Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NONO )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Эта статья о гене, кодирующем человеческий белок. Для использования в других целях, см nono (значения) .
НЕТ НЕТ
Белок NONO PDB 2cpj.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3SDE

Идентификаторы
ПсевдонимыНОО , NMT55, NRB54, Р54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, доменне содержащее программный модуль, октамеры-связывающий доменне содержащее программный модуль октамер связывания
Внешние идентификаторыOMIM : 300084 MGI : 1855692 HomoloGene : 7212 GeneCards : Ноно
Расположение гена ( человек )
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человека) [1]
Х-хромосома (человек)
Геномное местоположение для NONO
Геномное местоположение для NONO
ГруппаXq13.1Начинать71 254 814 п.н. [1]
Конец71 301 522 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Х-хромосома (мышь)
Chr.Х-хромосома (мышь) [2]
Х-хромосома (мышь)
Геномное местоположение для NONO
Геномное местоположение для NONO
ГруппаX | XDНачинать101 429 318 п.н. [2]
Конец101 448 591 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NONO 210470 x at fs.png

PBB GE NONO 208698 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0000980 цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК • Связывание ДНК
• связывание с хроматином • GO: 0000975 связывание цис-регуляторной области транскрипции • связывание с белком GO: 0001948 • идентичное связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание РНК






Сотовый компонент• параспеклы
• ядерное пятнышко
• мембрана
• ядерный матрикс
• нуклеоплазма
• комплекс регулятора транскрипции РНК-полимеразы II
• ядрышко
• ядро
Биологический процесс• сплайсинг мРНК через сплайсосомы
• рекомбинация ДНК
• регулирование транскрипции, шаблон ДНК
• ритмический процесс
• обработка мРНК
• транскрипция, шаблон ДНК
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• регуляция циркадного ритма
• циркадный ритм
• сплайсинг РНК
• отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути нейрона, вызванного окислительным стрессом
• восстановление ДНК
• активация врожденного иммунного ответа
• процесс иммунной системы
• врожденный иммунный ответ
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4841

53610

Ансамбль

ENSG00000147140

ENSMUSG00000031311

UniProt

Q15233

Q99K48

RefSeq (мРНК)

NM_007363
NM_001145408
NM_001145409
NM_001145410

NM_001252518
NM_023144

RefSeq (белок)

NP_001138880
NP_001138881
NP_001138882
NP_031389

NP_001239447
NP_075633

Расположение (UCSC)Chr X: 71,25 - 71,3 МбChr X: 101,43 - 101,45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Номера ПМ , содержащий домен октамер-связывающий белок (ноно) представляет собой белок , который у человека кодируется NONO гена . [5] [6] [7]

Белок NonO принадлежит к семейству белков поведения дрозофилы / сплайсинга человека (DBHS). [8] Белки семейства DHBS включают SFPQ млекопитающих (фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином; также известный как PSF), NONO (белок, связывающий октамер, не содержащий домена POU; он же p54nrb) и PSPC1 (компонент 1 параспекла; он же PSP1) и беспозвоночных NONA (белок без переходного процесса A) и Hrp65. [9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что NONO взаимодействует с SFPQ , [10] SPI1 [11] и рецептором андрогенов . [12]

Функции [ править ]

NONO участвует во многих ядерных процессах и связывается как с ДНК, так и с РНК . [13]

Как и все белки, семейный белок DBHS описывается как многофункциональный ядерный белок. [14] Было показано, что белок NONO участвует во многих биологических функциях, включая сплайсинг пре-мРНК; активация транскрипции ; прекращение транскрипции; Раскручивание и спаривание ДНК и поддержание правильной работы циркадных часов . [13] [15] [16] [17] [18] [19]

Было установлено, что NONO связывается с белком Rasd1 , в результате чего димер Rasd1 может действовать, модулируя функцию NONO , подавляя экспрессию генов CREB , NR4A1 и Nr4A2 . [20]

NONO связывается с SFPQ с образованием гетеродимера, который взаимодействует с белком MATR3 . [21] Взаимодействие этих трех белков может быть частью процесса в ядре, который отвечает за удержание дефектных, еще недостаточно зрелых для экспорта или предназначенных для удержания в ядре РНК . [21]

Местоположение гена [ править ]

Белок NONO (Human) кодируется геном NONO , который расположен на плюс-цепи Х-хромосомы . [22]

Роль в болезни [ править ]

Меланома [ править ]

НОО были показано, что более сильно выраженно в меланомах клеточных линий и образцах ткани меланомы по сравнению с нормальными клетками человеческой линии и нормальной тканью кожи. [23] Исследования показали, что нокаут белка NONO из клеточных линий меланомы приводит как к снижению скорости пролиферации раковых клеток, так и к значительному снижению потенциальной миграции раковых клеток. [23]

Рак груди [ править ]

Исследования рака груди показали, что потеря или изменение NONO в сочетании с потерей рецептора эстрогена hERα приводит к более агрессивному раку груди, который показывает увеличение как размера опухоли, так и метастазов . [24]

Умственная отсталость, связанная с кардиомиопатией без уплотнения [ править ]

Исследования на людях и мышах показали, что нулевые мутации NONO, вероятно, приводят к развитию клинически распознаваемой умственной отсталости с когнитивным и аффективным дефицитом. [25] Позже было обнаружено, что эти патогенные варианты также были тесно связаны с кардиомиопатией с некомпактностью левого желудочка, а иногда и с аномалией Эбштейна . [26] [27]

Структура [ править ]

Как и другие белки семейства DBHS, белок NONO редко функционирует в одиночку и в основном образует гомо- и гетеродимеры с другими белками DBHS для выполнения своих различных функций. [28] Предполагается, что эти димеры могут иметь разные функции, которые зависят от типа клетки, в которой они находятся. [29]

Предполагается, что это состояние фосфорилирования NONO, которое действует, чтобы управлять белками многих разнородных функций в ядре. [13]

Специфичность ткани [ править ]

NONO находится в ядре большинства клеток млекопитающих и в основном распределяется в нуклеоплазме , а также может быть обнаружен в концентрированном виде в субъядерных доменах, известных как параспеклы . [30]

НОНО также наблюдалась в головном мозге, локализован в цитоплазме из гиппокампа нейронов , которые связаны с транспортными РНК гранул . [31] Он также сильно экспрессируется в сердечной ткани. [27]

Открытие [ править ]

Белок NONO был впервые обнаружен в 1993 году исследователями лаборатории Колд-Спрингс-Харбор . Из-за того, что белок был первоначально идентифицирован как РНК-связывающий белок, он был назван p54nrb, что означает ядерный РНК-связывающий белок, 54 кДа. [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147140 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031311 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Dong B, Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (август 1993). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA / BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. DOI : 10.1093 / NAR / 21.17.4085 . PMC 310009 . PMID 8371983 .  
  6. ^ Traish А.М., Хуанг YH, Ashba Дж, Pronovost М, Павао М, McAneny БД, Морленд РБ (август 1997 г.). «Потеря экспрессии ядерного белка 55 кДа (nmt55) при раке груди человека, отрицательном по рецепторам эстрогена». Диагностическая молекулярная патология . 6 (4): 209–21. DOI : 10.1097 / 00019606-199708000-00005 . PMID 9360842 . 
  7. ^ "Entrez Gene: NONO Non-POU домен, содержащий октамер-связывание" .
  8. ^ a b Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA / BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. DOI : 10.1093 / NAR / 21.17.4085 . PMC 310009 . PMID 8371983 .  
  9. ^ Passon DM, Ли M, Rackham O, Стенли WA, Садовска A, Filipovska A, Fox AH, Бонд CS (март 2012). «Структура гетеродимера человеческого NONO и компонента 1 белка параспеклов и анализ его роли в формировании субядерного тела» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (13): 4846–50. DOI : 10.1073 / pnas.1120792109 . PMC 3324020 . PMID 22416126 .  
  10. ↑ Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стержень в мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. DOI : 10.1017 / S1355838202022070 . PMC 1370341 . PMID 12403470 .  
  11. ^ Халлир M, Тавитян A, Moreau-Gachelin F (май 1996). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–81. DOI : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 . 
  12. ^ Иситани К, Т Yoshida, Китагава Н, Н Охта, Нозав S, S Като (июль 2003 г.). «p54nrb действует как транскрипционный коактиватор для активации функции 1 рецептора андрогенов человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 306 (3): 660–5. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 01021-0 . PMID 12810069 . 
  13. ^ a b c Shav-Tal Y, Zipori D (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb / NonO - многофункциональные ядерные белки» . FEBS Lett . 531 (2): 109–14. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6 . PMID 12417296 . 
  14. ^ Duvignaud JB, Bédard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagné SM, Vincent M (май 2016). «Структура, динамика и взаимодействие p54 (nrb) / NonO RRM1 с 5 'последовательностью РНК сайта сплайсинга». Биохимия . 55 (18): 2553–66. DOI : 10.1021 / acs.biochem.5b01240 . PMID 27064654 . 
  15. ↑ Basu A, Dong B, Krainer AR, Howe CC (февраль 1997 г.). «Проксимальный энхансер-связывающий белок внутрицистернальной А-частицы активирует транскрипцию и идентичен РНК- и ДНК-связывающему белку p54nrb / NonO» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (2): 677–86. DOI : 10.1128 / mcb.17.2.677 . PMC 231793 . PMID 9001221 .  
  16. ^ Danckwardt S, Kaufmann I, Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert А.С., Геринг NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W, Вильма М, Hentze МВт, Kulozik AE (июнь 2007). «Факторы сплайсинга стимулируют полиаденилирование посредством USE по сигналам образования неканонических 3'-концов» . Журнал EMBO . 26 (11): 2658–69. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601699 . PMC 1888663 . PMID 17464285 .  
  17. ^ Халлир M, Lerga A, S Barnache, Тавитян A, Moreau-Gachelin F (февраль 1998). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–42. DOI : 10.1074 / jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 . 
  18. ^ Kameoka S, P Duque, Konarska MM (апрель 2004). «p54 (nrb) ассоциируется с 5'-сайтом сплайсинга в больших комплексах транскрипции / сплайсинга» . Журнал EMBO . 23 (8): 1782–91. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600187 . PMC 394241 . PMID 15057275 .  
  19. ^ Ковальской E, Риппергер JA, HOEGGER DC, Брюггер P, T Buch, Birchler T, Мюллер, Альбрехт U, Contaldo C, Brown SA (январь 2013). «NONO связывает циркадные часы с клеточным циклом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (5): 1592–9. DOI : 10.1073 / pnas.1213317110 . PMC 3562797 . PMID 23267082 .  
  20. Перейти ↑ Ong SA, Tan JJ, Tew WL, Chen KS (01.01.2011). «Rasd1 модулирует коактиваторную функцию NonO в пути циклического АМФ» . PLOS ONE . 6 (9): e24401. DOI : 10.1371 / journal.pone.0024401 . PMC 3168489 . PMID 21915321 .  
  21. ^ а б Чжан З., Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует удержание в ядре РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Cell . 106 (4): 465–75. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4 . PMID 11525732 . 
  22. ^ «NONO - белок, связывающий октамер, не содержащий домена POU - Homo sapiens (человек) - ген и белок NONO» . www.uniprot.org . Проверено 14 октября 2016 .
  23. ^ a b Schiffner S, Zimara N, Schmid R, Bosserhoff AK (август 2011 г.). «p54nrb - новый регулятор прогрессирования злокачественной меланомы» . Канцерогенез . 32 (8): 1176–82. DOI : 10.1093 / carcin / bgr103 . PMID 21642354 . 
  24. ^ Pavao M, Хуан YH, Hafer LJ, Морленд РБ, Traish AM (2001-01-01). «Иммунодетекция изоформ nmt55 / p54nrb при раке груди человека» . BMC Рак . 1 : 15. DOI : 10.1186 / 1471-2407-1-15 . PMC 59838 . PMID 11710964 .  
  25. ^ Mircsof D, Langouët M, Rio M, Moutton S, Siquier-Pernet K, Bole-Feysot C и др. (Декабрь 2015 г.). «Мутации в NONO приводят к синдромальной умственной отсталости и тормозящим синаптическим дефектам» . Природа Неврологии . 18 (12): 1731–6. DOI : 10.1038 / nn.4169 . PMC 5392243 . PMID 26571461 .  
  26. ^ Рейнштейн Е, Цур S, R Коэна, Bormans С, Бехар ДМ (ноябрь 2016). «Умственная отсталость и кардиомиопатия без уплотнения с мутацией de novo NONO, идентифицированной с помощью секвенирования экзома» . Европейский журнал генетики человека . 24 (11): 1635–1638. DOI : 10.1038 / ejhg.2016.72 . PMC 5110068 . PMID 27329731 .  
  27. ^ a b Скотт Д.А., Эрнандес-Гарсия А., Азамиан М.С., Джордан В.К., Ким Б.Дж., Старкович М. и др. (Январь 2017 г.). «Врожденные пороки сердца и отсутствие уплотнения левого желудочка у мужчин с вариантами потери функции в NONO». Журнал медицинской генетики . 54 (1): 47–53. DOI : 10.1136 / jmedgenet-2016-104039 . PMID 27550220 . 
  28. ^ Fox AH, Бонд CS, Lamond AI (ноябрь 2005). «P54nrb образует гетеродимер с PSP1, который локализуется в парапеклах РНК-зависимым образом» . Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5304–15. DOI : 10,1091 / mbc.E05-06-0587 . PMC 1266428 . PMID 16148043 .  
  29. ↑ Knott GJ, Bond CS, Fox AH (май 2016 г.). «Белки DBHS SFPQ, NONO и PSPC1: многоцелевой молекулярный каркас» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (9): 3989–4004. DOI : 10.1093 / NAR / gkw271 . PMC 4872119 . PMID 27084935 .  
  30. ^ Fox AH, Lamond AI (июль 2010). «Параспеклы» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): a000687. DOI : 10.1101 / cshperspect.a000687 . PMC 2890200 . PMID 20573717 .  
  31. ^ Kanai Y, Dohmae N, N Hirokawa (август 2004). «Кинезин транспортирует РНК: выделение и характеристика гранулы, транспортирующей РНК». Нейрон . 43 (4): 513–25. DOI : 10.1016 / j.neuron.2004.07.022 . PMID 15312650 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шав-Тал Й., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54 (nrb) / NonO - многофункциональные ядерные белки» . Письма FEBS . 531 (2): 109–14. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6 . PMID  12417296 .
  • Чжан У.В., Чжан LX, Буш Р.К., Фаррес Дж., Буш Х. (февраль 1993 г.). «Очистка и характеристика ДНК-связывающего гетеродимера 52 и 100 кДа из клеток HeLa» . Биохимический журнал . 290 (Pt 1): 267–72. DOI : 10.1042 / bj2900267 . PMC  1132410 . PMID  8439294 .
  • Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–81. DOI : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID  8626664 .
  • Петерс Ю., Хаберхаузен Г., Костшева М., Нолте Д., Мюллер Ю. (октябрь 1997 г.). «AFX1 и p54nrb: точное картирование, геномная структура и исключение в качестве генов-кандидатов Х-сцепленной дистонии паркинсонизма». Генетика человека . 100 (5–6): 569–72. DOI : 10.1007 / s004390050553 . PMID  9341872 .
  • Кларк Дж, Лу Й.Дж., Сидхар С.К., Паркер С., Гилл С., Смедли Д., Хамуди Р., Лайнхан В.М., Шипли Дж., Купер С.С. (октябрь 1997 г.). «Слияние генов факторов сплайсинга PSF и NonO (p54nrb) с геном TFE3 при папиллярной почечно-клеточной карциноме» . Онкоген . 15 (18): 2233–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201394 . PMID  9393982 .
  • Штрауб Т., Грю П., Усе А., Лисби М., Кнудсен Б. Р., Танге Т. О., Вестергаард О., Боэге Ф. (октябрь 1998 г.). «Фактор сплайсинга РНК PSF / p54 регулирует активность ДНК-топоизомеразы I путем прямого взаимодействия» . Журнал биологической химии . 273 (41): 26261–4. DOI : 10.1074 / jbc.273.41.26261 . PMID  9756848 .
  • Кархумаа П., Парккила С., Вахид А., Парккила А.К., Каунисто К., Такер П.В., Хуанг С.Дж., Слай В.С., Раджаниеми Х. (май 2000 г.). «Ядерный белок NonO / p54 (nrb) представляет собой неклассическую карбоангидразу» . Журнал биологической химии . 275 (21): 16044–9. DOI : 10.1074 / jbc.275.21.16044 . PMID  10821857 .
  • Штрауб Т., Кнудсен Б.Р., Бёге Ф. (июнь 2000 г.). «PSF / p54 (nrb) стимулирует« прыжки »топоизомеразы I ДНК между отдельными спиралями ДНК». Биохимия . 39 (25): 7552–8. DOI : 10.1021 / bi992898e . PMID  10858305 .
  • Матур М., Такер П. У., Сэмюэлс Х. Х. (апрель 2001 г.). «PSF - это новый корепрессор, который опосредует свое действие через Sin3A и ДНК-связывающий домен рецепторов ядерных гормонов» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (7): 2298–311. DOI : 10.1128 / MCB.21.7.2298-2311.2001 . PMC  86864 . PMID  11259580 .
  • Чжан З., Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует удержание в ядре РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Cell . 106 (4): 465–75. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4 . PMID  11525732 .
  • Павао М., Хуанг Ю.Х., Хафер Л.Дж., Морленд РБ, Траиш А.М. (2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55 / p54nrb при раке груди человека» . BMC Рак . 1 : 15. DOI : 10.1186 / 1471-2407-1-15 . PMC  59838 . PMID  11710964 .
  • Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID  11790298 .
  • Канализация М.Б., Нгуен В.К., Хуанг С.Дж., Такер П.В., Кагава Н., Уотерман М.Р. (апрель 2002 г.). «Активация транскрипции человеческого CYP17 в адренокортикальных клетках H295R зависит от образования комплекса между p54 (nrb) / NonO, белком-ассоциированным фактором сплайсинга, и SF-1, комплексом, который также участвует в репрессии транскрипции» . Эндокринология . 143 (4): 1280–90. DOI : 10.1210 / en.143.4.1280 . PMID  11897684 .
  • Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID  12171929 .
  • Эмили А., Шалес М., Маккракен С., Се В., Такер П. У., Кобаяши Р., Бленкоу Б.Дж., Инглес С.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Связанные со сплайсингом и транскрипцией белки PSF и p54nrb / nonO связываются с CTD РНК-полимеразы II» . РНК . 8 (9): 1102–11. DOI : 10.1017 / S1355838202025037 . PMC  1370324 . PMID  12358429 .
  • Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард, округ Колумбия, Томпсон А.Б., Паттон Дж. Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стержень в мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. DOI : 10.1017 / S1355838202022070 . PMC  1370341 . PMID  12403470 .