ПАПОЛА

Идентификаторы

PAPOLA , PAP, поли(А) полимераза альфа, PAP-альфа

Внешние идентификаторы

OMIM : 605553 MGI : 109301 HomoloGene : 23389 GeneCards : PAPOLA

Местоположение гена ( человек )

Хр.	Хромосома 14 (человек) ^[1]

Группа	14q32.2	Начинать	96 501 433 п.н. ^[1]
Группа	14q32.2	Конец	96 567 116 п.н. ^[1]

Местоположение гена ( Мышь )

Хр.	Хромосома 12 (мышь) ^[2]

Группа	12\|12 в.д.	Начинать	105 784 694 п.н. ^[2]
Группа	12\|12 в.д.	Конец	105 838 944 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Бгы

Топ выражен в
яичко желудок почка легкое эндометрий сердце
Дополнительные данные эталонного выражения

БиоGPS


Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность связывание нуклеотидов нуклеотидилтрансферазная активность связывание ионов марганца связывание ионов металлов GO:0001948 связывание белка связывание РНК Связывание АТФ связывание ионов магния активность полинуклеотидаденилилтрансферазы
Сотовый компонент	цитоплазма нуклеоплазма ядро
Биологический процесс	Сплайсинг мРНК через сплайсосому терминация транскрипции РНК-полимеразы II Процессинг 3'-конца РНК процессинг мРНК полиаденилирование мРНК процессинг 3'-конца мРНК регуляция процессинга 3'-конца мРНК полиаденилирование РНК
Источники: Амиго / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

мышь

Энтрез


10914


18789

Ансамбль


ENSG00000090060


ЭНСМУСГ00000021111

ЮниПрот


P51003


Q61183

RefSeq (мРНК)

НМ_001252006 НМ_001252007 НМ_001293627 НМ_001293628 НМ_001293632
NM_032632 NM_001363662 NM_001363664 NM_001363665 NM_001363666


NM_011112 NM_001347440

RefSeq (белок)

НП_001238935 НП_001238936 НП_001280556 НП_001280557 НП_001280561
НП_116021 НП_001350591 НП_001350593 НП_001350594 НП_001350595


НП_001334369 НП_035242

Местоположение (UCSC)

Хр 14: 96,5 – 96,57 Мб

Хр 12: 105,78 – 105,84 Мб

Поиск в пабмеде

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр/редактирование человека

Просмотр/редактирование мыши

Поли(А)полимераза альфа представляет собой фермент , который у человека кодируется геном PAPOLA . ^[5]^[6]^[7]

PAPOLA связывается с FIP1L1 (фактор, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1), субъединицей комплекса субъединицы 1 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF1). Этот комплекс полиаденилирует 3'-конец мРНК - предшественника (пре-мРНК) (см. CPSF ). CPSF1 представляет собой белок процессинга РНК , который связывается с богатыми урацилом последовательностями в пре-мРНК, связывается с полинуклеотидной аденилилтрансферазой POPOLA и стимулирует ее активность , тем самым добавляя аденилилтрансферазу .остатков к пре-мРНК. Это полиадениловое действие увеличивает созревание пре-мРНК и ее перемещение из ядра в цитоплазму, при этом резко увеличивая стабильность мРНК, образованной из пре-мРНК: FIP1L1 является фактором процессинга 3'-конца пре-мРНК. Слияние гена FIP1L1 между ним и генами либо рецептора тромбоцитарного фактора роста, альфа ( PGDFRA ) , либо гена рецептора ретиноевой кислоты альфа (RARA) является причиной некоторых заболеваний человека, связанных с патологически повышенным уровнем эозинофилов в крови и/или лейкемией . ^[8]

использованная литература

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000090060 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000021111 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Справочник по PubMed для людей:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Справочник по PubMed для мыши:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Турессон А.С., Астром Дж., Астром А., Гронвик К.О., Виртанен А. (март 1994 г.). «Множественные формы поли(А) полимераз в клетках человека» . Proc Natl Acad Sci USA . 91 (3): 979–83. Бибкод : 1994PNAS...91..979T . doi : 10.1073/pnas.91.3.979 . ПВК 521437 . PMID 8302877 .
^ Ямаути Т., Сугимото Дж., Хатакеяма Т., Асакава С., Симидзу Н., Исобе М. (сентябрь 1999 г.). «Назначение гена поли (А) полимеразы (РАР) человека хромосоме 14q32.1-q32.2 и выделение полиморфной последовательности повторов СА» . Джей Хам Жене . 44 (4): 253–5. doi : 10.1007/s100380050154 . PMID 10429366 .
^ «Ген Entrez: поли (A) полимераза альфа PAPOLA» .
^ «Фактор FIP1L1, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1 [Homo sapiens (человек)] - ген - NCBI» .

дальнейшее чтение

Weichs an der Glon C, Ashe M, Eggermont J, Proudfoot NJ (1993). «Tat-зависимая окклюзия сайта поли(А) ВИЧ» . ЭМБО Дж . 12 (5): 2119–28. doi : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05860.x . ПВК 413433 . PMID 8491200 .
Пендурти У.Р., Алок Д., Рао Л.В. (1997). «Связывание фактора VIIa с тканевым фактором вызывает изменения в экспрессии генов в клетках фибробластов человека: активация поли(А) полимеразы» . проц. Натл. акад. науч. США . 94 (23): 12598–603. Бибкод : 1997PNAS...9412598P . doi : 10.1073/pnas.94.23.12598 . ПМС 25051 . PMID 9356495 .
Варани Л., Гундерсон С.И., Маттай И.В. и соавт. (2000). «Структура ЯМР комплекса белок U1A 38 кДа - PIE РНК раскрывает основу кооперативности в регуляции полиаденилирования человеческим белком U1A». Нац. Структура биол . 7 (4): 329–35. дои : 10.1038/74101 . PMID 10742179 . S2CID 13432764 .
Моуланд А.Дж., Коади М., Яо XJ, Коэн Э.А. (2002). «Гипофосфорилирование поли(А)-полимеразы и повышенная активность полиаденилирования связаны с экспрессией Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1» . Вирусология . 292 (2): 321–30. doi : 10.1006/viro.2001.1261 . PMID 11878934 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Э.А., Граус Л.Х. и соавт. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . проц. Натл. акад. науч. США . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . ПМС 139241 . PMID 12477932 .
Ким Х, Ли Дж. Х., Ли И (2003). «Регулирование поли(А) полимеразы с помощью 14-3-3эпсилон» . ЭМБО Дж . 22 (19): 5208–19. doi : 10.1093/emboj/cdg486 . ПВК 204469 . PMID 14517258 .
Ота Т., Судзуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нац. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Боумистер Т., Баух А., Руффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нац. Клеточная биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Кауфманн И., Мартин Г., Фридлайн А. и др. (2005). «Человеческий Fip1 представляет собой субъединицу CPSF, которая связывается с элементами РНК, богатыми U, и стимулирует поли (А) полимеразу» . ЭМБО Дж . 23 (3): 616–26. doi : 10.1038/sj.emboj.7600070 . ПВК 1271804 . PMID 14749727 .
Детвилер С., Арингьери С., Кардинале С. и др. (2005). «Отдельные мотивы последовательности в пределах 68-кДа субъединицы фактора расщепления Im медиаторного связывания РНК, межбелковых взаимодействий и субклеточной локализации» (PDF) . Дж. Биол. хим . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID 15169763 .
Колланд Ф., Жак Х., Троуплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–1332. doi : 10.1101/гр.2334104 . ПВК 442148 . PMID 15231748 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . проц. Натл. акад. науч. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . ПВК 514446 . PMID 15302935 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Файнгольд Э.А. и соавт. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–217. doi : 10.1101/гр.2596504 . ПМС 528928 . PMID 15489334 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «На пути к карте в масштабе протеома сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

Эта статья о гене на хромосоме 14 человека незавершена . Вы можете помочь Википедии, дополнив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000090060 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000021111 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Справочник по PubMed для людей:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Справочник по PubMed для мыши:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8302877-5] ↑ Турессон А.С., Астром Дж., Астром А., Гронвик К.О., Виртанен А. (март 1994 г.). «Множественные формы поли(А) полимераз в клетках человека» . Proc Natl Acad Sci USA . 91 (3): 979–83. Бибкод : 1994PNAS...91..979T . doi : 10.1073/pnas.91.3.979 . ПВК 521437 . PMID 8302877 .

[pmid10429366-6] Ямаути Т., Сугимото Дж., Хатакеяма Т., Асакава С., Симидзу Н., Исобе М. (сентябрь 1999 г.). «Назначение гена поли (А) полимеразы (РАР) человека хромосоме 14q32.1-q32.2 и выделение полиморфной последовательности повторов СА» . Джей Хам Жене . 44 (4): 253–5. doi : 10.1007/s100380050154 . PMID 10429366 .

[entrez-7] «Ген Entrez: поли (A) полимераза альфа PAPOLA» .

[nih.gov-8] «Фактор FIP1L1, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1 [Homo sapiens (человек)] - ген - NCBI» .

[1]