1A
BMPR1B
TGFBR2:
Рецепторы активина 2 типа
ACVR2A
ACVR2B
AMHR2
BMPR2
TGFBR3:
бетагликан
Преобразователи / SMAD
R-SMAD ( SMAD1
SMAD2
SMAD3
SMAD5
SMAD9 )
I-SMAD ( SMAD6
SMAD7 )
SMAD4
Ингибиторы лигандов
Цербер
Chordin
Декорин
Фоллистатин
Гремлин
Левша
LTBP1
Noggin
ПАРН
THBS1
Корецепторы
БАМБИ
Cripto
Другой
САРА
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора