• биологический процесс • сборка тонких волокон сердечной мышцы • развитие мышечных волокон
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
4892
18175
Ансамбль
ENSG00000197893
ENSMUSG00000049134
UniProt
Q86VF7
Q80XB4
RefSeq (мРНК)
NM_001261463 NM_006175 NM_198060 NM_001322945
NM_001286552 NM_008733 NM_198059
RefSeq (белок)
NP_001248392 NP_001309874 NP_006166 NP_932326
NP_001273481 NP_032759 NP_932307
Расположение (UCSC)
Chr 10: 113.59 - 113.66 Мб
Chr 19: 56.32 - 56.39 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Небулина связанных с анкеровки-белка (NRAP) представляет собой белок , который у человека кодируется NRAP гена . N-RAP представляет собой мышечно-специфическую изоформу, принадлежащую к семейству белков небулина . Это семейство состоит из 5 членов: N-RAP, небулина , nebulette , LASP-1 и LASP-2. N-RAP участвует как в миофибриллярном миогенезе во время развития, так и в межклеточных связях в зрелых мышцах. [5] [6] [7] [8]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 Функция
3 Клиническое значение
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Структура [ править ]
N-RAP представляет собой белок 197 кДа, состоящий из 1730 аминокислот. [9] [10] Как член небулина семейства белков, N-ПДП характеризуется 35 аминокислотных участков «» небулина повторы «», которые являются актин - связывающие домены , содержащие консервативную S Dxx Y K мотив. [11] Подобно небулину , группы из семи одиночных повторов в N-RAP образуют «суперповторы», которые включают единственный консервативный мотив W L K G I G W в конце третьего повтора. [12] Уникальной особенностью NRAP по сравнению с небулином является его N-концевой цистеин, богатыйLIM , общая функция с LASP-1 и LASP-2. [8]
Функция [ править ]
N-RAP играет важную роль в организации миофибрилл во время развития кардиомиоцитов. Ясно, что NRAP имеет решающее значение для нормальной α-актинин-зависимой организации миофибрилл в кардиомиоцитах, так как нокдаун уровней белка N-RAP вызывает разборку миофбрилл в эмбриональных кардиомиоцитах. [13] В частности, исследования показывают, что суперповторы NRAP могут быть важным каркасом для организации альфа-актинина и актина в саркомерные комплексы I-ZI в премиофибриллах [14], а исследования динамической визуализации показали, что N-RAP отходит от комплексов IZI. после завершения сборки тонких нитей актина. [15]Во взрослой сердечной мышце, N-RAP локализуется на вставочные диски , [16] , где она функционирует на якорь терминал актин нитей к сарколемме . Было высказано предположение, что его роль во взрослых мышцах заключается в передаче силы от саркомера во внеклеточный матрикс. [17]
Клиническое значение [ править ]
Хотя не существует известной прямой связи между мутациями N-RAP и кардиомиопатиями человека, было показано, что активность N-RAP значительно повышается в моделях дилатационной кардиомиопатии на мышах . [18] [19] Было высказано предположение, что это адаптивный ответ для коррекции неорганизованной архитектуры тонких нитей актина на интеркалированных дисковых соединениях в кардиомиоцитах во время дилатационной кардиомиопатии .
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000197893 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049134 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Mohiddin SA, Lu S, Кардосо JP, Carroll S, Джа S, Horowits R, Fananapazir L (июль 2003). «Геномная организация, альтернативный сплайсинг и экспрессия человеческого и мышиного N-RAP, небулинового белка LIM поперечно-полосатой мышцы». Подвижность клеток и цитоскелет . 55 (3): 200–12. DOI : 10.1002 / cm.10123 . PMID 12789664 .
^ Ли G, Herrera AH, Horowits R (май 1999). «Молекулярные взаимодействия N-RAP, связанного с небулином белка поперечно-полосатых мышечных соединений мышечных сухожилий и интеркалированных дисков». Биохимия . 38 (19): 6135–43. DOI : 10.1021 / bi982395t . PMID 10320340 .
^ «Entrez Gene: NRAP-связанный с небулином якорной белок» .
^ a b Папас К.Т., Блисс К.Т., Зисенисс А., Грегорио С.К. (январь 2011 г.). «Семья Небулина: группа поддержки актина» . Тенденции в клеточной биологии . 21 (1): 29–37. DOI : 10.1016 / j.tcb.2010.09.005 . PMC 3014390 . PMID 20951588 .
^ Labeit S, Гибсон Т, Лейки А, Леонард К, Zeviani М, Р Knight, Wardale J, J Trinick (май 1991 г.). «Доказательства того, что небулин является белком-правителем в тонких мышечных волокнах» . Письма FEBS . 282 (2): 313–6. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80503-u . PMID 2037050 .
^ Labeit S, Kolmerer B (апрель 1995 г.). «Полная первичная структура человеческого небулина и ее соотношение со структурой мышц». Журнал молекулярной биологии . 248 (2): 308–15. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (95) 80052-2 . PMID 7739042 .
^ Dhume A, Lu S, Horowits R (август 2006). «Целенаправленное нарушение функции гена N-RAP посредством РНК-интерференции: роль N-RAP в организации миофибрилл». Подвижность клеток и цитоскелет . 63 (8): 493–511. DOI : 10.1002 / cm.20141 . PMID 16767749 .
^ Carroll S, Lu S, Herrera AH, Horowits R (январь 2004). «Сборка каркасов N-RAP IZI во время миофибриллогенеза в культивируемых кардиомиоцитах цыплят» . Журнал клеточной науки . 117 (Pt 1): 105–14. DOI : 10,1242 / jcs.00847 . PMID 14657273 .
^ Manisastry С.М., Zaal KJ, Horowits R (июль 2009). «Сборка миофибрилл визуализируется путем визуализации N-RAP, альфа-актинина и актина в живых кардиомиоцитах» . Экспериментальные исследования клеток . 315 (12): 2126–39. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2009.02.006 . PMC 2742992 . PMID 19233165 .
^ Lu S, Borst DE, Horowits R (май 2005). «Экспрессия N-RAP во время развития сердца мыши» . Динамика развития . 233 (1): 201–12. DOI : 10.1002 / dvdy.20314 . PMID 15765519 . S2CID 22925166 .
^ Ло G, Чжан JQ, Нгуен Т. П., Herrera АГ, Патерсон В, Horowits R (1997). «Полная последовательность кДНК и тканевая локализация N-RAP, нового небулинового белка поперечно-полосатой мышцы». Подвижность клеток и цитоскелет . 38 (1): 75–90. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0169 (1997) 38: 1 <75 :: AID-CM7> 3.0.CO; 2-G . PMID 9295142 .
^ Сассмен MA, Welch S, Камбон N, Klevitsky R, Hewett TE, Цена R, Witt SA, Кимбалл TR (январь 1998). «Дегенерация миофибрилл, вызванная сверхэкспрессией тропомодулина, приводит к дилатационной кардиомиопатии у молодых мышей» . Журнал клинических исследований . 101 (1): 51–61. DOI : 10.1172 / JCI1167 . PMC 508539 . PMID 9421465 .
^ Ehler Е, Horowits Р, С Zuppinger, Цена RL, Perriard Е, Лей М, Caroni Р, Сассмен М, Eppenberger НМ, Perriard JC (май 2001 г.). «Изменения на вставочном диске, связанные с отсутствием мышечного белка LIM» . Журнал клеточной биологии . 153 (4): 763–72. DOI : 10.1083 / jcb.153.4.763 . PMC 2192386 . PMID 11352937 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D, Toppo S, Trevisan S, Scarso S, Valle G (январь 1996 г.). «Идентификация 4370 экспрессируемых тегов последовательности из библиотеки кДНК, специфичной для 3'-конца скелетных мышц человека, путем секвенирования ДНК и гибридизации с фильтром» . Геномные исследования . 6 (1): 35–42. DOI : 10.1101 / gr.6.1.35 . PMID 8681137 .
Луо Дж., Чжан Дж. К., Нгуен Т. П., Эррера А. Х., Патерсон Б., Хоровиц Р. (1997). «Полная последовательность кДНК и тканевая локализация N-RAP, нового небулинового белка поперечно-полосатой мышцы». Подвижность клеток и цитоскелет . 38 (1): 75–90. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0169 (1997) 38: 1 <75 :: AID-CM7> 3.0.CO; 2-G . PMID 9295142 .
Луо Г., Лерой Е., Козак К.А., Полимеропулос М.Х., Хоровиц Р. (октябрь 1997 г.). «Картирование гена (NRAP), кодирующего N-RAP, в геномах мыши и человека» . Геномика . 45 (1): 229–32. DOI : 10.1006 / geno.1997.4917 . PMID 9339382 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Witt SH, Granzier H, Witt CC, Labeit S (июль 2005 г.). «MURF-1 и MURF-2 нацелены на определенную подгруппу миофибриллярных белков с избыточностью: к пониманию MURF-зависимого убиквитинирования мышц». Журнал молекулярной биологии . 350 (4): 713–22. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.05.021 . PMID 15967462 .
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виман С. (январь 2006 г.) «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Выпуск базы данных): D415–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
↑ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss Дж., Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний» . Циркуляционные исследования . 113 (9): 1043–1053. DOI : 10,1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .
