Мульти-антимикробный экструзионный белок

Мульти антимикробный экструзионный белок

Идентификаторы

Символ

Приятель

Pfam

Клан пфам

ИнтерПро

TCDB

OPM суперсемейство

Белок OPM

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	краткое изложение структуры

М в конечном виде п т imicrobial х xtrusion белки ( MATE )также известный как множественная лекарственная и токсин экструзия или множественные лекарственные и токсическое соединение экструзия представляет собой семейство белков , которые функционируюткачестве лекарственного средства / натрия или протонных антипортеров . ^[1]^[2]^[3]

Функция [ править ]

Белки MATE у бактерий , архей и эукариот функционируют как основные переносчики метаболических и ксенобиотических органических катионов. ^[2]^[3]

Структура [ править ]

Предполагается, что эти белки имеют 12 альфа-спиральных трансмембранных областей, некоторые из животных белков могут иметь дополнительную С-концевую спираль. ^[4] Рентгеновская структура NorM была определена до 3,65 Å, что выявило обращенную наружу конформацию с двумя порталами, открытыми для внешнего листка мембраны, и уникальную топологию предсказанных 12 трансмембранных спиралей, отличных от любых других известных множественных лекарств. переносчик сопротивления. ^[5]

Открытие [ править ]

С множественным лекарственным откачивающим Транспортером NORM из В. parahaemolyticus , который опосредует устойчивость к нескольким антимикробным агентам ( норфлоксацин , канамицина , этидийбромид и т.д.) и его гомологу из E.coli , были идентифицированы в 1998 году ^[6] NORM , кажется, функции в качестве лекарственного средства / натрия антиносителя что является первым примером обнаруженного переносчика оттока нескольких лекарственных препаратов, связанного с Na ⁺ . ^[7] NorM является прототипом нового семейства транспортеров, а Brown et al.. назвали его семейством экструзионных соединений с множественными лекарствами и токсичными соединениями. ^[1] NorM называют «последним из переносчиков множества лекарственных средств», потому что это последний переносчик множества лекарственных средств, обнаруженный как функционально, так и структурно. ^[8]

Гены [ править ]

Следующие гены человека кодируют белки MATE:

SLC47A1
SLC47A2

См. Также [ править ]

Семейство носителей растворенных веществ
Надсемейство "резистентность-нодуляция-деление клеток" (RND)

Ссылки [ править ]

^ a b Brown MH, Paulsen IT, Skurray RA (январь 1999 г.). «Множественный эффлюксный белок NorM является прототипом нового семейства транспортеров» . Мол. Microbiol . 31 (1): 394–5. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.1999.01162.x . PMID 9987140 . S2CID 39261040 .
^ a b Курода Т., Цучия Т. (декабрь 2008 г.). «Транспортеры мультилекарственного оттока в семье MATE». Биохим. Биофиз. Acta . 1794 (5): 763–8. DOI : 10.1016 / j.bbapap.2008.11.012 . PMID 19100867 .
^ a b Omote H; и другие. (2006). «Белки MATE как основные переносчики метаболических и ксенобиотических органических катионов». Направления фармакологических наук . 27 (11): 587–93. DOI : 10.1016 / j.tips.2006.09.001 . PMID 16996621 .
^ Hvorup RN, Winnen B, Chang AB, Цзян У, Чжоу XF, Saier MH (март 2003). «Суперсемейство экспортеров множественных лекарств / олигосахаридил-липидов / полисахаридов (MOP)» . Евро. J. Biochem . 270 (5): 799–813. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03418.x . PMID 12603313 .
^ Он X, Шевчик P, Karykin A, Hong WX, Чжан Q, G Chang (2010). «Структура катионно-связанного экструзионного транспортера для множественных лекарств и токсичных соединений» . Природа . 467 (7318): 991–994. Bibcode : 2010Natur.467..991H . DOI : 10,1038 / природа09408 . PMC 3152480 . PMID 20861838 .
^ Морит У, Кодам К, Шиот S, Шахта Т, Катаок А, Мидзусим Т, Цутий Т (июль 1998 года). "NorM, предполагаемый белок оттока нескольких лекарственных препаратов, Vibrio parahaemolyticus и его гомолог в Escherichia coli" . Противомикробный. Агенты Chemother . 42 (7): 1778–82. DOI : 10.1128 / AAC.42.7.1778 . PMC 105682 . PMID 9661020 .
^ Морит У, Катаок А, Шиот S, Мидзусим Т, Цутий Т (декабрь 2000 г.). «NorM Vibrio parahaemolyticus является Na + -приводимым насосом для оттока нескольких лекарственных препаратов» . J. Bacteriol . 182 (23): 6694–7. DOI : 10.1128 / JB.182.23.6694-6697.2000 . PMC 111412 . PMID 11073914 .
^ Ван Вейн HW (2010). «Структурная биология: последний из переносчиков множества лекарственных средств». Природа . 467 (7318): 926–7. Bibcode : 2010Natur.467..926V . DOI : 10.1038 / 467926a . PMID 20962836 . S2CID 4338964 .

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR002528

Эта статья о мембранном белке незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid9987140-1] Brown MH, Paulsen IT, Skurray RA (январь 1999 г.). «Множественный эффлюксный белок NorM является прототипом нового семейства транспортеров» . Мол. Microbiol . 31 (1): 394–5. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.1999.01162.x . PMID 9987140 . S2CID 39261040 .

[pmid19100867-2] Курода Т., Цучия Т. (декабрь 2008 г.). «Транспортеры мультилекарственного оттока в семье MATE». Биохим. Биофиз. Acta . 1794 (5): 763–8. DOI : 10.1016 / j.bbapap.2008.11.012 . PMID 19100867 .

[pmid16996621-3] Omote H; и другие. (2006). «Белки MATE как основные переносчики метаболических и ксенобиотических органических катионов». Направления фармакологических наук . 27 (11): 587–93. DOI : 10.1016 / j.tips.2006.09.001 . PMID 16996621 .

[pmid12603313-4] Hvorup RN, Winnen B, Chang AB, Цзян У, Чжоу XF, Saier MH (март 2003). «Суперсемейство экспортеров множественных лекарств / олигосахаридил-липидов / полисахаридов (MOP)» . Евро. J. Biochem . 270 (5): 799–813. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03418.x . PMID 12603313 .

[pmid20861838-5] Он X, Шевчик P, Karykin A, Hong WX, Чжан Q, G Chang (2010). «Структура катионно-связанного экструзионного транспортера для множественных лекарств и токсичных соединений» . Природа . 467 (7318): 991–994. Bibcode : 2010Natur.467..991H . DOI : 10,1038 / природа09408 . PMC 3152480 . PMID 20861838 .

[pmid9661020-6] Морит У, Кодам К, Шиот S, Шахта Т, Катаок А, Мидзусим Т, Цутий Т (июль 1998 года). "NorM, предполагаемый белок оттока нескольких лекарственных препаратов, Vibrio parahaemolyticus и его гомолог в Escherichia coli" . Противомикробный. Агенты Chemother . 42 (7): 1778–82. DOI : 10.1128 / AAC.42.7.1778 . PMC 105682 . PMID 9661020 .

[pmid11073914-7] Морит У, Катаок А, Шиот S, Мидзусим Т, Цутий Т (декабрь 2000 г.). «NorM Vibrio parahaemolyticus является Na + -приводимым насосом для оттока нескольких лекарственных препаратов» . J. Bacteriol . 182 (23): 6694–7. DOI : 10.1128 / JB.182.23.6694-6697.2000 . PMC 111412 . PMID 11073914 .

[pmid20962836-8] Ван Вейн HW (2010). «Структурная биология: последний из переносчиков множества лекарственных средств». Природа . 467 (7318): 926–7. Bibcode : 2010Natur.467..926V . DOI : 10.1038 / 467926a . PMID 20962836 . S2CID 4338964 .

[1]