орнитин аминотрансфераза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ОАТ + PLP, человек | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
ЕС нет. | 2.6.1.13 | ||||||||
№ CAS | 9030-42-6 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
|
орнитин аминотрансфераза | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | ОВС | ||||||
Ген NCBI | 4942 | ||||||
HGNC | 8091 | ||||||
OMIM | 258870 | ||||||
RefSeq | NM_000274 | ||||||
UniProt | P04181 | ||||||
Прочие данные | |||||||
Номер ЕС | 2.6.1.13 | ||||||
Locus | Chr. 10 q26 | ||||||
|
Орнитинаминотрансфераза (ОАТ) - это фермент, который кодируется у человека геном ОАТ , расположенным на хромосоме 10 .
ОАТ участвует в окончательном образовании незаменимой аминокислоты пролина из аминокислоты орнитина . Орнитин - аминотрансфераза формирует начальный промежуточный продукт в этом процессе. Он также катализирует обратную реакцию и поэтому необходим для создания орнитина из исходного субстрата пролина.
Структура [ править ]
Ген ОАТ кодирует белок размером примерно 46 кДа. Белок ОАТ экспрессируется главным образом в печени и почках, но также в головном мозге и сетчатке. [1] Белок ОАТ находится в митохондриях клеток, где он экспрессируется. [2]
Структура белка ОАТ была определена с помощью рентгеновской кристаллографии и показывает сходство с другими аминотрансферазами подгруппы 2, такими как диалкиглюцин декарбоксилаца . [3] Белок ОАТ функционирует как димер, и каждый мономер состоит из большого домена, который вносит наибольший вклад в интерфейс субъединиц, и малого С-концевого домена, а также N-концевого участка, содержащего спираль, петлю и трехцепочечный бета-меандр. В центральном большом домене находится семицепочечный бета-лист, покрытый восемью спиралями. Кофактор белка ОАТ ( пиридоксаль-5'-фосфат ) связывается с ОАТ через основание Шиффа.в положении лизина 292, расположенном между двумя из семи нитей бета-листа. Считается, что три аминокислоты (R 180, E 235 и R413) участвуют в связывании субстрата в активном центре . [3]
Функция [ править ]
Орнитинаминотрансфераза катализирует перенос дельта-аминогруппы от L- орнитина.
- L-орнитин + 2-оксокислота = L-глутамат-5-полуальдегид + L-аминокислота
Реакция требует пиридоксаль-5'-фосфата в качестве кофактора и является частью подпути, который синтезирует L- глутамат-5-полуальдегид из L- орнитина .
Клиническое значение [ править ]
Мутации в гене OAT могут привести к неправильной работе белков, включая как точечные мутации, которые отменяют каталитическую активность, большие мутации со сдвигом рамки считывания, так и мутировавшие белки, которые не нацелены должным образом на митохондрии, где происходит его нормальная функциональность. [2] В последнем случае нарушение импорта митохондрий вызывает эктопическое накопление белка ОАТ в цитозоле с последующей быстрой деградацией в результате протеолиза . Дефицит активности ОАТ вызывает дефицит орнитинаминотрансферазы , также известный как спиральная атрофия сосудистой оболочки и сетчатки. [4] [5] [6] [7]
Считается, что механизм спиральной атрофии сосудистой оболочки и сетчатки связан с токсичностью глиоксилата . [1]
См. Также [ править ]
- Глутамат-5-полуальдегид
Ссылки [ править ]
- ^ а б Рао Г. Н., Котлиер Э (1984). «Активность орнитин-дельта-аминотрансферазы в сетчатке и других тканях». Neurochem. Res . 9 (4): 555–62. DOI : 10.1007 / bf00964382 . PMID 6462326 . S2CID 19775002 .
- ^ а б Кобаяси Т., Огава Х., Касахара М., Сиодзава З., Мацудзава Т. (1995). «Одна аминокислотная замена в зрелой последовательности орнитинаминотрансферазы препятствует проникновению предшественника в митохондрии» . Являюсь. J. Hum. Genet . 57 (2): 284–91. PMC 1801533 . PMID 7668253 .
- ^ a b Шен Б.В., Хенниг М., Хоэнестер Э., Янсониус Дж. Н., Ширмер Т. (1998). «Кристаллическая структура рекомбинантной орнитинаминотрансферазы человека». J. Mol. Биол . 277 (1): 81–102. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1583 . PMID 9514741 .
- ^ «Циркулярная атрофия сосудистой оболочки и сетчатки» . Национальные институты здоровья . Проверено 23 августа 2012 .
- ^ Kim SJ, Lim DH, Ким JH, Кан SW (2013). «Гиратная атрофия сосудистой оболочки и сетчатки, диагностированная с помощью анализа гена орнитин-δ-аминотрансферазы: отчет о болезни» . Корейский J Ophthalmol . 27 (5): 388–91. DOI : 10.3341 / kjo.2013.27.5.388 . PMC 3782588 . PMID 24082780 .
- ^ Katagiri S, Gekka Т, Т Hayashi, Ida Н, Охаши Т, У Eto, Tsuneoka Н (2014). «Мутации ОАТ и клинические особенности у двух братьев-японцев с спиральной атрофией сосудистой оболочки и сетчатки». Док офтальмол . 128 (2): 137–48. DOI : 10.1007 / s10633-014-9426-1 . PMID 24429551 . S2CID 713618 .
- ^ Doimo М, Desbats М.А., Baldoin МС, Lenzini Е, G Бассо, Мерфи Е, Грациано С, Сери М, Burlina А, Сартори G, Trevisson Е, Сальвиати L (2013). «Функциональный анализ миссенс-мутаций ОАТ, вызывающих спиральную атрофию сосудистой оболочки и сетчатки». Гм. Мутат . 34 (1): 229–36. DOI : 10.1002 / humu.22233 . PMID 23076989 . S2CID 205921336 .
Внешние ссылки [ править ]
- Орнитин + аминотрансфераза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- Зайлер N (сентябрь 2000 г.). «Орнитинаминотрансфераза, потенциальная мишень для лечения гипераммониемий» . Curr Drug Targets . 1 (2): 119–53. DOI : 10,2174 / 1389450003349254 . PMID 11465067 .