Натрономонады

В систематике , Natronomonas является родом из Halobacteriaceae . ^[1]

Описание и значение [ править ]

Natronomonas pharaonis - аэробный , чрезвычайно галогеналкалифильный архей, который оптимально растет в 3,5 М хлориде натрия и при pH 8,5, но чувствителен к высоким концентрациям магния .

Структура генома [ править ]

Геном из Natronomonas pharaonis состоит из трех кольцевых репликонов, в хромосоме , которая является 2595221 п.н., типичным haloarchaeal плазмидой 131 т.п.н., и уникальной Мультикопийные плазмида 23-кб. Его хромосома имеет высокое содержание G + C (63,4%). Также высокая доля кислых аминокислот (в среднем 19,3%) содержится в белках N. pharaonis.что приводит к низким изоэлектрическим точкам (средний pI 4,6). Это считается одной из адаптивных особенностей галоархей, которые, как известно, применяют стратегию солености (высокие внутренние концентрации соли), чтобы выжить в своей гиперсоленой среде (Falb et al.). Кроме того, примечательно, что, поскольку у архея отсутствует генетическое кодирование ключевых ферментов гликолитических путей, он не способен к утилизации сахара.

Строение клетки и метаболизм [ править ]

Natronomonas , как и другие представители Halobacteriaceae, обладают отчетливыми физиологическими характеристиками, поскольку для роста им требуются не только высокие концентрации NaCl, но также высокие значения pH и низкие концентрации Mg2 +. Обычно в качестве источника углерода используются аминокислоты, но серия исследований показала, что археи обладают высокой степенью самообеспеченности питательными веществами. Кроме того, в отличие от других алкалифилов, которые используют натрий Na + вместо протонов H + в качестве связующего иона между дыхательной цепью и АТФ-синтазой, Natronomonas использует протоны в качестве связующего иона.

Археи растут в сильно щелочных условиях с pH около 11, что приводит к снижению уровня аммиака в дополнение к низкой доступности ионов металлов. Анализ генома показывает, что в процессе метаболизма азота у архея есть три механизма, которые поставляют аммиак, который затем ассимилируется в глутамат: прямое поглощение аммиака, поглощение нитрата и последующее восстановление до аммиака и поглощение мочевины, которая расщепляется уреаза для выделения аммиака. Зеленые стрелки на рисунке представляют собой переносчики экзогенного источника азота аммиака ( AmtB ), нитрата (NarK) и мочевины (UrtA-E), а синие стрелки представляют собой ферменты для восстановления нитрата (NarB + Nir A) и гидролиза. мочевины (UreA-G). Другие сокращения: GlnA + GltB = глутамат; 2-OG = оксоглутарат; fdx = ферредоксин.

Вероятно, что Natronomonas использует ферредоксин, а не НАДН в качестве донора электронов для всех трех восстановительных превращений. Это очевидно из наличия консервативных ферредоксин-связывающих остатков в белке NirA N. pharaonis и ферредоксиновой зависимости нитрат- и нитритредуктаз у галофильных Haloferax mediterranei .

Экология [ править ]

Штаммы N. pharaonis были впервые выделены из сильно соленых содовых озер в Египте и Кении, которые показывают значения pH около 11.

Ссылки [ править ]

Дальнейшее чтение [ править ]

Научные журналы [ править ]

• Орен А; Ventosa A (2000). «Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия» . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. DOI : 10.1099 / 00207713-50-3-1405 . PMID  10843089 .
• Камекура М; Дьялл-Смит М.Л.; Упасани V; Ventosa A; и другие. (1997). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natron. pharaonis comb. nov., соответственно " . Int. J. Syst. Бактериол . 47 (3): 853–857. DOI : 10.1099 / 00207713-47-3-853 . PMID  9226918 .
• Натараджан, Джанани; Шульц, Анита; Курц, Урсула; Шульц, Иоахим Э. (2014). «Биохимическая характеристика тандемного домена HAMP из Natronomonas pharaonis в качестве преобразователя внутрибелкового сигнала» . Журнал FEBS . 281 (14): 3218–3227. DOI : 10.1111 / febs.12855 . PMID  24863503 .

Научные книги [ править ]

• Гиббонс, NE (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae fam. Nov.». В RE Бьюкенен; NE Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминантной бактериологии (8-е изд.). Балтимор: ISBN компании Williams & Wilkins Co. 978-0-683-01117-3.

Научные базы данных [ править ]

• Ссылки PubMed по Natronomonas
• Ссылки PubMed Central для Natronomonas
• Ссылки Google Scholar для Natronomonas

Внешние ссылки [ править ]

• Страница таксономии NCBI для Natronomonas
• Поиск по страницам таксономии "Древо жизни" для Natronomonas
• Поиск видов на 2000 страниц для Natronomonas
• Страница MicrobeWiki для Natronomonas
• Страница LPSN для Natronomonas
• Типовой штамм Natronomonas pharaonis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию