Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
NAB2
Идентификаторы
ПсевдонимыNAB2 , MADER, NGFI-A связывающий белок 2
Внешние идентификаторыOMIM : 602381 MGI : 107563 HomoloGene : 4353 GeneCards : NAB2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение NAB2
Геномное расположение NAB2
Группа12q13.3Начинать57 089 043 п.н. [1]
Конец57 095 476 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение NAB2
Геномное расположение NAB2
Группа10 D3 | 10 74,6 смНачинать127 660 918 п.н. [2]
Конец127 668 568 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NAB2 216017 s в формате fs.png

PBB GE NAB2 212803 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• транскрипционный фактор связывания
• GO: 0001948 связывания с белками
• GO: 0001106 транскрипции корепрессор активность
• идентичные связывания с белками
• ГО: coregulator активность 0001104 транскрипции
Сотовый компонент• ядро клетки
Биологический процесс• Дифференциация шванновских клеток
• миелинизация
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III
• клеточная пролиферация
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• эндохондральная оссификация
• регуляция развития эпидермиса
• транскрипция, ДНК-шаблон
• развитие нервной системы
• положительная регуляция активности тау-протеинкиназы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4665

17937

Ансамбль

ENSG00000166886

ENSMUSG00000025402

UniProt

Q15742

Q61127

RefSeq (мРНК)

NM_005967
NM_001330305

NM_001122895
NM_008668

RefSeq (белок)

NP_001317234
NP_005958

NP_001116367
NP_032694

Расположение (UCSC)Chr 12: 57.09 - 57,1 МбChr 10: 127.66 - 127.67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

NGFI-А-связывающий белок 2 , также известный как РВГ-1-связывающий белок 2 или меланома-ассоциированного белка замедленного раннего ответа (Mader) представляет собой белок , который у человека кодируется NAB2 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член семейства белков, связывающих NGFI-A (NAB), которые функционируют в ядре, подавляя или активируя транскрипцию, индуцированную некоторыми членами семейства трансактиваторов EGR (реакция раннего роста) . Белки NAB могут гомо- или гетеро-мультимеризоваться с другими белками EGR или NAB через консервативный N-концевой домен и репрессировать транскрипцию через два частично повторяющихся C-концевых домена. Репрессия транскрипции кодируемым белком частично опосредуется взаимодействиями с комплексом ремоделирования нуклеосом и деактилазы (NuRD). Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, но их биологическая ценность не определена. [7]

Патология [ править ]

Повторяющиеся соматические слияния двух генов, NGFI-A-связывающего белка 2 (NAB2) и STAT6 , локализованного в хромосомной области 12q13, были идентифицированы в солитарных фиброзных опухолях . [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000166886 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025402 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Svaren Дж, Sevetson БР, Апель Е.Д., Zimonjic БД, Попеску NC, Milbrandt J (август 1996 г.). «NAB2, корепрессор NGFI-A (Egr-1) и Krox20, индуцируется пролиферативными и дифференцирующими стимулами» . Mol Cell Biol . 16 (7): 3545–53. DOI : 10,1128 / MCB.16.7.3545 . PMC 231349 . PMID 8668170 .  
  6. ^ Кирш КН, Korradi Y, Джонсон JP (июль 1996). «Мадер: новый ядерный белок сверхэкспрессирован в меланомах человека». Онкоген . 12 (5): 963–71. PMID 8649813 . 
  7. ^ a b «Ген Entrez: NAB2 NGFI-A связывающий белок 2 (EGR1 связывающий белок 2)» .
  8. ^ Kabbinavar, FF; Hambleton, J; Масса, RD; Hurwitz, HI; Bergsland, E; Саркар, С (2005). «Комбинированный анализ эффективности: добавление бевацизумаба к фторурацилу / лейковорину улучшает выживаемость пациентов с метастатическим колоректальным раком». Журнал клинической онкологии . 23 (16): 3706–12. DOI : 10.1200 / JCO.2005.00.232 . PMID 15867200 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Сварен Дж., Апель Э.Д., Симбургер К.С. и др. (1997). «Гены Nab2 и Stat6 имеют общую область терминации транскрипции». Геномика . 41 (1): 33–9. DOI : 10.1006 / geno.1997.4609 . PMID  9126479 .
  • Ку З., Вольфраим Л.А., Сварен Дж. И др. (1998). «Транскрипционный корепрессор NAB2 ингибирует индуцированную NGF дифференцировку клеток PC12» . J. Cell Biol . 142 (4): 1075–82. DOI : 10,1083 / jcb.142.4.1075 . PMC  2132876 . PMID  9722618 .
  • Сварен Дж., Севетсон Б.Р., Голда Т. и др. (1998). «Новые мутанты корепрессоров NAB усиливают активацию трансактиваторами Egr» . EMBO J . 17 (20): 6010–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.20.6010 . PMC  1170927 . PMID  9774344 .
  • Абдулкадир С.А., Ку З., Гарабедян Э. и др. (2001). «Нарушение туморогенеза простаты у мышей с дефицитом Egr1». Nat. Med . 7 (1): 101–7. DOI : 10.1038 / 83231 . PMID  11135623 . S2CID  7191051 .
  • Абдулкадир С.А., Карбоун Дж. М., Нотон С. К. и др. (2001). «Частая и ранняя потеря корепрессора EGR1 NAB2 при карциноме простаты человека». Гм. Патол . 32 (9): 935–9. DOI : 10.1053 / hupa.2001.27102 . PMID  11567222 .
  • Венкен К., Ди Мария Э, Беллоне Э и др. (2003). «Поиск мутаций в корепрессорных белках EGR2, NAB1 и NAB2, при периферических невропатиях человека». Нейрогенетика . 4 (1): 37–41. DOI : 10.1007 / s10048-001-0124-2 . PMID  12030330 . S2CID  1928229 .
  • Люцерна М., Меччерякова Д., Кадл А. и др. (2003). «NAB2, корепрессор EGR-1, ингибирует индукцию гена, опосредованную фактором роста эндотелия сосудов, и ангиогенные ответы эндотелиальных клеток» . J. Biol. Chem . 278 (13): 11433–40. DOI : 10.1074 / jbc.M204937200 . PMID  12427750 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Камбринк Дж, Герлингер М, Джонсон Дж. П. (2005). «Egr-1 индуцирует экспрессию своего корепрессора nab2 путем активации промотора nab2, тем самым создавая петлю отрицательной обратной связи» . J. Biol. Chem . 280 (52): 42785–93. DOI : 10.1074 / jbc.M511079200 . PMID  16260776 .
  • Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Сринивасан Р., Магер Г.М., Уорд Р.М. и др. (2006). «NAB2 подавляет транскрипцию, взаимодействуя с субъединицей CHD4 ремоделирования нуклеосом и комплекса деацетилазы (NuRD)» . J. Biol. Chem . 281 (22): 15129–37. DOI : 10.1074 / jbc.M600775200 . PMID  16574654 .
  • Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .