Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP107 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP107
Белок NUP107 PDB 3CQC.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3CQC , 3CQG , 3I4R , 5A9Q

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP107 , NUP84, NPHS11, нуклеопорин 107 кДа, нуклеопорин 107, ODG6, ODG6; GAMOS7
Внешние идентификаторыOMIM : 607617 MGI : 2143854 HomoloGene : 5555 GeneCards : Nup107
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение NUP107
Геномное расположение NUP107
Группа12q15Начинать68 686 951 п.н. [1]
Конец68 745 809 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение NUP107
Геномное расположение NUP107
Группа10 | 10 D2Начинать117 750 621 п.н. [2]
Конец117 792 705 б.п. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP107 218768 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0005487 структурный компонент ядерной поры
• связывание белка GO: 0001948
Сотовый компонент• конденсированная кинетохора хромосомы
• цитозоль
• центросома
• не мембрана
• ядерная периферия
• мембрана
• ядерная оболочка
• ядерная пора
• нуклеоплазма
• хромосома
• внешнее кольцо ядерной поры
• хромосома, центромерная область
• ядро клетки
• кинетохора
• клетка-хозяин
Биологический процесс• транспорт мРНК
• сборка комплекса ядерных пор
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• импорт белка в ядро
• вирусная транскрипция
• сумоилирование белка
• разборка митотической ядерной оболочки
• регуляция клеточного ответа на тепло
• транспорт белка
• посттранскрипционное связывание гена РНК-полимеразы II ДНК на периферии ядра
• GO: 0022415 вирусный процесс
• экспорт тРНК из ядра
• сцепление сестринских хроматид
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• Экспорт мРНК из ядра
• развитие женских гонад
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• регуляция гликолитического процесса
• транспорт
• развитие нефронов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

57122

103468

Ансамбль

ENSG00000111581

ENSMUSG00000052798

UniProt

P57740

Q8BH74

RefSeq (мРНК)

NM_020401
NM_001330192

NM_134010

RefSeq (белок)

NP_001317121
NP_065134

NP_598771

Расположение (UCSC)Chr 12: 68.69 - 68.75 МбChr 10: 117.75 - 117.79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 107 ( Nup107 ) представляет собой белок , который у человека кодируется Nup107 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член семейства нуклеопоринов. Белок локализован на краю ядра и является важным компонентом комплекса ядерных пор (NPC). Все молекулы, входящие в ядро ​​или покидающие его, либо диффундируют через NPC, либо активно транспортируются им. Альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга этого гена наблюдались, но не были полностью охарактеризованы. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что NUP107 взаимодействует с NUP133 . [8] [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111581 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052798 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Boehmer Т, Enninga Дж, Дэйлс S, Блобель G, Н Чжун (февраль 2003 г.). «Истощение одного нуклеопорина, Nup107, предотвращает сборку подмножества нуклеопоринов в комплекс ядерных пор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (3): 981–5. DOI : 10.1073 / pnas.252749899 . PMC 298712 . PMID 12552102 .  
  6. ^ Walther ТС, Алвес А, Пикерсгиль Н, Loïodice я, Хецер М, Galy В, Хюльсманне ВВ, Кохер Т, Вильма М, Аллен Т, Mattaj ИВ, Doye V (апрель 2003 г.). «Консервированный комплекс Nup107-160 имеет решающее значение для сборки ядерного комплекса пор». Cell . 113 (2): 195–206. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00235-6 . PMID 12705868 . S2CID 16449133 .  
  7. ^ а б «Ген Энтреза: NUP107 нуклеопорин 107 кДа» .
  8. ^ Loïodice я, Алвес А, Rabut G, Ван Overbeek М, Элленберга Дж, Sibarita JB, Doye В (июль 2004). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10,1091 / mbc.E03-12-0878 . PMC 452587 . PMID 15146057 .  
  9. ^ Belgareh N, Rabut G, Bai SW, ван Овербек М, Beaudouin Дж, Дайгле Н, Зацепина О. В., Pasteau Р, Лабас В, Фромон-Расин М, Элленберга Дж, Doye В (сентябрь 2001). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется на кинетохоры в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 154 (6): 1147–60. DOI : 10.1083 / jcb.200101081 . PMC 2150808 . PMID 11564755 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, который связан с CAN / Nup214 на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 137 (5): 989–1000. DOI : 10,1083 / jcb.137.5.989 . PMC  2136229 . PMID  9166401 .
  • Бельгаре Н., Рабут Г., Бай С.В., ван Овербек М., Бодуэн Дж., Дайгл Н., Зацепина О.В., Пасто Ф., Лабас В., Фромонт-Расин М., Элленберг Дж., Дой В. (сентябрь 2001 г.). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется на кинетохоры в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 154 (6): 1147–60. DOI : 10.1083 / jcb.200101081 . PMC  2150808 . PMID  11564755 .
  • Васу С., Шах С., Орджало А., Парк М., Фишер WH, Forbes DJ (октябрь 2001 г.). «Новые нуклеопорины позвоночных Nup133 и Nup160 играют роль в экспорте мРНК» . Журнал клеточной биологии . 155 (3): 339–54. DOI : 10.1083 / jcb.200108007 . PMC  2150853 . PMID  11684705 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес МБ, Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С. P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS,Кшивинский М.И., Скальска Ю., Смаилус Д.Е., Шнерч А., Шейн Дж. Э., Джонс С.Дж., Марра М.А. (декабрь 2002 г.).«Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Walther TC, Askjaer P, Gentzel M, Habermann A, Griffiths G, Wilm M, Mattaj IW, Hetzer M (август 2003 г.). «RanGTP обеспечивает сборку ядерных поровых комплексов». Природа . 424 (6949): 689–94. DOI : 10,1038 / природа01898 . PMID  12894213 . S2CID  4423987 .
  • Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10,1091 / mbc.E03-12-0878 . PMC  452587 . PMID  15146057 .
  • Krull S, Thyberg J, Björkroth B, Rackwitz HR, Cordes VC (сентябрь 2004 г.). «Нуклеопорины как компоненты структуры ядра ядерной поры и Tpr как архитектурный элемент ядерной корзины» . Молекулярная биология клетки . 15 (9): 4261–77. DOI : 10,1091 / mbc.E04-03-0165 . PMC  515357 . PMID  15229283 .
  • Berke IC, Boehmer T, Blobel G, Schwartz TU (ноябрь 2004 г.). «Структурный и функциональный анализ доменов Nup133 выявляет модульные строительные блоки комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 167 (4): 591–7. DOI : 10.1083 / jcb.200408109 . PMC  2172596 . PMID  15557116 .
  • Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (14): 5391–6. DOI : 10.1073 / pnas.0507066103 . PMC  1459365 . PMID  16565220 .
  • Орджало А.В., Арнаутов А., Шен З., Боярчук Ю., Зейтлин С. Г., Фонтура Б., Бриггс С., Дассо М., Forbes DJ (сентябрь 2006 г.). «Нуклеопориновый комплекс Nup107-160 необходим для правильной сборки биполярного веретена» . Молекулярная биология клетки . 17 (9): 3806–18. DOI : 10,1091 / mbc.E05-11-1061 . PMC  1593160 . PMID  16807356 .
  • Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / NBT1240 . PMID  16964243 . S2CID  14294292 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Главы Дж. С., Крутчинский А. Н., Кристя И. М., Берке И. К., Бёмер Т., Блобель Г., Чайт Б.Т. (март 2007 г.) «Зависимое от клеточного цикла фосфорилирование субкомплекса ядерных пор Nup107-160» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (10): 3811–6. DOI : 10.1073 / pnas.0700058104 . PMC  1820666 . PMID  17360435 .
  • Zuccolo M, Alves A, Galy V, Bolhy S, Formstecher E, Racine V, Sibarita JB, Fukagawa T., Shiekhattar R, Yen T, Doye V (апрель 2007 г.). «Субкомплекс ядерных пор человека Nup107-160 способствует правильным функциям кинетохор» . Журнал EMBO . 26 (7): 1853–64. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601642 . PMC  1847668 . PMID  17363900 .
  • Бёмер Т., Шварц Т.У. (сентябрь 2007 г.). «Очистка, кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ гетеродимерного нуклеопоринового комплекса Nup107-Nup133» . Acta Crystallographica Раздел F . 63 (Pt 9): 816–8. DOI : 10.1107 / S1744309107040523 . PMC  2376328 . PMID  17768364 .


  • v
  • т
  • е