• Связывание с ионами кальция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание Notch • Активность ингибитора фермента GO: 0048551 • Связывание ионов металлов • связывание ферментов • Связывание с хроматином • GO: 0001948 связывание с белками • последовательное связывание ДНК • активность гетеродимеризации белков • связывание хроматина с ДНК • активность трансмембранного сигнального рецептора • активность сигнального рецептора • GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент
• цитоплазма • цитозоль • мембрана • соединение адгезивов • внеклеточная область • ядро клетки • поверхность клетки • апикальная плазматическая мембрана • эндоплазматический ретикулум • интегральный компонент мембраны • аппарат Гольджи • рецепторный комплекс • клеточная мембрана • нуклеоплазма • комплекс MAML1-RBP-Jkapp-ICN1 • периферия клетки • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана Гольджи • акросома • цитоплазматический пузырек
Биологический процесс
• развитие гладкомышечных клеток сердечных сосудов • развитие энтодермы • морфогенез клапана легочной артерии • позитивная регуляция дифференцировки эндотелиальных клеток • регуляция сомитогенеза • дифференцировка клеток в спинном мозге • негативная регуляция дифференцировки нейронов • регуляция сборки внеклеточного матрикса • развитие дистальных канальцев • отрицательная регуляция пролиферации глиальных клеток • переход эпителия в мезенхиму, участвующий в формировании эндокардиальной подушки • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез аортального клапана • дифференцировка олигодендроцитов • морфогенез эндокарда • негативная регуляция дифференцировки остеобластов • негативная регуляция дифференцировки стволовых клеток • негативная регуляция оссификации • образование петель сердца • негативная регуляция дифференцировки фоторецепторных клеток • дифференцировка артериальных эндотелиальных клеток • регуляция транскрипции РНК-полимеразы II промотор, участвующий в дифференцировке клеток-предшественников миокарда • морфогенез атриовентрикулярного клапана • Сигнальный путь Notch, участвующий в регуляции пролиферации кардиобластов вторичного поля сердца • гуморальный иммунный ответ • морфогенез передней кишки • негативная регуляция дифференцировки олигодендроцитов • позитивная регуляция пролиферации клеток сердечной мышцы • регуляция процесса развития • развитие мезенхимных клеток • регенерация органов животных • ангиогенез • сперматогенез • негативная регуляция дифференцировки про-В-клеток • регуляция пролиферации кардиобластов • морфогенез волосяных фолликулов • васкулогенез, участвующий в морфогенезе коронарных сосудов • негативная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • регуляция нейрогенеза • негативная регуляция пролиферации клеток • развитие собирательного протока • позитивная регуляция пролиферации нейробластов • морфогенез ресничек • морфогенез сердечных трабекул • развитие атриовентрикулярных узлов • негативная регуляция миобентрикулярных узлов дифференцировка • обязательство клеточной судьбы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул фолликулостимулирующего гормона • развитие легких • негативная регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • морфогенез сердечной перегородки • морфогенез межжелудочковой перегородки • негативная регуляция дифференцировки клеток • морфогенез коронарной артерии • ответ на мурамилдипептид • морфогенез сердечного левого желудочка • внутриутробное развитие эмбриона • негативная регуляция гибели клеток • дифференцировка эндокардиальных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие сердца • предстательной железы эпителий морфогенез • эмбриональных конечностей морфогенез • рост участвует в сердечной морфогенеза • развитие нервной трубки • перикарда морфогенез • Эпидермис развитие • сердечного предсердия морфогенез • инициации транскрипции от РНК - полимеразы II промотора • кардиальной правого предсердия морфогенеза • негативной регуляции клеточного субстрата адгезии • миграция клеток, участвующих в формировании эндокардиальной подушки • дифференцировка клеток • дифференцировка венозных эндотелиальных клеток • регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • GO: 0048553 негативная регуляция каталитической активности • воспалительный ответ на антигенный стимул • позитивная регуляция дифференцировки астроцитов • позитивная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • формирование правого желудочка сердца • развитие эндокардиальной подушки • определение судьбы клеток • позитивная регуляция дифференцировки кератиноцитов • позитивная регуляция дифференцировки глиальных клеток • негативная регуляция нейрогенеза • развитие мезангиальных клеток клубочков • прорастание кровеносных сосудов • глиальной дифференцировки клеток • негативной регуляции транскрипции с РНК - полимеразы II , промотор • пролиферации сердечной мышцы клетки • секреторной columnal Luminar дифференцировки эпителиальных клеток участвует в простаты развития железистой ацинуса • положительное регулирование эпителиальные к мезенхимальных перехода • желудочковые трабекулы миокарда морфогенез • нейрональные стволовые поддержание популяции клеток • отрицательное регулирование миграции клеток , участвующей в всходах ангиогенез • ответа на липополисахарид • спецификацию шаблона отсека • иммунный ответ • дифференцировка нейронов • эпителиально-мезенхимальный переход • позитивная регуляция сигнального пути BMP • дифференцировка клеток скелетных мышц • регуляция экспрессии генов • позитивная регуляция репликации вирусного генома • регуляция пролиферации эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы • негативная регуляция транскрипции , ДНК-шаблон • морфогенез сердечного желудочка • морфогенез ветвления эпителиальной трубки • позитивная регуляция каскада JAK-STAT • негативная регуляция аноикиса • Notch сигнализации , участвующие в развитии сердца • ишемическая вены морфогенез • апоптический процесс вовлекается в эмбриональном значном морфогенезе • регулирование миграции клеток • axonogenesis • регенерация тканей • положительное регулирование миграции клеток • соматическое деление стволовых клеток • сердечного морфогенез мышечной ткани • негативная регуляция эндотелиальной клетки хемотаксис • дифференцировка кератиноцитов • негативная регуляция сигнального пути BMP • морфогенез эндокардиальной подушки • развитие эндокарда • развитие многоклеточного организма • обязательство судьбы слуховых рецепторов клетки • ответ на кортикостероид • образование трубки • определение симметрии слева / справа • дифференцировка астроцитов • негативная регуляция кальциевого ион-зависимого экзоцитоза • развитие мозга • регуляция пролиферации клеток • позитивная регуляция пролиферации клеток • отрицательная регуляция дифференцировки миотрубок • позитивная регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • формирование митрального клапана • развитие печени • формирование сердечной камеры • развитие переднего мозга • клеточный ответ на стимул сосудистого эндотелиального фактора роста • обязательство судьбы нейрона • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • регуляция сигнального пути Notch • спецификация левой / правой оси • положительная регуляция транскрипции из Промотор РНК-полимеразы II • переход от сердечного эпителия к мезенхиме • эмбриональный морфогенез задних конечностей • позитивная регуляция морфогенеза аорты • морфогенез венозных кровеносных сосудов • остановка клеточного цикла • сигнальный путь Notch • негативная регуляция экспрессии генов • негативная регуляция скорости роста • позитивная регуляция передачи сигнала белка Ras • позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • позитивная регуляция транскрипции рецептора Notch-мишени • положительное регулирование пути Notch Signaling • оттока тракт морфогенез • коронарный синус клапан морфогенез • негативная регуляция пролиферации клеток , участвующей в сердце клапана морфогенезе • отрицательная регуляция секреции составляющих внеклеточного матрикса • негативная регуляция гипертрофии сердечной мышцы • позитивная регуляция экспрессии генов • гомеостаз количества клеток в ткани • негативная регуляция развития биоминеральной ткани • позитивная регуляция процесса апоптоза, участвующего в морфогенезе • позитивная регуляция сердечной деятельности переход эпителия в мезенхиму • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
4851
18128
Ансамбль
ENSG00000148400
ENSMUSG00000026923
UniProt
P46531
Q01705
RefSeq (мРНК)
NM_017617
NM_008714
RefSeq (белок)
NP_060087
NP_032740
Расположение (UCSC)
Chr 9: 136,49 - 136,55 Мб
Chr 2: 26,46 - 26,52 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Гомолог 1 Notch, связанный с транслокацией ( Drosophila ), также известный как NOTCH1 , представляет собой ген человека , кодирующий однопроходный трансмембранный рецептор .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует члена семейства Notch . Члены этого семейства трансмембранных белков типа 1 имеют общие структурные характеристики, включая внеклеточный домен, состоящий из множества повторов, подобных эпидермальному фактору роста (EGF), и внутриклеточный домен, состоящий из множества разных типов доменов. Члены семейства Notch играют роль во множестве процессов развития, контролируя решения о судьбе клеток. Сеть передачи сигналов Notch представляет собой эволюционно консервативный межклеточный путь передачи сигналов, который регулирует взаимодействия между физически соседними клетками. У дрозофилы, notch взаимодействие с его связанными с клеткой лигандами (дельта, пильчатый) устанавливает межклеточный сигнальный путь, который играет ключевую роль в развитии. Гомологи notch-лигандов также были идентифицированы у людей, но точные взаимодействия между этими лигандами и человеческими гомологами notch еще предстоит определить. Этот белок расщепляется в сети транс-Гольджи и представлен на поверхности клетки в виде гетеродимера. Этот белок функционирует как рецептор для мембраносвязанных лигандов и может играть несколько ролей во время развития. [5]
Дефицит может быть связан с двустворчатым аортальным клапаном . [6]
Есть данные, что активированные Notch 1 и Notch 3 способствуют дифференцировке клеток-предшественников в астроглию . [7] Notch 1, когда активируется до рождения, индуцирует дифференцировку радиальной глии [8], но постнатально индуцирует дифференцировку в астроциты . [9] Одно исследование показывает, что каскад Notch-1 активируется Reelin неустановленным образом. [10] Reelin и Notch1 сотрудничают в развитии зубчатой извилины , согласно др. [11]
Взаимодействия [ править ]
NOTCH1 взаимодействует с:
GSK3B , [12]
Lck , [13]
MAML1 , [14] [15]
Матери против декапентаплегического гомолога 3 [16]
NFKB1 , [17] [18]
НОЯБРЬ , [19]
RBPJ , [20] [21]
SNW1 , [22] [23]
Убиквитин С , [24] и
ГГ1 . [25]
USP10 . [26]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000148400 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026923 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Gaiano N, Най JS, Fishell G (май 2000). «Радиальная глиальная идентичность обеспечивается передачей сигналов Notch1 в переднем мозге мышей». Нейрон . 26 (2): 395–404. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 81172-1 . PMID 10839358 . S2CID 15861936 .
↑ Chambers CB, Peng Y, Nguyen H, Gaiano N, Fishell G, Nye JS (март 2001 г.). «Пространственно-временная селективность ответа на сигналы Notch1 в предшественниках переднего мозга млекопитающих» . Развитие . 128 (5): 689–702. PMID 11171394 .
^ Keilani S, Sugaya K (июль 2008). «Рилин индуцирует фенотип радиальной глии в клетках-предшественниках нейронов человека посредством активации Notch-1» . BMC Dev. Биол. 8 (1): 69. DOI : 10,1186 / 1471-213X-8-69 . PMC 2447831 . PMID 18593473 .
^ Sibbe М, Фёрстера Е, Басак О, Тейлор В, Frotscher М (июль 2009 г.). «Reelin и Notch1 сотрудничают в развитии зубчатой извилины» . J. Neurosci. 29 (26): 8578–85. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.0958-09.2009 . PMC 6665659 . PMID 19571148 .
Перейти ↑ Sade H, Krishna S, Sarin A (январь 2004 г.). «Антиапоптотический эффект Notch-1 требует p56lck-зависимой, Akt / PKB-опосредованной передачи сигналов в Т-клетках» . J. Biol. Chem . 279 (4): 2937–44. DOI : 10.1074 / jbc.M309924200 . PMID 14583609 . S2CID 42454311 .
^ Wu L, Aster JC, Blacklow SC, озеро R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (декабрь 2000). «MAML1, человеческий гомолог главного разума дрозофилы, является коактиватором транскрипции для рецепторов NOTCH». Nat. Genet . 26 (4): 484–9. DOI : 10.1038 / 82644 . PMID 11101851 . S2CID 23335042 .
↑ Wu L, Sun T, Kobayashi K, Gao P, Griffin JD (ноябрь 2002 г.). «Идентификация семейства основных транскрипционных коактиваторов для рецепторов notch млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 22 (21): 7688–700. DOI : 10.1128 / mcb.22.21.7688-7700.2002 . PMC 135662 . PMID 12370315 .
^ Blokzijl A, Dahlqvist C, Reissmann E, Фальк, Молинер A, Lendahl U, Ибаньес CF (ноябрь 2003). «Перекрестное взаимодействие между сигнальными путями Notch и TGF-beta, опосредованное взаимодействием внутриклеточного домена Notch с Smad3» . J. Cell Biol . 163 (4): 723–8. DOI : 10,1083 / jcb.200305112 . PMC 2173673 . PMID 14638857 .
^ Гуань Е, Ван - J, J Laborda, Норкросс М, Baeuerle ПА, Хоффман Т (май 1996 г.). «Связанный с Т-клеточным лейкозом человеческий Notch / гомолог Notch, связанный с транслокацией, обладает I-каппа-B-подобной активностью и физически взаимодействует с белками ядерного фактора-каппа-B в Т-клетках» . J. Exp. Med . 183 (5): 2025–32. DOI : 10,1084 / jem.183.5.2025 . PMC 2192574 . PMID 8642313 .
Перейти ↑ Wang J, Shelly L, Miele L, Boykins R, Norcross MA, Guan E (июль 2001 г.). «Человеческий Notch-1 ингибирует активность NF-каппа B в ядре посредством прямого взаимодействия с участием нового домена» . J. Immunol . 167 (1): 289–95. DOI : 10.4049 / jimmunol.167.1.289 . PMID 11418662 . S2CID 22399328 .
^ Сакамото K, S Yamaguchi, Ando R, Мияваки A, Kabasawa Y, Такаги M, Li CL, Perbal B, Katsube K (август 2002). «Белок сверхэкспрессированного гена нефробластомы (NOV / ccn3) связывается с внеклеточным доменом Notch1 и ингибирует дифференцировку миобластов через сигнальный путь Notch» . J. Biol. Chem . 277 (33): 29399–405. DOI : 10.1074 / jbc.M203727200 . PMID 12050162 . S2CID 26465428 .
^ Nam Y, Вэн AP, Aster JC, Blacklow SC (июнь 2003). «Структурные требования для сборки CSL.intracellular Notch1.Mastermind-like 1 комплекса транскрипционной активации» . J. Biol. Chem . 278 (23): 21232–9. DOI : 10.1074 / jbc.M301567200 . PMID 12644465 . S2CID 13637961 .
^ Астры JC, Робертсон Е.С., Hasserjian РП, Тернер JR, КлеГГ Е, Склар J (апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные либо первичного сайта связывания для RBP-Jkappa, либо последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию» . J. Biol. Chem . 272 (17): 11336–43. DOI : 10.1074 / jbc.272.17.11336 . PMID 9111040 . S2CID 36236215 .
^ Beatus Р, Лундквист Дж, Оберг С, Педерсен К, Lendahl U (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Мех. Dev . 104 (1-2): 3-20. DOI : 10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2 . PMID 11404076 . S2CID 9526831 .
^ Чжоу S, M Fujimuro, Се JJ, Chen L, Миямото A, Weinmaster G, Hayward SD (апрель 2000). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкириновых повторов NotchIC для облегчения функции NotchIC» . Мол. Клетка. Биол . 20 (7): 2400–10. DOI : 10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000 . PMC 85419 . PMID 10713164 .
^ Chastagner P, Israël A, C Бру (2008). «AIP4 / Itch регулирует деградацию рецептора Notch в отсутствие лиганда» . PLOS ONE . 3 (7): e2735. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2735C . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002735 . PMC 2444042 . PMID 18628966 .
↑ Yeh TS, Lin YM, Hsieh RH, Tseng MJ (октябрь 2003 г.). «Ассоциация фактора транскрипции YY1 с высокомолекулярным комплексом Notch подавляет трансактивационную активность Notch» . J. Biol. Chem . 278 (43): 41963–9. DOI : 10.1074 / jbc.M304353200 . PMID 12913000 . S2CID 23574059 .
^ Lim R, Sugino T, Nolte H, Andrade J, Zimmermann B, Shi C, Doddaballapur A, Ong YT, Wilhelm K, Fasse JW, Ernst A, Kaulich M, Husnjak K, Boettger T, Guenther S, Braun T, Krüger М., Бенедито Р., Дикич И., Потенте М. (апрель 2019 г.). «Деубиквитиназа USP10 регулирует передачу сигналов Notch в эндотелии». Наука . 364 (6436): 188–193. Bibcode : 2019Sci ... 364..188L . DOI : 10.1126 / science.aat0778 (неактивный 2021-01-14). PMID 30975888 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
Дальнейшее чтение [ править ]
Artavanis-Tsakonas S, Rand MD, Lake RJ (1999). «Передача сигналов Notch: контроль клеточной судьбы и интеграция сигналов в развитии». Наука . 284 (5415): 770–6. Bibcode : 1999Sci ... 284..770A . DOI : 10.1126 / science.284.5415.770 . PMID 10221902 .
Мумм Дж. С., Копан Р. (2001). «Сигнализация Notch: снаружи внутрь». Dev. Биол . 228 (2): 151–65. DOI : 10.1006 / dbio.2000.9960 . PMID 11112321 .
Allenspach EJ, Maillard I, Aster JC, Pear WS (2003). «Передача сигналов Notch при раке» . Cancer Biol. Ther . 1 (5): 466–76. DOI : 10,4161 / cbt.1.5.159 . PMID 12496471 . S2CID 1328739 .
Астер JC (2006). «Дерегулированная передача сигналов NOTCH при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе / лимфоме: новые идеи, вопросы и возможности». Int. J. Hematol . 82 (4): 295–301. DOI : 10.1532 / IJH97.05096 . PMID 16298817 . S2CID 32528011 .
Внешние ссылки [ править ]
NOTCH1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
NOTCH1
vтеPDB галерея
1pb5 : Структура ЯМР прототипа модуля LNR из Notch1 человека
1toz : ЯМР-структура области связывания лиганда NOTCH-1 человека.
1ymp : Кристаллическая структура частичного анкиринового домена Mouse Notch-1: повторения с 4 по 7 сохраняют анкириновую складку
1yyh : Кристаллическая структура анкиринового домена Notch 1 человека.
2f8x : Кристаллическая структура активированных Notch, CSL и MAML на последовательности ДНК промотора HES-1.
2f8y : Кристаллическая структура анкирина Notch1 человека повторяется с разрешением 1,55 A.
2he0 : Кристаллическая структура мутанта анкиринового домена Notch1 человека